MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Stigmatella aurantiaca DW4/3-1 chromosome

Total Repeats: 25512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014623	CTGG	2	8	180	187	0 %	25 %	50 %	25 %	310817279
2	NC_014623	CGAG	2	8	629	636	25 %	0 %	50 %	25 %	310817279
3	NC_014623	TCCA	2	8	1156	1163	25 %	25 %	0 %	50 %	310817279
4	NC_014623	GGAC	2	8	1549	1556	25 %	0 %	50 %	25 %	310817280
5	NC_014623	GCCT	2	8	1584	1591	0 %	25 %	25 %	50 %	310817280
6	NC_014623	CTGC	2	8	2066	2073	0 %	25 %	25 %	50 %	310817280
7	NC_014623	TCTT	2	8	2381	2388	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_014623	TGCA	2	8	2548	2555	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_014623	CTGA	2	8	3283	3290	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_014623	CGCT	2	8	4742	4749	0 %	25 %	25 %	50 %	310817283
11	NC_014623	GACG	2	8	4830	4837	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_014623	CTTC	2	8	4937	4944	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_014623	CGAG	2	8	5005	5012	25 %	0 %	50 %	25 %	310817284
14	NC_014623	CGAG	2	8	5251	5258	25 %	0 %	50 %	25 %	310817284
15	NC_014623	GCAC	2	8	5721	5728	25 %	0 %	25 %	50 %	310817285
16	NC_014623	GCTC	2	8	6201	6208	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_014623	CGGG	3	12	7126	7137	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18	NC_014623	GCCG	2	8	7693	7700	0 %	0 %	50 %	50 %	310817287
19	NC_014623	GCCA	2	8	8096	8103	25 %	0 %	25 %	50 %	310817288
20	NC_014623	TCCC	2	8	8212	8219	0 %	25 %	0 %	75 %	310817288
21	NC_014623	CGCC	2	8	8346	8353	0 %	0 %	25 %	75 %	310817288
22	NC_014623	CCTC	2	8	8361	8368	0 %	25 %	0 %	75 %	310817288
23	NC_014623	TCCT	2	8	8789	8796	0 %	50 %	0 %	50 %	310817288
24	NC_014623	CACG	2	8	8806	8813	25 %	0 %	25 %	50 %	310817288
25	NC_014623	GCAC	2	8	9320	9327	25 %	0 %	25 %	50 %	310817288
26	NC_014623	GGCG	2	8	9581	9588	0 %	0 %	75 %	25 %	310817289
27	NC_014623	CTGT	2	8	9756	9763	0 %	50 %	25 %	25 %	310817289
28	NC_014623	CTCG	2	8	9812	9819	0 %	25 %	25 %	50 %	310817289
29	NC_014623	ATCT	2	8	9939	9946	25 %	50 %	0 %	25 %	310817289
30	NC_014623	CGGT	2	8	10221	10228	0 %	25 %	50 %	25 %	310817289
31	NC_014623	CCTC	2	8	10441	10448	0 %	25 %	0 %	75 %	310817289
32	NC_014623	CCCG	2	8	10577	10584	0 %	0 %	25 %	75 %	310817289
33	NC_014623	CGGA	2	8	11218	11225	25 %	0 %	50 %	25 %	310817290
34	NC_014623	TCTT	2	8	11670	11677	0 %	75 %	0 %	25 %	310817290
35	NC_014623	CGGC	3	12	11841	11852	0 %	0 %	50 %	50 %	310817291
36	NC_014623	CGGT	2	8	12082	12089	0 %	25 %	50 %	25 %	310817291
37	NC_014623	GGGA	2	8	13501	13508	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014623	CCTG	2	8	14152	14159	0 %	25 %	25 %	50 %	310817293
39	NC_014623	GCGT	2	8	14345	14352	0 %	25 %	50 %	25 %	310817293
40	NC_014623	TGGC	2	8	14404	14411	0 %	25 %	50 %	25 %	310817293
41	NC_014623	CGGA	2	8	14617	14624	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_014623	GCGG	2	8	14649	14656	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
43	NC_014623	GGTG	2	8	14972	14979	0 %	25 %	75 %	0 %	310817294
44	NC_014623	TCAC	2	8	14986	14993	25 %	25 %	0 %	50 %	310817294
45	NC_014623	CCGG	2	8	15084	15091	0 %	0 %	50 %	50 %	310817294
