MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 2071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014554	GAAAC	2	10	346	355	60 %	0 %	20 %	20 %	308179192
2	NC_014554	ATATT	2	10	2830	2839	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014554	TATAA	2	10	3130	3139	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014554	CACCG	2	10	3597	3606	20 %	0 %	20 %	60 %	308179195
5	NC_014554	GTTGC	2	10	5366	5375	0 %	40 %	40 %	20 %	308179196
6	NC_014554	TTAAC	2	10	10056	10065	40 %	40 %	0 %	20 %	308179198
7	NC_014554	TCGTA	2	10	11485	11494	20 %	40 %	20 %	20 %	308179201
8	NC_014554	GACCA	2	10	11557	11566	40 %	0 %	20 %	40 %	308179201
9	NC_014554	GCTGA	2	10	11773	11782	20 %	20 %	40 %	20 %	308179201
10	NC_014554	CCTTG	2	10	12141	12150	0 %	40 %	20 %	40 %	308179201
11	NC_014554	AAAAC	2	10	17027	17036	80 %	0 %	0 %	20 %	308179205
12	NC_014554	ATCTT	2	10	18949	18958	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_014554	TTCAC	2	10	20717	20726	20 %	40 %	0 %	40 %	308179207
14	NC_014554	GGCGT	2	10	25871	25880	0 %	20 %	60 %	20 %	308179212
15	NC_014554	TCAAA	2	10	28340	28349	60 %	20 %	0 %	20 %	308179213
16	NC_014554	TCCGC	2	10	30379	30388	0 %	20 %	20 %	60 %	308179214
17	NC_014554	GTATA	2	10	31025	31034	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014554	CGCAC	2	10	31710	31719	20 %	0 %	20 %	60 %	308179215
19	NC_014554	TGATT	2	10	32073	32082	20 %	60 %	20 %	0 %	308179215
20	NC_014554	AAACA	2	10	32157	32166	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_014554	TTAGT	2	10	32237	32246	20 %	60 %	20 %	0 %	308179216
22	NC_014554	CCATA	2	10	33933	33942	40 %	20 %	0 %	40 %	308179217
23	NC_014554	GAAAC	2	10	34340	34349	60 %	0 %	20 %	20 %	308179217
24	NC_014554	ACTGG	2	10	34468	34477	20 %	20 %	40 %	20 %	308179217
25	NC_014554	GGTTT	2	10	36721	36730	0 %	60 %	40 %	0 %	308179219
26	NC_014554	TGATT	2	10	37908	37917	20 %	60 %	20 %	0 %	308179221
27	NC_014554	TGATT	2	10	39469	39478	20 %	60 %	20 %	0 %	308179222
28	NC_014554	GTATG	2	10	43139	43148	20 %	40 %	40 %	0 %	308179225
29	NC_014554	ATGTC	2	10	43217	43226	20 %	40 %	20 %	20 %	308179225
30	NC_014554	TTGTT	2	10	47077	47086	0 %	80 %	20 %	0 %	308179228
31	NC_014554	GAAAT	2	10	49340	49349	60 %	20 %	20 %	0 %	308179231
32	NC_014554	TGCGG	2	10	51638	51647	0 %	20 %	60 %	20 %	308179234
33	NC_014554	GCACG	2	10	55032	55041	20 %	0 %	40 %	40 %	308179236
34	NC_014554	TTACA	2	10	56969	56978	40 %	40 %	0 %	20 %	308179237
35	NC_014554	GGCAA	2	10	57781	57790	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_014554	GACCT	2	10	59287	59296	20 %	20 %	20 %	40 %	308179239
37	NC_014554	GATCA	2	10	59458	59467	40 %	20 %	20 %	20 %	308179239
38	NC_014554	GCTTG	2	10	64784	64793	0 %	40 %	40 %	20 %	308179245
39	NC_014554	ACTTC	2	10	64912	64921	20 %	40 %	0 %	40 %	308179245
40	NC_014554	AACGG	2	10	65129	65138	40 %	0 %	40 %	20 %	308179246
41	NC_014554	GTTAA	2	10	65162	65171	40 %	40 %	20 %	0 %	308179246
42	NC_014554	GCTTA	2	10	67138	67147	20 %	40 %	20 %	20 %	308179247
43	NC_014554	TTGAC	2	10	67387	67396	20 %	40 %	20 %	20 %	308179247
44	NC_014554	ATGCC	2	10	71918	71927	20 %	20 %	20 %	40 %	308179252
45	NC_014554	CTGAC	2	10	75171	75180	20 %	20 %	20 %	40 %	308179254
46	NC_014554	TTGAA	2	10	77245	77254	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014554	GTTAG	2	10	80766	80775	20 %	40 %	40 %	0 %	308179260
