MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Ketogulonicigenium vulgare Y25 plasmid pYP1

Total Repeats: 36

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014621	TCGCA	2	10	31566	31575	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_014621	GGACC	2	10	31615	31624	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_014621	TGACC	2	10	37036	37045	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_014621	TGCGC	2	10	37114	37123	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_014621	CCTGA	2	10	37376	37385	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_014621	GCGCC	2	10	37808	37817	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
7	NC_014621	CGACC	2	10	38115	38124	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
8	NC_014621	CGGCC	2	10	38177	38186	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
9	NC_014621	GATGG	2	10	38959	38968	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014621	TGGCT	2	10	39397	39406	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_014621	ATGGG	2	10	39525	39534	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014621	GATTG	2	10	56068	56077	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014621	TGATG	2	10	58845	58854	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014621	GTCGC	2	10	65811	65820	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_014621	CCGGT	2	10	71930	71939	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
16	NC_014621	GGCGC	2	10	77814	77823	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
17	NC_014621	GGTCA	2	10	95776	95785	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_014621	GCAAC	2	10	95823	95832	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_014621	GCCGG	2	10	95925	95934	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
20	NC_014621	AAAGC	2	10	102230	102239	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_014621	GCGGG	2	10	107946	107955	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
22	NC_014621	GCGCA	2	10	137074	137083	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_014621	CACGC	2	10	137256	137265	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
24	NC_014621	CATTT	2	10	138988	138997	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_014621	AACGC	2	10	171769	171778	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_014621	GCGAC	2	10	225851	225860	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NC_014621	CGCGC	2	10	228807	228816	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
28	NC_014621	TCGTG	2	10	230970	230979	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_014621	CAACA	2	10	231742	231751	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_014621	CAAGT	2	10	231937	231946	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_014621	ATCAA	2	10	232093	232102	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_014621	TTGAA	2	10	233928	233937	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014621	TTGCT	2	10	234227	234236	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_014621	CTCAT	2	10	234557	234566	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_014621	CTTCG	2	10	249094	249103	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_014621	CCAGA	2	10	259899	259908	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.