MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Pantoea vagans C9-1 plasmid pPag1

Total Repeats: 331

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014561	TCAC	2	8	538	545	25 %	25 %	0 %	50 %	308185379
2	NC_014561	TTTC	2	8	920	927	0 %	75 %	0 %	25 %	308185379
3	NC_014561	TTCA	2	8	2490	2497	25 %	50 %	0 %	25 %	308185381
4	NC_014561	CACC	2	8	2711	2718	25 %	0 %	0 %	75 %	308185381
5	NC_014561	ATTC	2	8	2778	2785	25 %	50 %	0 %	25 %	308185381
6	NC_014561	CAAT	2	8	2827	2834	50 %	25 %	0 %	25 %	308185381
7	NC_014561	CCAG	2	8	3998	4005	25 %	0 %	25 %	50 %	308185383
8	NC_014561	GTTT	2	8	4532	4539	0 %	75 %	25 %	0 %	308185384
9	NC_014561	TCAG	2	8	4695	4702	25 %	25 %	25 %	25 %	308185384
10	NC_014561	CAGC	2	8	5035	5042	25 %	0 %	25 %	50 %	308185385
11	NC_014561	TCCA	2	8	5749	5756	25 %	25 %	0 %	50 %	308185386
12	NC_014561	CCAG	2	8	6958	6965	25 %	0 %	25 %	50 %	308185388
13	NC_014561	CGAT	2	8	7092	7099	25 %	25 %	25 %	25 %	308185388
14	NC_014561	CAGT	2	8	7618	7625	25 %	25 %	25 %	25 %	308185388
15	NC_014561	CTGC	2	8	9498	9505	0 %	25 %	25 %	50 %	308185390
16	NC_014561	GTCA	2	8	11102	11109	25 %	25 %	25 %	25 %	308185391
17	NC_014561	GATG	2	8	11731	11738	25 %	25 %	50 %	0 %	308185391
18	NC_014561	GCAG	2	8	11803	11810	25 %	0 %	50 %	25 %	308185391
19	NC_014561	TTAT	2	8	12653	12660	25 %	75 %	0 %	0 %	308185392
20	NC_014561	TACC	2	8	12663	12670	25 %	25 %	0 %	50 %	308185392
21	NC_014561	AGAT	2	8	13230	13237	50 %	25 %	25 %	0 %	308185392
22	NC_014561	GCTG	2	8	13366	13373	0 %	25 %	50 %	25 %	308185392
23	NC_014561	CCCG	2	8	13608	13615	0 %	0 %	25 %	75 %	308185392
24	NC_014561	GGCG	2	8	13651	13658	0 %	0 %	75 %	25 %	308185392
25	NC_014561	CTGA	2	8	14667	14674	25 %	25 %	25 %	25 %	308185393
26	NC_014561	GTCA	2	8	16103	16110	25 %	25 %	25 %	25 %	308185394
27	NC_014561	CAGC	2	8	16213	16220	25 %	0 %	25 %	50 %	308185394
28	NC_014561	CATC	2	8	16306	16313	25 %	25 %	0 %	50 %	308185394
29	NC_014561	CACC	2	8	17041	17048	25 %	0 %	0 %	75 %	308185396
30	NC_014561	AGCG	2	8	17199	17206	25 %	0 %	50 %	25 %	308185396
31	NC_014561	CAGA	2	8	17723	17730	50 %	0 %	25 %	25 %	308185396
32	NC_014561	CGGA	2	8	17801	17808	25 %	0 %	50 %	25 %	308185396
33	NC_014561	AAGC	2	8	18292	18299	50 %	0 %	25 %	25 %	308185396
34	NC_014561	TGGT	2	8	18441	18448	0 %	50 %	50 %	0 %	308185396
35	NC_014561	ATGA	2	8	19896	19903	50 %	25 %	25 %	0 %	308185397
36	NC_014561	TCTG	2	8	20847	20854	0 %	50 %	25 %	25 %	308185398
37	NC_014561	GCCA	2	8	21052	21059	25 %	0 %	25 %	50 %	308185399
38	NC_014561	TCAG	2	8	22289	22296	25 %	25 %	25 %	25 %	308185401
39	NC_014561	CTGG	2	8	22476	22483	0 %	25 %	50 %	25 %	308185401
40	NC_014561	ATCG	2	8	24277	24284	25 %	25 %	25 %	25 %	308185401
41	NC_014561	GGCA	2	8	24546	24553	25 %	0 %	50 %	25 %	308185401
42	NC_014561	TGGC	2	8	25843	25850	0 %	25 %	50 %	25 %	308185402
43	NC_014561	GCCT	2	8	26486	26493	0 %	25 %	25 %	50 %	308185404
44	NC_014561	CAGC	3	12	26514	26525	25 %	0 %	25 %	50 %	308185404
45	NC_014561	GGAA	2	8	26757	26764	50 %	0 %	50 %	0 %	308185404
46	NC_014561	GCCA	2	8	26794	26801	25 %	0 %	25 %	50 %	308185404
