MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Bifidobacterium bifidum S17 chromosome

Total Repeats: 154

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014616	T	6	6	14853	14858	0 %	100 %	0 %	0 %	310286531
2	NC_014616	T	6	6	18030	18035	0 %	100 %	0 %	0 %	310286537
3	NC_014616	A	6	6	61259	61264	100 %	0 %	0 %	0 %	310286569
4	NC_014616	A	7	7	68404	68410	100 %	0 %	0 %	0 %	310286573
5	NC_014616	A	6	6	68412	68417	100 %	0 %	0 %	0 %	310286573
6	NC_014616	T	6	6	70901	70906	0 %	100 %	0 %	0 %	310286576
7	NC_014616	C	9	9	73200	73208	0 %	0 %	0 %	100 %	310286578
8	NC_014616	T	7	7	75602	75608	0 %	100 %	0 %	0 %	310286580
9	NC_014616	T	6	6	81090	81095	0 %	100 %	0 %	0 %	310286584
10	NC_014616	A	6	6	103828	103833	100 %	0 %	0 %	0 %	310286614
11	NC_014616	C	6	6	112841	112846	0 %	0 %	0 %	100 %	310286627
12	NC_014616	G	6	6	123044	123049	0 %	0 %	100 %	0 %	310286643
13	NC_014616	C	6	6	126464	126469	0 %	0 %	0 %	100 %	310286647
14	NC_014616	C	6	6	127289	127294	0 %	0 %	0 %	100 %	310286647
15	NC_014616	A	6	6	131609	131614	100 %	0 %	0 %	0 %	310286651
16	NC_014616	A	7	7	133147	133153	100 %	0 %	0 %	0 %	310286653
17	NC_014616	A	7	7	192410	192416	100 %	0 %	0 %	0 %	310286698
18	NC_014616	G	10	10	219911	219920	0 %	0 %	100 %	0 %	310286718
19	NC_014616	T	6	6	229278	229283	0 %	100 %	0 %	0 %	310286726
20	NC_014616	A	6	6	229341	229346	100 %	0 %	0 %	0 %	310286726
21	NC_014616	T	7	7	230815	230821	0 %	100 %	0 %	0 %	310286728
22	NC_014616	T	6	6	233214	233219	0 %	100 %	0 %	0 %	310286728
23	NC_014616	A	7	7	235516	235522	100 %	0 %	0 %	0 %	310286729
24	NC_014616	G	6	6	235529	235534	0 %	0 %	100 %	0 %	310286729
25	NC_014616	G	6	6	235702	235707	0 %	0 %	100 %	0 %	310286729
26	NC_014616	A	6	6	239328	239333	100 %	0 %	0 %	0 %	310286733
27	NC_014616	C	6	6	290712	290717	0 %	0 %	0 %	100 %	310286769
28	NC_014616	T	6	6	294033	294038	0 %	100 %	0 %	0 %	310286772
29	NC_014616	T	6	6	294409	294414	0 %	100 %	0 %	0 %	310286772
30	NC_014616	C	8	8	296613	296620	0 %	0 %	0 %	100 %	310286776
31	NC_014616	G	6	6	334992	334997	0 %	0 %	100 %	0 %	310286806
32	NC_014616	A	7	7	361205	361211	100 %	0 %	0 %	0 %	310286823
33	NC_014616	G	6	6	375325	375330	0 %	0 %	100 %	0 %	310286833
34	NC_014616	G	10	10	380455	380464	0 %	0 %	100 %	0 %	310286838
35	NC_014616	A	6	6	409044	409049	100 %	0 %	0 %	0 %	310286865
36	NC_014616	T	7	7	417814	417820	0 %	100 %	0 %	0 %	310286872
37	NC_014616	G	8	8	424331	424338	0 %	0 %	100 %	0 %	310286879
38	NC_014616	A	6	6	442984	442989	100 %	0 %	0 %	0 %	310286892