46	NC_014623	AAGA	2	8	15408	15415	75 %	0 %	25 %	0 %	310817294
47	NC_014623	AGGT	2	8	15673	15680	25 %	25 %	50 %	0 %	310817294
48	NC_014623	GAGG	2	8	16065	16072	25 %	0 %	75 %	0 %	310817294
49	NC_014623	CGAG	2	8	16157	16164	25 %	0 %	50 %	25 %	310817294
50	NC_014623	TCGC	2	8	17162	17169	0 %	25 %	25 %	50 %	310817294
51	NC_014623	AAAG	2	8	17339	17346	75 %	0 %	25 %	0 %	310817294
52	NC_014623	GATG	2	8	17714	17721	25 %	25 %	50 %	0 %	310817294
53	NC_014623	TCGC	2	8	18386	18393	0 %	25 %	25 %	50 %	310817295
54	NC_014623	CCCG	2	8	18394	18401	0 %	0 %	25 %	75 %	310817295
55	NC_014623	CGGC	2	8	18535	18542	0 %	0 %	50 %	50 %	310817295
56	NC_014623	GCCC	2	8	19267	19274	0 %	0 %	25 %	75 %	310817296
57	NC_014623	GCAC	2	8	20932	20939	25 %	0 %	25 %	50 %	310817297
58	NC_014623	TGGC	2	8	21029	21036	0 %	25 %	50 %	25 %	310817297
59	NC_014623	AGCA	2	8	21079	21086	50 %	0 %	25 %	25 %	310817297
60	NC_014623	CGGC	2	8	21350	21357	0 %	0 %	50 %	50 %	310817297
61	NC_014623	CTGG	2	8	22006	22013	0 %	25 %	50 %	25 %	310817298
62	NC_014623	GGGA	2	8	22266	22273	25 %	0 %	75 %	0 %	310817298
63	NC_014623	CTCC	2	8	22613	22620	0 %	25 %	0 %	75 %	310817298
64	NC_014623	GAAA	2	8	22752	22759	75 %	0 %	25 %	0 %	310817298
65	NC_014623	CCAC	2	8	24393	24400	25 %	0 %	0 %	75 %	310817300
66	NC_014623	CGTC	2	8	24523	24530	0 %	25 %	25 %	50 %	310817300
67	NC_014623	CGCA	2	8	25286	25293	25 %	0 %	25 %	50 %	310817300
68	NC_014623	GAAA	2	8	25539	25546	75 %	0 %	25 %	0 %	310817300
69	NC_014623	GGCT	2	8	25612	25619	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_014623	GAGG	2	8	25646	25653	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014623	AGCC	2	8	25987	25994	25 %	0 %	25 %	50 %	310817301
72	NC_014623	CATC	2	8	26066	26073	25 %	25 %	0 %	50 %	310817301
73	NC_014623	CGCC	2	8	27012	27019	0 %	0 %	25 %	75 %	310817302
74	NC_014623	CGCC	2	8	27462	27469	0 %	0 %	25 %	75 %	310817302
75	NC_014623	CGGA	2	8	28081	28088	25 %	0 %	50 %	25 %	310817302
76	NC_014623	GGAC	2	8	28101	28108	25 %	0 %	50 %	25 %	310817302
77	NC_014623	CGCC	2	8	29352	29359	0 %	0 %	25 %	75 %	310817302
78	NC_014623	GCCG	2	8	29750	29757	0 %	0 %	50 %	50 %	310817302
79	NC_014623	CGGG	2	8	31388	31395	0 %	0 %	75 %	25 %	310817302
80	NC_014623	CGTC	2	8	31452	31459	0 %	25 %	25 %	50 %	310817302
81	NC_014623	TTGC	2	8	31658	31665	0 %	50 %	25 %	25 %	310817303
82	NC_014623	CTTC	2	8	31885	31892	0 %	50 %	0 %	50 %	310817303
83	NC_014623	CCGC	2	8	32146	32153	0 %	0 %	25 %	75 %	310817303
84	NC_014623	TTCC	2	8	32533	32540	0 %	50 %	0 %	50 %	310817303
85	NC_014623	CAGA	2	8	33407	33414	50 %	0 %	25 %	25 %	310817303
86	NC_014623	CCAG	2	8	34588	34595	25 %	0 %	25 %	50 %	310817303
87	NC_014623	TCCC	2	8	35083	35090	0 %	25 %	0 %	75 %	310817303
88	NC_014623	ACGT	2	8	35256	35263	25 %	25 %	25 %	25 %	310817303
89	NC_014623	GGAA	2	8	35505	35512	50 %	0 %	50 %	0 %	310817303
90	NC_014623	CCGG	2	8	35621	35628	0 %	0 %	50 %	50 %	310817303
91	NC_014623	GGCA	2	8	35640	35647	25 %	0 %	50 %	25 %	310817303
92	NC_014623	CCGG	2	8	36166	36173	0 %	0 %	50 %	50 %	310817303
93	NC_014623	TCGC	2	8	36230	36237	0 %	25 %	25 %	50 %	310817303
94	NC_014623	GCTC	2	8	36331	36338	0 %	25 %	25 %	50 %	310817303
95	NC_014623	TCCG	2	8	36873	36880	0 %	25 %	25 %	50 %	310817303