48	NC_014554	CTAAG	2	10	81196	81205	40 %	20 %	20 %	20 %	308179260
49	NC_014554	GGGGC	2	10	87812	87821	0 %	0 %	80 %	20 %	308179267
50	NC_014554	TATGA	2	10	88496	88505	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014554	GCACG	2	10	89061	89070	20 %	0 %	40 %	40 %	308179269
52	NC_014554	TGATT	2	10	94387	94396	20 %	60 %	20 %	0 %	308179275
53	NC_014554	TGGGA	2	10	97073	97082	20 %	20 %	60 %	0 %	308179279
54	NC_014554	TAAGC	2	10	98615	98624	40 %	20 %	20 %	20 %	308179281
55	NC_014554	GATCA	2	10	98662	98671	40 %	20 %	20 %	20 %	308179281
56	NC_014554	TTGAT	2	10	100386	100395	20 %	60 %	20 %	0 %	308179282
57	NC_014554	CACGT	2	10	100567	100576	20 %	20 %	20 %	40 %	308179283
58	NC_014554	GGCGG	2	10	100815	100824	0 %	0 %	80 %	20 %	308179283
59	NC_014554	CACGG	2	10	101109	101118	20 %	0 %	40 %	40 %	308179283
60	NC_014554	TTCAT	2	10	103766	103775	20 %	60 %	0 %	20 %	308179286
61	NC_014554	GGTTA	2	10	105911	105920	20 %	40 %	40 %	0 %	308179288
62	NC_014554	ATTGA	2	10	107245	107254	40 %	40 %	20 %	0 %	308179289
63	NC_014554	GCTGG	2	10	108709	108718	0 %	20 %	60 %	20 %	308179290
64	NC_014554	ACCGT	2	10	109414	109423	20 %	20 %	20 %	40 %	308179291
65	NC_014554	TCATT	2	10	111453	111462	20 %	60 %	0 %	20 %	308179292
66	NC_014554	TAAAT	2	10	112794	112803	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014554	AGCTA	2	10	112904	112913	40 %	20 %	20 %	20 %	308179293
68	NC_014554	TTCGA	2	10	117354	117363	20 %	40 %	20 %	20 %	308179299
69	NC_014554	ATGTT	2	10	117520	117529	20 %	60 %	20 %	0 %	308179299
70	NC_014554	CGGCG	2	10	119357	119366	0 %	0 %	60 %	40 %	308179301
71	NC_014554	CATGC	2	10	120542	120551	20 %	20 %	20 %	40 %	308179302
72	NC_014554	CAACC	2	10	120805	120814	40 %	0 %	0 %	60 %	308179302
73	NC_014554	ATCAA	2	10	121408	121417	60 %	20 %	0 %	20 %	308179303
74	NC_014554	GTTCA	2	10	122576	122585	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_014554	TAATC	2	10	127544	127553	40 %	40 %	0 %	20 %	308179308
76	NC_014554	TCGAT	2	10	128742	128751	20 %	40 %	20 %	20 %	308179309
77	NC_014554	AAATT	2	10	129033	129042	60 %	40 %	0 %	0 %	308179309
78	NC_014554	GTACC	2	10	130826	130835	20 %	20 %	20 %	40 %	308179310
79	NC_014554	GAATT	2	10	131637	131646	40 %	40 %	20 %	0 %	308179311
80	NC_014554	AATCA	2	10	134817	134826	60 %	20 %	0 %	20 %	308179315
81	NC_014554	TTGAC	2	10	137001	137010	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_014554	TAAAA	2	10	137047	137056	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014554	TAAAC	2	10	137473	137482	60 %	20 %	0 %	20 %	308179318
84	NC_014554	ATGAA	2	10	140036	140045	60 %	20 %	20 %	0 %	308179320
85	NC_014554	GGAAT	2	10	140547	140556	40 %	20 %	40 %	0 %	308179321
86	NC_014554	ATTAA	2	10	142082	142091	60 %	40 %	0 %	0 %	308179321
87	NC_014554	TGACG	2	10	143308	143317	20 %	20 %	40 %	20 %	308179323
88	NC_014554	TCACC	2	10	144910	144919	20 %	20 %	0 %	60 %	308179325
89	NC_014554	AACTA	2	10	145860	145869	60 %	20 %	0 %	20 %	308179326
90	NC_014554	GCAAA	2	10	145951	145960	60 %	0 %	20 %	20 %	308179326
91	NC_014554	ACCGA	2	10	146134	146143	40 %	0 %	20 %	40 %	308179326
92	NC_014554	TTTTA	2	10	147871	147880	20 %	80 %	0 %	0 %	308179329
93	NC_014554	TATCT	2	10	149805	149814	20 %	60 %	0 %	20 %	308179331
