MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III plasmid pST-III

Total Repeats: 139

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014558	A	7	7	585	591	100 %	0 %	0 %	0 %	308183775
2	NC_014558	A	6	6	1306	1311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014558	A	6	6	1335	1340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014558	A	6	6	1345	1350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014558	T	6	6	2257	2262	0 %	100 %	0 %	0 %	308183776
6	NC_014558	T	6	6	2540	2545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014558	A	6	6	3585	3590	100 %	0 %	0 %	0 %	308183777
8	NC_014558	A	6	6	3722	3727	100 %	0 %	0 %	0 %	308183778
9	NC_014558	A	7	7	3793	3799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014558	T	6	6	3850	3855	0 %	100 %	0 %	0 %	308183779
11	NC_014558	T	7	7	4154	4160	0 %	100 %	0 %	0 %	308183779
12	NC_014558	A	6	6	5158	5163	100 %	0 %	0 %	0 %	308183780
13	NC_014558	A	6	6	5530	5535	100 %	0 %	0 %	0 %	308183780
14	NC_014558	T	6	6	6161	6166	0 %	100 %	0 %	0 %	308183781
15	NC_014558	T	7	7	6732	6738	0 %	100 %	0 %	0 %	308183781
16	NC_014558	T	6	6	6931	6936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014558	T	7	7	7071	7077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014558	T	7	7	7109	7115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014558	A	7	7	7153	7159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014558	T	6	6	8177	8182	0 %	100 %	0 %	0 %	308183782
21	NC_014558	T	7	7	9365	9371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014558	C	6	6	9405	9410	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
23	NC_014558	A	6	6	10257	10262	100 %	0 %	0 %	0 %	308183784
24	NC_014558	T	6	6	10744	10749	0 %	100 %	0 %	0 %	308183785
25	NC_014558	A	6	6	12257	12262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014558	T	7	7	12608	12614	0 %	100 %	0 %	0 %	308183786
27	NC_014558	A	6	6	13059	13064	100 %	0 %	0 %	0 %	308183786
28	NC_014558	A	6	6	14703	14708	100 %	0 %	0 %	0 %	308183787
29	NC_014558	A	6	6	14887	14892	100 %	0 %	0 %	0 %	308183787
30	NC_014558	T	6	6	15204	15209	0 %	100 %	0 %	0 %	308183787
31	NC_014558	A	6	6	15272	15277	100 %	0 %	0 %	0 %	308183787
32	NC_014558	A	6	6	15459	15464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014558	T	8	8	16253	16260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014558	T	6	6	16665	16670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014558	A	6	6	17588	17593	100 %	0 %	0 %	0 %	308183788
36	NC_014558	A	6	6	17656	17661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014558	T	6	6	18171	18176	0 %	100 %	0 %	0 %	308183789
38	NC_014558	T	6	6	18245	18250	0 %	100 %	0 %	0 %	308183789
39	NC_014558	T	6	6	19335	19340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014558	T	6	6	19680	19685	0 %	100 %	0 %	0 %	308183791
41	NC_014558	A	6	6	19828	19833	100 %	0 %	0 %	0 %	308183791
42	NC_014558	T	6	6	20360	20365	0 %	100 %	0 %	0 %	308183792
43	NC_014558	T	6	6	20811	20816	0 %	100 %	0 %	0 %	308183792
44	NC_014558	T	6	6	22710	22715	0 %	100 %	0 %	0 %	308183793
45	NC_014558	A	6	6	23012	23017	100 %	0 %	0 %	0 %	308183793
46	NC_014558	T	6	6	23041	23046	0 %	100 %	0 %	0 %	308183793
47	NC_014558	A	6	6	24297	24302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014558	A	7	7	24345	24351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014558	T	6	6	24549	24554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014558	T	8	8	25296	25303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014558	T	8	8	25319	25326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014558	T	6	6	27493	27498	0 %	100 %	0 %	0 %	308183755
53	NC_014558	A	6	6	27647	27652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014558	A	6	6	27726	27731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014558	T	6	6	27755	27760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014558	A	6	6	27834	27839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014558	A	6	6	29586	29591	100 %	0 %	0 %	0 %	308183757
58	NC_014558	T	6	6	29705	29710	0 %	100 %	0 %	0 %	308183757
59	NC_014558	T	6	6	29788	29793	0 %	100 %	0 %	0 %	308183757
60	NC_014558	A	6	6	30271	30276	100 %	0 %	0 %	0 %	308183757
61	NC_014558	T	7	7	30426	30432	0 %	100 %	0 %	0 %	308183757
62	NC_014558	T	6	6	30535	30540	0 %	100 %	0 %	0 %	308183757
63	NC_014558	T	6	6	31060	31065	0 %	100 %	0 %	0 %	308183758
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65	NC_014558	T	6	6	31959	31964	0 %	100 %	0 %	0 %	308183759
