MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III plasmid pST-III

Total Repeats: 517

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014558	GTA	2	6	369	374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183775
2	NC_014558	TGA	2	6	392	397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183775
3	NC_014558	AAC	2	6	443	448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308183775
4	NC_014558	CAG	2	6	558	563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308183775
5	NC_014558	AAT	2	6	717	722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308183775
6	NC_014558	GAA	2	6	729	734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308183775
7	NC_014558	GAA	3	9	767	775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308183775
8	NC_014558	ATG	2	6	778	783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183775
9	NC_014558	CCA	2	6	801	806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308183775
10	NC_014558	TCT	2	6	838	843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308183775
11	NC_014558	GAT	2	6	876	881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183775
12	NC_014558	AGA	2	6	896	901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308183775
13	NC_014558	GAA	2	6	1038	1043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308183775
14	NC_014558	TTA	2	6	1167	1172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308183775
15	NC_014558	GAT	2	6	1194	1199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183775
16	NC_014558	AGG	2	6	1201	1206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308183775
17	NC_014558	CGT	3	9	1646	1654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308183776
18	NC_014558	TAC	2	6	1732	1737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183776
19	NC_014558	GTC	2	6	1902	1907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308183776
20	NC_014558	TAA	2	6	1961	1966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308183776
21	NC_014558	ATC	2	6	2040	2045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183776
22	NC_014558	TAG	2	6	2191	2196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183776
23	NC_014558	TTG	2	6	2377	2382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308183776
24	NC_014558	ATT	2	6	2782	2787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308183777
25	NC_014558	ACA	2	6	2817	2822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308183777
26	NC_014558	TGA	2	6	2853	2858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183777
27	NC_014558	ATT	2	6	2908	2913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308183777
28	NC_014558	CTG	2	6	3424	3429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308183777
29	NC_014558	TTA	2	6	3455	3460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308183777
30	NC_014558	CGA	2	6	3502	3507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308183777
31	NC_014558	TCA	2	6	3557	3562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183777
32	NC_014558	ATC	2	6	3858	3863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183779
33	NC_014558	TTC	2	6	3877	3882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308183779
34	NC_014558	CTT	2	6	3957	3962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308183779
35	NC_014558	CAG	2	6	3992	3997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308183779
36	NC_014558	CAA	2	6	4089	4094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308183779
37	NC_014558	TAA	2	6	4217	4222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308183779
38	NC_014558	TAG	2	6	4319	4324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183779
39	NC_014558	AAC	2	6	4458	4463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308183779
40	NC_014558	ATC	2	6	4504	4509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183779
41	NC_014558	ACA	2	6	4565	4570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308183779
42	NC_014558	TTG	2	6	4781	4786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308183780
43	NC_014558	ATA	2	6	4811	4816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308183780
44	NC_014558	CAT	2	6	4860	4865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183780
45	NC_014558	CAT	2	6	4948	4953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183780
46	NC_014558	ATT	2	6	4973	4978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308183780
47	NC_014558	GTT	2	6	4979	4984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308183780
48	NC_014558	CAA	2	6	5280	5285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308183780
49	NC_014558	GAC	2	6	5303	5308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308183780
50	NC_014558	ACC	2	6	5441	5446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308183780
51	NC_014558	AAG	2	6	5468	5473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308183780
52	NC_014558	GCC	2	6	5635	5640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308183781
53	NC_014558	ATG	2	6	5659	5664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183781
54	NC_014558	TAG	2	6	5667	5672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183781
55	NC_014558	TCA	2	6	5680	5685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183781
56	NC_014558	TGC	2	6	5706	5711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308183781
57	NC_014558	CTT	2	6	5805	5810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308183781
58	NC_014558	CAT	2	6	5825	5830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183781
59	NC_014558	TGT	2	6	5855	5860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308183781
60	NC_014558	ACC	2	6	5944	5949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308183781
61	NC_014558	ACT	2	6	5967	5972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183781
62	NC_014558	CAT	2	6	6254	6259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183781
63	NC_014558	GCT	2	6	6287	6292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308183781
64	NC_014558	GTC	2	6	6324	6329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308183781
65	NC_014558	TTC	2	6	6504	6509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308183781