94	NC_014554	CAACG	2	10	151811	151820	40 %	0 %	20 %	40 %	308179332
95	NC_014554	ATTGG	3	15	153309	153323	20 %	40 %	40 %	0 %	308179333
96	NC_014554	AAAAC	2	10	155037	155046	80 %	0 %	0 %	20 %	308179335
97	NC_014554	TCCGG	2	10	155056	155065	0 %	20 %	40 %	40 %	308179335
98	NC_014554	TTAAC	2	10	155673	155682	40 %	40 %	0 %	20 %	308179335
99	NC_014554	GTTGT	2	10	155786	155795	0 %	60 %	40 %	0 %	308179335
100	NC_014554	AGGTC	2	10	157039	157048	20 %	20 %	40 %	20 %	308179336
101	NC_014554	GATCG	2	10	157924	157933	20 %	20 %	40 %	20 %	308179337
102	NC_014554	CAACG	2	10	165754	165763	40 %	0 %	20 %	40 %	308179342
103	NC_014554	TTTAA	2	10	167698	167707	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014554	AATTG	2	10	167773	167782	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014554	ATATA	2	10	167829	167838	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014554	TTCGT	2	10	168414	168423	0 %	60 %	20 %	20 %	308179343
107	NC_014554	TCTGG	2	10	168597	168606	0 %	40 %	40 %	20 %	308179343
108	NC_014554	GGTTA	2	10	173038	173047	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014554	ATTAA	2	10	173352	173361	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014554	AACTG	2	10	174744	174753	40 %	20 %	20 %	20 %	308179346
111	NC_014554	GGCGT	2	10	182568	182577	0 %	20 %	60 %	20 %	308179351
112	NC_014554	TGTGA	2	10	182667	182676	20 %	40 %	40 %	0 %	308179351
113	NC_014554	TTTGG	2	10	183727	183736	0 %	60 %	40 %	0 %	308179352
114	NC_014554	ATCTG	2	10	185598	185607	20 %	40 %	20 %	20 %	308179353
115	NC_014554	TCAAA	2	10	190766	190775	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_014554	TATAA	2	10	190902	190911	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014554	AACCC	2	10	196094	196103	40 %	0 %	0 %	60 %	308179365
118	NC_014554	TCCAA	2	10	198419	198428	40 %	20 %	0 %	40 %	308179367
119	NC_014554	AGGAC	2	10	198566	198575	40 %	0 %	40 %	20 %	308179367
120	NC_014554	AGTTG	2	10	199303	199312	20 %	40 %	40 %	0 %	308179368
121	NC_014554	TTGTG	2	10	199581	199590	0 %	60 %	40 %	0 %	308179368
122	NC_014554	ACTTG	2	10	201409	201418	20 %	40 %	20 %	20 %	308179370
123	NC_014554	TTTAA	2	10	201866	201875	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014554	TACGT	2	10	201906	201915	20 %	40 %	20 %	20 %	308179371
125	NC_014554	AAAAT	2	10	204099	204108	80 %	20 %	0 %	0 %	308179373
126	NC_014554	GTAAA	2	10	205590	205599	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014554	ACCAT	2	10	206313	206322	40 %	20 %	0 %	40 %	308179376
128	NC_014554	ATGCA	2	10	211513	211522	40 %	20 %	20 %	20 %	308179379
129	NC_014554	AAAAT	2	10	214818	214827	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014554	GGCGC	2	10	217059	217068	0 %	0 %	60 %	40 %	308179387
131	NC_014554	AGCTT	2	10	221805	221814	20 %	40 %	20 %	20 %	308179390
132	NC_014554	TGAAC	2	10	222646	222655	40 %	20 %	20 %	20 %	308179392
133	NC_014554	ACTGA	2	10	223464	223473	40 %	20 %	20 %	20 %	308179393
134	NC_014554	TGATG	2	10	224915	224924	20 %	40 %	40 %	0 %	308179394
135	NC_014554	TTGGT	2	10	225310	225319	0 %	60 %	40 %	0 %	308179394
136	NC_014554	AGCGC	2	10	229400	229409	20 %	0 %	40 %	40 %	308179399
137	NC_014554	GTGAC	2	10	231907	231916	20 %	20 %	40 %	20 %	308179401
