MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III plasmid pST-III

Total Repeats: 87

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014558	A	7	7	585	591	100 %	0 %	0 %	0 %	308183775
2	NC_014558	T	6	6	2257	2262	0 %	100 %	0 %	0 %	308183776
3	NC_014558	A	6	6	3585	3590	100 %	0 %	0 %	0 %	308183777
4	NC_014558	A	6	6	3722	3727	100 %	0 %	0 %	0 %	308183778
5	NC_014558	T	6	6	3850	3855	0 %	100 %	0 %	0 %	308183779
6	NC_014558	T	7	7	4154	4160	0 %	100 %	0 %	0 %	308183779
7	NC_014558	A	6	6	5158	5163	100 %	0 %	0 %	0 %	308183780
8	NC_014558	A	6	6	5530	5535	100 %	0 %	0 %	0 %	308183780
9	NC_014558	T	6	6	6161	6166	0 %	100 %	0 %	0 %	308183781
10	NC_014558	T	7	7	6732	6738	0 %	100 %	0 %	0 %	308183781
11	NC_014558	T	6	6	8177	8182	0 %	100 %	0 %	0 %	308183782
12	NC_014558	A	6	6	10257	10262	100 %	0 %	0 %	0 %	308183784
13	NC_014558	T	6	6	10744	10749	0 %	100 %	0 %	0 %	308183785
14	NC_014558	T	7	7	12608	12614	0 %	100 %	0 %	0 %	308183786
15	NC_014558	A	6	6	13059	13064	100 %	0 %	0 %	0 %	308183786
16	NC_014558	A	6	6	14703	14708	100 %	0 %	0 %	0 %	308183787
17	NC_014558	A	6	6	14887	14892	100 %	0 %	0 %	0 %	308183787
18	NC_014558	T	6	6	15204	15209	0 %	100 %	0 %	0 %	308183787
19	NC_014558	A	6	6	15272	15277	100 %	0 %	0 %	0 %	308183787
20	NC_014558	A	6	6	17588	17593	100 %	0 %	0 %	0 %	308183788
21	NC_014558	T	6	6	18171	18176	0 %	100 %	0 %	0 %	308183789
22	NC_014558	T	6	6	18245	18250	0 %	100 %	0 %	0 %	308183789
23	NC_014558	T	6	6	19680	19685	0 %	100 %	0 %	0 %	308183791
24	NC_014558	A	6	6	19828	19833	100 %	0 %	0 %	0 %	308183791
25	NC_014558	T	6	6	20360	20365	0 %	100 %	0 %	0 %	308183792
26	NC_014558	T	6	6	20811	20816	0 %	100 %	0 %	0 %	308183792
27	NC_014558	T	6	6	22710	22715	0 %	100 %	0 %	0 %	308183793
28	NC_014558	A	6	6	23012	23017	100 %	0 %	0 %	0 %	308183793
29	NC_014558	T	6	6	23041	23046	0 %	100 %	0 %	0 %	308183793
30	NC_014558	T	6	6	27493	27498	0 %	100 %	0 %	0 %	308183755
31	NC_014558	A	6	6	29586	29591	100 %	0 %	0 %	0 %	308183757
32	NC_014558	T	6	6	29705	29710	0 %	100 %	0 %	0 %	308183757
33	NC_014558	T	6	6	29788	29793	0 %	100 %	0 %	0 %	308183757
34	NC_014558	A	6	6	30271	30276	100 %	0 %	0 %	0 %	308183757
35	NC_014558	T	7	7	30426	30432	0 %	100 %	0 %	0 %	308183757
36	NC_014558	T	6	6	30535	30540	0 %	100 %	0 %	0 %	308183757
37	NC_014558	T	6	6	31060	31065	0 %	100 %	0 %	0 %	308183758
38	NC_014558	T	8	8	31682	31689	0 %	100 %	0 %	0 %	308183758
39	NC_014558	T	6	6	31959	31964	0 %	100 %	0 %	0 %	308183759
40	NC_014558	T	6	6	32397	32402	0 %	100 %	0 %	0 %	308183759
41	NC_014558	T	6	6	32757	32762	0 %	100 %	0 %	0 %	308183759
42	NC_014558	A	8	8	32933	32940	100 %	0 %	0 %	0 %	308183759
43	NC_014558	A	6	6	32989	32994	100 %	0 %	0 %	0 %	308183759
