MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Ketogulonicigenium vulgare Y25 chromosome

Total Repeats: 2488

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014625	CGATG	2	10	1651	1660	20 %	20 %	40 %	20 %	310814536
2	NC_014625	GCTGC	2	10	2233	2242	0 %	20 %	40 %	40 %	310814537
3	NC_014625	TGCGA	2	10	2713	2722	20 %	20 %	40 %	20 %	310814537
4	NC_014625	GGTGC	2	10	3269	3278	0 %	20 %	60 %	20 %	310814537
5	NC_014625	CGCAA	2	10	3959	3968	40 %	0 %	20 %	40 %	310814538
6	NC_014625	GCATC	2	10	6862	6871	20 %	20 %	20 %	40 %	310814541
7	NC_014625	TCGTG	2	10	14383	14392	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_014625	CAACA	2	10	15155	15164	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_014625	CAAGT	2	10	15350	15359	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_014625	ATCAA	2	10	15506	15515	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_014625	TTGAA	2	10	17341	17350	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014625	TTGCT	2	10	17640	17649	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_014625	CTCAT	2	10	17970	17979	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_014625	GATCA	2	10	20325	20334	40 %	20 %	20 %	20 %	310814548
15	NC_014625	TAAGC	2	10	20775	20784	40 %	20 %	20 %	20 %	310814548
16	NC_014625	GGGCG	2	10	21487	21496	0 %	0 %	80 %	20 %	310814549
17	NC_014625	GCTGC	2	10	23455	23464	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_014625	CGCTG	2	10	24068	24077	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_014625	GATCA	2	10	24949	24958	40 %	20 %	20 %	20 %	310814551
20	NC_014625	GCGCG	2	10	25330	25339	0 %	0 %	60 %	40 %	310814551
21	NC_014625	CAGCA	2	10	25883	25892	40 %	0 %	20 %	40 %	310814552
22	NC_014625	CCTCG	2	10	27173	27182	0 %	20 %	20 %	60 %	310814553
23	NC_014625	GCGCC	2	10	27521	27530	0 %	0 %	40 %	60 %	310814553
24	NC_014625	TCAGG	2	10	27863	27872	20 %	20 %	40 %	20 %	310814553
25	NC_014625	GGCGC	2	10	28544	28553	0 %	0 %	60 %	40 %	310814553
26	NC_014625	GGCGC	2	10	28961	28970	0 %	0 %	60 %	40 %	310814554
27	NC_014625	GCCGC	2	10	29332	29341	0 %	0 %	40 %	60 %	310814554
28	NC_014625	AAGCG	2	10	31836	31845	40 %	0 %	40 %	20 %	310814557
29	NC_014625	CTGAT	2	10	32306	32315	20 %	40 %	20 %	20 %	310814557
30	NC_014625	GATCC	2	10	34139	34148	20 %	20 %	20 %	40 %	310814558
31	NC_014625	CGGGC	2	10	36791	36800	0 %	0 %	60 %	40 %	310814562
32	NC_014625	TGGAT	2	10	37582	37591	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014625	GTTTC	2	10	38632	38641	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_014625	GCCAC	2	10	39268	39277	20 %	0 %	20 %	60 %	310814564
35	NC_014625	CGCGC	2	10	39666	39675	0 %	0 %	40 %	60 %	310814564
36	NC_014625	CGCGC	3	15	41540	41554	0 %	0 %	40 %	60 %	310814566
37	NC_014625	GCGGG	2	10	42916	42925	0 %	0 %	80 %	20 %	310814568
38	NC_014625	CATCA	2	10	42965	42974	40 %	20 %	0 %	40 %	310814568
39	NC_014625	GGCGC	3	15	43539	43553	0 %	0 %	60 %	40 %	310814568
40	NC_014625	GCCCG	2	10	45013	45022	0 %	0 %	40 %	60 %	310814568
41	NC_014625	GCCCG	2	10	45997	46006	0 %	0 %	40 %	60 %	310814569
