MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bifidobacterium bifidum S17 chromosome

Total Repeats: 1649

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014616	AACGC	2	10	3017	3026	40 %	0 %	20 %	40 %	310286522
2	NC_014616	CGAAT	2	10	3340	3349	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_014616	ATGAC	2	10	3382	3391	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_014616	GGGCA	2	10	8143	8152	20 %	0 %	60 %	20 %	310286526
5	NC_014616	TCGGC	2	10	8156	8165	0 %	20 %	40 %	40 %	310286526
6	NC_014616	TCGTC	2	10	10882	10891	0 %	40 %	20 %	40 %	310286527
7	NC_014616	ACGCC	2	10	12722	12731	20 %	0 %	20 %	60 %	310286530
8	NC_014616	TTCGA	2	10	14644	14653	20 %	40 %	20 %	20 %	310286531
9	NC_014616	CGCGA	2	10	15328	15337	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_014616	TGGCG	2	10	16384	16393	0 %	20 %	60 %	20 %	310286532
11	NC_014616	ACGGC	2	10	16966	16975	20 %	0 %	40 %	40 %	310286534
12	NC_014616	GCAGT	2	10	17659	17668	20 %	20 %	40 %	20 %	310286536
13	NC_014616	CACGG	2	10	19848	19857	20 %	0 %	40 %	40 %	310286540
14	NC_014616	AGCTG	2	10	20897	20906	20 %	20 %	40 %	20 %	310286541
15	NC_014616	GCGGT	2	10	21819	21828	0 %	20 %	60 %	20 %	310286542
16	NC_014616	TTGTC	2	10	22692	22701	0 %	60 %	20 %	20 %	310286543
17	NC_014616	CGAGC	2	10	23389	23398	20 %	0 %	40 %	40 %	310286543
18	NC_014616	GTGAT	2	10	26037	26046	20 %	40 %	40 %	0 %	310286543
19	NC_014616	CGGGC	2	10	31464	31473	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
20	NC_014616	AAGAA	2	10	31893	31902	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014616	AGCGC	2	10	32013	32022	20 %	0 %	40 %	40 %	310286548
22	NC_014616	TCGCG	2	10	35575	35584	0 %	20 %	40 %	40 %	310286551
23	NC_014616	ACGCC	2	10	36503	36512	20 %	0 %	20 %	60 %	310286551
24	NC_014616	CGTTG	2	10	37176	37185	0 %	40 %	40 %	20 %	310286552
25	NC_014616	GTCGG	2	10	39611	39620	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
26	NC_014616	CGAGC	2	10	40394	40403	20 %	0 %	40 %	40 %	310286555
27	NC_014616	AGCGC	2	10	41843	41852	20 %	0 %	40 %	40 %	310286556
28	NC_014616	AGGGC	2	10	46318	46327	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
29	NC_014616	AACGC	2	10	46625	46634	40 %	0 %	20 %	40 %	310286559
30	NC_014616	CAGAT	2	10	47977	47986	40 %	20 %	20 %	20 %	310286559
31	NC_014616	CATCG	2	10	48969	48978	20 %	20 %	20 %	40 %	310286559
32	NC_014616	ATGGC	2	10	52287	52296	20 %	20 %	40 %	20 %	310286561
33	NC_014616	ATCAG	2	10	53019	53028	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_014616	GCAGC	2	10	53482	53491	20 %	0 %	40 %	40 %	310286562
35	NC_014616	CGGCT	2	10	55886	55895	0 %	20 %	40 %	40 %	310286563
36	NC_014616	GGCGT	2	10	56784	56793	0 %	20 %	60 %	20 %	310286565
37	NC_014616	TGCGG	2	10	64380	64389	0 %	20 %	60 %	20 %	310286571
38	NC_014616	AGTGA	2	10	68019	68028	40 %	20 %	40 %	0 %	310286573
39	NC_014616	CGTGG	2	10	69418	69427	0 %	20 %	60 %	20 %	310286574
40	NC_014616	GGCCC	2	10	69443	69452	0 %	0 %	40 %	60 %	310286574
41	NC_014616	CGCGC	2	10	69613	69622	0 %	0 %	40 %	60 %	310286574
42	NC_014616	CTTCG	2	10	75388	75397	0 %	40 %	20 %	40 %	310286580
43	NC_014616	CTACG	2	10	75774	75783	20 %	20 %	20 %	40 %	310286580
44	NC_014616	AAGCT	2	10	77662	77671	40 %	20 %	20 %	20 %	310286582
45	NC_014616	GAATG	2	10	78957	78966	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014616	TTGCT	2	10	81708	81717	0 %	60 %	20 %	20 %	310286584