39	NC_014616	T	7	7	477027	477033	0 %	100 %	0 %	0 %	310286923
40	NC_014616	G	6	6	480268	480273	0 %	0 %	100 %	0 %	310286928
41	NC_014616	C	6	6	497783	497788	0 %	0 %	0 %	100 %	310286944
42	NC_014616	T	6	6	499516	499521	0 %	100 %	0 %	0 %	310286946
43	NC_014616	A	6	6	506669	506674	100 %	0 %	0 %	0 %	310286950
44	NC_014616	A	6	6	548869	548874	100 %	0 %	0 %	0 %	310286974
45	NC_014616	G	6	6	556633	556638	0 %	0 %	100 %	0 %	310286980
46	NC_014616	A	6	6	567043	567048	100 %	0 %	0 %	0 %	310286987
47	NC_014616	G	6	6	609393	609398	0 %	0 %	100 %	0 %	310287017
48	NC_014616	A	7	7	631975	631981	100 %	0 %	0 %	0 %	310287030
49	NC_014616	G	6	6	669046	669051	0 %	0 %	100 %	0 %	310287065
50	NC_014616	T	6	6	671542	671547	0 %	100 %	0 %	0 %	310287069
51	NC_014616	T	6	6	671739	671744	0 %	100 %	0 %	0 %	310287069
52	NC_014616	A	7	7	702612	702618	100 %	0 %	0 %	0 %	310287094
53	NC_014616	C	6	6	704879	704884	0 %	0 %	0 %	100 %	310287096
54	NC_014616	C	6	6	706425	706430	0 %	0 %	0 %	100 %	310287097
55	NC_014616	G	6	6	707450	707455	0 %	0 %	100 %	0 %	310287098
56	NC_014616	A	6	6	707578	707583	100 %	0 %	0 %	0 %	310287098
57	NC_014616	C	6	6	710531	710536	0 %	0 %	0 %	100 %	310287100
58	NC_014616	C	8	8	716464	716471	0 %	0 %	0 %	100 %	310287104
59	NC_014616	A	6	6	737309	737314	100 %	0 %	0 %	0 %	310287121
60	NC_014616	A	6	6	740758	740763	100 %	0 %	0 %	0 %	310287122
61	NC_014616	A	7	7	750300	750306	100 %	0 %	0 %	0 %	310287132
62	NC_014616	T	6	6	758126	758131	0 %	100 %	0 %	0 %	310287142
63	NC_014616	C	6	6	796341	796346	0 %	0 %	0 %	100 %	310287170
64	NC_014616	T	6	6	798448	798453	0 %	100 %	0 %	0 %	310287171
65	NC_014616	T	6	6	798492	798497	0 %	100 %	0 %	0 %	310287171
66	NC_014616	A	6	6	837349	837354	100 %	0 %	0 %	0 %	310287207
67	NC_014616	A	6	6	850059	850064	100 %	0 %	0 %	0 %	310287217
68	NC_014616	G	6	6	869269	869274	0 %	0 %	100 %	0 %	310287228
69	NC_014616	T	6	6	873063	873068	0 %	100 %	0 %	0 %	310287231
70	NC_014616	A	6	6	886933	886938	100 %	0 %	0 %	0 %	310287245
71	NC_014616	T	7	7	891353	891359	0 %	100 %	0 %	0 %	310287249
72	NC_014616	G	6	6	913399	913404	0 %	0 %	100 %	0 %	310287265
73	NC_014616	A	6	6	922738	922743	100 %	0 %	0 %	0 %	310287274
74	NC_014616	T	6	6	927751	927756	0 %	100 %	0 %	0 %	310287278
75	NC_014616	G	6	6	933465	933470	0 %	0 %	100 %	0 %	310287282
76	NC_014616	G	6	6	933608	933613	0 %	0 %	100 %	0 %	310287282
77	NC_014616	A	6	6	958639	958644	100 %	0 %	0 %	0 %	310287303
78	NC_014616	G	9	9	962254	962262	0 %	0 %	100 %	0 %	310287305
