MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Ketogulonicigenium vulgare Y25 plasmid pYP1

Total Repeats: 226

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014621	CGACG	2	10	276	285	20 %	0 %	40 %	40 %	310639222
2	NC_014621	CACCG	2	10	298	307	20 %	0 %	20 %	60 %	310639222
3	NC_014621	CAGCA	2	10	2888	2897	40 %	0 %	20 %	40 %	310639227
4	NC_014621	CGAGG	2	10	5059	5068	20 %	0 %	60 %	20 %	310639228
5	NC_014621	GGCGA	2	10	5309	5318	20 %	0 %	60 %	20 %	310639228
6	NC_014621	CGCTG	2	10	6017	6026	0 %	20 %	40 %	40 %	310639229
7	NC_014621	GGCAT	2	10	9571	9580	20 %	20 %	40 %	20 %	310639232
8	NC_014621	TGTGC	2	10	10361	10370	0 %	40 %	40 %	20 %	310639233
9	NC_014621	GGAAA	2	10	10713	10722	60 %	0 %	40 %	0 %	310639233
10	NC_014621	CATCA	2	10	12542	12551	40 %	20 %	0 %	40 %	310639235
11	NC_014621	GCGCC	2	10	13106	13115	0 %	0 %	40 %	60 %	310639235
12	NC_014621	TGCGC	2	10	13308	13317	0 %	20 %	40 %	40 %	310639235
13	NC_014621	GCCTG	2	10	14892	14901	0 %	20 %	40 %	40 %	310639238
14	NC_014621	GGCTC	2	10	15290	15299	0 %	20 %	40 %	40 %	310639238
15	NC_014621	CGGAA	2	10	15395	15404	40 %	0 %	40 %	20 %	310639238
16	NC_014621	ATCGG	2	10	16052	16061	20 %	20 %	40 %	20 %	310639238
17	NC_014621	GAAGC	2	10	23299	23308	40 %	0 %	40 %	20 %	310639247
18	NC_014621	GCTAC	2	10	24093	24102	20 %	20 %	20 %	40 %	310639247
19	NC_014621	ACTGG	2	10	24201	24210	20 %	20 %	40 %	20 %	310639247
20	NC_014621	GGCCA	2	10	30389	30398	20 %	0 %	40 %	40 %	310639251
21	NC_014621	TCGCA	2	10	31566	31575	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_014621	GGACC	2	10	31615	31624	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_014621	GGGCC	2	10	32423	32432	0 %	0 %	60 %	40 %	310639253
24	NC_014621	CTGCG	2	10	33268	33277	0 %	20 %	40 %	40 %	310639253
25	NC_014621	TGACC	2	10	37036	37045	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_014621	TGCGC	2	10	37114	37123	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NC_014621	CCTGA	2	10	37376	37385	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_014621	GCGCC	2	10	37808	37817	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
29	NC_014621	CGACC	2	10	38115	38124	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
30	NC_014621	CGGCC	2	10	38177	38186	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
31	NC_014621	GATGG	2	10	38959	38968	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014621	TGGCT	2	10	39397	39406	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_014621	ATGGG	2	10	39525	39534	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014621	CGCGG	2	10	43048	43057	0 %	0 %	60 %	40 %	310639256
35	NC_014621	GCCGA	2	10	45994	46003	20 %	0 %	40 %	40 %	310639259
36	NC_014621	TGATA	2	10	46900	46909	40 %	40 %	20 %	0 %	310639260
37	NC_014621	CGCGC	2	10	52496	52505	0 %	0 %	40 %	60 %	310639264
38	NC_014621	GCGGG	2	10	52827	52836	0 %	0 %	80 %	20 %	310639264
39	NC_014621	GGACA	2	10	53285	53294	40 %	0 %	40 %	20 %	310639265
40	NC_014621	GATCA	2	10	54418	54427	40 %	20 %	20 %	20 %	310639266
41	NC_014621	GCCGC	2	10	55104	55113	0 %	0 %	40 %	60 %	310639268
42	NC_014621	GATTG	2	10	56068	56077	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014621	TGAAA	2	10	57036	57045	60 %	20 %	20 %	0 %	310639271
44	NC_014621	GCGCC	2	10	57596	57605	0 %	0 %	40 %	60 %	310639271
45	NC_014621	TGATG	2	10	58845	58854	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014621	CAATC	2	10	59292	59301	40 %	20 %	0 %	40 %	310639274
47	NC_014621	GTATC	2	10	59892	59901	20 %	40 %	20 %	20 %	310639274
