MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bifidobacterium bifidum S17 chromosome

Total Repeats: 5166

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014616	CGTT	2	8	581	588	0 %	50 %	25 %	25 %	310286521
2	NC_014616	CGCA	2	8	609	616	25 %	0 %	25 %	50 %	310286521
3	NC_014616	CCGA	2	8	1300	1307	25 %	0 %	25 %	50 %	310286521
4	NC_014616	ACAT	2	8	1746	1753	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014616	CTGC	2	8	2431	2438	0 %	25 %	25 %	50 %	310286522
6	NC_014616	ACCT	2	8	2446	2453	25 %	25 %	0 %	50 %	310286522
7	NC_014616	CGAC	2	8	2456	2463	25 %	0 %	25 %	50 %	310286522
8	NC_014616	CGAC	2	8	2693	2700	25 %	0 %	25 %	50 %	310286522
9	NC_014616	GGCG	2	8	3858	3865	0 %	0 %	75 %	25 %	310286523
10	NC_014616	CACG	2	8	3945	3952	25 %	0 %	25 %	50 %	310286523
11	NC_014616	GGCG	2	8	4155	4162	0 %	0 %	75 %	25 %	310286523
12	NC_014616	GCAG	2	8	4212	4219	25 %	0 %	50 %	25 %	310286523
13	NC_014616	CGGG	2	8	4741	4748	0 %	0 %	75 %	25 %	310286524
14	NC_014616	ACCT	2	8	5160	5167	25 %	25 %	0 %	50 %	310286524
15	NC_014616	AGGA	2	8	5420	5427	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014616	CAAC	2	8	6041	6048	50 %	0 %	0 %	50 %	310286525
17	NC_014616	TCAC	2	8	6219	6226	25 %	25 %	0 %	50 %	310286525
18	NC_014616	CGGC	2	8	6874	6881	0 %	0 %	50 %	50 %	310286525
19	NC_014616	CGGT	2	8	7093	7100	0 %	25 %	50 %	25 %	310286525
20	NC_014616	ACCG	2	8	7317	7324	25 %	0 %	25 %	50 %	310286525
21	NC_014616	CCGC	2	8	8176	8183	0 %	0 %	25 %	75 %	310286526
22	NC_014616	CCAG	2	8	9035	9042	25 %	0 %	25 %	50 %	310286526
23	NC_014616	CGCT	2	8	10238	10245	0 %	25 %	25 %	50 %	310286526
24	NC_014616	CGGA	2	8	10544	10551	25 %	0 %	50 %	25 %	310286527
25	NC_014616	GAGC	2	8	10658	10665	25 %	0 %	50 %	25 %	310286527
26	NC_014616	CATA	2	8	11054	11061	50 %	25 %	0 %	25 %	310286527
27	NC_014616	TGGC	2	8	12363	12370	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_014616	GGTG	2	8	12683	12690	0 %	25 %	75 %	0 %	310286530
29	NC_014616	GCCG	2	8	15158	15165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_014616	GGGC	2	8	15815	15822	0 %	0 %	75 %	25 %	310286532
31	NC_014616	TTTC	2	8	16076	16083	0 %	75 %	0 %	25 %	310286532
32	NC_014616	CGGC	2	8	16329	16336	0 %	0 %	50 %	50 %	310286532
33	NC_014616	CGGC	2	8	16520	16527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_014616	TCGG	2	8	16576	16583	0 %	25 %	50 %	25 %	310286533
35	NC_014616	TGGC	2	8	16720	16727	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_014616	GTTT	2	8	16822	16829	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014616	GTCA	2	8	17180	17187	25 %	25 %	25 %	25 %	310286534
38	NC_014616	GCCA	2	8	17541	17548	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_014616	CTTA	2	8	18219	18226	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_014616	GCGA	2	8	20175	20182	25 %	0 %	50 %	25 %	310286540
41	NC_014616	CCAC	2	8	20274	20281	25 %	0 %	0 %	75 %	310286540
42	NC_014616	GCCT	2	8	20645	20652	0 %	25 %	25 %	50 %	310286540
43	NC_014616	CGGC	2	8	21260	21267	0 %	0 %	50 %	50 %	310286541
44	NC_014616	GACG	2	8	21401	21408	25 %	0 %	50 %	25 %	310286541
45	NC_014616	GTCG	2	8	21943	21950	0 %	25 %	50 %	25 %	310286542
46	NC_014616	CCTT	2	8	22820	22827	0 %	50 %	0 %	50 %	310286543
47	NC_014616	AGCG	2	8	22951	22958	25 %	0 %	50 %	25 %	310286543
48	NC_014616	CAGA	2	8	23247	23254	50 %	0 %	25 %	25 %	310286543
