MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori PeCan4 chromosome

Total Repeats: 14794

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014555	GAT	3	9	122	130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182189
2	NC_014555	GTT	2	6	305	310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308182189
3	NC_014555	TTC	2	6	356	361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182189
4	NC_014555	ACA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308182189
5	NC_014555	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182190
6	NC_014555	CTT	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182190
7	NC_014555	TGA	2	6	818	823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182190
8	NC_014555	GCC	2	6	1048	1053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308182191
9	NC_014555	ACT	2	6	1189	1194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182191
10	NC_014555	GCT	2	6	1212	1217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308182191
11	NC_014555	GGC	2	6	1403	1408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308182191
12	NC_014555	GTT	2	6	1623	1628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308182191
13	NC_014555	CTT	2	6	1657	1662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182191
14	NC_014555	TTC	2	6	1762	1767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182192
15	NC_014555	CAC	2	6	1861	1866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308182192
16	NC_014555	GTT	2	6	1897	1902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308182192
17	NC_014555	CTT	2	6	1986	1991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182192
18	NC_014555	TGG	2	6	2043	2048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308182192
19	NC_014555	TCA	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182192
20	NC_014555	AAT	2	6	2104	2109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182192
21	NC_014555	TAG	2	6	2157	2162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182192
22	NC_014555	AGC	2	6	2776	2781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308182193
23	NC_014555	GTG	2	6	2965	2970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308182193
24	NC_014555	AGA	2	6	3063	3068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308182193
25	NC_014555	GTG	2	6	3124	3129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308182193
26	NC_014555	GCC	2	6	3131	3136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308182193
27	NC_014555	GTT	2	6	3577	3582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308182194
28	NC_014555	CTA	2	6	3617	3622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182194
29	NC_014555	ATC	2	6	3661	3666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182194
30	NC_014555	ATT	2	6	3905	3910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182194
31	NC_014555	GGC	2	6	3978	3983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308182194
32	NC_014555	GGT	2	6	7211	7216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308182195
33	NC_014555	CAT	2	6	7385	7390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182196
34	NC_014555	GCC	2	6	7391	7396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308182196
35	NC_014555	TCT	2	6	7452	7457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182196
36	NC_014555	AAT	2	6	7550	7555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182196
37	NC_014555	CTT	2	6	7558	7563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182196
38	NC_014555	CAT	2	6	7648	7653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182196
39	NC_014555	ATG	2	6	7701	7706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182196
40	NC_014555	TCA	2	6	7725	7730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182196
41	NC_014555	CCG	2	6	7779	7784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308182196
42	NC_014555	CTT	2	6	7798	7803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182196
43	NC_014555	CCG	2	6	7807	7812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308182196
44	NC_014555	GTG	2	6	8034	8039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308182196
45	NC_014555	TTC	2	6	8114	8119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182196
46	NC_014555	CCG	2	6	8133	8138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308182196
47	NC_014555	CAC	2	6	8234	8239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308182196
48	NC_014555	GAT	2	6	8276	8281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182196
49	NC_014555	TAG	2	6	8315	8320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182196
50	NC_014555	GGA	2	6	8323	8328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308182196
51	NC_014555	ACA	2	6	8457	8462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308182196
52	NC_014555	TCT	2	6	8598	8603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182196
53	NC_014555	CTT	2	6	8719	8724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182196
54	NC_014555	GCA	2	6	8772	8777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308182196
55	NC_014555	CTT	2	6	8797	8802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182196
56	NC_014555	ACA	2	6	9125	9130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308182197
57	NC_014555	TCT	2	6	9159	9164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182197
58	NC_014555	CTT	2	6	9241	9246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182197
59	NC_014555	GAT	3	9	9329	9337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182197
60	NC_014555	TCT	2	6	9357	9362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182197
61	NC_014555	CTA	2	6	9373	9378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182197
62	NC_014555	TTG	2	6	9800	9805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308182198
63	NC_014555	GAA	2	6	9816	9821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308182198
64	NC_014555	TAT	2	6	9996	10001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182198
65	NC_014555	AGA	2	6	10010	10015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308182198
66	NC_014555	ACC	2	6	10018	10023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308182198
67	NC_014555	AAG	2	6	10051	10056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308182198
68	NC_014555	ATT	2	6	10084	10089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182198
69	NC_014555	CAT	2	6	10265	10270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182198
70	NC_014555	GTG	2	6	10299	10304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308182198
71	NC_014555	ATG	2	6	10579	10584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182198