138	NC_014554	TCTAT	2	10	232036	232045	20 %	60 %	0 %	20 %	308179402
139	NC_014554	GGTCA	2	10	236386	236395	20 %	20 %	40 %	20 %	308179407
140	NC_014554	GTGAC	2	10	236675	236684	20 %	20 %	40 %	20 %	308179407
141	NC_014554	TAATT	2	10	237096	237105	40 %	60 %	0 %	0 %	308179407
142	NC_014554	AGGTT	2	10	238422	238431	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014554	GTGAC	2	10	242166	242175	20 %	20 %	40 %	20 %	308179411
144	NC_014554	ACAAT	2	10	242900	242909	60 %	20 %	0 %	20 %	308179412
145	NC_014554	TAAAG	2	10	248526	248535	60 %	20 %	20 %	0 %	308179418
146	NC_014554	AAAAT	2	10	249374	249383	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014554	TAAGA	2	10	250368	250377	60 %	20 %	20 %	0 %	308179420
148	NC_014554	TTAAT	2	10	251953	251962	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014554	CTGGC	2	10	252366	252375	0 %	20 %	40 %	40 %	308179423
150	NC_014554	CCGTT	2	10	254068	254077	0 %	40 %	20 %	40 %	308179424
151	NC_014554	AACGG	2	10	255091	255100	40 %	0 %	40 %	20 %	308179426
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154	NC_014554	AAGTT	2	10	257313	257322	40 %	40 %	20 %	0 %	308179428
155	NC_014554	GAATT	2	10	258347	258356	40 %	40 %	20 %	0 %	308179429
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157	NC_014554	AATTA	2	10	259198	259207	60 %	40 %	0 %	0 %	308179430
158	NC_014554	TTAAT	2	10	259544	259553	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_014554	GGCGT	2	10	259875	259884	0 %	20 %	60 %	20 %	308179431
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161	NC_014554	ACGAA	2	10	264288	264297	60 %	0 %	20 %	20 %	308179432
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163	NC_014554	TTACG	2	10	266875	266884	20 %	40 %	20 %	20 %	308179434
164	NC_014554	GTACC	2	10	267332	267341	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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166	NC_014554	TGATT	2	10	269910	269919	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
167	NC_014554	TTGGC	2	10	274179	274188	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
168	NC_014554	ATCAC	2	10	277897	277906	40 %	20 %	0 %	40 %	308179443
169	NC_014554	ACATT	2	10	280516	280525	40 %	40 %	0 %	20 %	308179445
170	NC_014554	GATGT	2	10	281211	281220	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
171	NC_014554	TGGCG	2	10	282206	282215	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
172	NC_014554	ATTAA	2	10	283560	283569	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_014554	AATAT	2	10	284544	284553	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_014554	TTTAC	2	10	284616	284625	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
175	NC_014554	TGAGT	2	10	285237	285246	20 %	40 %	40 %	0 %	308179451
176	NC_014554	TGAAT	2	10	285993	286002	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
177	NC_014554	TTCGT	2	10	288567	288576	0 %	60 %	20 %	20 %	308179454
178	NC_014554	TAAAC	2	10	290589	290598	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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182	NC_014554	CAACT	2	10	295866	295875	40 %	20 %	0 %	40 %	308179464
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191	NC_014554	AACGA	2	10	304035	304044	60 %	0 %	20 %	20 %	308179470