47	NC_014561	GCTG	2	8	27173	27180	0 %	25 %	50 %	25 %	308185404
48	NC_014561	ACTG	2	8	27294	27301	25 %	25 %	25 %	25 %	308185404
49	NC_014561	GGCC	2	8	28080	28087	0 %	0 %	50 %	50 %	308185404
50	NC_014561	GATC	2	8	29887	29894	25 %	25 %	25 %	25 %	308185406
51	NC_014561	TTCG	2	8	30117	30124	0 %	50 %	25 %	25 %	308185406
52	NC_014561	TCCG	2	8	30283	30290	0 %	25 %	25 %	50 %	308185406
53	NC_014561	GGAG	2	8	31743	31750	25 %	0 %	75 %	0 %	308185408
54	NC_014561	CCGT	2	8	32504	32511	0 %	25 %	25 %	50 %	308185409
55	NC_014561	AGCG	2	8	33218	33225	25 %	0 %	50 %	25 %	308185409
56	NC_014561	CCGC	2	8	33638	33645	0 %	0 %	25 %	75 %	308185409
57	NC_014561	TCTG	2	8	33672	33679	0 %	50 %	25 %	25 %	308185409
58	NC_014561	GCTG	2	8	33793	33800	0 %	25 %	50 %	25 %	308185409
59	NC_014561	AGAT	2	8	34246	34253	50 %	25 %	25 %	0 %	308185411
60	NC_014561	GGCA	2	8	37128	37135	25 %	0 %	50 %	25 %	308185415
61	NC_014561	ATGT	2	8	37559	37566	25 %	50 %	25 %	0 %	308185416
62	NC_014561	GCTG	2	8	38420	38427	0 %	25 %	50 %	25 %	308185417
63	NC_014561	GCAG	2	8	38704	38711	25 %	0 %	50 %	25 %	308185419
64	NC_014561	AGGA	2	8	39278	39285	50 %	0 %	50 %	0 %	308185420
65	NC_014561	CCTG	2	8	40706	40713	0 %	25 %	25 %	50 %	308185422
66	NC_014561	CTCG	2	8	40717	40724	0 %	25 %	25 %	50 %	308185422
67	NC_014561	CTGG	2	8	41144	41151	0 %	25 %	50 %	25 %	308185422
68	NC_014561	CCTG	2	8	41213	41220	0 %	25 %	25 %	50 %	308185422
69	NC_014561	GCGG	3	12	41231	41242	0 %	0 %	75 %	25 %	308185422
70	NC_014561	GCTG	2	8	41371	41378	0 %	25 %	50 %	25 %	308185422
71	NC_014561	ATGT	2	8	41403	41410	25 %	50 %	25 %	0 %	308185422
72	NC_014561	ATTC	2	8	41480	41487	25 %	50 %	0 %	25 %	308185422
73	NC_014561	TGTC	2	8	41510	41517	0 %	50 %	25 %	25 %	308185422
74	NC_014561	GTGC	2	8	42066	42073	0 %	25 %	50 %	25 %	308185422
75	NC_014561	GGGC	2	8	42391	42398	0 %	0 %	75 %	25 %	308185422
76	NC_014561	AGCC	2	8	45256	45263	25 %	0 %	25 %	50 %	308185425
77	NC_014561	GCTG	2	8	45971	45978	0 %	25 %	50 %	25 %	308185426
78	NC_014561	CAGC	2	8	46144	46151	25 %	0 %	25 %	50 %	308185426
79	NC_014561	CTGC	2	8	46455	46462	0 %	25 %	25 %	50 %	308185426
80	NC_014561	CATG	2	8	47085	47092	25 %	25 %	25 %	25 %	308185426
81	NC_014561	ACGC	2	8	48196	48203	25 %	0 %	25 %	50 %	308185427
82	NC_014561	GGCG	2	8	48574	48581	0 %	0 %	75 %	25 %	308185428
83	NC_014561	AAAC	2	8	48739	48746	75 %	0 %	0 %	25 %	308185428
84	NC_014561	GAAG	2	8	48815	48822	50 %	0 %	50 %	0 %	308185428
85	NC_014561	TGGA	2	8	49433	49440	25 %	25 %	50 %	0 %	308185428
86	NC_014561	CGCT	2	8	50231	50238	0 %	25 %	25 %	50 %	308185429
87	NC_014561	ATCA	2	8	51112	51119	50 %	25 %	0 %	25 %	308185430
88	NC_014561	GTCG	2	8	51306	51313	0 %	25 %	50 %	25 %	308185430
89	NC_014561	AGTG	2	8	52579	52586	25 %	25 %	50 %	0 %	308185432
90	NC_014561	ACCA	2	8	52638	52645	50 %	0 %	0 %	50 %	308185432
91	NC_014561	CAGC	2	8	53346	53353	25 %	0 %	25 %	50 %	308185432
92	NC_014561	CGAT	2	8	53377	53384	25 %	25 %	25 %	25 %	308185432
93	NC_014561	TCAT	2	8	54245	54252	25 %	50 %	0 %	25 %	308185433
94	NC_014561	GATC	2	8	54489	54496	25 %	25 %	25 %	25 %	308185433
