MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Ketogulonicigenium vulgare Y25 chromosome

Total Repeats: 2162

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014625	CGATG	2	10	1651	1660	20 %	20 %	40 %	20 %	310814536
2	NC_014625	GCTGC	2	10	2233	2242	0 %	20 %	40 %	40 %	310814537
3	NC_014625	TGCGA	2	10	2713	2722	20 %	20 %	40 %	20 %	310814537
4	NC_014625	GGTGC	2	10	3269	3278	0 %	20 %	60 %	20 %	310814537
5	NC_014625	CGCAA	2	10	3959	3968	40 %	0 %	20 %	40 %	310814538
6	NC_014625	GCATC	2	10	6862	6871	20 %	20 %	20 %	40 %	310814541
7	NC_014625	GATCA	2	10	20325	20334	40 %	20 %	20 %	20 %	310814548
8	NC_014625	TAAGC	2	10	20775	20784	40 %	20 %	20 %	20 %	310814548
9	NC_014625	GGGCG	2	10	21487	21496	0 %	0 %	80 %	20 %	310814549
10	NC_014625	GATCA	2	10	24949	24958	40 %	20 %	20 %	20 %	310814551
11	NC_014625	GCGCG	2	10	25330	25339	0 %	0 %	60 %	40 %	310814551
12	NC_014625	CAGCA	2	10	25883	25892	40 %	0 %	20 %	40 %	310814552
13	NC_014625	CCTCG	2	10	27173	27182	0 %	20 %	20 %	60 %	310814553
14	NC_014625	GCGCC	2	10	27521	27530	0 %	0 %	40 %	60 %	310814553
15	NC_014625	TCAGG	2	10	27863	27872	20 %	20 %	40 %	20 %	310814553
16	NC_014625	GGCGC	2	10	28544	28553	0 %	0 %	60 %	40 %	310814553
17	NC_014625	GGCGC	2	10	28961	28970	0 %	0 %	60 %	40 %	310814554
18	NC_014625	GCCGC	2	10	29332	29341	0 %	0 %	40 %	60 %	310814554
19	NC_014625	AAGCG	2	10	31836	31845	40 %	0 %	40 %	20 %	310814557
20	NC_014625	CTGAT	2	10	32306	32315	20 %	40 %	20 %	20 %	310814557
21	NC_014625	GATCC	2	10	34139	34148	20 %	20 %	20 %	40 %	310814558
22	NC_014625	CGGGC	2	10	36791	36800	0 %	0 %	60 %	40 %	310814562
23	NC_014625	GCCAC	2	10	39268	39277	20 %	0 %	20 %	60 %	310814564
24	NC_014625	CGCGC	2	10	39666	39675	0 %	0 %	40 %	60 %	310814564
25	NC_014625	CGCGC	3	15	41540	41554	0 %	0 %	40 %	60 %	310814566
26	NC_014625	GCGGG	2	10	42916	42925	0 %	0 %	80 %	20 %	310814568
27	NC_014625	CATCA	2	10	42965	42974	40 %	20 %	0 %	40 %	310814568
28	NC_014625	GGCGC	3	15	43539	43553	0 %	0 %	60 %	40 %	310814568
29	NC_014625	GCCCG	2	10	45013	45022	0 %	0 %	40 %	60 %	310814568
30	NC_014625	GCCCG	2	10	45997	46006	0 %	0 %	40 %	60 %	310814569
31	NC_014625	GATGC	2	10	46668	46677	20 %	20 %	40 %	20 %	310814569
32	NC_014625	GCGCG	2	10	46778	46787	0 %	0 %	60 %	40 %	310814570
33	NC_014625	CGGAT	2	10	48401	48410	20 %	20 %	40 %	20 %	310814572
34	NC_014625	GCGAT	2	10	49279	49288	20 %	20 %	40 %	20 %	310814573
35	NC_014625	GCGCA	2	10	50103	50112	20 %	0 %	40 %	40 %	310814575
36	NC_014625	GGGGC	2	10	50137	50146	0 %	0 %	80 %	20 %	310814575
37	NC_014625	CGCGG	2	10	51492	51501	0 %	0 %	60 %	40 %	310814577
38	NC_014625	TGCGG	2	10	52473	52482	0 %	20 %	60 %	20 %	310814578
39	NC_014625	GCCGT	2	10	54432	54441	0 %	20 %	40 %	40 %	310814581
40	NC_014625	GGTCA	2	10	55036	55045	20 %	20 %	40 %	20 %	310814582
41	NC_014625	CGGCG	2	10	55228	55237	0 %	0 %	60 %	40 %	310814582
42	NC_014625	CAGCG	2	10	56431	56440	20 %	0 %	40 %	40 %	310814583
43	NC_014625	TTGCG	2	10	56688	56697	0 %	40 %	40 %	20 %	310814583
44	NC_014625	GGATG	2	10	58851	58860	20 %	20 %	60 %	0 %	310814584