79	NC_014616	A	6	6	973388	973393	100 %	0 %	0 %	0 %	310287314
80	NC_014616	G	6	6	977195	977200	0 %	0 %	100 %	0 %	310287318
81	NC_014616	T	6	6	993785	993790	0 %	100 %	0 %	0 %	310287333
82	NC_014616	G	6	6	1001207	1001212	0 %	0 %	100 %	0 %	310287343
83	NC_014616	T	6	6	1016496	1016501	0 %	100 %	0 %	0 %	310287355
84	NC_014616	C	6	6	1016554	1016559	0 %	0 %	0 %	100 %	310287355
85	NC_014616	C	6	6	1022711	1022716	0 %	0 %	0 %	100 %	310287361
86	NC_014616	G	6	6	1025156	1025161	0 %	0 %	100 %	0 %	310287363
87	NC_014616	G	6	6	1032400	1032405	0 %	0 %	100 %	0 %	310287370
88	NC_014616	T	6	6	1072670	1072675	0 %	100 %	0 %	0 %	310287402
89	NC_014616	C	9	9	1072676	1072684	0 %	0 %	0 %	100 %	310287402
90	NC_014616	A	6	6	1076253	1076258	100 %	0 %	0 %	0 %	310287403
91	NC_014616	T	6	6	1088906	1088911	0 %	100 %	0 %	0 %	310287414
92	NC_014616	T	6	6	1101972	1101977	0 %	100 %	0 %	0 %	310287427
93	NC_014616	A	6	6	1104700	1104705	100 %	0 %	0 %	0 %	310287429
94	NC_014616	G	6	6	1120567	1120572	0 %	0 %	100 %	0 %	310287448
95	NC_014616	T	6	6	1150396	1150401	0 %	100 %	0 %	0 %	310287480
96	NC_014616	T	6	6	1166795	1166800	0 %	100 %	0 %	0 %	310287491
97	NC_014616	A	6	6	1195448	1195453	100 %	0 %	0 %	0 %	310287515
98	NC_014616	T	6	6	1205294	1205299	0 %	100 %	0 %	0 %	310287521
99	NC_014616	C	6	6	1271026	1271031	0 %	0 %	0 %	100 %	310287580
100	NC_014616	G	6	6	1287726	1287731	0 %	0 %	100 %	0 %	310287596
101	NC_014616	T	6	6	1306125	1306130	0 %	100 %	0 %	0 %	310287613
102	NC_014616	T	6	6	1306727	1306732	0 %	100 %	0 %	0 %	310287613
103	NC_014616	T	7	7	1306742	1306748	0 %	100 %	0 %	0 %	310287613
104	NC_014616	G	6	6	1318597	1318602	0 %	0 %	100 %	0 %	310287623
105	NC_014616	G	6	6	1319122	1319127	0 %	0 %	100 %	0 %	310287623
106	NC_014616	A	6	6	1348095	1348100	100 %	0 %	0 %	0 %	310287652
107	NC_014616	A	6	6	1352704	1352709	100 %	0 %	0 %	0 %	310287657
108	NC_014616	C	6	6	1358913	1358918	0 %	0 %	0 %	100 %	310287665
109	NC_014616	G	6	6	1375610	1375615	0 %	0 %	100 %	0 %	310287680
110	NC_014616	T	7	7	1384011	1384017	0 %	100 %	0 %	0 %	310287683
111	NC_014616	C	6	6	1410595	1410600	0 %	0 %	0 %	100 %	310287704
112	NC_014616	T	6	6	1427601	1427606	0 %	100 %	0 %	0 %	310287719
113	NC_014616	T	6	6	1428015	1428020	0 %	100 %	0 %	0 %	310287719
114	NC_014616	A	6	6	1432497	1432502	100 %	0 %	0 %	0 %	310287725
115	NC_014616	G	6	6	1436389	1436394	0 %	0 %	100 %	0 %	310287728
116	NC_014616	C	6	6	1447391	1447396	0 %	0 %	0 %	100 %	310287734
117	NC_014616	C	8	8	1465143	1465150	0 %	0 %	0 %	100 %	310287746
