MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III plasmid pST-III

Total Repeats: 153

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014558	ATAC	2	8	489	496	50 %	25 %	0 %	25 %	308183775
2	NC_014558	GTTG	2	8	497	504	0 %	50 %	50 %	0 %	308183775
3	NC_014558	TTAT	2	8	1185	1192	25 %	75 %	0 %	0 %	308183775
4	NC_014558	TTAG	2	8	1875	1882	25 %	50 %	25 %	0 %	308183776
5	NC_014558	CGAT	2	8	1947	1954	25 %	25 %	25 %	25 %	308183776
6	NC_014558	GATT	2	8	2076	2083	25 %	50 %	25 %	0 %	308183776
7	NC_014558	TTCG	2	8	2455	2462	0 %	50 %	25 %	25 %	308183776
8	NC_014558	GCCA	2	8	4448	4455	25 %	0 %	25 %	50 %	308183779
9	NC_014558	ACTA	2	8	4683	4690	50 %	25 %	0 %	25 %	308183779
10	NC_014558	AAAC	2	8	5184	5191	75 %	0 %	0 %	25 %	308183780
11	NC_014558	ATTG	2	8	5736	5743	25 %	50 %	25 %	0 %	308183781
12	NC_014558	TTTC	2	8	6194	6201	0 %	75 %	0 %	25 %	308183781
13	NC_014558	ATGA	2	8	6905	6912	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014558	CCAA	2	8	6979	6986	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_014558	TATC	2	8	7284	7291	25 %	50 %	0 %	25 %	308183782
16	NC_014558	ATAA	2	8	7865	7872	75 %	25 %	0 %	0 %	308183782
17	NC_014558	CCAA	2	8	9210	9217	50 %	0 %	0 %	50 %	308183783
18	NC_014558	CCAA	2	8	9580	9587	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_014558	TTTA	2	8	9601	9608	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014558	TTAA	2	8	9801	9808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014558	AATT	2	8	10594	10601	50 %	50 %	0 %	0 %	308183785
22	NC_014558	TTTG	2	8	10726	10733	0 %	75 %	25 %	0 %	308183785
23	NC_014558	TGAT	2	8	10884	10891	25 %	50 %	25 %	0 %	308183785
24	NC_014558	TTTC	2	8	11564	11571	0 %	75 %	0 %	25 %	308183785
25	NC_014558	ACTA	2	8	11930	11937	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_014558	TACC	2	8	12559	12566	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_014558	AAAG	2	8	13148	13155	75 %	0 %	25 %	0 %	308183786
28	NC_014558	ACAA	2	8	13241	13248	75 %	0 %	0 %	25 %	308183786
29	NC_014558	TAAC	2	8	13401	13408	50 %	25 %	0 %	25 %	308183786
30	NC_014558	CAAA	2	8	13988	13995	75 %	0 %	0 %	25 %	308183786
31	NC_014558	TTAA	2	8	14207	14214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014558	TAAT	2	8	14552	14559	50 %	50 %	0 %	0 %	308183787
33	NC_014558	AAAT	2	8	14854	14861	75 %	25 %	0 %	0 %	308183787
34	NC_014558	CAAA	2	8	15438	15445	75 %	0 %	0 %	25 %	308183787
35	NC_014558	ATTT	2	8	15526	15533	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014558	TAAG	2	8	15816	15823	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014558	TCAA	2	8	15926	15933	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_014558	TTGA	2	8	16074	16081	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014558	TCAA	2	8	16330	16337	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_014558	TAAT	2	8	16810	16817	50 %	50 %	0 %	0 %	308183788
41	NC_014558	AAAT	2	8	16854	16861	75 %	25 %	0 %	0 %	308183788
42	NC_014558	AATT	2	8	16934	16941	50 %	50 %	0 %	0 %	308183788
43	NC_014558	GAAA	2	8	17437	17444	75 %	0 %	25 %	0 %	308183788
44	NC_014558	TAAT	2	8	17551	17558	50 %	50 %	0 %	0 %	308183788
45	NC_014558	AGGA	2	8	18451	18458	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014558	AACC	2	8	18747	18754	50 %	0 %	0 %	50 %	308183790
47	NC_014558	CATC	2	8	19659	19666	25 %	25 %	0 %	50 %	308183791
48	NC_014558	AAGA	2	8	19858	19865	75 %	0 %	25 %	0 %	308183791
49	NC_014558	CTTT	2	8	19875	19882	0 %	75 %	0 %	25 %	308183791
50	NC_014558	CCAC	2	8	20144	20151	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