45	NC_014625	TCGAT	2	10	61987	61996	20 %	40 %	20 %	20 %	310814587
46	NC_014625	CGCGC	2	10	63017	63026	0 %	0 %	40 %	60 %	310814588
47	NC_014625	CTGCG	2	10	64486	64495	0 %	20 %	40 %	40 %	310814589
48	NC_014625	TGATC	2	10	65710	65719	20 %	40 %	20 %	20 %	310814591
49	NC_014625	CGCGT	2	10	67076	67085	0 %	20 %	40 %	40 %	310814593
50	NC_014625	TTGCT	2	10	67652	67661	0 %	60 %	20 %	20 %	310814594
51	NC_014625	CAGCG	2	10	69624	69633	20 %	0 %	40 %	40 %	310814596
52	NC_014625	GCCCG	2	10	71039	71048	0 %	0 %	40 %	60 %	310814597
53	NC_014625	TGACC	2	10	71458	71467	20 %	20 %	20 %	40 %	310814597
54	NC_014625	GCGCT	2	10	74079	74088	0 %	20 %	40 %	40 %	310814600
55	NC_014625	AAATC	2	10	75062	75071	60 %	20 %	0 %	20 %	310814601
56	NC_014625	GATTG	2	10	75610	75619	20 %	40 %	40 %	0 %	310814601
57	NC_014625	GATCT	2	10	76658	76667	20 %	40 %	20 %	20 %	310814602
58	NC_014625	GGCAA	2	10	77480	77489	40 %	0 %	40 %	20 %	310814602
59	NC_014625	TGGCG	2	10	78084	78093	0 %	20 %	60 %	20 %	310814602
60	NC_014625	GCCGC	2	10	79246	79255	0 %	0 %	40 %	60 %	310814602
61	NC_014625	TGCCG	2	10	80141	80150	0 %	20 %	40 %	40 %	310814603
62	NC_014625	TGCGC	2	10	81515	81524	0 %	20 %	40 %	40 %	310814605
63	NC_014625	TGCGC	2	10	81869	81878	0 %	20 %	40 %	40 %	310814605
64	NC_014625	TCGAT	2	10	83558	83567	20 %	40 %	20 %	20 %	310814609
65	NC_014625	ACGAT	2	10	85186	85195	40 %	20 %	20 %	20 %	310814611
66	NC_014625	CGGGT	2	10	85789	85798	0 %	20 %	60 %	20 %	310814613
67	NC_014625	CGGGG	2	10	89437	89446	0 %	0 %	80 %	20 %	310814617
68	NC_014625	GCGCG	2	10	89601	89610	0 %	0 %	60 %	40 %	310814617
69	NC_014625	GTTTT	2	10	90523	90532	0 %	80 %	20 %	0 %	310814620
70	NC_014625	GGCAT	2	10	91461	91470	20 %	20 %	40 %	20 %	310814621
71	NC_014625	TCGGT	2	10	91760	91769	0 %	40 %	40 %	20 %	310814622
72	NC_014625	GTGAT	2	10	92622	92631	20 %	40 %	40 %	0 %	310814623
73	NC_014625	CGGGC	2	10	97469	97478	0 %	0 %	60 %	40 %	310814629
74	NC_014625	CCGAC	2	10	97867	97876	20 %	0 %	20 %	60 %	310814629
75	NC_014625	CGCGC	2	10	98539	98548	0 %	0 %	40 %	60 %	310814630
76	NC_014625	GTCCA	2	10	98705	98714	20 %	20 %	20 %	40 %	310814630
77	NC_014625	CAATG	2	10	98781	98790	40 %	20 %	20 %	20 %	310814630
78	NC_014625	GCGGG	2	10	100107	100116	0 %	0 %	80 %	20 %	310814632
79	NC_014625	TGCTG	2	10	103106	103115	0 %	40 %	40 %	20 %	310814635
80	NC_014625	TGACC	2	10	105569	105578	20 %	20 %	20 %	40 %	310814637
81	NC_014625	GCGCC	2	10	105710	105719	0 %	0 %	40 %	60 %	310814637
82	NC_014625	GCTGC	2	10	105866	105875	0 %	20 %	40 %	40 %	310814637
83	NC_014625	TCAGC	2	10	106349	106358	20 %	20 %	20 %	40 %	310814638
84	NC_014625	GCGCG	2	10	107097	107106	0 %	0 %	60 %	40 %	310814639
85	NC_014625	TGATC	2	10	108000	108009	20 %	40 %	20 %	20 %	310814641
86	NC_014625	TCGGC	2	10	108441	108450	0 %	20 %	40 %	40 %	310814641
87	NC_014625	ATCGA	2	10	108497	108506	40 %	20 %	20 %	20 %	310814641
88	NC_014625	GGATC	2	10	110328	110337	20 %	20 %	40 %	20 %	310814641
89	NC_014625	ATCGC	2	10	110366	110375	20 %	20 %	20 %	40 %	310814641
