MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Ketogulonicigenium vulgare Y25 plasmid pYP1

Total Repeats: 96

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014621	CAGG	2	8	2505	2512	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_014621	CATC	2	8	3903	3910	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_014621	CCGG	2	8	4467	4474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_014621	GCAG	2	8	8806	8813	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014621	ACTT	2	8	27297	27304	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_014621	CAAC	2	8	30854	30861	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_014621	CAGA	2	8	31147	31154	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_014621	CACC	2	8	34965	34972	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
9	NC_014621	TGGA	2	8	35017	35024	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014621	CAGA	2	8	35495	35502	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_014621	GATG	2	8	36706	36713	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014621	TGTC	2	8	36753	36760	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_014621	GTTC	2	8	36865	36872	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_014621	AGGC	2	8	37062	37069	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_014621	GCAA	2	8	37401	37408	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_014621	CGCC	2	8	37839	37846	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
17	NC_014621	ACAG	2	8	38517	38524	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_014621	CCGC	2	8	38726	38733	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19	NC_014621	CTGG	2	8	39111	39118	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_014621	CACC	2	8	39483	39490	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
21	NC_014621	CCCG	2	8	39792	39799	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
22	NC_014621	CGGC	2	8	40810	40817	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_014621	TGCA	2	8	42633	42640	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_014621	TTTG	2	8	54872	54879	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014621	TTAA	2	8	56954	56961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014621	GCGT	2	8	56980	56987	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_014621	TGAG	2	8	59147	59154	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014621	TGGA	2	8	67648	67655	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014621	CCGC	2	8	68050	68057	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
30	NC_014621	GGGA	2	8	78389	78396	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014621	CTTC	2	8	80466	80473	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_014621	GGTC	2	8	80981	80988	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_014621	TGGA	2	8	88793	88800	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014621	ATCG	2	8	88879	88886	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_014621	ATCA	2	8	94607	94614	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_014621	ACGG	2	8	95311	95318	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_014621	CGGA	2	8	95335	95342	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_014621	GCGG	2	8	95403	95410	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
39	NC_014621	CCCA	2	8	95665	95672	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
40	NC_014621	GGGC	2	8	99160	99167	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
41	NC_014621	GTCG	2	8	103264	103271	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_014621	CGGG	2	8	110426	110433	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
43	NC_014621	AACA	2	8	112548	112555	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_014621	CAAG	2	8	119597	119604	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_014621	GGGA	2	8	123195	123202	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014621	TCGA	2	8	126218	126225	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_014621	ATCC	2	8	126283	126290	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_014621	CGCC	2	8	131232	131239	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
49	NC_014621	CGGG	2	8	137946	137953	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
50	NC_014621	GATC	2	8	138309	138316	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_014621	GGCG	2	8	138536	138543	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
52	NC_014621	GCCC	2	8	138667	138674	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
53	NC_014621	GACT	2	8	139825	139832	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_014621	TCTT	2	8	146205	146212	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_014621	GCAC	2	8	153360	153367	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_014621	GGCG	2	8	170102	170109	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
57	NC_014621	CTAT	2	8	171995	172002	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_014621	CAAA	2	8	172062	172069	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_014621	AAAT	2	8	175763	175770	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014621	ACCG	2	8	175790	175797	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_014621	TAAA	2	8	187312	187319	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014621	TTAC	2	8	191138	191145	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_014621	GCAA	2	8	191203	191210	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_014621	CGCC	2	8	209991	209998	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
65	NC_014621	GGGC	2	8	221821	221828	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
66	NC_014621	TAAG	2	8	223426	223433	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014621	TTAC	2	8	223441	223448	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_014621	CGGG	2	8	227810	227817	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
69	NC_014621	GGGC	2	8	227977	227984	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
70	NC_014621	TATC	2	8	227985	227992	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_014621	CCAG	2	8	228002	228009	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_014621	GCGG	2	8	228240	228247	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
73	NC_014621	GGGC	2	8	228677	228684	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
74	NC_014621	TGGC	2	8	228716	228723	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_014621	TGGC	2	8	229088	229095	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_014621	GAAC	2	8	229985	229992	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_014621	GTGA	2	8	230330	230337	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014621	TTGC	2	8	230739	230746	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_014621	TTCT	2	8	231815	231822	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_014621	TATG	2	8	231989	231996	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014621	GCGA	2	8	232386	232393	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_014621	GGCC	2	8	232439	232446	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_014621	CAAG	2	8	232717	232724	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_014621	CGTC	2	8	233082	233089	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_014621	GATT	2	8	233625	233632	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014621	AGCC	2	8	234383	234390	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_014621	GTTT	2	8	235289	235296	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014621	GCCT	2	8	236702	236709	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_014621	TCGA	2	8	236844	236851	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_014621	GGGA	2	8	236935	236942	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014621	CTTG	2	8	240182	240189	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_014621	CGTC	2	8	249139	249146	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_014621	GAAA	2	8	262793	262800	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014621	GCAC	2	8	262903	262910	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_014621	CCGC	2	8	264374	264381	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
96	NC_014621	TGCG	2	8	265672	265679	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.