MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III plasmid pST-III

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014558	AT	3	6	671	676	50 %	50 %	0 %	0 %	308183775
2	NC_014558	AC	3	6	870	875	50 %	0 %	0 %	50 %	308183775
3	NC_014558	AT	3	6	3883	3888	50 %	50 %	0 %	0 %	308183779
4	NC_014558	TG	3	6	4793	4798	0 %	50 %	50 %	0 %	308183780
5	NC_014558	GC	4	8	6268	6275	0 %	0 %	50 %	50 %	308183781
6	NC_014558	CT	3	6	7509	7514	0 %	50 %	0 %	50 %	308183782
7	NC_014558	GT	3	6	7534	7539	0 %	50 %	50 %	0 %	308183782
8	NC_014558	TC	3	6	13916	13921	0 %	50 %	0 %	50 %	308183786
9	NC_014558	TA	3	6	14016	14021	50 %	50 %	0 %	0 %	308183786
10	NC_014558	AT	3	6	14746	14751	50 %	50 %	0 %	0 %	308183787
11	NC_014558	TA	3	6	17832	17837	50 %	50 %	0 %	0 %	308183789
12	NC_014558	AT	3	6	18314	18319	50 %	50 %	0 %	0 %	308183789
13	NC_014558	GT	3	6	21648	21653	0 %	50 %	50 %	0 %	308183793
14	NC_014558	TG	3	6	21737	21742	0 %	50 %	50 %	0 %	308183793
15	NC_014558	CG	3	6	22508	22513	0 %	0 %	50 %	50 %	308183793
16	NC_014558	GC	3	6	22904	22909	0 %	0 %	50 %	50 %	308183793
17	NC_014558	TG	3	6	23219	23224	0 %	50 %	50 %	0 %	308183793
18	NC_014558	TC	3	6	23270	23275	0 %	50 %	0 %	50 %	308183793
19	NC_014558	GT	3	6	24945	24950	0 %	50 %	50 %	0 %	308183795
20	NC_014558	CG	3	6	27367	27372	0 %	0 %	50 %	50 %	308183755
21	NC_014558	AG	3	6	29397	29402	50 %	0 %	50 %	0 %	308183757
22	NC_014558	TA	3	6	30053	30058	50 %	50 %	0 %	0 %	308183757
23	NC_014558	TG	3	6	31019	31024	0 %	50 %	50 %	0 %	308183758
24	NC_014558	GT	3	6	31146	31151	0 %	50 %	50 %	0 %	308183758
25	NC_014558	AT	3	6	31308	31313	50 %	50 %	0 %	0 %	308183758
26	NC_014558	GT	4	8	31968	31975	0 %	50 %	50 %	0 %	308183759
27	NC_014558	CT	3	6	32162	32167	0 %	50 %	0 %	50 %	308183759
28	NC_014558	AT	3	6	32286	32291	50 %	50 %	0 %	0 %	308183759
29	NC_014558	AT	3	6	33769	33774	50 %	50 %	0 %	0 %	308183759
30	NC_014558	AT	3	6	33849	33854	50 %	50 %	0 %	0 %	308183759
31	NC_014558	AC	3	6	38934	38939	50 %	0 %	0 %	50 %	308183762
32	NC_014558	TA	3	6	38949	38954	50 %	50 %	0 %	0 %	308183762
33	NC_014558	AT	3	6	39062	39067	50 %	50 %	0 %	0 %	308183762
34	NC_014558	AT	3	6	44201	44206	50 %	50 %	0 %	0 %	308183767
35	NC_014558	TA	3	6	44962	44967	50 %	50 %	0 %	0 %	308183767
36	NC_014558	CT	3	6	44991	44996	0 %	50 %	0 %	50 %	308183767
37	NC_014558	GC	3	6	46065	46070	0 %	0 %	50 %	50 %	308183768
38	NC_014558	GT	3	6	49745	49750	0 %	50 %	50 %	0 %	308183769
39	NC_014558	TC	3	6	52810	52815	0 %	50 %	0 %	50 %	308183774

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.