49	NC_014616	CGAG	2	8	23550	23557	25 %	0 %	50 %	25 %	310286543
50	NC_014616	TGCC	2	8	23724	23731	0 %	25 %	25 %	50 %	310286543
51	NC_014616	CGCC	2	8	23766	23773	0 %	0 %	25 %	75 %	310286543
52	NC_014616	CCGT	2	8	23951	23958	0 %	25 %	25 %	50 %	310286543
53	NC_014616	GTTC	2	8	24183	24190	0 %	50 %	25 %	25 %	310286543
54	NC_014616	ACGA	2	8	24239	24246	50 %	0 %	25 %	25 %	310286543
55	NC_014616	GTCG	2	8	25540	25547	0 %	25 %	50 %	25 %	310286543
56	NC_014616	CGGC	2	8	25598	25605	0 %	0 %	50 %	50 %	310286543
57	NC_014616	GCCG	2	8	25864	25871	0 %	0 %	50 %	50 %	310286543
58	NC_014616	GACG	2	8	28578	28585	25 %	0 %	50 %	25 %	310286544
59	NC_014616	GCTG	2	8	29219	29226	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_014616	ATCT	2	8	29390	29397	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_014616	TAGA	2	8	29508	29515	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014616	GTCG	2	8	30448	30455	0 %	25 %	50 %	25 %	310286545
63	NC_014616	GAAA	2	8	30918	30925	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014616	CCCG	2	8	31207	31214	0 %	0 %	25 %	75 %	310286546
65	NC_014616	GAAA	2	8	31554	31561	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014616	CGGC	2	8	31859	31866	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_014616	CCAG	2	8	32190	32197	25 %	0 %	25 %	50 %	310286548
68	NC_014616	GTTC	2	8	32712	32719	0 %	50 %	25 %	25 %	310286548
69	NC_014616	GCCC	2	8	32849	32856	0 %	0 %	25 %	75 %	310286548
70	NC_014616	GCCG	2	8	33118	33125	0 %	0 %	50 %	50 %	310286548
71	NC_014616	CTGC	2	8	33247	33254	0 %	25 %	25 %	50 %	310286548
72	NC_014616	CGAT	2	8	34149	34156	25 %	25 %	25 %	25 %	310286549
73	NC_014616	CTGC	2	8	34612	34619	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_014616	TTCC	2	8	35126	35133	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_014616	GTCA	2	8	35463	35470	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_014616	TGGC	2	8	35588	35595	0 %	25 %	50 %	25 %	310286551
77	NC_014616	GGCC	2	8	35598	35605	0 %	0 %	50 %	50 %	310286551
78	NC_014616	GCCG	2	8	35768	35775	0 %	0 %	50 %	50 %	310286551
79	NC_014616	CAGC	2	8	36527	36534	25 %	0 %	25 %	50 %	310286551
80	NC_014616	CCCG	2	8	36660	36667	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
81	NC_014616	GATC	2	8	37889	37896	25 %	25 %	25 %	25 %	310286552
82	NC_014616	GCCT	2	8	38065	38072	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_014616	GCCG	2	8	38197	38204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_014616	CTCG	2	8	39048	39055	0 %	25 %	25 %	50 %	310286554
85	NC_014616	ACCG	2	8	39093	39100	25 %	0 %	25 %	50 %	310286554
86	NC_014616	TCGC	2	8	40850	40857	0 %	25 %	25 %	50 %	310286556
87	NC_014616	AGCC	2	8	41115	41122	25 %	0 %	25 %	50 %	310286556
88	NC_014616	GGGC	2	8	41409	41416	0 %	0 %	75 %	25 %	310286556
89	NC_014616	GCCC	2	8	41823	41830	0 %	0 %	25 %	75 %	310286556
90	NC_014616	CCCG	2	8	41948	41955	0 %	0 %	25 %	75 %	310286556
91	NC_014616	GCCG	2	8	42258	42265	0 %	0 %	50 %	50 %	310286556
92	NC_014616	TTCG	2	8	42339	42346	0 %	50 %	25 %	25 %	310286556
93	NC_014616	CGTG	2	8	42519	42526	0 %	25 %	50 %	25 %	310286556
94	NC_014616	ACGA	2	8	44872	44879	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_014616	CGTG	2	8	44933	44940	0 %	25 %	50 %	25 %	310286558
96	NC_014616	CGGC	2	8	45175	45182	0 %	0 %	50 %	50 %	310286558
97	NC_014616	GCGA	2	8	45850	45857	25 %	0 %	50 %	25 %	310286558