90	NC_014625	CGCGC	2	10	110397	110406	0 %	0 %	40 %	60 %	310814641
91	NC_014625	GAATG	2	10	111443	111452	40 %	20 %	40 %	0 %	310814642
92	NC_014625	GCCAT	2	10	112225	112234	20 %	20 %	20 %	40 %	310814643
93	NC_014625	GCAGG	2	10	113233	113242	20 %	0 %	60 %	20 %	310814644
94	NC_014625	TGGTG	2	10	114723	114732	0 %	40 %	60 %	0 %	310814646
95	NC_014625	GGCTG	2	10	114912	114921	0 %	20 %	60 %	20 %	310814646
96	NC_014625	TGCCT	2	10	115105	115114	0 %	40 %	20 %	40 %	310814647
97	NC_014625	CGATG	2	10	115646	115655	20 %	20 %	40 %	20 %	310814648
98	NC_014625	CGACC	2	10	118381	118390	20 %	0 %	20 %	60 %	310814652
99	NC_014625	GATCG	2	10	121221	121230	20 %	20 %	40 %	20 %	310814655
100	NC_014625	TGGGT	2	10	121836	121845	0 %	40 %	60 %	0 %	310814657
101	NC_014625	GATGC	2	10	122191	122200	20 %	20 %	40 %	20 %	310814657
102	NC_014625	ATCCA	2	10	122316	122325	40 %	20 %	0 %	40 %	310814657
103	NC_014625	GCGCG	2	10	125600	125609	0 %	0 %	60 %	40 %	310814662
104	NC_014625	TGCAT	2	10	127277	127286	20 %	40 %	20 %	20 %	310814665
105	NC_014625	AGCGA	2	10	127418	127427	40 %	0 %	40 %	20 %	310814665
106	NC_014625	ACGCA	2	10	127576	127585	40 %	0 %	20 %	40 %	310814665
107	NC_014625	GAAGA	2	10	128857	128866	60 %	0 %	40 %	0 %	310814666
108	NC_014625	GCTTA	2	10	128907	128916	20 %	40 %	20 %	20 %	310814666
109	NC_014625	GCCCG	2	10	129422	129431	0 %	0 %	40 %	60 %	310814668
110	NC_014625	GCTGG	2	10	131582	131591	0 %	20 %	60 %	20 %	310814671
111	NC_014625	GGGCT	2	10	133509	133518	0 %	20 %	60 %	20 %	310814673
112	NC_014625	TGCCG	2	10	134590	134599	0 %	20 %	40 %	40 %	310814674
113	NC_014625	GGGCT	2	10	134681	134690	0 %	20 %	60 %	20 %	310814674
114	NC_014625	CAGCG	2	10	136713	136722	20 %	0 %	40 %	40 %	310814678
115	NC_014625	TCCAA	2	10	138749	138758	40 %	20 %	0 %	40 %	310814679
116	NC_014625	AGCGT	2	10	139186	139195	20 %	20 %	40 %	20 %	310814680
117	NC_014625	CGCGC	2	10	140007	140016	0 %	0 %	40 %	60 %	310814681
118	NC_014625	GGCTC	2	10	141342	141351	0 %	20 %	40 %	40 %	310814682
119	NC_014625	CATCG	2	10	141930	141939	20 %	20 %	20 %	40 %	310814683
120	NC_014625	GGTTT	2	10	143988	143997	0 %	60 %	40 %	0 %	310814684
121	NC_014625	GACAT	2	10	144217	144226	40 %	20 %	20 %	20 %	310814684
122	NC_014625	GACCA	2	10	145902	145911	40 %	0 %	20 %	40 %	310814686
123	NC_014625	ATCGC	2	10	147236	147245	20 %	20 %	20 %	40 %	310814689
124	NC_014625	AGGCG	2	10	148599	148608	20 %	0 %	60 %	20 %	310814690
125	NC_014625	GCCGA	2	10	150038	150047	20 %	0 %	40 %	40 %	310814691
126	NC_014625	CCCGA	2	10	150287	150296	20 %	0 %	20 %	60 %	310814691
127	NC_014625	GGGCA	2	10	151404	151413	20 %	0 %	60 %	20 %	310814692
128	NC_014625	GTGGC	2	10	155277	155286	0 %	20 %	60 %	20 %	310814697
129	NC_014625	CGGCG	2	10	155310	155319	0 %	0 %	60 %	40 %	310814697
130	NC_014625	TCGGA	2	10	159305	159314	20 %	20 %	40 %	20 %	310814701
131	NC_014625	CCGGA	2	10	159972	159981	20 %	0 %	40 %	40 %	310814702
132	NC_014625	GATTG	2	10	161405	161414	20 %	40 %	40 %	0 %	310814705
133	NC_014625	GCCTC	2	10	162411	162420	0 %	20 %	20 %	60 %	310814705
