MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Stigmatella aurantiaca DW4/3-1 chromosome

Total Repeats: 868

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014623	GCCAC	2	10	4082	4091	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2	NC_014623	CGCGG	2	10	4235	4244	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3	NC_014623	GCGGG	2	10	7120	7129	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
4	NC_014623	AAGCA	2	10	17926	17935	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_014623	TGGGC	2	10	21460	21469	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6	NC_014623	CCACC	2	10	25596	25605	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
7	NC_014623	TCCAA	2	10	54375	54384	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_014623	CCAGG	2	10	63641	63650	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
9	NC_014623	TCCTC	2	10	80226	80235	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
10	NC_014623	GACGA	2	10	90789	90798	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_014623	GGAAA	2	10	103931	103940	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014623	TGGGG	2	10	115662	115671	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014623	CCGGA	2	10	116885	116894	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_014623	CGGCC	2	10	119820	119829	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
15	NC_014623	GCCCA	2	10	123383	123392	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
16	NC_014623	CTTGC	2	10	123559	123568	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_014623	GGGGC	2	10	123606	123615	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
18	NC_014623	CGGTG	2	10	139340	139349	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
19	NC_014623	GGCCC	2	10	144086	144095	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
20	NC_014623	TGGGC	2	10	152615	152624	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
21	NC_014623	GCTGG	2	10	165101	165110	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
22	NC_014623	GGCAG	2	10	198624	198633	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
23	NC_014623	GTGCG	2	10	207411	207420	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
24	NC_014623	CTGTC	2	10	214554	214563	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_014623	CTGGG	2	10	217604	217613	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
26	NC_014623	GCTCG	2	10	217764	217773	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NC_014623	CGCAA	2	10	229378	229387	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_014623	CGGCG	2	10	236000	236009	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
29	NC_014623	GAATG	2	10	248881	248890	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014623	CCTGT	2	10	259111	259120	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_014623	AAAGG	2	10	262607	262616	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014623	GGGTT	2	10	265026	265035	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014623	AGGGG	2	10	265100	265109	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014623	AGGCG	2	10	268451	268460	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
35	NC_014623	CCGGA	2	10	268572	268581	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
36	NC_014623	CGGCC	2	10	271015	271024	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
37	NC_014623	CAGGG	2	10	274678	274687	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
38	NC_014623	TGGGG	2	10	286242	286251	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014623	GCGTG	2	10	293107	293116	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
40	NC_014623	GGGAG	2	10	296223	296232	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014623	AGGAC	2	10	302196	302205	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_014623	CGGAG	2	10	303672	303681	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
43	NC_014623	GGGGT	2	10	312294	312303	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014623	CCCAA	2	10	326144	326153	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
45	NC_014623	ACCCG	2	10	327249	327258	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
46	NC_014623	GGCGG	2	10	328176	328185	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
47	NC_014623	GTCAG	2	10	328291	328300	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_014623	GGCGG	2	10	332351	332360	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
49	NC_014623	GGACG	2	10	353455	353464	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
50	NC_014623	TCGGG	2	10	368786	368795	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
51	NC_014623	TGGGC	2	10	379696	379705	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
52	NC_014623	AGCGC	2	10	387555	387564	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
53	NC_014623	GACGC	2	10	394673	394682	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
54	NC_014623	GTCCA	2	10	408625	408634	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_014623	GTACC	2	10	416856	416865	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
56	NC_014623	CTGCG	2	10	422589	422598	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
57	NC_014623	GAGCT	2	10	448452	448461	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_014623	CGACC	2	10	451336	451345	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
59	NC_014623	GGGAT	2	10	456353	456362	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014623	CGGCT	2	10	462856	462865	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
61	NC_014623	ATGTG	2	10	467348	467357	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014623	ATTGA	2	10	472676	472685	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014623	TTGAA	2	10	472789	472798	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014623	GCCAT	2	10	478179	478188	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_014623	TGCCT	2	10	490317	490326	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
