MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori PeCan4 chromosome

Total Repeats: 1068

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014555	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	308182191
2	NC_014555	TTTTA	2	10	7235	7244	20 %	80 %	0 %	0 %	308182195
3	NC_014555	TTTCT	2	10	8164	8173	0 %	80 %	0 %	20 %	308182196
4	NC_014555	TTTTG	2	10	11698	11707	0 %	80 %	20 %	0 %	308182199
5	NC_014555	GGGTT	2	10	11920	11929	0 %	40 %	60 %	0 %	308182199
6	NC_014555	TGGTG	2	10	12537	12546	0 %	40 %	60 %	0 %	308182200
7	NC_014555	CAAAA	2	10	18397	18406	80 %	0 %	0 %	20 %	308182205
8	NC_014555	AAGCT	2	10	19300	19309	40 %	20 %	20 %	20 %	308182206
9	NC_014555	CATCA	2	10	19773	19782	40 %	20 %	0 %	40 %	308182206
10	NC_014555	TGAAA	2	10	20744	20753	60 %	20 %	20 %	0 %	308182207
11	NC_014555	CCATG	2	10	22925	22934	20 %	20 %	20 %	40 %	308182209
12	NC_014555	TCGGA	2	10	24644	24653	20 %	20 %	40 %	20 %	308182209
13	NC_014555	CAAGC	2	10	27558	27567	40 %	0 %	20 %	40 %	308182211
14	NC_014555	GCTGG	2	10	27931	27940	0 %	20 %	60 %	20 %	308182211
15	NC_014555	TGGGT	2	10	27995	28004	0 %	40 %	60 %	0 %	308182211
16	NC_014555	TTTTA	2	10	28484	28493	20 %	80 %	0 %	0 %	308182212
17	NC_014555	GTGGG	2	10	32069	32078	0 %	20 %	80 %	0 %	308182217
18	NC_014555	TGGGG	2	10	33320	33329	0 %	20 %	80 %	0 %	308182219
19	NC_014555	AGAAA	2	10	40389	40398	80 %	0 %	20 %	0 %	308182227
20	NC_014555	TACTC	2	10	41242	41251	20 %	40 %	0 %	40 %	308182228
21	NC_014555	TAAAA	2	10	43100	43109	80 %	20 %	0 %	0 %	308182229
22	NC_014555	TCCCA	2	10	44112	44121	20 %	20 %	0 %	60 %	308182230
23	NC_014555	GCTCC	2	10	44433	44442	0 %	20 %	20 %	60 %	308182230
24	NC_014555	TCGCA	2	10	44970	44979	20 %	20 %	20 %	40 %	308182230
25	NC_014555	AGGGC	2	10	45213	45222	20 %	0 %	60 %	20 %	308182230
26	NC_014555	TGAAA	2	10	48625	48634	60 %	20 %	20 %	0 %	308182233
27	NC_014555	TCAAA	2	10	48879	48888	60 %	20 %	0 %	20 %	308182233
28	NC_014555	CGTTT	2	10	49690	49699	0 %	60 %	20 %	20 %	308182233
29	NC_014555	TCGCC	2	10	51622	51631	0 %	20 %	20 %	60 %	308182234
30	NC_014555	TAAAA	2	10	51918	51927	80 %	20 %	0 %	0 %	308182234
31	NC_014555	TCAAA	2	10	52634	52643	60 %	20 %	0 %	20 %	308182234
32	NC_014555	TCAAT	2	10	65725	65734	40 %	40 %	0 %	20 %	308182244
33	NC_014555	CTTGG	2	10	66514	66523	0 %	40 %	40 %	20 %	308182245
34	NC_014555	CTTCT	2	10	66568	66577	0 %	60 %	0 %	40 %	308182245
35	NC_014555	TGCCT	2	10	66645	66654	0 %	40 %	20 %	40 %	308182245
36	NC_014555	TCCAA	2	10	67057	67066	40 %	20 %	0 %	40 %	308182246
37	NC_014555	CGCCA	2	10	69774	69783	20 %	0 %	20 %	60 %	308182249