44	NC_014558	A	6	6	33017	33022	100 %	0 %	0 %	0 %	308183759
45	NC_014558	T	7	7	33360	33366	0 %	100 %	0 %	0 %	308183759
46	NC_014558	A	7	7	33730	33736	100 %	0 %	0 %	0 %	308183759
47	NC_014558	T	7	7	34005	34011	0 %	100 %	0 %	0 %	308183759
48	NC_014558	T	7	7	34114	34120	0 %	100 %	0 %	0 %	308183759
49	NC_014558	T	6	6	34683	34688	0 %	100 %	0 %	0 %	308183760
50	NC_014558	T	7	7	34925	34931	0 %	100 %	0 %	0 %	308183760
51	NC_014558	T	9	9	36014	36022	0 %	100 %	0 %	0 %	308183761
52	NC_014558	A	7	7	36587	36593	100 %	0 %	0 %	0 %	308183761
53	NC_014558	T	7	7	36618	36624	0 %	100 %	0 %	0 %	308183761
54	NC_014558	A	6	6	36662	36667	100 %	0 %	0 %	0 %	308183761
55	NC_014558	T	6	6	36964	36969	0 %	100 %	0 %	0 %	308183761
56	NC_014558	T	6	6	37260	37265	0 %	100 %	0 %	0 %	308183761
57	NC_014558	T	7	7	37773	37779	0 %	100 %	0 %	0 %	308183762
58	NC_014558	C	7	7	38283	38289	0 %	0 %	0 %	100 %	308183762
59	NC_014558	T	8	8	38405	38412	0 %	100 %	0 %	0 %	308183762
60	NC_014558	A	6	6	38867	38872	100 %	0 %	0 %	0 %	308183762
61	NC_014558	A	6	6	38941	38946	100 %	0 %	0 %	0 %	308183762
62	NC_014558	A	6	6	40090	40095	100 %	0 %	0 %	0 %	308183763
63	NC_014558	A	7	7	40629	40635	100 %	0 %	0 %	0 %	308183763
64	NC_014558	T	6	6	41847	41852	0 %	100 %	0 %	0 %	308183764
65	NC_014558	T	6	6	43255	43260	0 %	100 %	0 %	0 %	308183765
66	NC_014558	T	7	7	43489	43495	0 %	100 %	0 %	0 %	308183766
67	NC_014558	A	6	6	43817	43822	100 %	0 %	0 %	0 %	308183766
68	NC_014558	T	6	6	43991	43996	0 %	100 %	0 %	0 %	308183767
69	NC_014558	T	8	8	44404	44411	0 %	100 %	0 %	0 %	308183767
70	NC_014558	T	7	7	44808	44814	0 %	100 %	0 %	0 %	308183767
71	NC_014558	T	6	6	44865	44870	0 %	100 %	0 %	0 %	308183767
72	NC_014558	T	6	6	45386	45391	0 %	100 %	0 %	0 %	308183768
73	NC_014558	T	7	7	45479	45485	0 %	100 %	0 %	0 %	308183768
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75	NC_014558	T	7	7	49401	49407	0 %	100 %	0 %	0 %	308183769
76	NC_014558	T	6	6	49575	49580	0 %	100 %	0 %	0 %	308183769
77	NC_014558	T	6	6	49802	49807	0 %	100 %	0 %	0 %	308183769
78	NC_014558	T	6	6	49859	49864	0 %	100 %	0 %	0 %	308183769
79	NC_014558	T	6	6	49866	49871	0 %	100 %	0 %	0 %	308183769
80	NC_014558	T	6	6	50117	50122	0 %	100 %	0 %	0 %	308183769
81	NC_014558	T	6	6	50251	50256	0 %	100 %	0 %	0 %	308183769
82	NC_014558	A	6	6	50742	50747	100 %	0 %	0 %	0 %	308183770
83	NC_014558	A	7	7	50757	50763	100 %	0 %	0 %	0 %	308183770
84	NC_014558	A	6	6	50971	50976	100 %	0 %	0 %	0 %	308183771
85	NC_014558	A	6	6	51176	51181	100 %	0 %	0 %	0 %	308183771
86	NC_014558	T	6	6	51227	51232	0 %	100 %	0 %	0 %	308183772
87	NC_014558	T	7	7	52925	52931	0 %	100 %	0 %	0 %	308183774

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.