MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Ketogulonicigenium vulgare Y25 chromosome

Total Repeats: 97

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014625	GGGCGC	2	12	8588	8599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014625	ATCCGG	2	12	17672	17683	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014625	CGCCAG	3	18	167783	167800	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4	NC_014625	CCAGCG	3	18	167869	167886	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5	NC_014625	ATCCAG	2	12	168523	168534	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014625	CCGCGC	2	12	168755	168766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_014625	CTGTCC	2	12	169248	169259	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
8	NC_014625	CCTGCG	2	12	173432	173443	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
9	NC_014625	GCGCCC	2	12	182868	182879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_014625	CGACCT	2	12	213908	213919	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11	NC_014625	ATCCGG	2	12	242557	242568	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014625	GTCGCC	2	12	308759	308770	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
13	NC_014625	GCGCCC	2	12	336069	336080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_014625	GGCGGG	2	12	359487	359498	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_014625	GGGCAG	2	12	382900	382911	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_014625	GCAGGT	2	12	383640	383651	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_014625	ATCCGG	2	12	402601	402612	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014625	GTTCTG	2	12	521333	521344	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_014625	CGGTCA	2	12	542692	542703	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014625	CTCGAA	2	12	583525	583536	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_014625	GATGCC	2	12	615530	615541	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014625	TGATCC	2	12	623431	623442	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014625	CGCTGG	2	12	658714	658725	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014625	GAAGGC	2	12	676783	676794	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_014625	CAACTC	2	12	678861	678872	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_014625	CCTCGG	2	12	713589	713600	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
27	NC_014625	ATAGGC	2	12	718430	718441	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_014625	GCAGGG	2	12	757460	757471	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_014625	CCACCG	2	12	778703	778714	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_014625	TCACCG	2	12	780088	780099	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
31	NC_014625	TCAAAG	2	12	811426	811437	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_014625	GCCGAT	2	12	834072	834083	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_014625	AAAAGC	2	12	834550	834561	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_014625	CTTTGC	3	18	867658	867675	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_014625	GCAAGC	2	12	912334	912345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014625	CGGCTG	2	12	961322	961333	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014625	GCTGCG	2	12	961352	961363	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014625	GCCTCG	2	12	1002705	1002716	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
39	NC_014625	TTGCCA	2	12	1050827	1050838	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014625	TTGGCC	2	12	1097350	1097361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_014625	AAGAAT	2	12	1126987	1126998	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014625	CTACAA	2	12	1170663	1170674	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014625	TTTTCA	2	12	1193082	1193093	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_014625	AAAGGC	2	12	1196241	1196252	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_014625	TCAAGC	2	12	1196303	1196314	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014625	TGTCGA	2	12	1198276	1198287	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_014625	GAACCT	2	12	1213895	1213906	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014625	ATCGAG	2	12	1222563	1222574	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_014625	GAGGCC	2	12	1251745	1251756	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014625	GTTGCA	2	12	1295372	1295383	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_014625	CTTTCA	2	12	1301739	1301750	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014625	CCTTCG	2	12	1404210	1404221	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
53	NC_014625	GGTTGA	2	12	1479181	1479192	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014625	GCGCCA	2	12	1491707	1491718	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
55	NC_014625	CCCGTT	2	12	1508975	1508986	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
56	NC_014625	GCCAAC	2	12	1643994	1644005	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
57	NC_014625	CAGGAA	2	12	1645312	1645323	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_014625	ACCATC	2	12	1646315	1646326	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_014625	GCATCG	2	12	1656596	1656607	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014625	GGCAAG	2	12	1690549	1690560	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_014625	CCGCGA	2	12	1691073	1691084	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
62	NC_014625	CGCGCC	2	12	1765211	1765222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_014625	CAGCGC	2	12	1786410	1786421	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
64	NC_014625	GCACCG	2	12	1799262	1799273	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
65	NC_014625	TCATTC	2	12	1891574	1891585	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_014625	CTTTCC	2	12	1926230	1926241	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_014625	CCGGAT	2	12	1953100	1953111	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014625	GGGTTG	2	12	1959455	1959466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014625	GGATCA	2	12	1983121	1983132	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_014625	TGATCG	2	12	1988020	1988031	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_014625	TTCCAC	2	12	1990273	1990284	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_014625	CGCCCC	2	12	2011070	2011081	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
73	NC_014625	CGGATG	2	12	2015720	2015731	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_014625	CACCGC	2	12	2049660	2049671	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_014625	CGCAAG	2	12	2050374	2050385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_014625	GCCCCT	2	12	2110247	2110258	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_014625	AGGTGC	2	12	2116515	2116526	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_014625	CGCGGG	2	12	2139697	2139708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014625	CGCCTG	2	12	2153580	2153591	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
80	NC_014625	CAAGCG	2	12	2187068	2187079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_014625	GGGCGC	2	12	2221835	2221846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014625	CGACCC	2	12	2251074	2251085	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_014625	GCGGCA	2	12	2254989	2255000	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_014625	CCAAAG	2	12	2259485	2259496	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_014625	AGCGTT	2	12	2386482	2386493	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_014625	CCCTTG	2	12	2391271	2391282	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
87	NC_014625	AAAGCG	2	12	2434489	2434500	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_014625	GGCGGG	2	12	2452443	2452454	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_014625	TCAACG	2	12	2471567	2471578	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_014625	GGGTCG	2	12	2576983	2576994	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_014625	TGGAGC	2	12	2631465	2631476	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_014625	GATAAA	2	12	2661802	2661813	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014625	CCTCGG	2	12	2672586	2672597	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
94	NC_014625	CGCCCG	2	12	2708520	2708531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_014625	AGCCGC	2	12	2708942	2708953	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
96	NC_014625	GGTTCA	2	12	2738558	2738569	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_014625	CAAAGG	2	12	2748582	2748593	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.