98	NC_014616	CTCA	2	8	46074	46081	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_014616	TGAT	2	8	46280	46287	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014616	TGCG	2	8	46397	46404	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_014616	AGAT	2	8	46561	46568	50 %	25 %	25 %	0 %	310286559
102	NC_014616	CGGG	2	8	47055	47062	0 %	0 %	75 %	25 %	310286559
103	NC_014616	CGAC	2	8	47404	47411	25 %	0 %	25 %	50 %	310286559
104	NC_014616	GCTC	2	8	48194	48201	0 %	25 %	25 %	50 %	310286559
105	NC_014616	TCGG	2	8	48715	48722	0 %	25 %	50 %	25 %	310286559
106	NC_014616	GGCC	2	8	48777	48784	0 %	0 %	50 %	50 %	310286559
107	NC_014616	GTTC	2	8	48821	48828	0 %	50 %	25 %	25 %	310286559
108	NC_014616	CTCA	2	8	48900	48907	25 %	25 %	0 %	50 %	310286559
109	NC_014616	GGCC	2	8	49825	49832	0 %	0 %	50 %	50 %	310286560
110	NC_014616	GACG	2	8	50350	50357	25 %	0 %	50 %	25 %	310286560
111	NC_014616	CGCC	2	8	50878	50885	0 %	0 %	25 %	75 %	310286560
112	NC_014616	GCCG	2	8	51358	51365	0 %	0 %	50 %	50 %	310286560
113	NC_014616	CTGC	2	8	51601	51608	0 %	25 %	25 %	50 %	310286560
114	NC_014616	CGCC	2	8	52549	52556	0 %	0 %	25 %	75 %	310286561
115	NC_014616	GCGT	2	8	53911	53918	0 %	25 %	50 %	25 %	310286562
116	NC_014616	GCTG	2	8	54500	54507	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_014616	ATCT	2	8	54578	54585	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_014616	TAGA	2	8	54696	54703	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014616	TACG	2	8	55070	55077	25 %	25 %	25 %	25 %	310286563
120	NC_014616	GCGG	2	8	55177	55184	0 %	0 %	75 %	25 %	310286563
121	NC_014616	TCGG	2	8	55218	55225	0 %	25 %	50 %	25 %	310286563
122	NC_014616	CGGC	2	8	55624	55631	0 %	0 %	50 %	50 %	310286563
123	NC_014616	CGGT	2	8	55737	55744	0 %	25 %	50 %	25 %	310286563
124	NC_014616	TGCT	2	8	56011	56018	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_014616	GCCG	2	8	56415	56422	0 %	0 %	50 %	50 %	310286564
126	NC_014616	GGCG	2	8	56813	56820	0 %	0 %	75 %	25 %	310286565
127	NC_014616	CGGC	2	8	57300	57307	0 %	0 %	50 %	50 %	310286565
128	NC_014616	GCGG	2	8	57898	57905	0 %	0 %	75 %	25 %	310286566
129	NC_014616	GAGG	2	8	58026	58033	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014616	ATAC	2	8	58826	58833	50 %	25 %	0 %	25 %	310286567
131	NC_014616	CCAT	2	8	59338	59345	25 %	25 %	0 %	50 %	310286568
132	NC_014616	GCCA	2	8	59426	59433	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_014616	GTGG	2	8	60577	60584	0 %	25 %	75 %	0 %	310286569
134	NC_014616	GTTC	2	8	60809	60816	0 %	50 %	25 %	25 %	310286569
135	NC_014616	TGTT	2	8	61188	61195	0 %	75 %	25 %	0 %	310286569
136	NC_014616	AATC	2	8	61359	61366	50 %	25 %	0 %	25 %	310286569
137	NC_014616	TGGC	2	8	61419	61426	0 %	25 %	50 %	25 %	310286569
138	NC_014616	TGGT	2	8	61631	61638	0 %	50 %	50 %	0 %	310286569
139	NC_014616	GATG	2	8	61753	61760	25 %	25 %	50 %	0 %	310286569
140	NC_014616	CAGA	2	8	62129	62136	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_014616	ATTG	2	8	62227	62234	25 %	50 %	25 %	0 %	310286570
142	NC_014616	GTCG	2	8	62797	62804	0 %	25 %	50 %	25 %	310286570
143	NC_014616	ATGA	2	8	63351	63358	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014616	TCGG	2	8	63436	63443	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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