118	NC_014616	G	6	6	1471996	1472001	0 %	0 %	100 %	0 %	310287753
119	NC_014616	C	6	6	1475176	1475181	0 %	0 %	0 %	100 %	310287755
120	NC_014616	C	8	8	1510108	1510115	0 %	0 %	0 %	100 %	310287778
121	NC_014616	C	6	6	1511286	1511291	0 %	0 %	0 %	100 %	310287779
122	NC_014616	C	6	6	1527523	1527528	0 %	0 %	0 %	100 %	310287792
123	NC_014616	A	6	6	1530349	1530354	100 %	0 %	0 %	0 %	310287793
124	NC_014616	A	8	8	1533244	1533251	100 %	0 %	0 %	0 %	310287795
125	NC_014616	A	6	6	1550455	1550460	100 %	0 %	0 %	0 %	310287814
126	NC_014616	A	6	6	1572677	1572682	100 %	0 %	0 %	0 %	310287829
127	NC_014616	G	6	6	1627601	1627606	0 %	0 %	100 %	0 %	310287867
128	NC_014616	T	6	6	1627732	1627737	0 %	100 %	0 %	0 %	310287868
129	NC_014616	A	6	6	1693489	1693494	100 %	0 %	0 %	0 %	310287925
130	NC_014616	T	6	6	1700231	1700236	0 %	100 %	0 %	0 %	310287929
131	NC_014616	T	8	8	1709306	1709313	0 %	100 %	0 %	0 %	310287939
132	NC_014616	C	6	6	1713116	1713121	0 %	0 %	0 %	100 %	310287943
133	NC_014616	A	6	6	1762429	1762434	100 %	0 %	0 %	0 %	310287978
134	NC_014616	T	6	6	1783463	1783468	0 %	100 %	0 %	0 %	310287989
135	NC_014616	G	6	6	1808769	1808774	0 %	0 %	100 %	0 %	310288019
136	NC_014616	C	6	6	1870151	1870156	0 %	0 %	0 %	100 %	310288074
137	NC_014616	G	6	6	1880901	1880906	0 %	0 %	100 %	0 %	310288082
138	NC_014616	T	6	6	1890008	1890013	0 %	100 %	0 %	0 %	310288090
139	NC_014616	G	6	6	1902007	1902012	0 %	0 %	100 %	0 %	310288098
140	NC_014616	G	6	6	1961331	1961336	0 %	0 %	100 %	0 %	310288141
141	NC_014616	T	8	8	1996930	1996937	0 %	100 %	0 %	0 %	310288169
142	NC_014616	T	6	6	1997223	1997228	0 %	100 %	0 %	0 %	310288169
143	NC_014616	G	6	6	2000445	2000450	0 %	0 %	100 %	0 %	310288171
144	NC_014616	G	6	6	2010974	2010979	0 %	0 %	100 %	0 %	310288185
145	NC_014616	A	6	6	2013254	2013259	100 %	0 %	0 %	0 %	310288186
146	NC_014616	T	7	7	2020248	2020254	0 %	100 %	0 %	0 %	310288193
147	NC_014616	T	6	6	2028640	2028645	0 %	100 %	0 %	0 %	310288199
148	NC_014616	C	6	6	2042656	2042661	0 %	0 %	0 %	100 %	310288205
149	NC_014616	T	6	6	2069183	2069188	0 %	100 %	0 %	0 %	310288231
150	NC_014616	T	6	6	2070119	2070124	0 %	100 %	0 %	0 %	310288231
151	NC_014616	G	6	6	2076835	2076840	0 %	0 %	100 %	0 %	310288236
152	NC_014616	C	6	6	2139799	2139804	0 %	0 %	0 %	100 %	310288275
153	NC_014616	T	6	6	2147023	2147028	0 %	100 %	0 %	0 %	310288280
154	NC_014616	T	7	7	2156009	2156015	0 %	100 %	0 %	0 %	310288282

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.