47	NC_014616	GCCGG	2	10	82468	82477	0 %	0 %	60 %	40 %	310286585
48	NC_014616	GCCGC	2	10	82683	82692	0 %	0 %	40 %	60 %	310286585
49	NC_014616	GATGT	2	10	83953	83962	20 %	40 %	40 %	0 %	310286586
50	NC_014616	GTAAT	2	10	84809	84818	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014616	TGCGA	2	10	85077	85086	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_014616	CAGGC	2	10	85930	85939	20 %	0 %	40 %	40 %	310286587
53	NC_014616	CGCGC	2	10	87645	87654	0 %	0 %	40 %	60 %	310286589
54	NC_014616	GCGAT	2	10	89224	89233	20 %	20 %	40 %	20 %	310286593
55	NC_014616	ACTTC	2	10	90823	90832	20 %	40 %	0 %	40 %	310286597
56	NC_014616	ATGTC	2	10	95873	95882	20 %	40 %	20 %	20 %	310286604
57	NC_014616	AATCG	2	10	97207	97216	40 %	20 %	20 %	20 %	310286605
58	NC_014616	GCCGG	2	10	98032	98041	0 %	0 %	60 %	40 %	310286608
59	NC_014616	GCGGA	2	10	99088	99097	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
60	NC_014616	CCGTC	2	10	99878	99887	0 %	20 %	20 %	60 %	310286611
61	NC_014616	CGCAC	2	10	100229	100238	20 %	0 %	20 %	60 %	310286612
62	NC_014616	CCGGC	2	10	100830	100839	0 %	0 %	40 %	60 %	310286612
63	NC_014616	GCCGC	2	10	101114	101123	0 %	0 %	40 %	60 %	310286612
64	NC_014616	CGCGC	2	10	104866	104875	0 %	0 %	40 %	60 %	310286616
65	NC_014616	GGCGA	2	10	106675	106684	20 %	0 %	60 %	20 %	310286620
66	NC_014616	CCGCG	2	10	108673	108682	0 %	0 %	40 %	60 %	310286624
67	NC_014616	GAACC	2	10	109099	109108	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
68	NC_014616	GCATC	2	10	110517	110526	20 %	20 %	20 %	40 %	310286626
69	NC_014616	CGCGC	2	10	111943	111952	0 %	0 %	40 %	60 %	310286626
70	NC_014616	GCCTC	2	10	112215	112224	0 %	20 %	20 %	60 %	310286627
71	NC_014616	GCTGG	2	10	112863	112872	0 %	20 %	60 %	20 %	310286627
72	NC_014616	CGCAG	2	10	113391	113400	20 %	0 %	40 %	40 %	310286628
73	NC_014616	CTCGC	2	10	113482	113491	0 %	20 %	20 %	60 %	310286628
74	NC_014616	CGGAC	2	10	114372	114381	20 %	0 %	40 %	40 %	310286628
75	NC_014616	CCGTC	2	10	115156	115165	0 %	20 %	20 %	60 %	310286630
76	NC_014616	GGACT	2	10	115397	115406	20 %	20 %	40 %	20 %	310286630
77	NC_014616	TGATC	2	10	117355	117364	20 %	40 %	20 %	20 %	310286634
78	NC_014616	TGTCC	2	10	120617	120626	0 %	40 %	20 %	40 %	310286641
79	NC_014616	GATGG	2	10	120686	120695	20 %	20 %	60 %	0 %	310286641
80	NC_014616	TCAAT	2	10	122783	122792	40 %	40 %	0 %	20 %	310286643
81	NC_014616	CGCTG	2	10	124646	124655	0 %	20 %	40 %	40 %	310286646
82	NC_014616	ACATG	2	10	129942	129951	40 %	20 %	20 %	20 %	310286650
83	NC_014616	CATGA	2	10	131324	131333	40 %	20 %	20 %	20 %	310286651
84	NC_014616	GTCAT	2	10	131760	131769	20 %	40 %	20 %	20 %	310286651
85	NC_014616	GAGCT	2	10	134045	134054	20 %	20 %	40 %	20 %	310286654
86	NC_014616	ACGAG	2	10	134543	134552	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_014616	GTCGC	2	10	135575	135584	0 %	20 %	40 %	40 %	310286656
88	NC_014616	TCACG	2	10	137154	137163	20 %	20 %	20 %	40 %	310286656
89	NC_014616	GACGG	2	10	138357	138366	20 %	0 %	60 %	20 %	310286657
90	NC_014616	TCGTG	2	10	139372	139381	0 %	40 %	40 %	20 %	310286658
91	NC_014616	TTGCG	2	10	139813	139822	0 %	40 %	40 %	20 %	310286658
92	NC_014616	TCGCG	2	10	142184	142193	0 %	20 %	40 %	40 %	310286660
93	NC_014616	GCCGG	2	10	143428	143437	0 %	0 %	60 %	40 %	310286661
94	NC_014616	GGTCA	2	10	143796	143805	20 %	20 %	40 %	20 %	310286662
95	NC_014616	GGCGA	2	10	146014	146023	20 %	0 %	60 %	20 %	310286663
