MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Pantoea vagans C9-1 plasmid pPag1

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014561	GC	3	6	6334	6339	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_014561	AG	3	6	6402	6407	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014561	GA	3	6	6422	6427	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014561	AT	3	6	8156	8161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014561	CA	4	8	8219	8226	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_014561	CT	3	6	9940	9945	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_014561	TC	3	6	10292	10297	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_014561	CA	3	6	12563	12568	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_014561	TC	3	6	14548	14553	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_014561	CT	3	6	16779	16784	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_014561	GT	3	6	21344	21349	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014561	AG	4	8	25249	25256	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014561	GC	3	6	26322	26327	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_014561	AC	3	6	26399	26404	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_014561	GA	3	6	35200	35205	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014561	CA	3	6	35670	35675	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_014561	TA	3	6	38052	38057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014561	TA	3	6	39814	39819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014561	AC	3	6	40091	40096	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_014561	CG	3	6	43002	43007	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_014561	AT	3	6	55022	55027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014561	GC	3	6	55131	55136	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_014561	TA	3	6	59343	59348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014561	GC	4	8	62053	62060	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_014561	AG	4	8	62641	62648	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014561	AG	3	6	62684	62689	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014561	AG	3	6	64674	64679	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014561	CG	3	6	75647	75652	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_014561	TA	3	6	79672	79677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014561	AC	3	6	80624	80629	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_014561	TC	3	6	80853	80858	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_014561	TA	3	6	85138	85143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014561	CT	3	6	85197	85202	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_014561	CT	3	6	85916	85921	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_014561	GT	3	6	86076	86081	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014561	CT	3	6	86122	86127	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_014561	CT	3	6	86324	86329	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_014561	TA	3	6	92122	92127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014561	CT	3	6	98775	98780	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_014561	TA	4	8	99011	99018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014561	GC	3	6	112009	112014	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_014561	CA	3	6	129623	129628	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_014561	GC	3	6	131257	131262	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_014561	CA	3	6	135844	135849	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_014561	CG	3	6	139040	139045	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_014561	CT	3	6	139719	139724	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_014561	GT	3	6	142937	142942	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014561	CG	3	6	143822	143827	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_014561	TA	3	6	144421	144426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014561	GT	3	6	148988	148993	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014561	AG	3	6	160984	160989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014561	TG	3	6	161035	161040	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014561	TA	3	6	163554	163559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014561	CT	3	6	163697	163702	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_014561	AG	3	6	163951	163956	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014561	TG	3	6	164163	164168	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014561	GA	3	6	166710	166715	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014561	CT	3	6	166976	166981	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_014561	TC	3	6	167360	167365	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.