42	NC_014625	GATGC	2	10	46668	46677	20 %	20 %	40 %	20 %	310814569
43	NC_014625	GCGCG	2	10	46778	46787	0 %	0 %	60 %	40 %	310814570
44	NC_014625	CGGAT	2	10	48401	48410	20 %	20 %	40 %	20 %	310814572
45	NC_014625	GCGAT	2	10	49279	49288	20 %	20 %	40 %	20 %	310814573
46	NC_014625	GCGCA	2	10	50103	50112	20 %	0 %	40 %	40 %	310814575
47	NC_014625	GGGGC	2	10	50137	50146	0 %	0 %	80 %	20 %	310814575
48	NC_014625	CGCGG	2	10	51492	51501	0 %	0 %	60 %	40 %	310814577
49	NC_014625	TGCGG	2	10	52473	52482	0 %	20 %	60 %	20 %	310814578
50	NC_014625	TGCAA	2	10	52693	52702	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_014625	GCCGT	2	10	54432	54441	0 %	20 %	40 %	40 %	310814581
52	NC_014625	GGTCA	2	10	55036	55045	20 %	20 %	40 %	20 %	310814582
53	NC_014625	CGGCG	2	10	55228	55237	0 %	0 %	60 %	40 %	310814582
54	NC_014625	CAGCG	2	10	56431	56440	20 %	0 %	40 %	40 %	310814583
55	NC_014625	TTGCG	2	10	56688	56697	0 %	40 %	40 %	20 %	310814583
56	NC_014625	GGATG	2	10	58851	58860	20 %	20 %	60 %	0 %	310814584
57	NC_014625	GCGCG	2	10	59283	59292	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
58	NC_014625	TCGAT	2	10	61987	61996	20 %	40 %	20 %	20 %	310814587
59	NC_014625	CGCGC	2	10	63017	63026	0 %	0 %	40 %	60 %	310814588
60	NC_014625	CTGCG	2	10	64486	64495	0 %	20 %	40 %	40 %	310814589
61	NC_014625	TGATC	2	10	65710	65719	20 %	40 %	20 %	20 %	310814591
62	NC_014625	CGCGT	2	10	67076	67085	0 %	20 %	40 %	40 %	310814593
63	NC_014625	TTGCT	2	10	67652	67661	0 %	60 %	20 %	20 %	310814594
64	NC_014625	CAGCG	2	10	69624	69633	20 %	0 %	40 %	40 %	310814596
65	NC_014625	GCCCG	2	10	71039	71048	0 %	0 %	40 %	60 %	310814597
66	NC_014625	TGACC	2	10	71458	71467	20 %	20 %	20 %	40 %	310814597
67	NC_014625	GCGCT	2	10	74079	74088	0 %	20 %	40 %	40 %	310814600
68	NC_014625	AAATC	2	10	75062	75071	60 %	20 %	0 %	20 %	310814601
69	NC_014625	GATTG	2	10	75610	75619	20 %	40 %	40 %	0 %	310814601
70	NC_014625	GATCT	2	10	76658	76667	20 %	40 %	20 %	20 %	310814602
71	NC_014625	GGCAA	2	10	77480	77489	40 %	0 %	40 %	20 %	310814602
72	NC_014625	TGGCG	2	10	78084	78093	0 %	20 %	60 %	20 %	310814602
73	NC_014625	GCCGC	2	10	79246	79255	0 %	0 %	40 %	60 %	310814602
74	NC_014625	TGCCG	2	10	80141	80150	0 %	20 %	40 %	40 %	310814603
75	NC_014625	GACCC	2	10	80819	80828	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
76	NC_014625	TGCGC	2	10	81515	81524	0 %	20 %	40 %	40 %	310814605
77	NC_014625	TGCGC	2	10	81869	81878	0 %	20 %	40 %	40 %	310814605
78	NC_014625	TCGAT	2	10	83558	83567	20 %	40 %	20 %	20 %	310814609
79	NC_014625	ACGAT	2	10	85186	85195	40 %	20 %	20 %	20 %	310814611
80	NC_014625	CGGGT	2	10	85789	85798	0 %	20 %	60 %	20 %	310814613
81	NC_014625	CGGGG	2	10	89437	89446	0 %	0 %	80 %	20 %	310814617
82	NC_014625	GCGCG	2	10	89601	89610	0 %	0 %	60 %	40 %	310814617
83	NC_014625	GTTTT	2	10	90523	90532	0 %	80 %	20 %	0 %	310814620
84	NC_014625	GGCAT	2	10	91461	91470	20 %	20 %	40 %	20 %	310814621
85	NC_014625	TCGGT	2	10	91760	91769	0 %	40 %	40 %	20 %	310814622
86	NC_014625	GTGAT	2	10	92622	92631	20 %	40 %	40 %	0 %	310814623