95	NC_014561	CAAT	2	8	54528	54535	50 %	25 %	0 %	25 %	308185433
96	NC_014561	AGCC	2	8	54632	54639	25 %	0 %	25 %	50 %	308185433
97	NC_014561	TCAC	2	8	54857	54864	25 %	25 %	0 %	50 %	308185433
98	NC_014561	CGAA	2	8	54865	54872	50 %	0 %	25 %	25 %	308185433
99	NC_014561	CTAT	2	8	55213	55220	25 %	50 %	0 %	25 %	308185434
100	NC_014561	CCCA	2	8	55513	55520	25 %	0 %	0 %	75 %	308185434
101	NC_014561	CCTG	2	8	55918	55925	0 %	25 %	25 %	50 %	308185434
102	NC_014561	GGAT	2	8	56008	56015	25 %	25 %	50 %	0 %	308185434
103	NC_014561	CTTC	2	8	56077	56084	0 %	50 %	0 %	50 %	308185434
104	NC_014561	GGTC	2	8	56141	56148	0 %	25 %	50 %	25 %	308185434
105	NC_014561	AGTG	2	8	56681	56688	25 %	25 %	50 %	0 %	308185435
106	NC_014561	TCGC	2	8	56699	56706	0 %	25 %	25 %	50 %	308185435
107	NC_014561	CAGG	2	8	56710	56717	25 %	0 %	50 %	25 %	308185435
108	NC_014561	AGCC	2	8	57324	57331	25 %	0 %	25 %	50 %	308185435
109	NC_014561	GCAG	2	8	57600	57607	25 %	0 %	50 %	25 %	308185435
110	NC_014561	GCCG	2	8	57905	57912	0 %	0 %	50 %	50 %	308185435
111	NC_014561	TTTC	2	8	58194	58201	0 %	75 %	0 %	25 %	308185436
112	NC_014561	CGCC	2	8	58388	58395	0 %	0 %	25 %	75 %	308185436
113	NC_014561	ACAT	2	8	60489	60496	50 %	25 %	0 %	25 %	308185437
114	NC_014561	CCGG	2	8	61740	61747	0 %	0 %	50 %	50 %	308185438
115	NC_014561	TCGT	2	8	62917	62924	0 %	50 %	25 %	25 %	308185440
116	NC_014561	CTGC	2	8	63095	63102	0 %	25 %	25 %	50 %	308185440
117	NC_014561	CGGG	2	8	63727	63734	0 %	0 %	75 %	25 %	308185440
118	NC_014561	GTCA	2	8	63796	63803	25 %	25 %	25 %	25 %	308185440
119	NC_014561	GGTC	2	8	64704	64711	0 %	25 %	50 %	25 %	308185441
120	NC_014561	TGAC	2	8	65006	65013	25 %	25 %	25 %	25 %	308185441
121	NC_014561	GAAC	2	8	65352	65359	50 %	0 %	25 %	25 %	308185441
122	NC_014561	AGGG	2	8	65580	65587	25 %	0 %	75 %	0 %	308185441
123	NC_014561	CCGG	2	8	65968	65975	0 %	0 %	50 %	50 %	308185442
124	NC_014561	GCTG	2	8	66127	66134	0 %	25 %	50 %	25 %	308185442
125	NC_014561	GCCC	2	8	66151	66158	0 %	0 %	25 %	75 %	308185442
126	NC_014561	CTGC	2	8	66593	66600	0 %	25 %	25 %	50 %	308185443
127	NC_014561	GCCA	2	8	66695	66702	25 %	0 %	25 %	50 %	308185443
128	NC_014561	CGAA	2	8	66714	66721	50 %	0 %	25 %	25 %	308185443
129	NC_014561	CTTC	2	8	66758	66765	0 %	50 %	0 %	50 %	308185443
130	NC_014561	AACC	2	8	67031	67038	50 %	0 %	0 %	50 %	308185443
131	NC_014561	GATG	2	8	67136	67143	25 %	25 %	50 %	0 %	308185443
132	NC_014561	CAGC	2	8	67533	67540	25 %	0 %	25 %	50 %	308185443
133	NC_014561	GCCC	2	8	67818	67825	0 %	0 %	25 %	75 %	308185443
134	NC_014561	CGCC	2	8	68311	68318	0 %	0 %	25 %	75 %	308185444
135	NC_014561	AGCC	2	8	69091	69098	25 %	0 %	25 %	50 %	308185446
136	NC_014561	AGCC	2	8	69562	69569	25 %	0 %	25 %	50 %	308185446
137	NC_014561	GCCA	2	8	69790	69797	25 %	0 %	25 %	50 %	308185446
138	NC_014561	GCCA	2	8	70153	70160	25 %	0 %	25 %	50 %	308185446
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319	NC_014561	TGGT	2	8	155128	155135	0 %	50 %	50 %	0 %	308185530
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.