51	NC_014558	CCAG	2	8	20232	20239	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_014558	CATA	2	8	20261	20268	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_014558	AATT	2	8	20298	20305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014558	TCAG	2	8	20791	20798	25 %	25 %	25 %	25 %	308183792
55	NC_014558	CCAA	2	8	21164	21171	50 %	0 %	0 %	50 %	308183792
56	NC_014558	ACGG	2	8	21339	21346	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_014558	CATG	2	8	21373	21380	25 %	25 %	25 %	25 %	308183793
58	NC_014558	CATT	2	8	21386	21393	25 %	50 %	0 %	25 %	308183793
59	NC_014558	GCTT	2	8	21842	21849	0 %	50 %	25 %	25 %	308183793
60	NC_014558	TTGG	2	8	22429	22436	0 %	50 %	50 %	0 %	308183793
61	NC_014558	ATTG	2	8	23568	23575	25 %	50 %	25 %	0 %	308183794
62	NC_014558	TTCT	2	8	23923	23930	0 %	75 %	0 %	25 %	308183794
63	NC_014558	TGAT	2	8	24097	24104	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014558	AATG	2	8	24204	24211	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014558	AAGC	2	8	24213	24220	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_014558	TGAT	2	8	24907	24914	25 %	50 %	25 %	0 %	308183795
67	NC_014558	TAGC	2	8	25254	25261	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_014558	AGCT	2	8	25328	25335	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_014558	AGAA	2	8	25538	25545	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014558	CAGT	2	8	26135	26142	25 %	25 %	25 %	25 %	308183754
71	NC_014558	CTAG	2	8	26166	26173	25 %	25 %	25 %	25 %	308183754
72	NC_014558	ATAA	2	8	26593	26600	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014558	TAAA	2	8	26937	26944	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014558	ATTA	2	8	26991	26998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014558	GCGT	2	8	27052	27059	0 %	25 %	50 %	25 %	308183755
76	NC_014558	CTTA	2	8	27592	27599	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_014558	TCTA	2	8	27687	27694	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_014558	TGAT	2	8	27792	27799	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014558	TTTA	2	8	27917	27924	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014558	TACT	2	8	27939	27946	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_014558	AATC	2	8	28162	28169	50 %	25 %	0 %	25 %	308183756
82	NC_014558	CTTA	2	8	28791	28798	25 %	50 %	0 %	25 %	308183757
83	NC_014558	CAAT	2	8	28952	28959	50 %	25 %	0 %	25 %	308183757
84	NC_014558	TCTA	2	8	28962	28969	25 %	50 %	0 %	25 %	308183757
85	NC_014558	TGTC	2	8	29281	29288	0 %	50 %	25 %	25 %	308183757
86	NC_014558	CTTT	2	8	29437	29444	0 %	75 %	0 %	25 %	308183757
87	NC_014558	ATAA	2	8	30343	30350	75 %	25 %	0 %	0 %	308183757
88	NC_014558	CAAT	2	8	30707	30714	50 %	25 %	0 %	25 %	308183757
89	NC_014558	TTGC	2	8	30818	30825	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_014558	TTTG	2	8	31830	31837	0 %	75 %	25 %	0 %	308183759
91	NC_014558	AACT	2	8	32128	32135	50 %	25 %	0 %	25 %	308183759
92	NC_014558	ATTA	2	8	33286	33293	50 %	50 %	0 %	0 %	308183759
93	NC_014558	TACC	2	8	33648	33655	25 %	25 %	0 %	50 %	308183759
94	NC_014558	GATT	2	8	34126	34133	25 %	50 %	25 %	0 %	308183759
95	NC_014558	CCTG	2	8	34294	34301	0 %	25 %	25 %	50 %	308183759
96	NC_014558	CTAA	2	8	34412	34419	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_014558	CTAA	2	8	35039	35046	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_014558	AATG	2	8	35242	35249	50 %	25 %	25 %	0 %	308183761
99	NC_014558	TAAT	2	8	35565	35572	50 %	50 %	0 %	0 %	308183761
100	NC_014558	TCCC	2	8	35958	35965	0 %	25 %	0 %	75 %	308183761
101	NC_014558	TATT	2	8	36008	36015	25 %	75 %	0 %	0 %	308183761