48	NC_014621	GTCTC	2	10	62008	62017	0 %	40 %	20 %	40 %	310639277
49	NC_014621	AGCGC	2	10	64002	64011	20 %	0 %	40 %	40 %	310639278
50	NC_014621	GTCGC	2	10	65811	65820	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
51	NC_014621	AAAAG	2	10	66978	66987	80 %	0 %	20 %	0 %	310639281
52	NC_014621	GCCGC	2	10	68164	68173	0 %	0 %	40 %	60 %	310639283
53	NC_014621	AGGGT	2	10	69345	69354	20 %	20 %	60 %	0 %	310639284
54	NC_014621	CCGAT	2	10	69980	69989	20 %	20 %	20 %	40 %	310639286
55	NC_014621	CAATC	2	10	71312	71321	40 %	20 %	0 %	40 %	310639286
56	NC_014621	CCGGT	2	10	71930	71939	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
57	NC_014621	GCCGC	2	10	72248	72257	0 %	0 %	40 %	60 %	310639287
58	NC_014621	ATCCG	2	10	73279	73288	20 %	20 %	20 %	40 %	310639289
59	NC_014621	CGGCC	2	10	74756	74765	0 %	0 %	40 %	60 %	310639292
60	NC_014621	CTTGC	2	10	75351	75360	0 %	40 %	20 %	40 %	310639292
61	NC_014621	ATGCG	2	10	76231	76240	20 %	20 %	40 %	20 %	310639293
62	NC_014621	GATTA	2	10	77248	77257	40 %	40 %	20 %	0 %	310639294
63	NC_014621	GGCGC	2	10	77814	77823	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
64	NC_014621	GGTTG	2	10	77967	77976	0 %	40 %	60 %	0 %	310639296
65	NC_014621	CAGCG	2	10	78615	78624	20 %	0 %	40 %	40 %	310639297
66	NC_014621	GATCG	2	10	79681	79690	20 %	20 %	40 %	20 %	310639298
67	NC_014621	GCCGC	2	10	79738	79747	0 %	0 %	40 %	60 %	310639298
68	NC_014621	GCCGC	2	10	80363	80372	0 %	0 %	40 %	60 %	310639298
69	NC_014621	GATCT	2	10	81367	81376	20 %	40 %	20 %	20 %	310639300
70	NC_014621	TGATC	2	10	81552	81561	20 %	40 %	20 %	20 %	310639300
71	NC_014621	GGCGC	2	10	83307	83316	0 %	0 %	60 %	40 %	310639301
72	NC_014621	TGCGG	2	10	87957	87966	0 %	20 %	60 %	20 %	310639305
73	NC_014621	AAGGC	2	10	88027	88036	40 %	0 %	40 %	20 %	310639305
74	NC_014621	CAATC	2	10	88154	88163	40 %	20 %	0 %	40 %	310639305
75	NC_014621	CGGGC	2	10	89429	89438	0 %	0 %	60 %	40 %	310639306
76	NC_014621	GCGCG	2	10	91120	91129	0 %	0 %	60 %	40 %	310639308
77	NC_014621	GCATC	2	10	92294	92303	20 %	20 %	20 %	40 %	310639309
78	NC_014621	CGGCG	2	10	93591	93600	0 %	0 %	60 %	40 %	310639310
79	NC_014621	CTGCG	2	10	93698	93707	0 %	20 %	40 %	40 %	310639310
80	NC_014621	GATCT	2	10	94305	94314	20 %	40 %	20 %	20 %	310639311
81	NC_014621	GCCGT	2	10	94338	94347	0 %	20 %	40 %	40 %	310639311
82	NC_014621	GGTCA	2	10	95776	95785	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
83	NC_014621	GCAAC	2	10	95823	95832	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
84	NC_014621	GCCGG	2	10	95925	95934	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
85	NC_014621	CGCGG	2	10	97345	97354	0 %	0 %	60 %	40 %	310639313
86	NC_014621	CGTGC	2	10	97471	97480	0 %	20 %	40 %	40 %	310639313
87	NC_014621	GGCCG	2	10	98495	98504	0 %	0 %	60 %	40 %	310639315
88	NC_014621	CGATG	2	10	99450	99459	20 %	20 %	40 %	20 %	310639316
89	NC_014621	GACGC	2	10	100648	100657	20 %	0 %	40 %	40 %	310639319
90	NC_014621	GGGCA	2	10	100856	100865	20 %	0 %	60 %	20 %	310639319
91	NC_014621	AAAGC	2	10	102230	102239	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_014621	CGCCC	2	10	103890	103899	0 %	0 %	20 %	80 %	310639324
93	NC_014621	CCGCC	2	10	104351	104360	0 %	0 %	20 %	80 %	310639324
94	NC_014621	AAAGA	2	10	105863	105872	80 %	0 %	20 %	0 %	310639327
95	NC_014621	CCGCA	2	10	106755	106764	20 %	0 %	20 %	60 %	310639328
96	NC_014621	GCGGG	2	10	107946	107955	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
97	NC_014621	CGGCG	2	10	109120	109129	0 %	0 %	60 %	40 %	310639331