96	NC_014616	CCCCG	2	10	146684	146693	0 %	0 %	20 %	80 %	310286663
97	NC_014616	GCCAC	2	10	150200	150209	20 %	0 %	20 %	60 %	310286665
98	NC_014616	GCTCG	2	10	150867	150876	0 %	20 %	40 %	40 %	310286665
99	NC_014616	GCGCT	2	10	151141	151150	0 %	20 %	40 %	40 %	310286665
100	NC_014616	ACTCG	2	10	151575	151584	20 %	20 %	20 %	40 %	310286665
101	NC_014616	CGATG	2	10	152316	152325	20 %	20 %	40 %	20 %	310286665
102	NC_014616	CGTGC	2	10	153441	153450	0 %	20 %	40 %	40 %	310286666
103	NC_014616	GGTGC	2	10	154025	154034	0 %	20 %	60 %	20 %	310286667
104	NC_014616	GGCGT	2	10	154229	154238	0 %	20 %	60 %	20 %	310286667
105	NC_014616	CGGCG	2	10	155169	155178	0 %	0 %	60 %	40 %	310286668
106	NC_014616	AGCGC	2	10	156287	156296	20 %	0 %	40 %	40 %	310286669
107	NC_014616	AACGC	2	10	156371	156380	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
108	NC_014616	GACGC	2	10	156780	156789	20 %	0 %	40 %	40 %	310286670
109	NC_014616	ACCGT	2	10	158340	158349	20 %	20 %	20 %	40 %	310286672
110	NC_014616	ACTCT	2	10	162551	162560	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
111	NC_014616	GGACG	2	10	162877	162886	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
112	NC_014616	GCATG	2	10	163462	163471	20 %	20 %	40 %	20 %	310286676
113	NC_014616	CTCAC	2	10	165349	165358	20 %	20 %	0 %	60 %	310286678
114	NC_014616	GCCGC	2	10	166622	166631	0 %	0 %	40 %	60 %	310286678
115	NC_014616	CGGGC	2	10	170809	170818	0 %	0 %	60 %	40 %	310286680
116	NC_014616	TCATC	2	10	170939	170948	20 %	40 %	0 %	40 %	310286680
117	NC_014616	GCACC	2	10	172601	172610	20 %	0 %	20 %	60 %	310286681
118	NC_014616	TCATT	2	10	173188	173197	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_014616	GGTCT	2	10	173394	173403	0 %	40 %	40 %	20 %	310286682
120	NC_014616	ATCGG	2	10	176683	176692	20 %	20 %	40 %	20 %	310286683
121	NC_014616	ATCGG	2	10	179820	179829	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
122	NC_014616	CGGCG	2	10	179897	179906	0 %	0 %	60 %	40 %	310286686
123	NC_014616	TGCTT	2	10	181671	181680	0 %	60 %	20 %	20 %	310286688
124	NC_014616	CGTCG	2	10	182766	182775	0 %	20 %	40 %	40 %	310286690
125	NC_014616	GTCCA	2	10	183269	183278	20 %	20 %	20 %	40 %	310286691
126	NC_014616	AGTTC	2	10	183763	183772	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_014616	CAGGC	2	10	184470	184479	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
128	NC_014616	GCATC	2	10	184619	184628	20 %	20 %	20 %	40 %	310286692
129	NC_014616	CGCAG	2	10	184769	184778	20 %	0 %	40 %	40 %	310286692
130	NC_014616	GCATT	2	10	184994	185003	20 %	40 %	20 %	20 %	310286693
131	NC_014616	CGGAC	2	10	185564	185573	20 %	0 %	40 %	40 %	310286693
132	NC_014616	CGCTG	2	10	189206	189215	0 %	20 %	40 %	40 %	310286696
133	NC_014616	GCGGT	2	10	189930	189939	0 %	20 %	60 %	20 %	310286696
134	NC_014616	CGGCC	2	10	193025	193034	0 %	0 %	40 %	60 %	310286699
135	NC_014616	GACCA	2	10	193176	193185	40 %	0 %	20 %	40 %	310286699
136	NC_014616	GACTC	2	10	194114	194123	20 %	20 %	20 %	40 %	310286700
137	NC_014616	TTCCA	2	10	194245	194254	20 %	40 %	0 %	40 %	310286700
138	NC_014616	CGATA	2	10	194349	194358	40 %	20 %	20 %	20 %	310286700
139	NC_014616	ACGCG	2	10	196962	196971	20 %	0 %	40 %	40 %	310286703
140	NC_014616	AAGAG	2	10	197050	197059	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014616	TGTCG	2	10	197680	197689	0 %	40 %	40 %	20 %	310286704
