MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III plasmid pST-III

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014558	ATGA	2	8	6905	6912	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014558	CCAA	2	8	6979	6986	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_014558	CCAA	2	8	9580	9587	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_014558	TTTA	2	8	9601	9608	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014558	TTAA	2	8	9801	9808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014558	ACTA	2	8	11930	11937	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_014558	TACC	2	8	12559	12566	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_014558	TTAA	2	8	14207	14214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014558	ATTT	2	8	15526	15533	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014558	TAAG	2	8	15816	15823	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014558	TCAA	2	8	15926	15933	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_014558	TTGA	2	8	16074	16081	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014558	TCAA	2	8	16330	16337	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_014558	AGGA	2	8	18451	18458	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014558	CCAC	2	8	20144	20151	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
16	NC_014558	CCAG	2	8	20232	20239	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_014558	CATA	2	8	20261	20268	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_014558	AATT	2	8	20298	20305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014558	ACGG	2	8	21339	21346	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_014558	TGAT	2	8	24097	24104	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014558	AATG	2	8	24204	24211	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014558	AAGC	2	8	24213	24220	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_014558	TAGC	2	8	25254	25261	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_014558	AGCT	2	8	25328	25335	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_014558	AGAA	2	8	25538	25545	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014558	ATAA	2	8	26593	26600	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014558	TAAA	2	8	26937	26944	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014558	ATTA	2	8	26991	26998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014558	CTTA	2	8	27592	27599	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_014558	TCTA	2	8	27687	27694	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_014558	TGAT	2	8	27792	27799	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014558	TTTA	2	8	27917	27924	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014558	TACT	2	8	27939	27946	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_014558	TTGC	2	8	30818	30825	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_014558	CTAA	2	8	34412	34419	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_014558	CTAA	2	8	35039	35046	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_014558	AATT	2	8	39189	39196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014558	ATCA	2	8	39463	39470	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_014558	TCAT	2	8	39753	39760	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_014558	GATA	2	8	40829	40836	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014558	CAAA	2	8	45181	45188	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_014558	AACC	2	8	46691	46698	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_014558	CTTG	2	8	46907	46914	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_014558	TTTA	2	8	46938	46945	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014558	TGAT	2	8	47005	47012	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014558	TGGC	2	8	47942	47949	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_014558	CTTT	2	8	50433	50440	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_014558	CTTT	2	8	51982	51989	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_014558	CGGC	2	8	52251	52258	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_014558	TGTT	2	8	53203	53210	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014558	GGTG	2	8	53471	53478	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.