134	NC_014625	GACCA	2	10	162815	162824	40 %	0 %	20 %	40 %	310814705
135	NC_014625	GCGAA	2	10	163619	163628	40 %	0 %	40 %	20 %	310814706
136	NC_014625	CGGCG	2	10	165233	165242	0 %	0 %	60 %	40 %	310814709
137	NC_014625	TGATC	2	10	167618	167627	20 %	40 %	20 %	20 %	310814710
138	NC_014625	GCGCG	2	10	171794	171803	0 %	0 %	60 %	40 %	310814713
139	NC_014625	GCGCG	2	10	174687	174696	0 %	0 %	60 %	40 %	310814714
140	NC_014625	TGCCG	2	10	176123	176132	0 %	20 %	40 %	40 %	310814715
141	NC_014625	CTTTG	2	10	176273	176282	0 %	60 %	20 %	20 %	310814715
142	NC_014625	CCCGA	2	10	177030	177039	20 %	0 %	20 %	60 %	310814716
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147	NC_014625	GTCGT	2	10	185228	185237	0 %	40 %	40 %	20 %	310814727
148	NC_014625	GCGCC	2	10	187855	187864	0 %	0 %	40 %	60 %	310814730
149	NC_014625	CCGCG	2	10	188799	188808	0 %	0 %	40 %	60 %	310814730
150	NC_014625	GGGCA	2	10	192741	192750	20 %	0 %	60 %	20 %	310814736
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152	NC_014625	TGCAG	2	10	197239	197248	20 %	20 %	40 %	20 %	310814743
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155	NC_014625	GTCTG	2	10	201439	201448	0 %	40 %	40 %	20 %	310814747
156	NC_014625	GCGCG	2	10	202247	202256	0 %	0 %	60 %	40 %	310814747
157	NC_014625	AGCGC	2	10	202691	202700	20 %	0 %	40 %	40 %	310814748
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169	NC_014625	GCGCG	2	10	218762	218771	0 %	0 %	60 %	40 %	310814762
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177	NC_014625	GCGCC	2	10	226599	226608	0 %	0 %	40 %	60 %	310814770
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196	NC_014625	CGTGA	2	10	253897	253906	20 %	20 %	40 %	20 %	310814790
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211	NC_014625	ATGCC	2	10	285212	285221	20 %	20 %	20 %	40 %	310814825
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230	NC_014625	GCGCG	2	10	307134	307143	0 %	0 %	60 %	40 %	310814849
231	NC_014625	GCACA	2	10	307348	307357	40 %	0 %	20 %	40 %	310814849
232	NC_014625	GGGTG	2	10	307943	307952	0 %	20 %	80 %	0 %	310814849
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234	NC_014625	CATCA	2	10	311014	311023	40 %	20 %	0 %	40 %	310814851
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250	NC_014625	CAAGC	2	10	337932	337941	40 %	0 %	20 %	40 %	310814877
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253	NC_014625	GGATC	2	10	342471	342480	20 %	20 %	40 %	20 %	310814884
254	NC_014625	GATCC	2	10	343542	343551	20 %	20 %	20 %	40 %	310814884
255	NC_014625	TGGCC	2	10	344229	344238	0 %	20 %	40 %	40 %	310814885
256	NC_014625	CCCAG	2	10	344360	344369	20 %	0 %	20 %	60 %	310814885
257	NC_014625	TGCAT	2	10	344916	344925	20 %	40 %	20 %	20 %	310814886
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259	NC_014625	TGGTG	2	10	348517	348526	0 %	40 %	60 %	0 %	310814889
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261	NC_014625	AGCGC	2	10	349204	349213	20 %	0 %	40 %	40 %	310814889
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