66	NC_014623	AAGGC	2	10	524004	524013	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_014623	GGGCA	2	10	541955	541964	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
68	NC_014623	GGGAT	2	10	542989	542998	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014623	GGCCA	2	10	556838	556847	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
70	NC_014623	CGAAA	2	10	574829	574838	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_014623	TCAAC	2	10	575166	575175	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
72	NC_014623	TCGTG	2	10	576262	576271	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_014623	GAAAA	2	10	577678	577687	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014623	CTTCT	2	10	580534	580543	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
75	NC_014623	GTTTT	2	10	580754	580763	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014623	GAATG	2	10	593713	593722	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014623	CTTTG	2	10	610152	610161	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_014623	TCCGC	2	10	644716	644725	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
79	NC_014623	AGGAG	2	10	670124	670133	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014623	CAATC	2	10	679488	679497	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
81	NC_014623	GCCCC	2	10	721839	721848	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
82	NC_014623	ACCCG	2	10	734303	734312	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
83	NC_014623	TGTGC	2	10	766316	766325	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_014623	TCACC	2	10	777400	777409	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
85	NC_014623	AGGGT	2	10	791761	791770	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014623	GCGGG	2	10	795521	795530	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
87	NC_014623	GGGCC	2	10	799459	799468	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
88	NC_014623	CAGAA	2	10	804363	804372	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_014623	CGGTC	2	10	826851	826860	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
90	NC_014623	CTTCT	2	10	827068	827077	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
91	NC_014623	TGGGC	2	10	827761	827770	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
92	NC_014623	TGGCT	2	10	835966	835975	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
93	NC_014623	GCCCG	2	10	848656	848665	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
94	NC_014623	TTCCA	2	10	848701	848710	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_014623	AGAGC	2	10	864465	864474	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_014623	GCGGA	2	10	864650	864659	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
97	NC_014623	TTCGA	2	10	864741	864750	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_014623	CCTGG	2	10	874440	874449	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
99	NC_014623	GGAGG	2	10	901422	901431	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014623	CCCGG	2	10	944688	944697	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
101	NC_014623	GGCGA	2	10	945970	945979	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
102	NC_014623	CTTGG	2	10	967847	967856	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_014623	CGGTT	2	10	969826	969835	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_014623	CGGCG	2	10	971097	971106	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
105	NC_014623	AGCCT	2	10	976250	976259	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_014623	GTCTC	2	10	1005861	1005870	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
107	NC_014623	AGGGG	2	10	1016887	1016896	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014623	GGTCC	2	10	1033933	1033942	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
109	NC_014623	ACCCA	2	10	1034099	1034108	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
110	NC_014623	GGCAG	2	10	1034770	1034779	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
111	NC_014623	AGAGG	2	10	1043067	1043076	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014623	ACCTG	2	10	1047413	1047422	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_014623	AGGTG	2	10	1048437	1048446	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014623	TCCCG	2	10	1080254	1080263	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
115	NC_014623	ACGAC	2	10	1084747	1084756	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_014623	CGCGC	2	10	1085638	1085647	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
117	NC_014623	AGAGA	2	10	1107512	1107521	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014623	TCCCA	2	10	1122388	1122397	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
119	NC_014623	ACGTG	2	10	1124186	1124195	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_014623	CCTTG	2	10	1124970	1124979	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
121	NC_014623	CGTTC	2	10	1130680	1130689	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
122	NC_014623	TGGCT	2	10	1141738	1141747	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
123	NC_014623	CGGGG	2	10	1153459	1153468	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
124	NC_014623	GCCGC	2	10	1153536	1153545	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
125	NC_014623	CCCTG	2	10	1203417	1203426	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
126	NC_014623	GCCGC	2	10	1210491	1210500	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
127	NC_014623	TTGGG	2	10	1225695	1225704	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014623	GGGGC	2	10	1227828	1227837	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
129	NC_014623	GGATC	2	10	1233223	1233232	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
130	NC_014623	GGGCG	2	10	1234221	1234230	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
131	NC_014623	GAGAA	2	10	1273011	1273020	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014623	CTGAG	2	10	1278699	1278708	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_014623	AGGGG	2	10	1300620	1300629	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014623	CCACG	2	10	1323585	1323594	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
