MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori SJM180 chromosome

Total Repeats: 2310

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014560	CT	3	6	703	708	0 %	50 %	0 %	50 %	308183798
2	NC_014560	TC	3	6	1285	1290	0 %	50 %	0 %	50 %	308183799
3	NC_014560	CT	3	6	1561	1566	0 %	50 %	0 %	50 %	308183799
4	NC_014560	TG	3	6	2520	2525	0 %	50 %	50 %	0 %	308183801
5	NC_014560	GC	3	6	2790	2795	0 %	0 %	50 %	50 %	308183801
6	NC_014560	AG	3	6	2947	2952	50 %	0 %	50 %	0 %	308183801
7	NC_014560	TG	3	6	3429	3434	0 %	50 %	50 %	0 %	308183802
8	NC_014560	TC	3	6	4977	4982	0 %	50 %	0 %	50 %	308183803
9	NC_014560	GC	3	6	6185	6190	0 %	0 %	50 %	50 %	308183806
10	NC_014560	AC	3	6	6611	6616	50 %	0 %	0 %	50 %	308183806
11	NC_014560	GA	7	14	7364	7377	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014560	GC	3	6	8029	8034	0 %	0 %	50 %	50 %	308183808
13	NC_014560	AG	3	6	8241	8246	50 %	0 %	50 %	0 %	308183808
14	NC_014560	AG	3	6	10437	10442	50 %	0 %	50 %	0 %	308183810
15	NC_014560	AG	3	6	11832	11837	50 %	0 %	50 %	0 %	308183811
16	NC_014560	AG	3	6	11892	11897	50 %	0 %	50 %	0 %	308183811
17	NC_014560	AG	3	6	12729	12734	50 %	0 %	50 %	0 %	308183811
18	NC_014560	GA	3	6	12900	12905	50 %	0 %	50 %	0 %	308183812
19	NC_014560	TG	3	6	13974	13979	0 %	50 %	50 %	0 %	308183813
20	NC_014560	GC	3	6	14617	14622	0 %	0 %	50 %	50 %	308183815
21	NC_014560	GC	3	6	14753	14758	0 %	0 %	50 %	50 %	308183815
22	NC_014560	TC	3	6	14794	14799	0 %	50 %	0 %	50 %	308183815
23	NC_014560	TC	3	6	14832	14837	0 %	50 %	0 %	50 %	308183815
24	NC_014560	AG	4	8	15219	15226	50 %	0 %	50 %	0 %	308183815
25	NC_014560	CA	3	6	16773	16778	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_014560	GC	3	6	17284	17289	0 %	0 %	50 %	50 %	308183816
27	NC_014560	CG	3	6	17390	17395	0 %	0 %	50 %	50 %	308183816
28	NC_014560	AG	3	6	18673	18678	50 %	0 %	50 %	0 %	308183817
29	NC_014560	AG	3	6	19472	19477	50 %	0 %	50 %	0 %	308183818
30	NC_014560	GA	3	6	19663	19668	50 %	0 %	50 %	0 %	308183818
31	NC_014560	AG	3	6	22170	22175	50 %	0 %	50 %	0 %	308183820
32	NC_014560	GA	3	6	23325	23330	50 %	0 %	50 %	0 %	308183822
33	NC_014560	CG	3	6	24194	24199	0 %	0 %	50 %	50 %	308183823
34	NC_014560	TC	3	6	24261	24266	0 %	50 %	0 %	50 %	308183823
35	NC_014560	AT	3	6	24652	24657	50 %	50 %	0 %	0 %	308183823
36	NC_014560	GT	3	6	25029	25034	0 %	50 %	50 %	0 %	308183823
37	NC_014560	GC	3	6	26397	26402	0 %	0 %	50 %	50 %	308183826
38	NC_014560	GC	3	6	26792	26797	0 %	0 %	50 %	50 %	308183826
39	NC_014560	AC	3	6	26950	26955	50 %	0 %	0 %	50 %	308183826
40	NC_014560	AG	3	6	26960	26965	50 %	0 %	50 %	0 %	308183826
41	NC_014560	CA	3	6	27111	27116	50 %	0 %	0 %	50 %	308183826
42	NC_014560	TA	3	6	27510	27515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014560	TG	3	6	27969	27974	0 %	50 %	50 %	0 %	308183827
44	NC_014560	AG	3	6	28209	28214	50 %	0 %	50 %	0 %	308183827
45	NC_014560	AG	3	6	29320	29325	50 %	0 %	50 %	0 %	308183828
46	NC_014560	TC	3	6	30203	30208	0 %	50 %	0 %	50 %	308183830
47	NC_014560	TC	3	6	31254	31259	0 %	50 %	0 %	50 %	308183830
48	NC_014560	AT	3	6	32603	32608	50 %	50 %	0 %	0 %	308183832
49	NC_014560	GA	3	6	34743	34748	50 %	0 %	50 %	0 %	308183833
50	NC_014560	AG	3	6	35015	35020	50 %	0 %	50 %	0 %	308183834
51	NC_014560	CT	3	6	36880	36885	0 %	50 %	0 %	50 %	308183837