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195	NC_014554	AGGGT	2	10	306566	306575	20 %	20 %	60 %	0 %	308179473
196	NC_014554	GACCT	2	10	309174	309183	20 %	20 %	20 %	40 %	308179476
197	NC_014554	CTCAT	2	10	309717	309726	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
198	NC_014554	CAACA	2	10	309817	309826	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
199	NC_014554	GATTT	2	10	310974	310983	20 %	60 %	20 %	0 %	308179478
200	NC_014554	ATTAA	2	10	312111	312120	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
201	NC_014554	TACAA	2	10	312199	312208	60 %	20 %	0 %	20 %	308179480
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220	NC_014554	AAGCT	2	10	343597	343606	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
221	NC_014554	AAGCA	2	10	343657	343666	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
222	NC_014554	TAGTT	2	10	345575	345584	20 %	60 %	20 %	0 %	308179508
223	NC_014554	TTGGT	2	10	347394	347403	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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229	NC_014554	AATTA	2	10	353514	353523	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
230	NC_014554	ACTAA	2	10	358987	358996	60 %	20 %	0 %	20 %	308179526
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233	NC_014554	ATTGA	2	10	360277	360286	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
234	NC_014554	GCATG	2	10	360828	360837	20 %	20 %	40 %	20 %	308179530
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237	NC_014554	AGTAC	2	10	363569	363578	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
238	NC_014554	AGAGT	2	10	365525	365534	40 %	20 %	40 %	0 %	308179536
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248	NC_014554	ATTAA	2	10	383470	383479	60 %	40 %	0 %	0 %	308179553
249	NC_014554	TTGGC	2	10	385317	385326	0 %	40 %	40 %	20 %	308179555
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256	NC_014554	TCGGT	2	10	393431	393440	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
257	NC_014554	AAATT	2	10	394749	394758	60 %	40 %	0 %	0 %	308179563
258	NC_014554	TGACC	2	10	394888	394897	20 %	20 %	20 %	40 %	308179564
259	NC_014554	TTTAA	2	10	394991	395000	40 %	60 %	0 %	0 %	308179564
260	NC_014554	ACGGA	2	10	395430	395439	40 %	0 %	40 %	20 %	308179564
261	NC_014554	TAAGC	2	10	395699	395708	40 %	20 %	20 %	20 %	308179564
262	NC_014554	CGTTT	2	10	397224	397233	0 %	60 %	20 %	20 %	308179566
263	NC_014554	GATGG	2	10	398799	398808	20 %	20 %	60 %	0 %	308179569
264	NC_014554	TTTTA	2	10	402077	402086	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
265	NC_014554	TGGAC	2	10	402449	402458	20 %	20 %	40 %	20 %	308179571
266	NC_014554	TGATT	2	10	403311	403320	20 %	60 %	20 %	0 %	308179572
267	NC_014554	TTAAA	2	10	406996	407005	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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269	NC_014554	AATGA	2	10	407749	407758	60 %	20 %	20 %	0 %	308179578
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398	NC_014554	TGGAT	2	10	596437	596446	20 %	40 %	40 %	0 %	308179747
399	NC_014554	TAGTT	2	10	597629	597638	20 %	60 %	20 %	0 %	308179748
400	NC_014554	TATTT	2	10	601629	601638	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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