MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Ketogulonicigenium vulgare Y25 plasmid pYP1

Total Repeats: 126

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014621	TCGGCC	2	12	14011	14022	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	310639237
2	NC_014621	ACCGTC	2	12	15169	15180	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	310639238
3	NC_014621	GCCAGA	2	12	17155	17166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639239
4	NC_014621	CGGCAA	2	12	17384	17395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639239
5	NC_014621	GTGCTG	2	12	18160	18171	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	310639241
6	NC_014621	ATGCAC	2	12	26657	26668	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	310639249
7	NC_014621	CCGACA	2	12	28320	28331	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	310639251
8	NC_014621	ACCCCG	2	12	41475	41486	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	310639255
9	NC_014621	GATCCT	2	12	43686	43697	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	310639257
10	NC_014621	TGGCGC	2	12	44027	44038	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	310639257
11	NC_014621	GGCATT	2	12	44302	44313	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	310639257
12	NC_014621	CCGACC	2	12	44320	44331	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	310639257
13	NC_014621	ATGGCG	2	12	44891	44902	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	310639258
14	NC_014621	GCAGCG	2	12	45957	45968	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	310639259
15	NC_014621	CATCGC	2	12	47473	47484	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	310639261
16	NC_014621	GCGTTG	2	12	49986	49997	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	310639263
17	NC_014621	CGAGAT	2	12	59625	59636	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	310639274
18	NC_014621	GATCGT	2	12	62645	62656	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	310639278
19	NC_014621	CAGAGC	2	12	66580	66591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639279
20	NC_014621	ATCTGC	2	12	69054	69065	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	310639284
21	NC_014621	CGAGGG	2	12	71415	71426	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	310639286
22	NC_014621	CGCCCG	2	12	74933	74944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310639292
23	NC_014621	CTCGGG	2	12	75688	75699	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	310639293
24	NC_014621	CTGAAC	2	12	77125	77136	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	310639294
25	NC_014621	GCAACG	2	12	79049	79060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639298
26	NC_014621	CAGCAC	2	12	80257	80268	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	310639298
27	NC_014621	ATTACG	2	12	81638	81649	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	310639300
28	NC_014621	CACAGA	2	12	82907	82918	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	310639301
29	NC_014621	CCGAGC	2	12	83219	83230	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	310639301
30	NC_014621	CGCAAC	2	12	86008	86019	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	310639303
31	NC_014621	TCTGGT	2	12	86218	86229	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	310639304
32	NC_014621	GCCAGC	2	12	87383	87394	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	310639304
33	NC_014621	GATCCC	2	12	87972	87983	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	310639305
34	NC_014621	GCTGGT	2	12	88014	88025	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	310639305
35	NC_014621	CAGCAC	2	12	90676	90687	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	310639307
36	NC_014621	GTCAGC	2	12	90746	90757	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	310639307
37	NC_014621	CGATCG	2	12	94270	94281	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	310639311
38	NC_014621	CGGCGT	2	12	96781	96792	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	310639312
39	NC_014621	GGCAAA	2	12	98195	98206	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	310639314
40	NC_014621	TCGCCG	2	12	100454	100465	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	310639319
41	NC_014621	TCGGCC	2	12	102315	102326	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	310639322
42	NC_014621	AAGGGC	2	12	104457	104468	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	310639324
43	NC_014621	CCAGCG	2	12	105367	105378	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	310639325
44	NC_014621	CCGACG	2	12	107067	107078	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	310639329
45	NC_014621	CTTTGG	2	12	109231	109242	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	310639331
46	NC_014621	ATCGTC	2	12	110347	110358	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	310639332
47	NC_014621	CGAGGG	2	12	110891	110902	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	310639333
48	NC_014621	TGCTGG	2	12	110962	110973	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	310639333
49	NC_014621	CATCGG	2	12	114295	114306	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	310639335
50	NC_014621	TTGCCT	2	12	115682	115693	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	310639337
51	NC_014621	TTGCAC	2	12	115706	115717	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	310639337
52	NC_014621	GGCCGA	2	12	116118	116129	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	310639337
53	NC_014621	TCATGA	2	12	119010	119021	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	310639339
54	NC_014621	GCCATC	2	12	119435	119446	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	310639339
55	NC_014621	GCCGGG	2	12	123455	123466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310639343
56	NC_014621	GATCTG	2	12	124339	124350	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	310639344
57	NC_014621	GGCCAA	2	12	124587	124598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639344
58	NC_014621	GCCTCG	2	12	130921	130932	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	310639348
59	NC_014621	TCGCCA	2	12	131786	131797	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	310639350
60	NC_014621	CAGCGA	2	12	134611	134622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639353
61	NC_014621	TGCCAA	2	12	134909	134920	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	310639354
62	NC_014621	GCCAGC	2	12	144099	144110	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	310639360
63	NC_014621	GCATAG	2	12	146626	146637	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	310639363