38	NC_014555	CATCA	2	10	69786	69795	40 %	20 %	0 %	40 %	308182249
39	NC_014555	TTTTG	2	10	70367	70376	0 %	80 %	20 %	0 %	308182250
40	NC_014555	ATGGC	2	10	70561	70570	20 %	20 %	40 %	20 %	308182250
41	NC_014555	ACGCC	2	10	70673	70682	20 %	0 %	20 %	60 %	308182250
42	NC_014555	AAAGC	2	10	71439	71448	60 %	0 %	20 %	20 %	308182251
43	NC_014555	CTCAT	2	10	77566	77575	20 %	40 %	0 %	40 %	308182257
44	NC_014555	ATGCC	2	10	79612	79621	20 %	20 %	20 %	40 %	308182259
45	NC_014555	TTGAT	2	10	80697	80706	20 %	60 %	20 %	0 %	308182261
46	NC_014555	GGCGT	2	10	82511	82520	0 %	20 %	60 %	20 %	308182263
47	NC_014555	ATTTT	2	10	85554	85563	20 %	80 %	0 %	0 %	308182264
48	NC_014555	CTTTC	2	10	86076	86085	0 %	60 %	0 %	40 %	308182265
49	NC_014555	TGATT	2	10	89056	89065	20 %	60 %	20 %	0 %	308182268
50	NC_014555	ACGAT	2	10	95517	95526	40 %	20 %	20 %	20 %	308182273
51	NC_014555	AATTG	2	10	97359	97368	40 %	40 %	20 %	0 %	308182274
52	NC_014555	TCGTT	2	10	99158	99167	0 %	60 %	20 %	20 %	308182275
53	NC_014555	TCTTT	2	10	102474	102483	0 %	80 %	0 %	20 %	308182278
54	NC_014555	AAAGC	2	10	105239	105248	60 %	0 %	20 %	20 %	308182280
55	NC_014555	CAAAT	2	10	107235	107244	60 %	20 %	0 %	20 %	308182283
56	NC_014555	ACCCT	2	10	108664	108673	20 %	20 %	0 %	60 %	308182284
57	NC_014555	ATGCC	2	10	108796	108805	20 %	20 %	20 %	40 %	308182284
58	NC_014555	TGATT	2	10	110797	110806	20 %	60 %	20 %	0 %	308182286
59	NC_014555	CTAAA	2	10	111283	111292	60 %	20 %	0 %	20 %	308182288
60	NC_014555	AAGCC	2	10	117216	117225	40 %	0 %	20 %	40 %	308182291
61	NC_014555	GTTTG	2	10	118586	118595	0 %	60 %	40 %	0 %	308182292
62	NC_014555	TTGAT	2	10	118907	118916	20 %	60 %	20 %	0 %	308182292
63	NC_014555	CGCTG	2	10	121488	121497	0 %	20 %	40 %	40 %	308182294
64	NC_014555	TTTGA	2	10	121635	121644	20 %	60 %	20 %	0 %	308182294
65	NC_014555	ATCTC	2	10	122920	122929	20 %	40 %	0 %	40 %	308182294
66	NC_014555	TTTGT	2	10	123432	123441	0 %	80 %	20 %	0 %	308182295
67	NC_014555	TGCGT	2	10	125465	125474	0 %	40 %	40 %	20 %	308182297
68	NC_014555	GAAAA	2	10	125626	125635	80 %	0 %	20 %	0 %	308182297
69	NC_014555	GAAAA	2	10	125944	125953	80 %	0 %	20 %	0 %	308182297
70	NC_014555	ATTTT	2	10	128908	128917	20 %	80 %	0 %	0 %	308182302
71	NC_014555	ATGTT	2	10	128990	128999	20 %	60 %	20 %	0 %	308182302
72	NC_014555	AAAAG	2	10	129402	129411	80 %	0 %	20 %	0 %	308182302
73	NC_014555	AAATC	2	10	131674	131683	60 %	20 %	0 %	20 %	308182304
74	NC_014555	AAAAT	2	10	133146	133155	80 %	20 %	0 %	0 %	308182305
75	NC_014555	CAAAT	2	10	133198	133207	60 %	20 %	0 %	20 %	308182305
