MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori PeCan4 plasmid pHPPC4

Total Repeats: 29

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014556	TATT	2	8	153	160	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014556	GGTA	2	8	540	547	25 %	25 %	50 %	0 %	308183745
3	NC_014556	ATTT	2	8	757	764	25 %	75 %	0 %	0 %	308183745
4	NC_014556	TCAA	3	12	864	875	50 %	25 %	0 %	25 %	308183745
5	NC_014556	AGGG	2	8	1165	1172	25 %	0 %	75 %	0 %	308183745
6	NC_014556	CAAG	2	8	1229	1236	50 %	0 %	25 %	25 %	308183745
7	NC_014556	AAGT	2	8	2159	2166	50 %	25 %	25 %	0 %	308183746
8	NC_014556	TGAT	2	8	2184	2191	25 %	50 %	25 %	0 %	308183746
9	NC_014556	CTTC	2	8	2289	2296	0 %	50 %	0 %	50 %	308183746
10	NC_014556	TTCT	2	8	2361	2368	0 %	75 %	0 %	25 %	308183746
11	NC_014556	TTAG	2	8	2406	2413	25 %	50 %	25 %	0 %	308183746
12	NC_014556	AAAC	2	8	2860	2867	75 %	0 %	0 %	25 %	308183748
13	NC_014556	CTAA	2	8	3297	3304	50 %	25 %	0 %	25 %	308183749
14	NC_014556	ACAA	2	8	4036	4043	75 %	0 %	0 %	25 %	308183749
15	NC_014556	GAAA	2	8	4320	4327	75 %	0 %	25 %	0 %	308183749
16	NC_014556	ACCA	2	8	4385	4392	50 %	0 %	0 %	50 %	308183749
17	NC_014556	AGAA	2	8	4751	4758	75 %	0 %	25 %	0 %	308183749
18	NC_014556	CAAG	2	8	4902	4909	50 %	0 %	25 %	25 %	308183749
19	NC_014556	TATT	2	8	5980	5987	25 %	75 %	0 %	0 %	308183751
20	NC_014556	AATT	2	8	6084	6091	50 %	50 %	0 %	0 %	308183751
21	NC_014556	TGAT	2	8	6202	6209	25 %	50 %	25 %	0 %	308183751
22	NC_014556	ATCA	2	8	6789	6796	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_014556	ATCC	2	8	6930	6937	25 %	25 %	0 %	50 %	308183752
24	NC_014556	TTGT	2	8	7084	7091	0 %	75 %	25 %	0 %	308183752
25	NC_014556	TGAT	2	8	7496	7503	25 %	50 %	25 %	0 %	308183752
26	NC_014556	AATA	2	8	7670	7677	75 %	25 %	0 %	0 %	308183752
27	NC_014556	GATG	2	8	7798	7805	25 %	25 %	50 %	0 %	308183752
28	NC_014556	GTTT	2	8	8236	8243	0 %	75 %	25 %	0 %	308183752
29	NC_014556	TCTT	2	8	8469	8476	0 %	75 %	0 %	25 %	308183752

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.