87	NC_014625	ATCTG	2	10	94317	94326	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_014625	GCGCG	2	10	95253	95262	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
89	NC_014625	TGCTG	2	10	96149	96158	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
90	NC_014625	CGGGC	2	10	97469	97478	0 %	0 %	60 %	40 %	310814629
91	NC_014625	CCGAC	2	10	97867	97876	20 %	0 %	20 %	60 %	310814629
92	NC_014625	CGCGC	2	10	98539	98548	0 %	0 %	40 %	60 %	310814630
93	NC_014625	GTCCA	2	10	98705	98714	20 %	20 %	20 %	40 %	310814630
94	NC_014625	CAATG	2	10	98781	98790	40 %	20 %	20 %	20 %	310814630
95	NC_014625	GCCCG	2	10	99748	99757	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
96	NC_014625	GCGGG	2	10	100107	100116	0 %	0 %	80 %	20 %	310814632
97	NC_014625	GCCGC	2	10	101276	101285	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
98	NC_014625	TGCTG	2	10	103106	103115	0 %	40 %	40 %	20 %	310814635
99	NC_014625	TGACC	2	10	105569	105578	20 %	20 %	20 %	40 %	310814637
100	NC_014625	GCGCC	2	10	105710	105719	0 %	0 %	40 %	60 %	310814637
101	NC_014625	GCTGC	2	10	105866	105875	0 %	20 %	40 %	40 %	310814637
102	NC_014625	TCAGC	2	10	106349	106358	20 %	20 %	20 %	40 %	310814638
103	NC_014625	GCGCG	2	10	107097	107106	0 %	0 %	60 %	40 %	310814639
104	NC_014625	TGATC	2	10	108000	108009	20 %	40 %	20 %	20 %	310814641
105	NC_014625	TCGGC	2	10	108441	108450	0 %	20 %	40 %	40 %	310814641
106	NC_014625	ATCGA	2	10	108497	108506	40 %	20 %	20 %	20 %	310814641
107	NC_014625	GGATC	2	10	110328	110337	20 %	20 %	40 %	20 %	310814641
108	NC_014625	ATCGC	2	10	110366	110375	20 %	20 %	20 %	40 %	310814641
109	NC_014625	CGCGC	2	10	110397	110406	0 %	0 %	40 %	60 %	310814641
110	NC_014625	GAATG	2	10	111443	111452	40 %	20 %	40 %	0 %	310814642
111	NC_014625	GCCAT	2	10	112225	112234	20 %	20 %	20 %	40 %	310814643
112	NC_014625	GCAGG	2	10	113233	113242	20 %	0 %	60 %	20 %	310814644
113	NC_014625	TGGTG	2	10	114723	114732	0 %	40 %	60 %	0 %	310814646
114	NC_014625	GGCTG	2	10	114912	114921	0 %	20 %	60 %	20 %	310814646
115	NC_014625	TGCCT	2	10	115105	115114	0 %	40 %	20 %	40 %	310814647
116	NC_014625	CGATG	2	10	115646	115655	20 %	20 %	40 %	20 %	310814648
117	NC_014625	CGACC	2	10	118381	118390	20 %	0 %	20 %	60 %	310814652
118	NC_014625	GATCG	2	10	121221	121230	20 %	20 %	40 %	20 %	310814655
119	NC_014625	GCCCA	2	10	121801	121810	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
120	NC_014625	TGGGT	2	10	121836	121845	0 %	40 %	60 %	0 %	310814657
121	NC_014625	GATGC	2	10	122191	122200	20 %	20 %	40 %	20 %	310814657
122	NC_014625	ATCCA	2	10	122316	122325	40 %	20 %	0 %	40 %	310814657
123	NC_014625	GCAGG	2	10	123015	123024	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
124	NC_014625	GCGCG	2	10	125600	125609	0 %	0 %	60 %	40 %	310814662
125	NC_014625	TGCAT	2	10	127277	127286	20 %	40 %	20 %	20 %	310814665
126	NC_014625	AGCGA	2	10	127418	127427	40 %	0 %	40 %	20 %	310814665
127	NC_014625	ACGCA	2	10	127576	127585	40 %	0 %	20 %	40 %	310814665
128	NC_014625	GAAGA	2	10	128857	128866	60 %	0 %	40 %	0 %	310814666