76	NC_014555	TTTTC	2	10	135707	135716	0 %	80 %	0 %	20 %	308182310
77	NC_014555	TTCTT	2	10	137663	137672	0 %	80 %	0 %	20 %	308182312
78	NC_014555	TCTTT	2	10	138158	138167	0 %	80 %	0 %	20 %	308182313
79	NC_014555	TTTTG	2	10	139321	139330	0 %	80 %	20 %	0 %	308182314
80	NC_014555	GCGAT	2	10	140114	140123	20 %	20 %	40 %	20 %	308182314
81	NC_014555	GCTTG	2	10	140370	140379	0 %	40 %	40 %	20 %	308182314
82	NC_014555	TTTTG	2	10	141030	141039	0 %	80 %	20 %	0 %	308182315
83	NC_014555	CCAAA	2	10	142870	142879	60 %	0 %	0 %	40 %	308182316
84	NC_014555	TAAAA	2	10	144473	144482	80 %	20 %	0 %	0 %	308182317
85	NC_014555	ACGCC	2	10	146393	146402	20 %	0 %	20 %	60 %	308182318
86	NC_014555	TTATT	2	10	148289	148298	20 %	80 %	0 %	0 %	308182322
87	NC_014555	GCGTT	2	10	148656	148665	0 %	40 %	40 %	20 %	308182324
88	NC_014555	ATTTG	2	10	149631	149640	20 %	60 %	20 %	0 %	308182325
89	NC_014555	TGTTT	2	10	151359	151368	0 %	80 %	20 %	0 %	308182327
90	NC_014555	AAAAC	2	10	152251	152260	80 %	0 %	0 %	20 %	308182328
91	NC_014555	AGATT	2	10	154149	154158	40 %	40 %	20 %	0 %	308182330
92	NC_014555	AAGCC	2	10	155487	155496	40 %	0 %	20 %	40 %	308182333
93	NC_014555	TAAAA	2	10	156490	156499	80 %	20 %	0 %	0 %	308182334
94	NC_014555	GGCAT	2	10	157287	157296	20 %	20 %	40 %	20 %	308182334
95	NC_014555	ATTTT	2	10	157523	157532	20 %	80 %	0 %	0 %	308182335
96	NC_014555	GGGTG	2	10	157879	157888	0 %	20 %	80 %	0 %	308182335
97	NC_014555	CAAAA	2	10	158782	158791	80 %	0 %	0 %	20 %	308182336
98	NC_014555	ATTCA	2	10	159272	159281	40 %	40 %	0 %	20 %	308182337
99	NC_014555	ATCTT	2	10	162675	162684	20 %	60 %	0 %	20 %	308182340
100	NC_014555	TATCA	2	10	171119	171128	40 %	40 %	0 %	20 %	308182349
101	NC_014555	ATTTG	2	10	172127	172136	20 %	60 %	20 %	0 %	308182350
102	NC_014555	AATTG	2	10	172283	172292	40 %	40 %	20 %	0 %	308182351
103	NC_014555	AAATC	2	10	172366	172375	60 %	20 %	0 %	20 %	308182351
104	NC_014555	TTTCT	2	10	172940	172949	0 %	80 %	0 %	20 %	308182352
105	NC_014555	AAATG	2	10	173277	173286	60 %	20 %	20 %	0 %	308182352
106	NC_014555	TGTAA	2	10	174067	174076	40 %	40 %	20 %	0 %	308182353
107	NC_014555	ATAAA	2	10	175563	175572	80 %	20 %	0 %	0 %	308182354
108	NC_014555	AAAAG	2	10	176718	176727	80 %	0 %	20 %	0 %	308182355
109	NC_014555	ACCCC	2	10	176783	176792	20 %	0 %	0 %	80 %	308182355
110	NC_014555	TGAAT	2	10	177099	177108	40 %	40 %	20 %	0 %	308182356
111	NC_014555	GAGAT	2	10	181528	181537	40 %	20 %	40 %	0 %	308182360
112	NC_014555	AGAGG	2	10	182417	182426	40 %	0 %	60 %	0 %	308182360
113	NC_014555	TTCAA	2	10	184177	184186	40 %	40 %	0 %	20 %	308182362