142	NC_014616	TTCGC	2	10	198191	198200	0 %	40 %	20 %	40 %	310286704
143	NC_014616	CATCG	2	10	198250	198259	20 %	20 %	20 %	40 %	310286704
144	NC_014616	CCGGT	2	10	198384	198393	0 %	20 %	40 %	40 %	310286704
145	NC_014616	CGATG	2	10	199941	199950	20 %	20 %	40 %	20 %	310286705
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147	NC_014616	AAGTC	2	10	202628	202637	40 %	20 %	20 %	20 %	310286707
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149	NC_014616	CGCTG	2	10	207454	207463	0 %	20 %	40 %	40 %	310286709
150	NC_014616	CCACA	2	10	209524	209533	40 %	0 %	0 %	60 %	310286710
151	NC_014616	GCCGT	2	10	210929	210938	0 %	20 %	40 %	40 %	310286710
152	NC_014616	GGGCC	2	10	211069	211078	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
153	NC_014616	CCGCG	2	10	213408	213417	0 %	0 %	40 %	60 %	310286713
154	NC_014616	TGGCA	2	10	213696	213705	20 %	20 %	40 %	20 %	310286713
155	NC_014616	CGATG	2	10	215601	215610	20 %	20 %	40 %	20 %	310286713
156	NC_014616	GCTCG	2	10	215614	215623	0 %	20 %	40 %	40 %	310286713
157	NC_014616	CGGCG	2	10	216670	216679	0 %	0 %	60 %	40 %	310286714
158	NC_014616	GGGGC	2	10	217695	217704	0 %	0 %	80 %	20 %	310286715
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160	NC_014616	CGCGG	2	10	219140	219149	0 %	0 %	60 %	40 %	310286718
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162	NC_014616	ACGTC	2	10	226123	226132	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
163	NC_014616	GAACA	2	10	226906	226915	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
164	NC_014616	GCCAT	2	10	230605	230614	20 %	20 %	20 %	40 %	310286727
165	NC_014616	GAATC	2	10	231123	231132	40 %	20 %	20 %	20 %	310286728
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167	NC_014616	CGGCG	2	10	236966	236975	0 %	0 %	60 %	40 %	310286731
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170	NC_014616	GTACG	2	10	245130	245139	20 %	20 %	40 %	20 %	310286736
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174	NC_014616	TGGCG	2	10	253953	253962	0 %	20 %	60 %	20 %	310286739
175	NC_014616	CGAAG	2	10	255877	255886	40 %	0 %	40 %	20 %	310286741
176	NC_014616	CCACG	2	10	256245	256254	20 %	0 %	20 %	60 %	310286742
177	NC_014616	GGCCC	2	10	256622	256631	0 %	0 %	40 %	60 %	310286742
178	NC_014616	GGCGT	2	10	257522	257531	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
179	NC_014616	CGGGG	2	10	257771	257780	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
180	NC_014616	GGGAT	2	10	260816	260825	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
181	NC_014616	CCGTC	2	10	260924	260933	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
182	NC_014616	TCGCA	2	10	262212	262221	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
183	NC_014616	GGACG	2	10	262569	262578	20 %	0 %	60 %	20 %	310286747
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187	NC_014616	CGGCG	2	10	268575	268584	0 %	0 %	60 %	40 %	310286752
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195	NC_014616	CGCTG	2	10	275671	275680	0 %	20 %	40 %	40 %	310286756
196	NC_014616	GCTCG	2	10	276298	276307	0 %	20 %	40 %	40 %	310286756
197	NC_014616	CGACG	2	10	276943	276952	20 %	0 %	40 %	40 %	310286756
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199	NC_014616	TGCCG	2	10	277440	277449	0 %	20 %	40 %	40 %	310286757
200	NC_014616	GATGT	2	10	281231	281240	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