72	NC_014555	AGG	2	6	10644	10649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308182198
73	NC_014555	AAC	2	6	10671	10676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308182198
74	NC_014555	AGA	2	6	11057	11062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308182198
75	NC_014555	TTG	2	6	11070	11075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308182198
76	NC_014555	GAC	2	6	11157	11162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308182198
77	NC_014555	TTA	3	9	11178	11186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182198
78	NC_014555	TTG	2	6	11235	11240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308182198
79	NC_014555	TGT	2	6	11421	11426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308182199
80	NC_014555	TGT	2	6	11589	11594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308182199
81	NC_014555	AAG	2	6	11748	11753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308182199
82	NC_014555	TGG	3	9	12159	12167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308182199
83	NC_014555	GAA	3	9	12176	12184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308182199
84	NC_014555	ATT	2	6	12229	12234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182199
85	NC_014555	AGA	2	6	12280	12285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308182199
86	NC_014555	TTA	2	6	12593	12598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182200
87	NC_014555	GAA	2	6	12610	12615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308182200
88	NC_014555	ATT	2	6	12633	12638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182200
89	NC_014555	GTT	2	6	12677	12682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308182200
90	NC_014555	ATT	2	6	12700	12705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182200
91	NC_014555	AAT	2	6	12949	12954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182200
92	NC_014555	AAT	2	6	12982	12987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182200
93	NC_014555	CAA	2	6	13081	13086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308182200
94	NC_014555	CCA	2	6	13139	13144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308182200
95	NC_014555	TTG	2	6	13226	13231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308182200
96	NC_014555	AGA	2	6	13278	13283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308182200
97	NC_014555	GTG	2	6	13703	13708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308182201
98	NC_014555	GAA	2	6	13794	13799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308182202
99	NC_014555	ATT	2	6	13981	13986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182202
100	NC_014555	TAT	2	6	14020	14025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182202
101	NC_014555	GAA	2	6	14120	14125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308182203
102	NC_014555	AAC	2	6	14126	14131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308182203
103	NC_014555	ATG	2	6	14145	14150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182203
104	NC_014555	GTG	2	6	14291	14296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308182203
105	NC_014555	CAA	2	6	14330	14335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308182203
106	NC_014555	AAG	2	6	14391	14396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308182203
107	NC_014555	TAG	2	6	14658	14663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182203
108	NC_014555	ATT	2	6	14715	14720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182203
109	NC_014555	GCT	2	6	14938	14943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308182203
110	NC_014555	ACC	2	6	15153	15158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308182203
111	NC_014555	ATT	2	6	15276	15281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182203
112	NC_014555	AAG	2	6	15309	15314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308182203
113	NC_014555	CAA	2	6	15322	15327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308182203
114	NC_014555	AAG	2	6	15333	15338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308182203
115	NC_014555	ATG	2	6	15413	15418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182203
116	NC_014555	ACG	2	6	15510	15515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308182203
117	NC_014555	CTT	2	6	15583	15588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182203
118	NC_014555	AAG	2	6	15624	15629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308182203
119	NC_014555	AGA	2	6	15634	15639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308182203
120	NC_014555	TAT	2	6	15887	15892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182203
121	NC_014555	AGA	2	6	15910	15915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308182203
122	NC_014555	GTG	3	9	16037	16045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308182203
123	NC_014555	TAT	2	6	16731	16736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182204
124	NC_014555	GAA	2	6	16737	16742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308182204
125	NC_014555	CTT	2	6	16855	16860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182204
126	NC_014555	ATT	2	6	17002	17007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182204
127	NC_014555	TAT	2	6	17103	17108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182204
128	NC_014555	ACA	2	6	17203	17208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308182204
129	NC_014555	CGG	2	6	17257	17262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308182204
130	NC_014555	GTT	2	6	17279	17284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308182204
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250	NC_014555	AGA	3	9	30086	30094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308182215
251	NC_014555	GCG	2	6	30172	30177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308182215
252	NC_014555	TGT	2	6	30250	30255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308182215
253	NC_014555	TTG	2	6	30286	30291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308182215
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380	NC_014555	CTA	2	6	43821	43826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182230
381	NC_014555	TGG	2	6	43851	43856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308182230
382	NC_014555	TCT	2	6	43907	43912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182230
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499	NC_014555	CAT	2	6	64896	64901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182243
500	NC_014555	CTT	2	6	64908	64913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182243

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