52	NC_014560	TG	3	6	36993	36998	0 %	50 %	50 %	0 %	308183837
53	NC_014560	TG	3	6	37077	37082	0 %	50 %	50 %	0 %	308183837
54	NC_014560	AT	3	6	37434	37439	50 %	50 %	0 %	0 %	308183837
55	NC_014560	GA	3	6	37745	37750	50 %	0 %	50 %	0 %	308183838
56	NC_014560	GA	3	6	38107	38112	50 %	0 %	50 %	0 %	308183839
57	NC_014560	AG	3	6	38241	38246	50 %	0 %	50 %	0 %	308183839
58	NC_014560	CT	3	6	39224	39229	0 %	50 %	0 %	50 %	308183840
59	NC_014560	CT	3	6	39296	39301	0 %	50 %	0 %	50 %	308183840
60	NC_014560	AG	3	6	40503	40508	50 %	0 %	50 %	0 %	308183841
61	NC_014560	AG	3	6	40560	40565	50 %	0 %	50 %	0 %	308183841
62	NC_014560	AG	3	6	40643	40648	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014560	TG	3	6	40826	40831	0 %	50 %	50 %	0 %	308183842
64	NC_014560	AG	3	6	40907	40912	50 %	0 %	50 %	0 %	308183842
65	NC_014560	AG	3	6	42625	42630	50 %	0 %	50 %	0 %	308183843
66	NC_014560	AG	3	6	43603	43608	50 %	0 %	50 %	0 %	308183844
67	NC_014560	GT	3	6	44343	44348	0 %	50 %	50 %	0 %	308183845
68	NC_014560	AG	4	8	44457	44464	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014560	TC	3	6	44507	44512	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_014560	AG	3	6	44997	45002	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014560	AC	3	6	46347	46352	50 %	0 %	0 %	50 %	308183848
72	NC_014560	AG	3	6	47636	47641	50 %	0 %	50 %	0 %	308183848
73	NC_014560	GT	3	6	48372	48377	0 %	50 %	50 %	0 %	308183849
74	NC_014560	TG	3	6	49475	49480	0 %	50 %	50 %	0 %	308183850
75	NC_014560	GT	3	6	50235	50240	0 %	50 %	50 %	0 %	308183851
76	NC_014560	TA	3	6	50776	50781	50 %	50 %	0 %	0 %	308183851
77	NC_014560	AC	3	6	52246	52251	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_014560	AT	3	6	52732	52737	50 %	50 %	0 %	0 %	308183852
79	NC_014560	TG	3	6	52876	52881	0 %	50 %	50 %	0 %	308183852
80	NC_014560	CG	3	6	53680	53685	0 %	0 %	50 %	50 %	308183852
81	NC_014560	TA	3	6	54676	54681	50 %	50 %	0 %	0 %	308183853
82	NC_014560	CT	3	6	54816	54821	0 %	50 %	0 %	50 %	308183853
83	NC_014560	CT	3	6	55244	55249	0 %	50 %	0 %	50 %	308183853
84	NC_014560	AG	3	6	56446	56451	50 %	0 %	50 %	0 %	308183854
85	NC_014560	TG	3	6	57510	57515	0 %	50 %	50 %	0 %	308183854
86	NC_014560	CG	3	6	58332	58337	0 %	0 %	50 %	50 %	308183855
87	NC_014560	GT	3	6	58351	58356	0 %	50 %	50 %	0 %	308183855
88	NC_014560	CT	3	6	60964	60969	0 %	50 %	0 %	50 %	308183855
89	NC_014560	TC	3	6	62173	62178	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_014560	CA	3	6	62567	62572	50 %	0 %	0 %	50 %	308183858
91	NC_014560	AT	3	6	62996	63001	50 %	50 %	0 %	0 %	308183858
92	NC_014560	TC	3	6	63202	63207	0 %	50 %	0 %	50 %	308183859
93	NC_014560	TA	3	6	63391	63396	50 %	50 %	0 %	0 %	308183859
94	NC_014560	CG	3	6	63857	63862	0 %	0 %	50 %	50 %	308183859
95	NC_014560	AG	3	6	64436	64441	50 %	0 %	50 %	0 %	308183860
96	NC_014560	GC	3	6	65011	65016	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_014560	CT	3	6	65116	65121	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_014560	AG	4	8	65545	65552	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014560	GC	3	6	65995	66000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_014560	AG	3	6	66546	66551	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014560	TC	3	6	66751	66756	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_014560	GT	3	6	66838	66843	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014560	AG	3	6	67733	67738	50 %	0 %	50 %	0 %	308183862