66	NC_014558	CAA	2	6	6726	6731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308183781
67	NC_014558	ATT	2	6	7362	7367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308183782
68	NC_014558	ATC	2	6	7392	7397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183782
69	NC_014558	AAG	2	6	7418	7423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308183782
70	NC_014558	TAA	2	6	7516	7521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308183782
71	NC_014558	ACA	2	6	7545	7550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308183782
72	NC_014558	CTC	2	6	7594	7599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308183782
73	NC_014558	GTG	2	6	7602	7607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308183782
74	NC_014558	GAC	2	6	7668	7673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308183782
75	NC_014558	TTC	2	6	7947	7952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308183782
76	NC_014558	TGA	2	6	7957	7962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183782
77	NC_014558	TTA	2	6	8583	8588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308183783
78	NC_014558	TAT	2	6	8607	8612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308183783
79	NC_014558	CTG	2	6	8619	8624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308183783
80	NC_014558	CAA	2	6	8646	8651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308183783
81	NC_014558	TAC	3	9	8806	8814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183783
82	NC_014558	AAC	2	6	8815	8820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308183783
83	NC_014558	CTG	2	6	8829	8834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308183783
84	NC_014558	TGC	2	6	8842	8847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308183783
85	NC_014558	CTT	2	6	8874	8879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308183783
86	NC_014558	GCT	2	6	8882	8887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308183783
87	NC_014558	CAA	2	6	8889	8894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308183783
88	NC_014558	GAC	2	6	8914	8919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308183783
89	NC_014558	CAA	2	6	8921	8926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308183783
90	NC_014558	ATC	2	6	8941	8946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183783
91	NC_014558	CTG	2	6	9024	9029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308183783
92	NC_014558	CAA	2	6	9073	9078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308183783
93	NC_014558	TGC	2	6	9091	9096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308183783
94	NC_014558	TGG	2	6	9124	9129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308183783
95	NC_014558	ATG	2	6	10230	10235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183784
96	NC_014558	CTG	2	6	10251	10256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308183784
97	NC_014558	AAT	2	6	10292	10297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308183784
98	NC_014558	ATT	2	6	10620	10625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308183785
99	NC_014558	CAA	2	6	10910	10915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308183785
100	NC_014558	TCT	2	6	10944	10949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308183785
101	NC_014558	TAA	2	6	11097	11102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308183785
102	NC_014558	TAA	2	6	11113	11118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308183785
103	NC_014558	TCA	2	6	11125	11130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183785
104	NC_014558	GTC	2	6	11139	11144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308183785
105	NC_014558	CTG	2	6	11153	11158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308183785
106	NC_014558	CTC	2	6	11321	11326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308183785
107	NC_014558	GAA	2	6	11395	11400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308183785
108	NC_014558	TTC	2	6	11418	11423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308183785
109	NC_014558	TGA	2	6	11449	11454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183785
110	NC_014558	CAT	2	6	11522	11527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183785
111	NC_014558	AAG	2	6	11589	11594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308183785
112	NC_014558	GAT	2	6	11664	11669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183785
113	NC_014558	ACT	2	6	11790	11795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183785
114	NC_014558	TAA	2	6	12625	12630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308183786
115	NC_014558	GTT	2	6	12642	12647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308183786
116	NC_014558	CTT	2	6	12729	12734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308183786
117	NC_014558	CTT	2	6	12765	12770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308183786
118	NC_014558	TAA	2	6	12919	12924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308183786
119	NC_014558	CAA	3	9	12927	12935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308183786
120	NC_014558	ATA	2	6	13092	13097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308183786
121	NC_014558	TAA	2	6	13221	13226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308183786
122	NC_014558	CAA	2	6	13272	13277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308183786
123	NC_014558	ACC	3	9	13288	13296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308183786
124	NC_014558	CAG	2	6	13333	13338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308183786
125	NC_014558	TGA	2	6	13382	13387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183786
126	NC_014558	ACC	2	6	13389	13394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308183786
127	NC_014558	AAT	2	6	13433	13438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308183786
128	NC_014558	AAT	2	6	13470	13475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308183786
129	NC_014558	TCT	2	6	13613	13618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308183786
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