66	NC_014558	T	6	6	32397	32402	0 %	100 %	0 %	0 %	308183759
67	NC_014558	T	6	6	32757	32762	0 %	100 %	0 %	0 %	308183759
68	NC_014558	A	8	8	32933	32940	100 %	0 %	0 %	0 %	308183759
69	NC_014558	A	6	6	32989	32994	100 %	0 %	0 %	0 %	308183759
70	NC_014558	A	6	6	33017	33022	100 %	0 %	0 %	0 %	308183759
71	NC_014558	T	7	7	33360	33366	0 %	100 %	0 %	0 %	308183759
72	NC_014558	A	7	7	33730	33736	100 %	0 %	0 %	0 %	308183759
73	NC_014558	T	7	7	34005	34011	0 %	100 %	0 %	0 %	308183759
74	NC_014558	T	7	7	34114	34120	0 %	100 %	0 %	0 %	308183759
75	NC_014558	T	6	6	34683	34688	0 %	100 %	0 %	0 %	308183760
76	NC_014558	T	7	7	34925	34931	0 %	100 %	0 %	0 %	308183760
77	NC_014558	T	6	6	34981	34986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014558	A	6	6	35068	35073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014558	T	9	9	36014	36022	0 %	100 %	0 %	0 %	308183761
80	NC_014558	A	7	7	36587	36593	100 %	0 %	0 %	0 %	308183761
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85	NC_014558	T	7	7	37773	37779	0 %	100 %	0 %	0 %	308183762
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89	NC_014558	A	6	6	38941	38946	100 %	0 %	0 %	0 %	308183762
90	NC_014558	T	6	6	39195	39200	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014558	A	6	6	39314	39319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014558	A	6	6	39321	39326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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94	NC_014558	T	6	6	39417	39422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014558	A	6	6	39656	39661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014558	T	6	6	39885	39890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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99	NC_014558	A	8	8	41039	41046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014558	A	6	6	41093	41098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014558	A	7	7	41145	41151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014558	A	7	7	41163	41169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014558	T	6	6	41341	41346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014558	A	8	8	41593	41600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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106	NC_014558	T	6	6	43255	43260	0 %	100 %	0 %	0 %	308183765
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108	NC_014558	A	6	6	43817	43822	100 %	0 %	0 %	0 %	308183766
109	NC_014558	T	6	6	43991	43996	0 %	100 %	0 %	0 %	308183767
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111	NC_014558	T	7	7	44808	44814	0 %	100 %	0 %	0 %	308183767
112	NC_014558	T	6	6	44865	44870	0 %	100 %	0 %	0 %	308183767
113	NC_014558	T	6	6	45207	45212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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115	NC_014558	T	7	7	45479	45485	0 %	100 %	0 %	0 %	308183768
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117	NC_014558	T	7	7	47239	47245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014558	T	8	8	47265	47272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014558	T	6	6	48019	48024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014558	T	6	6	49356	49361	0 %	100 %	0 %	0 %	308183769
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123	NC_014558	T	6	6	49802	49807	0 %	100 %	0 %	0 %	308183769
124	NC_014558	T	6	6	49859	49864	0 %	100 %	0 %	0 %	308183769
125	NC_014558	T	6	6	49866	49871	0 %	100 %	0 %	0 %	308183769
126	NC_014558	T	6	6	50117	50122	0 %	100 %	0 %	0 %	308183769
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129	NC_014558	A	7	7	50757	50763	100 %	0 %	0 %	0 %	308183770
130	NC_014558	A	6	6	50971	50976	100 %	0 %	0 %	0 %	308183771
131	NC_014558	A	6	6	51176	51181	100 %	0 %	0 %	0 %	308183771
132	NC_014558	T	6	6	51227	51232	0 %	100 %	0 %	0 %	308183772
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134	NC_014558	T	6	6	52453	52458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014558	A	6	6	52560	52565	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014558	T	7	7	52925	52931	0 %	100 %	0 %	0 %	308183774
137	NC_014558	A	6	6	53166	53171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014558	T	8	8	53479	53486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014558	T	6	6	53493	53498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.