129	NC_014625	GCTTA	2	10	128907	128916	20 %	40 %	20 %	20 %	310814666
130	NC_014625	GCCCG	2	10	129422	129431	0 %	0 %	40 %	60 %	310814668
131	NC_014625	GCTGG	2	10	131582	131591	0 %	20 %	60 %	20 %	310814671
132	NC_014625	GGGCT	2	10	133509	133518	0 %	20 %	60 %	20 %	310814673
133	NC_014625	TGCCG	2	10	134590	134599	0 %	20 %	40 %	40 %	310814674
134	NC_014625	GGGCT	2	10	134681	134690	0 %	20 %	60 %	20 %	310814674
135	NC_014625	CACTT	2	10	136394	136403	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
136	NC_014625	CAGCG	2	10	136713	136722	20 %	0 %	40 %	40 %	310814678
137	NC_014625	CAAAA	2	10	137886	137895	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_014625	GGCGA	2	10	137939	137948	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
139	NC_014625	GGCGA	2	10	138068	138077	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
140	NC_014625	TCCAA	2	10	138749	138758	40 %	20 %	0 %	40 %	310814679
141	NC_014625	AGCGT	2	10	139186	139195	20 %	20 %	40 %	20 %	310814680
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147	NC_014625	GACCA	2	10	145902	145911	40 %	0 %	20 %	40 %	310814686
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151	NC_014625	CCCGA	2	10	150287	150296	20 %	0 %	20 %	60 %	310814691
152	NC_014625	GGGCA	2	10	151404	151413	20 %	0 %	60 %	20 %	310814692
153	NC_014625	GTGGC	2	10	155277	155286	0 %	20 %	60 %	20 %	310814697
154	NC_014625	CGGCG	2	10	155310	155319	0 %	0 %	60 %	40 %	310814697
155	NC_014625	TTGCG	2	10	158188	158197	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
156	NC_014625	TCGGA	2	10	159305	159314	20 %	20 %	40 %	20 %	310814701
157	NC_014625	CCGGA	2	10	159972	159981	20 %	0 %	40 %	40 %	310814702
158	NC_014625	GATTG	2	10	161405	161414	20 %	40 %	40 %	0 %	310814705
159	NC_014625	GCCTC	2	10	162411	162420	0 %	20 %	20 %	60 %	310814705
160	NC_014625	GACCA	2	10	162815	162824	40 %	0 %	20 %	40 %	310814705
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164	NC_014625	CTGAT	2	10	167980	167989	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
165	NC_014625	GCGCA	2	10	168841	168850	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
166	NC_014625	CCGCG	2	10	169499	169508	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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168	NC_014625	GCGCG	2	10	171794	171803	0 %	0 %	60 %	40 %	310814713
169	NC_014625	GCGCC	2	10	172939	172948	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
170	NC_014625	GCGCG	2	10	174687	174696	0 %	0 %	60 %	40 %	310814714
171	NC_014625	TGCCG	2	10	176123	176132	0 %	20 %	40 %	40 %	310814715
172	NC_014625	CTTTG	2	10	176273	176282	0 %	60 %	20 %	20 %	310814715
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175	NC_014625	TCTGT	2	10	178261	178270	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
176	NC_014625	TCCAT	2	10	179325	179334	20 %	40 %	0 %	40 %	310814720
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178	NC_014625	TGCGG	2	10	182903	182912	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