104	NC_014560	GA	3	6	68016	68021	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014560	TC	3	6	68048	68053	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_014560	AG	3	6	68782	68787	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014560	GA	3	6	69178	69183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014560	AC	3	6	69205	69210	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_014560	AG	3	6	69441	69446	50 %	0 %	50 %	0 %	308183863
110	NC_014560	AG	3	6	70065	70070	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014560	TA	3	6	70279	70284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014560	GC	3	6	70340	70345	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_014560	AG	3	6	70918	70923	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014560	GT	3	6	70996	71001	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014560	AG	3	6	71400	71405	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014560	AG	3	6	72466	72471	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014560	AG	3	6	72478	72483	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014560	AG	3	6	72490	72495	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014560	CT	3	6	72706	72711	0 %	50 %	0 %	50 %	308183865
120	NC_014560	CT	3	6	73791	73796	0 %	50 %	0 %	50 %	308183866
121	NC_014560	AG	3	6	74520	74525	50 %	0 %	50 %	0 %	308183867
122	NC_014560	GA	4	8	75103	75110	50 %	0 %	50 %	0 %	308183868
123	NC_014560	AG	3	6	76013	76018	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014560	TG	3	6	77074	77079	0 %	50 %	50 %	0 %	308183870
125	NC_014560	TG	4	8	77412	77419	0 %	50 %	50 %	0 %	308183870
126	NC_014560	TA	3	6	81145	81150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014560	GC	3	6	81995	82000	0 %	0 %	50 %	50 %	308183875
128	NC_014560	TA	3	6	82388	82393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014560	GT	3	6	82661	82666	0 %	50 %	50 %	0 %	308183876
130	NC_014560	AC	3	6	83147	83152	50 %	0 %	0 %	50 %	308183877
131	NC_014560	CT	3	6	83334	83339	0 %	50 %	0 %	50 %	308183877
132	NC_014560	GA	3	6	84070	84075	50 %	0 %	50 %	0 %	308183877
133	NC_014560	TC	3	6	84335	84340	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_014560	TC	3	6	84361	84366	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_014560	GA	3	6	87187	87192	50 %	0 %	50 %	0 %	308183880
136	NC_014560	GC	3	6	88270	88275	0 %	0 %	50 %	50 %	308183880
137	NC_014560	AG	3	6	88535	88540	50 %	0 %	50 %	0 %	308183880
138	NC_014560	CA	3	6	88762	88767	50 %	0 %	0 %	50 %	308183880
139	NC_014560	AG	3	6	88905	88910	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014560	AG	3	6	90582	90587	50 %	0 %	50 %	0 %	308183884
141	NC_014560	TG	3	6	91947	91952	0 %	50 %	50 %	0 %	308183885
142	NC_014560	TG	3	6	92591	92596	0 %	50 %	50 %	0 %	308183885
143	NC_014560	CT	3	6	92918	92923	0 %	50 %	0 %	50 %	308183885
144	NC_014560	CT	3	6	95046	95051	0 %	50 %	0 %	50 %	308183886
145	NC_014560	CA	3	6	95497	95502	50 %	0 %	0 %	50 %	308183887
146	NC_014560	AC	3	6	96159	96164	50 %	0 %	0 %	50 %	308183888
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