201	NC_014616	CGACG	2	10	281516	281525	20 %	0 %	40 %	40 %	310286760
202	NC_014616	TGCCG	2	10	282373	282382	0 %	20 %	40 %	40 %	310286760
203	NC_014616	GCATC	2	10	282878	282887	20 %	20 %	20 %	40 %	310286761
204	NC_014616	TATGC	2	10	285111	285120	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
205	NC_014616	AGCAC	2	10	286320	286329	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
206	NC_014616	GGTCA	2	10	286571	286580	20 %	20 %	40 %	20 %	310286764
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222	NC_014616	CGGCG	2	10	313823	313832	0 %	0 %	60 %	40 %	310286790
223	NC_014616	GGTGA	2	10	314549	314558	20 %	20 %	60 %	0 %	310286790
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231	NC_014616	CGCAC	2	10	321923	321932	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
232	NC_014616	CCACC	2	10	322015	322024	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
233	NC_014616	AAGGT	2	10	323755	323764	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
234	NC_014616	ACGTG	2	10	324246	324255	20 %	20 %	40 %	20 %	310286797
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240	NC_014616	ACGGC	2	10	338666	338675	20 %	0 %	40 %	40 %	310286806
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249	NC_014616	GGCAG	2	10	351855	351864	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
250	NC_014616	TGCGG	2	10	353065	353074	0 %	20 %	60 %	20 %	310286818
251	NC_014616	GACTG	2	10	354110	354119	20 %	20 %	40 %	20 %	310286819
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253	NC_014616	GCGCA	2	10	355604	355613	20 %	0 %	40 %	40 %	310286820
254	NC_014616	CGCTG	2	10	356038	356047	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
255	NC_014616	GTGAG	2	10	356114	356123	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
256	NC_014616	GTGCC	2	10	356189	356198	0 %	20 %	40 %	40 %	310286821
257	NC_014616	GGTCA	2	10	358859	358868	20 %	20 %	40 %	20 %	310286822
258	NC_014616	AAACA	2	10	360833	360842	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
259	NC_014616	TGCGC	2	10	362454	362463	0 %	20 %	40 %	40 %	310286823
260	NC_014616	CGCAA	2	10	362891	362900	40 %	0 %	20 %	40 %	310286824
261	NC_014616	CGATC	2	10	365803	365812	20 %	20 %	20 %	40 %	310286826
262	NC_014616	CTGGA	2	10	366038	366047	20 %	20 %	40 %	20 %	310286826
263	NC_014616	CGAGC	2	10	366322	366331	20 %	0 %	40 %	40 %	310286827
264	NC_014616	CGAGC	2	10	368142	368151	20 %	0 %	40 %	40 %	310286828
265	NC_014616	GCGCC	2	10	369092	369101	0 %	0 %	40 %	60 %	310286828
266	NC_014616	CGTGA	2	10	369988	369997	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
267	NC_014616	GACCG	2	10	371746	371755	20 %	0 %	40 %	40 %	310286831
268	NC_014616	CGTGC	2	10	373222	373231	0 %	20 %	40 %	40 %	310286832
269	NC_014616	AAGGA	2	10	374487	374496	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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271	NC_014616	CGGCT	2	10	375989	375998	0 %	20 %	40 %	40 %	310286834
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282	NC_014616	GGCGT	2	10	384737	384746	0 %	20 %	60 %	20 %	310286843
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302	NC_014616	CTCGG	2	10	403346	403355	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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397	NC_014616	TGCCG	2	10	514184	514193	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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