MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori PeCan4 plasmid pHPPC4

Total Repeats: 92

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014556	ATT	2	6	250	255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308183745
2	NC_014556	GAA	2	6	291	296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308183745
3	NC_014556	GGA	2	6	308	313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308183745
4	NC_014556	GAT	2	6	477	482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183745
5	NC_014556	CAA	2	6	567	572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308183745
6	NC_014556	TGT	2	6	701	706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308183745
7	NC_014556	TAT	2	6	732	737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308183745
8	NC_014556	AGA	2	6	980	985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308183745
9	NC_014556	GTG	2	6	1136	1141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308183745
10	NC_014556	ATG	2	6	1188	1193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183745
11	NC_014556	AAT	2	6	1494	1499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308183745
12	NC_014556	GTG	2	6	1616	1621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308183745
13	NC_014556	TGT	2	6	1777	1782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308183746
14	NC_014556	GTA	2	6	1802	1807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183746
15	NC_014556	ATG	2	6	1830	1835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183746
16	NC_014556	ATG	2	6	1944	1949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183746
17	NC_014556	TTG	2	6	2026	2031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308183746
18	NC_014556	TCA	2	6	2082	2087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183746
19	NC_014556	ATT	2	6	2093	2098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308183746
20	NC_014556	ATC	2	6	2204	2209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183746
21	NC_014556	CTT	2	6	2534	2539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308183747
22	NC_014556	ACA	2	6	2700	2705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014556	ATT	2	6	2870	2875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308183748
24	NC_014556	CAA	2	6	2994	2999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308183748
25	NC_014556	TAA	2	6	3025	3030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308183748
26	NC_014556	TAA	2	6	3097	3102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308183748
27	NC_014556	AAC	2	6	3129	3134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308183748
28	NC_014556	GCG	2	6	3211	3216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308183749
29	NC_014556	TGA	2	6	3377	3382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183749
30	NC_014556	ACA	2	6	3451	3456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308183749
31	NC_014556	CAT	2	6	3764	3769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183749
32	NC_014556	TAC	2	6	3873	3878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183749
33	NC_014556	TAA	2	6	3974	3979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308183749
34	NC_014556	ACT	2	6	3992	3997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183749
35	NC_014556	CTA	2	6	4046	4051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183749
36	NC_014556	CAA	2	6	4125	4130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308183749
37	NC_014556	ACA	2	6	4136	4141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308183749
38	NC_014556	TCA	2	6	4277	4282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183749
39	NC_014556	CAG	2	6	4577	4582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308183749
40	NC_014556	ATT	2	6	4677	4682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308183749
41	NC_014556	ACA	2	6	4803	4808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308183749
42	NC_014556	AAC	2	6	4893	4898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308183749
43	NC_014556	CTT	2	6	5006	5011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308183749
44	NC_014556	ACA	2	6	5076	5081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308183749
45	NC_014556	TTG	2	6	5172	5177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308183751
46	NC_014556	AAT	2	6	5265	5270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308183751
47	NC_014556	TCA	2	6	5272	5277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183751
48	NC_014556	TGC	2	6	5384	5389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308183751
49	NC_014556	ACA	2	6	5404	5409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308183751
50	NC_014556	AAT	2	6	5497	5502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308183751
51	NC_014556	TCA	2	6	5539	5544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183751
52	NC_014556	GTT	2	6	5592	5597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308183751
53	NC_014556	ATC	2	6	5613	5618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183751
54	NC_014556	TGG	2	6	5671	5676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308183751
55	NC_014556	ATA	2	6	5719	5724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308183751
56	NC_014556	AAT	2	6	5758	5763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308183751
57	NC_014556	AAT	2	6	5966	5971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308183751
58	NC_014556	ATA	2	6	6100	6105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308183751
59	NC_014556	GTG	2	6	6139	6144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308183751
60	NC_014556	ATG	2	6	6237	6242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183751
61	NC_014556	ATA	2	6	6446	6451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308183751
62	NC_014556	TTA	2	6	6610	6615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308183751
63	NC_014556	TGA	2	6	6626	6631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183751
64	NC_014556	AAT	2	6	6654	6659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308183751
65	NC_014556	TGA	2	6	6672	6677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014556	TAG	2	6	6720	6725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014556	AAT	2	6	6828	6833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014556	TCT	2	6	6984	6989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308183752
69	NC_014556	TGA	2	6	7005	7010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183752
70	NC_014556	AAT	2	6	7134	7139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308183752
71	NC_014556	TTG	2	6	7217	7222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308183752
72	NC_014556	ATG	2	6	7315	7320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183752
73	NC_014556	AGT	2	6	7357	7362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183752
74	NC_014556	TAA	2	6	7379	7384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308183752
75	NC_014556	ATT	2	6	7437	7442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308183752
76	NC_014556	GAT	2	6	7479	7484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183752
77	NC_014556	TAT	2	6	7489	7494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308183752
78	NC_014556	CAT	2	6	7546	7551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183752
79	NC_014556	ATA	2	6	7611	7616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308183752
80	NC_014556	AGA	2	6	7718	7723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308183752
81	NC_014556	AAT	2	6	7740	7745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308183752
82	NC_014556	TAA	2	6	8014	8019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308183752
83	NC_014556	AAT	2	6	8123	8128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308183752
84	NC_014556	ATT	2	6	8247	8252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308183752
85	NC_014556	AGT	2	6	8266	8271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183752
86	NC_014556	TTC	2	6	8405	8410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308183752
87	NC_014556	TTG	2	6	8424	8429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308183752
88	NC_014556	CAA	2	6	8516	8521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_014556	AAT	2	6	8554	8559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014556	AAT	2	6	8666	8671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014556	TAT	2	6	8672	8677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014556	TAA	2	6	8692	8697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.