64	NC_014621	CAGCGT	2	12	150608	150619	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	310639366
65	NC_014621	CCTGCG	2	12	153130	153141	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	310639368
66	NC_014621	GAGAAT	2	12	154827	154838	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	310639370
67	NC_014621	CCAGCT	2	12	155671	155682	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	310639371
68	NC_014621	AGGCGC	2	12	157555	157566	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	310639373
69	NC_014621	TGCGCC	2	12	161293	161304	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	310639376
70	NC_014621	CGCCTG	2	12	161474	161485	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	310639377
71	NC_014621	CGTATG	2	12	161504	161515	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	310639377
72	NC_014621	CGACAT	2	12	161659	161670	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	310639377
73	NC_014621	ATCAGG	2	12	162249	162260	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	310639377
74	NC_014621	CCGATC	2	12	163480	163491	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	310639378
75	NC_014621	AGGCCG	2	12	163719	163730	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	310639379
76	NC_014621	TGACCG	2	12	165264	165275	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	310639380
77	NC_014621	CTGGAT	2	12	167706	167717	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	310639382
78	NC_014621	CAAGGC	2	12	167878	167889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639383
79	NC_014621	CTCGGC	2	12	168965	168976	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	310639383
80	NC_014621	CCAGCG	2	12	169030	169041	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	310639383
81	NC_014621	ATCTCG	2	12	169843	169854	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	310639385
82	NC_014621	AGGGCG	2	12	172465	172476	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	310639387
83	NC_014621	AACCGC	2	12	173232	173243	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	310639387
84	NC_014621	GCCTGC	2	12	173920	173931	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	310639388
85	NC_014621	CGATGA	2	12	177966	177977	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	310639391
86	NC_014621	GCTGGC	2	12	178708	178719	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	310639392
87	NC_014621	GGCCGC	2	12	178828	178839	0 %	0 %	50 %	50 %	310639392
88	NC_014621	ACGGTG	2	12	180841	180852	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	310639394
89	NC_014621	CGCGCC	2	12	181217	181228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310639395
90	NC_014621	GGCAAG	2	12	181442	181453	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	310639395
91	NC_014621	CTTTGG	2	12	182158	182169	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	310639395
92	NC_014621	GCCTCG	2	12	185804	185815	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	310639399
93	NC_014621	GCGCGA	2	12	187676	187687	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	310639401
94	NC_014621	CTGGCG	2	12	187887	187898	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	310639401
95	NC_014621	CGGACG	2	12	188560	188571	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	310639402
96	NC_014621	CAAGGC	2	12	193197	193208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639407
97	NC_014621	CGCGCC	2	12	193780	193791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310639407
98	NC_014621	GATGGT	2	12	194566	194577	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	310639407
99	NC_014621	GGCAGG	2	12	194909	194920	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	310639407
100	NC_014621	CGATGC	2	12	195431	195442	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	310639408
101	NC_014621	GATCGG	2	12	195581	195592	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	310639408
102	NC_014621	GTATAG	2	12	196212	196223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639409
103	NC_014621	TGCCGG	2	12	200347	200358	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	310639412
104	NC_014621	CGGGTG	2	12	201034	201045	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	310639412
105	NC_014621	GATGAC	2	12	201332	201343	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	310639412
106	NC_014621	GGCGTC	2	12	202824	202835	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	310639413
107	NC_014621	CCCGGC	2	12	205916	205927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310639413
108	NC_014621	CGACAG	2	12	206520	206531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639413
109	NC_014621	CGGCAT	2	12	207598	207609	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	310639415
110	NC_014621	GCGCAG	2	12	209430	209441	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	310639416
111	NC_014621	CAAGGC	2	12	209687	209698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639416
112	NC_014621	CAGGTT	2	12	209718	209729	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	310639416
113	NC_014621	CACGCG	2	12	215428	215439	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	310639423
114	NC_014621	GCCAAG	2	12	220084	220095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639428
115	NC_014621	ACAAGG	2	12	220863	220874	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	310639429
116	NC_014621	CGAAAG	2	12	221535	221546	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	310639429
117	NC_014621	CGCGGG	2	12	222340	222351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310639430
118	NC_014621	GTTCGG	2	12	222670	222681	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	310639430
119	NC_014621	GTTCGG	2	12	236953	236964	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	310639438
120	NC_014621	GCCTTC	2	12	247220	247231	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	310639447
121	NC_014621	AGGCCG	2	12	249975	249986	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	310639450
122	NC_014621	GCGGTG	2	12	250559	250570	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	310639450
123	NC_014621	CAGCAT	2	12	251405	251416	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	310639451
124	NC_014621	AGCTGG	2	12	252259	252270	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	310639452
125	NC_014621	AGCGCA	2	12	257881	257892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639456
126	NC_014621	ACGCGG	2	12	259057	259068	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	310639457

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.