MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Ketogulonicigenium vulgare Y25 plasmid pYP12

Total Repeats: 360

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014626	CCA	2	6	3778	3783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_014626	GCC	2	6	6055	6060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_014626	GGC	2	6	6073	6078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014626	TTA	2	6	14531	14536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014626	GCA	2	6	17040	17045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014626	ATC	2	6	17066	17071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014626	TGG	2	6	17082	17087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014626	TCA	2	6	19793	19798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014626	CCA	2	6	19824	19829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_014626	GGA	2	6	22507	22512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014626	CCA	2	6	22515	22520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_014626	AGC	2	6	22562	22567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014626	GAC	2	6	22591	22596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014626	GTT	2	6	22603	22608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014626	ATC	2	6	22619	22624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014626	GCG	2	6	22647	22652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_014626	CAG	2	6	22702	22707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014626	CTT	2	6	22794	22799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014626	CGG	2	6	22805	22810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014626	ATC	4	12	22844	22855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_014626	CAC	2	6	22879	22884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_014626	CCA	2	6	22935	22940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_014626	GGC	2	6	23029	23034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014626	CGG	2	6	23049	23054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014626	TGC	2	6	23155	23160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_014626	GCA	2	6	23162	23167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014626	CCA	3	9	23207	23215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_014626	CAC	2	6	23223	23228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_014626	CAA	2	6	24082	24087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_014626	AGG	2	6	24090	24095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014626	GGC	2	6	24134	24139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_014626	GCC	2	6	25335	25340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_014626	GCC	2	6	25345	25350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_014626	TTC	2	6	25444	25449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_014626	GCC	2	6	26587	26592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_014626	CGC	2	6	26608	26613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_014626	GCG	2	6	31357	31362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014626	CGC	2	6	31374	31379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_014626	GTC	2	6	33050	33055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014626	CTC	2	6	35898	35903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_014626	CCG	2	6	35908	35913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_014626	ATA	2	6	35959	35964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014626	CAG	2	6	38900	38905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014626	TCC	2	6	39009	39014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_014626	TCC	2	6	40367	40372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_014626	GCC	2	6	40384	40389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_014626	GCA	2	6	40838	40843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014626	CGC	2	6	40915	40920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_014626	GCG	2	6	40932	40937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014626	CGG	2	6	40986	40991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014626	CGA	2	6	41031	41036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014626	CAG	2	6	41059	41064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014626	GCC	2	6	41157	41162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_014626	CCG	2	6	41171	41176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_014626	GCC	2	6	41185	41190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_014626	GCC	2	6	41286	41291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_014626	ACC	2	6	41311	41316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_014626	GCC	2	6	41383	41388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_014626	CCA	2	6	41450	41455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_014626	ACC	2	6	41500	41505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_014626	GCC	2	6	44285	44290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_014626	AAT	2	6	48247	48252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014626	GCC	2	6	48818	48823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_014626	TCA	2	6	48838	48843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014626	CAC	2	6	52181	52186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_014626	ACG	2	6	54700	54705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_014626	ATC	2	6	54875	54880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014626	CGA	2	6	55271	55276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_014626	GCG	2	6	56069	56074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_014626	CAT	2	6	57138	57143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014626	GCT	3	9	57190	57198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_014626	GCC	2	6	57237	57242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_014626	ACC	2	6	57278	57283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_014626	GCG	2	6	61368	61373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_014626	TGG	2	6	61394	61399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014626	GTG	2	6	61405	61410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014626	GCC	2	6	61415	61420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_014626	GTG	2	6	62716	62721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014626	GCC	2	6	62743	62748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_014626	GTG	2	6	63048	63053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014626	CGA	2	6	63057	63062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014626	GGC	2	6	71295	71300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014626	GCC	2	6	71308	71313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_014626	CGA	2	6	72565	72570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_014626	GCC	2	6	72581	72586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_014626	GAT	2	6	72693	72698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014626	GGC	2	6	76298	76303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_014626	GCC	2	6	76316	76321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_014626	TTA	2	6	77957	77962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014626	GCC	2	6	77970	77975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_014626	GTT	2	6	77999	78004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014626	TTC	2	6	88782	88787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_014626	GCA	2	6	88793	88798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_014626	CGC	2	6	92700	92705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_014626	GCG	2	6	92715	92720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_014626	GAA	2	6	92764	92769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014626	TGG	2	6	100245	100250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014626	CAA	2	6	100276	100281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_014626	GCG	2	6	100309	100314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014626	TAT	2	6	100343	100348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014626	CGC	2	6	100360	100365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_014626	CCG	2	6	102158	102163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_014626	ACG	2	6	102202	102207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_014626	GGC	2	6	102231	102236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_014626	TGA	2	6	102299	102304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014626	CGC	2	6	102356	102361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_014626	CGC	2	6	102386	102391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_014626	CAG	2	6	102402	102407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_014626	GCG	2	6	109438	109443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_014626	CGT	2	6	109506	109511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_014626	ATA	2	6	109544	109549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014626	CTG	2	6	109571	109576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_014626	GGC	2	6	109577	109582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_014626	GCC	2	6	109663	109668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_014626	CTA	2	6	109681	109686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_014626	GCA	2	6	113411	113416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_014626	CAG	2	6	113481	113486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_014626	AAT	2	6	113544	113549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014626	ACC	2	6	113555	113560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_014626	GCA	3	9	113562	113570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_014626	GGC	2	6	113637	113642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_014626	GGC	2	6	113662	113667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_014626	CTG	2	6	116979	116984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_014626	ATG	2	6	122862	122867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014626	GCC	2	6	122882	122887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_014626	ACC	2	6	122922	122927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_014626	GGC	2	6	122954	122959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_014626	GCC	2	6	123033	123038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_014626	GCG	3	9	123054	123062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_014626	CAC	2	6	123104	123109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_014626	CGC	2	6	123110	123115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_014626	CCA	2	6	123130	123135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_014626	AAT	2	6	123149	123154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014626	AGC	2	6	125997	126002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_014626	CTG	2	6	126006	126011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_014626	ATC	2	6	126028	126033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_014626	CTG	2	6	134200	134205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_014626	CAG	2	6	134231	134236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_014626	GCT	2	6	134305	134310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.