114	NC_014555	GCGAA	2	10	186750	186759	40 %	0 %	40 %	20 %	308182364
115	NC_014555	TCATT	2	10	189787	189796	20 %	60 %	0 %	20 %	308182366
116	NC_014555	CATAA	2	10	190347	190356	60 %	20 %	0 %	20 %	308182367
117	NC_014555	CTATT	2	10	190676	190685	20 %	60 %	0 %	20 %	308182368
118	NC_014555	TTTTC	2	10	191736	191745	0 %	80 %	0 %	20 %	308182369
119	NC_014555	ATTAG	2	10	193713	193722	40 %	40 %	20 %	0 %	308182371
120	NC_014555	TATTT	2	10	195486	195495	20 %	80 %	0 %	0 %	308182374
121	NC_014555	TTTCA	2	10	196142	196151	20 %	60 %	0 %	20 %	308182375
122	NC_014555	TTTGA	2	10	197630	197639	20 %	60 %	20 %	0 %	308182377
123	NC_014555	TGGGG	2	10	202349	202358	0 %	20 %	80 %	0 %	308182381
124	NC_014555	ATTCT	2	10	204782	204791	20 %	60 %	0 %	20 %	308182382
125	NC_014555	TATAA	2	10	206056	206065	60 %	40 %	0 %	0 %	308182383
126	NC_014555	GCAAA	2	10	207387	207396	60 %	0 %	20 %	20 %	308182384
127	NC_014555	CTTTT	2	10	207428	207437	0 %	80 %	0 %	20 %	308182384
128	NC_014555	TCGGC	2	10	208216	208225	0 %	20 %	40 %	40 %	308182385
129	NC_014555	TAAAA	2	10	209594	209603	80 %	20 %	0 %	0 %	308182386
130	NC_014555	CCACC	2	10	211119	211128	20 %	0 %	0 %	80 %	308182386
131	NC_014555	TTACA	2	10	211306	211315	40 %	40 %	0 %	20 %	308182387
132	NC_014555	TTAAT	2	10	214242	214251	40 %	60 %	0 %	0 %	308182390
133	NC_014555	GTGGG	2	10	216377	216386	0 %	20 %	80 %	0 %	308182393
134	NC_014555	TGATG	2	10	216567	216576	20 %	40 %	40 %	0 %	308182393
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236	NC_014555	ATAAA	2	10	360745	360754	80 %	20 %	0 %	0 %	308182530
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249	NC_014555	TGATT	2	10	379289	379298	20 %	60 %	20 %	0 %	308182548
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252	NC_014555	CCCGC	2	10	382412	382421	0 %	0 %	20 %	80 %	308182553
253	NC_014555	ACGCC	2	10	383894	383903	20 %	0 %	20 %	60 %	308182555
254	NC_014555	AACTT	2	10	388771	388780	40 %	40 %	0 %	20 %	308182561
255	NC_014555	AAGAT	2	10	390175	390184	60 %	20 %	20 %	0 %	308182562
256	NC_014555	CAAGC	2	10	390717	390726	40 %	0 %	20 %	40 %	308182562
257	NC_014555	AAAAT	2	10	391230	391239	80 %	20 %	0 %	0 %	308182563
258	NC_014555	AAATC	2	10	393726	393735	60 %	20 %	0 %	20 %	308182567
259	NC_014555	AGCAT	2	10	393880	393889	40 %	20 %	20 %	20 %	308182567
260	NC_014555	AAAGA	2	10	394215	394224	80 %	0 %	20 %	0 %	308182568
261	NC_014555	GCATC	2	10	399586	399595	20 %	20 %	20 %	40 %	308182571
262	NC_014555	ATTCA	2	10	402762	402771	40 %	40 %	0 %	20 %	308182575
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