179	NC_014625	CGTCG	2	10	182927	182936	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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182	NC_014625	GTCGT	2	10	185228	185237	0 %	40 %	40 %	20 %	310814727
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204	NC_014625	GGCGC	2	10	214722	214731	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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224	NC_014625	CAGAT	2	10	230104	230113	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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234	NC_014625	ATCAA	2	10	240391	240400	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
235	NC_014625	TTGAA	2	10	242226	242235	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
236	NC_014625	TTGCT	2	10	242525	242534	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
237	NC_014625	CTCAT	2	10	242855	242864	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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239	NC_014625	GGGCA	2	10	246067	246076	20 %	0 %	60 %	20 %	310814781
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251	NC_014625	CGCAG	2	10	267033	267042	20 %	0 %	40 %	40 %	310814807
252	NC_014625	ATCGA	2	10	267749	267758	40 %	20 %	20 %	20 %	310814808
253	NC_014625	AGCCA	2	10	268754	268763	40 %	0 %	20 %	40 %	310814809
254	NC_014625	TATGA	2	10	271899	271908	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
255	NC_014625	GCCGC	2	10	272245	272254	0 %	0 %	40 %	60 %	310814812
256	NC_014625	CTGAT	2	10	273145	273154	20 %	40 %	20 %	20 %	310814813
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259	NC_014625	GGCGA	2	10	274577	274586	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
260	NC_014625	GGGCA	2	10	274780	274789	20 %	0 %	60 %	20 %	310814814
261	NC_014625	ATCGC	2	10	275137	275146	20 %	20 %	20 %	40 %	310814814
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263	NC_014625	CGCTG	2	10	276958	276967	0 %	20 %	40 %	40 %	310814817
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270	NC_014625	GGCGG	2	10	290512	290521	0 %	0 %	80 %	20 %	310814832
271	NC_014625	CGCTG	2	10	290772	290781	0 %	20 %	40 %	40 %	310814832
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402	NC_014625	GGCCG	2	10	430289	430298	0 %	0 %	60 %	40 %	310814955
403	NC_014625	TGCGG	2	10	431100	431109	0 %	20 %	60 %	20 %	310814956
404	NC_014625	GGCGC	2	10	431209	431218	0 %	0 %	60 %	40 %	310814956
405	NC_014625	CGGCG	2	10	433790	433799	0 %	0 %	60 %	40 %	310814958
406	NC_014625	CGGGG	2	10	437423	437432	0 %	0 %	80 %	20 %	310814963
407	NC_014625	TCAAA	2	10	438635	438644	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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454	NC_014625	CGCGC	2	10	499590	499599	0 %	0 %	40 %	60 %	310815024
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461	NC_014625	GCCGC	2	10	507909	507918	0 %	0 %	40 %	60 %	310815029
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481	NC_014625	CGAGC	2	10	526238	526247	20 %	0 %	40 %	40 %	310815044
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