96	NC_014623	GGGC	2	8	37540	37547	0 %	0 %	75 %	25 %	310817303
97	NC_014623	CCGG	2	8	37633	37640	0 %	0 %	50 %	50 %	310817303
98	NC_014623	GCCG	2	8	37789	37796	0 %	0 %	50 %	50 %	310817303
99	NC_014623	TCGG	2	8	38085	38092	0 %	25 %	50 %	25 %	310817303
100	NC_014623	GCCG	2	8	38113	38120	0 %	0 %	50 %	50 %	310817303
101	NC_014623	GGGC	2	8	38182	38189	0 %	0 %	75 %	25 %	310817303
102	NC_014623	CACC	2	8	38323	38330	25 %	0 %	0 %	75 %	310817303
103	NC_014623	CGGG	2	8	38684	38691	0 %	0 %	75 %	25 %	310817303
104	NC_014623	GAGC	2	8	38867	38874	25 %	0 %	50 %	25 %	310817303
105	NC_014623	TCAC	2	8	39101	39108	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_014623	CCGG	2	8	39137	39144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_014623	CCGC	2	8	40160	40167	0 %	0 %	25 %	75 %	310817305
108	NC_014623	CCGT	2	8	40245	40252	0 %	25 %	25 %	50 %	310817305
109	NC_014623	CCGG	2	8	40806	40813	0 %	0 %	50 %	50 %	310817305
110	NC_014623	GTCC	2	8	41458	41465	0 %	25 %	25 %	50 %	310817305
111	NC_014623	GCCC	2	8	41994	42001	0 %	0 %	25 %	75 %	310817306
112	NC_014623	GCCG	2	8	42901	42908	0 %	0 %	50 %	50 %	310817306
113	NC_014623	CATC	2	8	43437	43444	25 %	25 %	0 %	50 %	310817306
114	NC_014623	GCTC	2	8	43860	43867	0 %	25 %	25 %	50 %	310817306
115	NC_014623	GTCG	2	8	44116	44123	0 %	25 %	50 %	25 %	310817306
116	NC_014623	CGAG	2	8	45807	45814	25 %	0 %	50 %	25 %	310817306
117	NC_014623	GCCT	2	8	46902	46909	0 %	25 %	25 %	50 %	310817307
118	NC_014623	GGGA	2	8	48185	48192	25 %	0 %	75 %	0 %	310817307
119	NC_014623	GCCG	2	8	48507	48514	0 %	0 %	50 %	50 %	310817307
120	NC_014623	TGGA	2	8	48990	48997	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014623	ACAG	2	8	49397	49404	50 %	0 %	25 %	25 %	310817308
122	NC_014623	CCGT	2	8	49727	49734	0 %	25 %	25 %	50 %	310817308
123	NC_014623	GGGT	2	8	49795	49802	0 %	25 %	75 %	0 %	310817308
124	NC_014623	GCGG	2	8	49809	49816	0 %	0 %	75 %	25 %	310817308
125	NC_014623	CTGG	2	8	50371	50378	0 %	25 %	50 %	25 %	310817309
126	NC_014623	CGCC	2	8	51422	51429	0 %	0 %	25 %	75 %	310817310
127	NC_014623	GGGC	2	8	52403	52410	0 %	0 %	75 %	25 %	310817310
128	NC_014623	GGCG	2	8	52833	52840	0 %	0 %	75 %	25 %	310817310
129	NC_014623	CGGG	2	8	53698	53705	0 %	0 %	75 %	25 %	310817312
130	NC_014623	GGTG	2	8	53876	53883	0 %	25 %	75 %	0 %	310817312
131	NC_014623	GCCC	2	8	54534	54541	0 %	0 %	25 %	75 %	310817313
132	NC_014623	CCAC	2	8	54554	54561	25 %	0 %	0 %	75 %	310817313
133	NC_014623	TCCA	2	8	54746	54753	25 %	25 %	0 %	50 %	310817313
134	NC_014623	CGCC	2	8	55860	55867	0 %	0 %	25 %	75 %	310817313
135	NC_014623	TGAA	2	8	56480	56487	50 %	25 %	25 %	0 %	310817313
136	NC_014623	CCGG	2	8	56548	56555	0 %	0 %	50 %	50 %	310817313
137	NC_014623	GGGC	2	8	56730	56737	0 %	0 %	75 %	25 %	310817313
138	NC_014623	CTGC	2	8	57538	57545	0 %	25 %	25 %	50 %	310817313
139	NC_014623	TCCA	2	8	58946	58953	25 %	25 %	0 %	50 %	310817314
140	NC_014623	CTCG	2	8	59088	59095	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_014623	CACG	2	8	60923	60930	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_014623	AGAC	2	8	60945	60952	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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