98	NC_014621	CGCGC	2	10	109761	109770	0 %	0 %	40 %	60 %	310639332
99	NC_014621	GGGCC	2	10	110032	110041	0 %	0 %	60 %	40 %	310639332
100	NC_014621	CTGGT	2	10	111177	111186	0 %	40 %	40 %	20 %	310639333
101	NC_014621	CTGAT	2	10	113680	113689	20 %	40 %	20 %	20 %	310639334
102	NC_014621	GCGCC	2	10	113833	113842	0 %	0 %	40 %	60 %	310639335
103	NC_014621	CGCTG	2	10	114040	114049	0 %	20 %	40 %	40 %	310639335
104	NC_014621	GCCGC	2	10	114632	114641	0 %	0 %	40 %	60 %	310639335
105	NC_014621	GATCT	2	10	116467	116476	20 %	40 %	20 %	20 %	310639337
106	NC_014621	CGCGC	2	10	116900	116909	0 %	0 %	40 %	60 %	310639338
107	NC_014621	CGCAT	2	10	117980	117989	20 %	20 %	20 %	40 %	310639339
108	NC_014621	ATCGC	2	10	118550	118559	20 %	20 %	20 %	40 %	310639339
109	NC_014621	CTGCG	2	10	121202	121211	0 %	20 %	40 %	40 %	310639341
110	NC_014621	CCCCG	2	10	121663	121672	0 %	0 %	20 %	80 %	310639341
111	NC_014621	GCAGC	2	10	130454	130463	20 %	0 %	40 %	40 %	310639348
112	NC_014621	GCAAA	2	10	131431	131440	60 %	0 %	20 %	20 %	310639350
113	NC_014621	CAATC	2	10	132372	132381	40 %	20 %	0 %	40 %	310639351
114	NC_014621	CCAGC	2	10	132660	132669	20 %	0 %	20 %	60 %	310639351
115	NC_014621	CGCGG	2	10	133368	133377	0 %	0 %	60 %	40 %	310639352
116	NC_014621	ACGTC	2	10	134745	134754	20 %	20 %	20 %	40 %	310639353
117	NC_014621	CGGCG	2	10	136367	136376	0 %	0 %	60 %	40 %	310639354
118	NC_014621	GCGCA	2	10	137074	137083	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
119	NC_014621	CACGC	2	10	137256	137265	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
120	NC_014621	CATTT	2	10	138988	138997	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_014621	CGCGC	2	10	139296	139305	0 %	0 %	40 %	60 %	310639355
122	NC_014621	CCCGG	2	10	140780	140789	0 %	0 %	40 %	60 %	310639356
123	NC_014621	CGATG	2	10	141597	141606	20 %	20 %	40 %	20 %	310639357
124	NC_014621	ATGGC	2	10	142277	142286	20 %	20 %	40 %	20 %	310639359
125	NC_014621	ATCCA	2	10	142775	142784	40 %	20 %	0 %	40 %	310639359
126	NC_014621	CCATC	2	10	143226	143235	20 %	20 %	0 %	60 %	310639359
127	NC_014621	GCGCG	2	10	143960	143969	0 %	0 %	60 %	40 %	310639360
128	NC_014621	CATCC	2	10	144667	144676	20 %	20 %	0 %	60 %	310639360
129	NC_014621	TCGCC	2	10	145585	145594	0 %	20 %	20 %	60 %	310639362
130	NC_014621	CGGCG	2	10	145679	145688	0 %	0 %	60 %	40 %	310639362
131	NC_014621	TCGCG	2	10	148725	148734	0 %	20 %	40 %	40 %	310639364
132	NC_014621	TTCCT	2	10	150032	150041	0 %	60 %	0 %	40 %	310639366
133	NC_014621	GATCG	2	10	152495	152504	20 %	20 %	40 %	20 %	310639368
134	NC_014621	CCGCG	2	10	154876	154885	0 %	0 %	40 %	60 %	310639370
135	NC_014621	GATGA	2	10	156322	156331	40 %	20 %	40 %	0 %	310639372
136	NC_014621	CCTGC	2	10	156696	156705	0 %	20 %	20 %	60 %	310639372
137	NC_014621	CAATT	2	10	159116	159125	40 %	40 %	0 %	20 %	310639375
138	NC_014621	GCCGC	2	10	160279	160288	0 %	0 %	40 %	60 %	310639376
139	NC_014621	CATCG	2	10	160728	160737	20 %	20 %	20 %	40 %	310639376
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146	NC_014621	GCGCG	2	10	169378	169387	0 %	0 %	60 %	40 %	310639384
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223	NC_014621	CATCT	2	10	265228	265237	20 %	40 %	0 %	40 %	310639465
224	NC_014621	GCAAG	2	10	267325	267334	40 %	0 %	40 %	20 %	310639468
225	NC_014621	TGCGC	2	10	267677	267686	0 %	20 %	40 %	40 %	310639468
226	NC_014621	GGCGT	2	10	268070	268079	0 %	20 %	60 %	20 %	310639469

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.