102	NC_014558	CTTC	2	8	36194	36201	0 %	50 %	0 %	50 %	308183761
103	NC_014558	AAAC	2	8	36458	36465	75 %	0 %	0 %	25 %	308183761
104	NC_014558	TTTA	2	8	36877	36884	25 %	75 %	0 %	0 %	308183761
105	NC_014558	TTTA	2	8	36928	36935	25 %	75 %	0 %	0 %	308183761
106	NC_014558	TCTG	2	8	37087	37094	0 %	50 %	25 %	25 %	308183761
107	NC_014558	GAAA	2	8	37365	37372	75 %	0 %	25 %	0 %	308183762
108	NC_014558	CCTT	2	8	38147	38154	0 %	50 %	0 %	50 %	308183762
109	NC_014558	ATGG	2	8	38256	38263	25 %	25 %	50 %	0 %	308183762
110	NC_014558	AAAC	2	8	38539	38546	75 %	0 %	0 %	25 %	308183762
111	NC_014558	TAAT	2	8	38634	38641	50 %	50 %	0 %	0 %	308183762
112	NC_014558	CTAA	2	8	38873	38880	50 %	25 %	0 %	25 %	308183762
113	NC_014558	AGTA	2	8	38900	38907	50 %	25 %	25 %	0 %	308183762
114	NC_014558	AATT	2	8	39189	39196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014558	ATCA	2	8	39463	39470	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_014558	TCAT	2	8	39753	39760	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_014558	AAGA	2	8	40236	40243	75 %	0 %	25 %	0 %	308183763
118	NC_014558	TTAT	2	8	40249	40256	25 %	75 %	0 %	0 %	308183763
119	NC_014558	TATT	2	8	40493	40500	25 %	75 %	0 %	0 %	308183763
120	NC_014558	ATTT	2	8	40712	40719	25 %	75 %	0 %	0 %	308183763
121	NC_014558	AATT	2	8	40778	40785	50 %	50 %	0 %	0 %	308183763
122	NC_014558	GATA	2	8	40829	40836	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014558	ATCA	2	8	42132	42139	50 %	25 %	0 %	25 %	308183764
124	NC_014558	ATTT	2	8	42964	42971	25 %	75 %	0 %	0 %	308183764
125	NC_014558	TGAT	2	8	43015	43022	25 %	50 %	25 %	0 %	308183764
126	NC_014558	TGAT	2	8	43764	43771	25 %	50 %	25 %	0 %	308183766
127	NC_014558	TTCC	2	8	44182	44189	0 %	50 %	0 %	50 %	308183767
128	NC_014558	AAAT	2	8	44503	44510	75 %	25 %	0 %	0 %	308183767
129	NC_014558	AAAG	2	8	44594	44601	75 %	0 %	25 %	0 %	308183767
130	NC_014558	CCAC	2	8	44893	44900	25 %	0 %	0 %	75 %	308183767
131	NC_014558	CAAA	2	8	45181	45188	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_014558	GAGT	2	8	45638	45645	25 %	25 %	50 %	0 %	308183768
133	NC_014558	AACC	2	8	46691	46698	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_014558	CTTG	2	8	46907	46914	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_014558	TTTA	2	8	46938	46945	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014558	TGAT	2	8	47005	47012	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014558	TGGC	2	8	47942	47949	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_014558	ATAA	2	8	48770	48777	75 %	25 %	0 %	0 %	308183769
139	NC_014558	TTGC	2	8	48824	48831	0 %	50 %	25 %	25 %	308183769
140	NC_014558	CGTT	2	8	49246	49253	0 %	50 %	25 %	25 %	308183769
141	NC_014558	TTAA	2	8	49471	49478	50 %	50 %	0 %	0 %	308183769
142	NC_014558	CTTT	2	8	49701	49708	0 %	75 %	0 %	25 %	308183769
143	NC_014558	CAAC	2	8	49880	49887	50 %	0 %	0 %	50 %	308183769
144	NC_014558	TCTT	2	8	50194	50201	0 %	75 %	0 %	25 %	308183769
145	NC_014558	CCTT	2	8	50311	50318	0 %	50 %	0 %	50 %	308183769
146	NC_014558	CTTT	2	8	50433	50440	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_014558	TCAA	2	8	50736	50743	50 %	25 %	0 %	25 %	308183770
148	NC_014558	CTTA	2	8	51415	51422	25 %	50 %	0 %	25 %	308183772
149	NC_014558	CTTT	2	8	51982	51989	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_014558	CGGC	2	8	52251	52258	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_014558	CTTT	2	8	52920	52927	0 %	75 %	0 %	25 %	308183774
152	NC_014558	TGTT	2	8	53203	53210	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
153	NC_014558	GGTG	2	8	53471	53478	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.