MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Ketogulonicigenium vulgare Y25 plasmid pYP12

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014626	TTGG	2	8	3761	3768	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014626	CCGC	3	12	4758	4769	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3	NC_014626	CAGA	2	8	10954	10961	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_014626	ATTC	2	8	14484	14491	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014626	ATCC	2	8	23008	23015	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_014626	CAGA	2	8	23038	23045	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_014626	AAAC	2	8	25370	25377	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_014626	GGAG	2	8	30141	30148	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014626	CATT	2	8	45145	45152	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_014626	GCCC	2	8	50627	50634	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11	NC_014626	AGCC	2	8	57290	57297	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_014626	GCAA	2	8	57888	57895	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_014626	GAAT	2	8	63101	63108	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014626	GTTT	2	8	83483	83490	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014626	CTTT	2	8	87136	87143	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_014626	TGGA	2	8	92730	92737	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014626	GGCA	2	8	102307	102314	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_014626	CGGG	2	8	113622	113629	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19	NC_014626	ATAA	2	8	113699	113706	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014626	GGCA	2	8	123177	123184	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_014626	GGGT	2	8	125826	125833	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014626	AATG	2	8	125854	125861	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014626	GATG	2	8	134500	134507	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014626	ATGC	2	8	134759	134766	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_014626	TCCA	2	8	135185	135192	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_014626	CCGG	2	8	136211	136218	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_014626	TGGC	2	8	139587	139594	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_014626	TAGC	2	8	141267	141274	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_014626	GGTC	2	8	142052	142059	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_014626	CGGG	2	8	142106	142113	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
31	NC_014626	GCAA	2	8	152702	152709	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_014626	CTGT	2	8	153512	153519	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_014626	GACA	2	8	153668	153675	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_014626	CCGT	2	8	153902	153909	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_014626	GCCG	2	8	163488	163495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_014626	CCAG	2	8	163542	163549	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_014626	TCGC	2	8	163937	163944	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_014626	GGCC	2	8	167856	167863	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_014626	GGCG	2	8	168264	168271	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40	NC_014626	ATAA	4	16	173407	173422	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014626	ATTT	2	8	176626	176633	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014626	TCCC	2	8	176735	176742	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
43	NC_014626	CAGG	2	8	181230	181237	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_014626	GCGG	2	8	184252	184259	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
45	NC_014626	GATG	2	8	184506	184513	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014626	GATG	2	8	184521	184528	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014626	CGCC	2	8	187393	187400	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
48	NC_014626	CAGC	2	8	188179	188186	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_014626	AGGC	2	8	188526	188533	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_014626	CGCC	2	8	188891	188898	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
51	NC_014626	TCGG	2	8	194198	194205	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_014626	GCAG	2	8	194382	194389	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_014626	TCGC	2	8	197252	197259	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_014626	CTGC	2	8	215426	215433	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_014626	GCAA	2	8	217164	217171	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_014626	GATT	2	8	229504	229511	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014626	CAGA	2	8	229557	229564	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_014626	ACAT	2	8	241373	241380	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.