MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori SJM180 chromosome

Total Repeats: 552

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014560	GTTT	2	8	2427	2434	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014560	ATGC	2	8	4280	4287	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014560	GTTT	2	8	7535	7542	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014560	ATAA	2	8	9759	9766	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014560	TATT	2	8	9959	9966	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014560	TTAA	2	8	13785	13792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014560	AATC	2	8	22826	22833	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_014560	TTTA	2	8	23193	23200	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014560	ATTA	2	8	25582	25589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014560	GGTT	2	8	31982	31989	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014560	CAAA	2	8	44267	44274	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_014560	AAAC	2	8	44437	44444	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_014560	CTGT	2	8	44542	44549	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_014560	AAAT	2	8	44641	44648	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014560	GATT	2	8	44727	44734	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014560	TTTC	2	8	44934	44941	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014560	AAAG	2	8	51376	51383	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014560	AATC	2	8	51498	51505	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_014560	AAAT	2	8	51736	51743	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014560	TTTA	2	8	61345	61352	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014560	ACAA	2	8	61645	61652	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_014560	CTAG	2	8	62310	62317	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_014560	CTAA	2	8	62436	62443	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_014560	CAAG	2	8	64650	64657	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_014560	AAAG	2	8	64948	64955	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014560	TGCT	2	8	65110	65117	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_014560	GAGC	3	12	65636	65647	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_014560	GAAA	2	8	65907	65914	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014560	AGAT	2	8	66212	66219	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014560	ACAA	2	8	66380	66387	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_014560	CATT	2	8	66410	66417	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_014560	AGCG	2	8	68178	68185	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_014560	AGCG	2	8	68277	68284	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_014560	GATA	2	8	68289	68296	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014560	TTGC	2	8	70239	70246	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_014560	TTTA	2	8	70438	70445	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014560	CAAA	2	8	75880	75887	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_014560	TAGA	2	8	80730	80737	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014560	ATTT	2	8	82421	82428	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014560	GTTT	2	8	84396	84403	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014560	AACT	2	8	86667	86674	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_014560	TATT	2	8	90056	90063	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014560	AAAC	2	8	95344	95351	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_014560	GGTG	2	8	97122	97129	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014560	TCCC	2	8	97192	97199	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
46	NC_014560	AAAG	2	8	99724	99731	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014560	TTCA	2	8	102741	102748	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_014560	ATCA	2	8	111002	111009	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_014560	AATA	2	8	111156	111163	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014560	TAAT	2	8	115656	115663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014560	AAGC	2	8	116533	116540	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_014560	CCGC	2	8	116556	116563	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
53	NC_014560	AAAT	2	8	118476	118483	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014560	ATTT	2	8	120003	120010	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014560	TCAT	2	8	124700	124707	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_014560	GTTA	2	8	131966	131973	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014560	AAAG	2	8	134873	134880	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014560	AAAG	2	8	135369	135376	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014560	GAAG	2	8	135426	135433	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014560	AATC	2	8	136596	136603	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_014560	CTAT	2	8	137212	137219	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_014560	TAGC	2	8	138355	138362	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_014560	CTTT	2	8	138383	138390	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_014560	TCTT	2	8	143396	143403	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_014560	AGTT	2	8	147284	147291	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014560	TAAG	2	8	147300	147307	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014560	ATTT	2	8	165773	165780	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014560	AAGC	2	8	171309	171316	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_014560	ATTG	2	8	174313	174320	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014560	TTTA	2	8	181138	181145	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014560	TTTC	2	8	181198	181205	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_014560	TTGA	2	8	181276	181283	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014560	GATT	2	8	189174	189181	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014560	CATT	2	8	194385	194392	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_014560	TGCA	2	8	196294	196301	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_014560	CAAC	2	8	209989	209996	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_014560	TTTG	2	8	210906	210913	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014560	TTTC	2	8	211080	211087	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_014560	CTGG	2	8	211496	211503	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_014560	TGGC	2	8	211518	211525	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_014560	TAAA	2	8	211902	211909	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014560	ACAT	2	8	211945	211952	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_014560	TGAT	2	8	212024	212031	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014560	GTTT	2	8	212161	212168	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014560	TTTG	2	8	212424	212431	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014560	TTGT	2	8	212441	212448	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014560	ATCT	2	8	212602	212609	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_014560	TTTG	2	8	213093	213100	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014560	GCTC	2	8	213276	213283	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_014560	GTTT	2	8	216315	216322	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014560	TTTA	2	8	217804	217811	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014560	GTTG	2	8	220973	220980	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014560	ATCC	2	8	228295	228302	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_014560	ATCA	2	8	229120	229127	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_014560	TATT	2	8	229855	229862	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014560	ATTT	2	8	235828	235835	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014560	TTTA	2	8	242397	242404	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014560	AGCG	2	8	246619	246626	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_014560	AACA	2	8	247102	247109	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_014560	TCCC	2	8	249761	249768	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
101	NC_014560	CATT	2	8	260959	260966	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_014560	TAAT	2	8	263630	263637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014560	TGAT	2	8	271749	271756	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014560	AAAT	2	8	289391	289398	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014560	CATT	2	8	311684	311691	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_014560	AACA	2	8	315399	315406	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_014560	TCAG	2	8	323743	323750	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_014560	AAAT	2	8	323773	323780	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014560	ATGC	2	8	326456	326463	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_014560	GCGT	2	8	330979	330986	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_014560	AAAG	2	8	331150	331157	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014560	TTAA	2	8	332201	332208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014560	ACTA	2	8	332222	332229	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_014560	TTGG	2	8	337725	337732	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014560	GGTT	2	8	339886	339893	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014560	AAAT	2	8	346030	346037	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014560	TAAC	2	8	348122	348129	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_014560	TTTA	2	8	351421	351428	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014560	TTTA	2	8	351431	351438	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014560	CTAA	2	8	351547	351554	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_014560	CTAA	2	8	351557	351564	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_014560	CTAA	2	8	351567	351574	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_014560	CTAA	2	8	351577	351584	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_014560	CTAA	2	8	351587	351594	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_014560	CTAA	2	8	351597	351604	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_014560	CTAA	2	8	351607	351614	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_014560	TGAA	2	8	355942	355949	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014560	AGAA	2	8	364982	364989	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014560	TAAA	2	8	366346	366353	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014560	TTAA	2	8	377964	377971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014560	TAAA	2	8	377975	377982	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014560	TCAA	2	8	379585	379592	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_014560	CAAG	2	8	382458	382465	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_014560	TTAT	2	8	382500	382507	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014560	TTTG	2	8	382566	382573	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014560	CAAA	2	8	388002	388009	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_014560	GTTT	2	8	394932	394939	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014560	TTTC	2	8	399236	399243	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_014560	GGGT	2	8	401126	401133	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014560	GAAA	2	8	401183	401190	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014560	AACA	2	8	401196	401203	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_014560	GTTT	2	8	406565	406572	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014560	TTGA	2	8	411880	411887	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014560	AGGG	2	8	413992	413999	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014560	CCAA	2	8	415357	415364	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_014560	AAAT	2	8	416417	416424	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014560	AAAT	2	8	422152	422159	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014560	AAGG	2	8	429508	429515	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014560	TCAA	2	8	433658	433665	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_014560	CAAT	2	8	435038	435045	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_014560	ACCC	2	8	438365	438372	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
152	NC_014560	ATTT	2	8	441379	441386	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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