135	NC_014623	CCTGC	2	10	1330496	1330505	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
136	NC_014623	CCCTC	2	10	1338352	1338361	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
137	NC_014623	GCGGA	2	10	1338711	1338720	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
138	NC_014623	ACAAG	2	10	1340141	1340150	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_014623	TTCAA	2	10	1341922	1341931	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_014623	CTGGG	2	10	1344577	1344586	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
141	NC_014623	GTGCC	2	10	1396905	1396914	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
142	NC_014623	GAGGG	2	10	1415315	1415324	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014623	ACTCC	2	10	1419854	1419863	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
144	NC_014623	AACCG	2	10	1437635	1437644	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
145	NC_014623	AAAAG	2	10	1442802	1442811	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014623	TCGCG	2	10	1501887	1501896	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
147	NC_014623	TCGTC	2	10	1510899	1510908	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
148	NC_014623	TCCGG	2	10	1559772	1559781	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
149	NC_014623	CAGCG	2	10	1602040	1602049	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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151	NC_014623	CGGCT	2	10	1608796	1608805	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
152	NC_014623	CGAGG	2	10	1625196	1625205	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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154	NC_014623	GGAGC	2	10	1638106	1638115	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
155	NC_014623	TGAGG	2	10	1642051	1642060	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_014623	GGCTG	2	10	1653343	1653352	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
159	NC_014623	GACAA	2	10	1655270	1655279	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
160	NC_014623	GCCGG	2	10	1659539	1659548	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
161	NC_014623	ACGCC	2	10	1670739	1670748	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
162	NC_014623	GGCCG	2	10	1673454	1673463	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
163	NC_014623	TCGAT	2	10	1695115	1695124	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
164	NC_014623	CCTCG	2	10	1708321	1708330	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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173	NC_014623	GTCCT	2	10	1795879	1795888	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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176	NC_014623	TCCAG	2	10	1819006	1819015	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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182	NC_014623	GAAGG	2	10	1913762	1913771	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
183	NC_014623	GCCCT	2	10	1941215	1941224	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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262	NC_014623	GTCCG	2	10	2825720	2825729	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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273	NC_014623	GGTGC	2	10	2973792	2973801	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
274	NC_014623	TGGCG	2	10	2974131	2974140	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
275	NC_014623	GAGCC	2	10	2987270	2987279	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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277	NC_014623	GCGTC	2	10	2991968	2991977	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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280	NC_014623	GTATG	2	10	3001972	3001981	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
281	NC_014623	TCGGC	2	10	3025624	3025633	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
282	NC_014623	TGGGC	2	10	3030302	3030311	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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284	NC_014623	CCCAG	2	10	3035592	3035601	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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409	NC_014623	GTGCG	2	10	4378557	4378566	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
410	NC_014623	CCCGT	2	10	4382862	4382871	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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419	NC_014623	CCACC	2	10	4474559	4474568	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
420	NC_014623	CATGC	2	10	4474730	4474739	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
421	NC_014623	GATTC	2	10	4493206	4493215	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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423	NC_014623	GGGGT	2	10	4514437	4514446	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
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488	NC_014623	CCCCT	2	10	5314316	5314325	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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492	NC_014623	TAGAG	2	10	5363228	5363237	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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495	NC_014623	CCGCC	2	10	5423504	5423513	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
496	NC_014623	CGAAG	2	10	5424434	5424443	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
497	NC_014623	ACGCA	2	10	5425723	5425732	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
498	NC_014623	GACAG	2	10	5430153	5430162	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
499	NC_014623	ATGGG	2	10	5485128	5485137	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
500	NC_014623	TTCCC	2	10	5561049	5561058	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding

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