MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 1561

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014554	GAAAC	2	10	346	355	60 %	0 %	20 %	20 %	308179192
2	NC_014554	CACCG	2	10	3597	3606	20 %	0 %	20 %	60 %	308179195
3	NC_014554	GTTGC	2	10	5366	5375	0 %	40 %	40 %	20 %	308179196
4	NC_014554	TTAAC	2	10	10056	10065	40 %	40 %	0 %	20 %	308179198
5	NC_014554	TCGTA	2	10	11485	11494	20 %	40 %	20 %	20 %	308179201
6	NC_014554	GACCA	2	10	11557	11566	40 %	0 %	20 %	40 %	308179201
7	NC_014554	GCTGA	2	10	11773	11782	20 %	20 %	40 %	20 %	308179201
8	NC_014554	CCTTG	2	10	12141	12150	0 %	40 %	20 %	40 %	308179201
9	NC_014554	AAAAC	2	10	17027	17036	80 %	0 %	0 %	20 %	308179205
10	NC_014554	TTCAC	2	10	20717	20726	20 %	40 %	0 %	40 %	308179207
11	NC_014554	GGCGT	2	10	25871	25880	0 %	20 %	60 %	20 %	308179212
12	NC_014554	TCAAA	2	10	28340	28349	60 %	20 %	0 %	20 %	308179213
13	NC_014554	TCCGC	2	10	30379	30388	0 %	20 %	20 %	60 %	308179214
14	NC_014554	CGCAC	2	10	31710	31719	20 %	0 %	20 %	60 %	308179215
15	NC_014554	TGATT	2	10	32073	32082	20 %	60 %	20 %	0 %	308179215
16	NC_014554	TTAGT	2	10	32237	32246	20 %	60 %	20 %	0 %	308179216
17	NC_014554	CCATA	2	10	33933	33942	40 %	20 %	0 %	40 %	308179217
18	NC_014554	GAAAC	2	10	34340	34349	60 %	0 %	20 %	20 %	308179217
19	NC_014554	ACTGG	2	10	34468	34477	20 %	20 %	40 %	20 %	308179217
20	NC_014554	GGTTT	2	10	36721	36730	0 %	60 %	40 %	0 %	308179219
21	NC_014554	TGATT	2	10	37908	37917	20 %	60 %	20 %	0 %	308179221
22	NC_014554	TGATT	2	10	39469	39478	20 %	60 %	20 %	0 %	308179222
23	NC_014554	GTATG	2	10	43139	43148	20 %	40 %	40 %	0 %	308179225
24	NC_014554	ATGTC	2	10	43217	43226	20 %	40 %	20 %	20 %	308179225
25	NC_014554	TTGTT	2	10	47077	47086	0 %	80 %	20 %	0 %	308179228
26	NC_014554	GAAAT	2	10	49340	49349	60 %	20 %	20 %	0 %	308179231
27	NC_014554	TGCGG	2	10	51638	51647	0 %	20 %	60 %	20 %	308179234
28	NC_014554	GCACG	2	10	55032	55041	20 %	0 %	40 %	40 %	308179236
29	NC_014554	TTACA	2	10	56969	56978	40 %	40 %	0 %	20 %	308179237
30	NC_014554	GACCT	2	10	59287	59296	20 %	20 %	20 %	40 %	308179239
31	NC_014554	GATCA	2	10	59458	59467	40 %	20 %	20 %	20 %	308179239
32	NC_014554	GCTTG	2	10	64784	64793	0 %	40 %	40 %	20 %	308179245
33	NC_014554	ACTTC	2	10	64912	64921	20 %	40 %	0 %	40 %	308179245
34	NC_014554	AACGG	2	10	65129	65138	40 %	0 %	40 %	20 %	308179246
35	NC_014554	GTTAA	2	10	65162	65171	40 %	40 %	20 %	0 %	308179246
36	NC_014554	GCTTA	2	10	67138	67147	20 %	40 %	20 %	20 %	308179247
37	NC_014554	TTGAC	2	10	67387	67396	20 %	40 %	20 %	20 %	308179247
38	NC_014554	ATGCC	2	10	71918	71927	20 %	20 %	20 %	40 %	308179252
39	NC_014554	CTGAC	2	10	75171	75180	20 %	20 %	20 %	40 %	308179254
40	NC_014554	GTTAG	2	10	80766	80775	20 %	40 %	40 %	0 %	308179260
41	NC_014554	CTAAG	2	10	81196	81205	40 %	20 %	20 %	20 %	308179260
42	NC_014554	GGGGC	2	10	87812	87821	0 %	0 %	80 %	20 %	308179267
43	NC_014554	GCACG	2	10	89061	89070	20 %	0 %	40 %	40 %	308179269
44	NC_014554	TGATT	2	10	94387	94396	20 %	60 %	20 %	0 %	308179275
45	NC_014554	TGGGA	2	10	97073	97082	20 %	20 %	60 %	0 %	308179279
46	NC_014554	TAAGC	2	10	98615	98624	40 %	20 %	20 %	20 %	308179281
47	NC_014554	GATCA	2	10	98662	98671	40 %	20 %	20 %	20 %	308179281
48	NC_014554	TTGAT	2	10	100386	100395	20 %	60 %	20 %	0 %	308179282
49	NC_014554	CACGT	2	10	100567	100576	20 %	20 %	20 %	40 %	308179283
50	NC_014554	GGCGG	2	10	100815	100824	0 %	0 %	80 %	20 %	308179283
51	NC_014554	CACGG	2	10	101109	101118	20 %	0 %	40 %	40 %	308179283
52	NC_014554	TTCAT	2	10	103766	103775	20 %	60 %	0 %	20 %	308179286
53	NC_014554	GGTTA	2	10	105911	105920	20 %	40 %	40 %	0 %	308179288
54	NC_014554	ATTGA	2	10	107245	107254	40 %	40 %	20 %	0 %	308179289
55	NC_014554	GCTGG	2	10	108709	108718	0 %	20 %	60 %	20 %	308179290
56	NC_014554	ACCGT	2	10	109414	109423	20 %	20 %	20 %	40 %	308179291
57	NC_014554	TCATT	2	10	111453	111462	20 %	60 %	0 %	20 %	308179292
58	NC_014554	AGCTA	2	10	112904	112913	40 %	20 %	20 %	20 %	308179293
59	NC_014554	TTCGA	2	10	117354	117363	20 %	40 %	20 %	20 %	308179299
60	NC_014554	ATGTT	2	10	117520	117529	20 %	60 %	20 %	0 %	308179299
61	NC_014554	CGGCG	2	10	119357	119366	0 %	0 %	60 %	40 %	308179301
62	NC_014554	CATGC	2	10	120542	120551	20 %	20 %	20 %	40 %	308179302
63	NC_014554	CAACC	2	10	120805	120814	40 %	0 %	0 %	60 %	308179302
64	NC_014554	ATCAA	2	10	121408	121417	60 %	20 %	0 %	20 %	308179303
65	NC_014554	TAATC	2	10	127544	127553	40 %	40 %	0 %	20 %	308179308
66	NC_014554	TCGAT	2	10	128742	128751	20 %	40 %	20 %	20 %	308179309
67	NC_014554	AAATT	2	10	129033	129042	60 %	40 %	0 %	0 %	308179309
68	NC_014554	GTACC	2	10	130826	130835	20 %	20 %	20 %	40 %	308179310
69	NC_014554	GAATT	2	10	131637	131646	40 %	40 %	20 %	0 %	308179311
70	NC_014554	AATCA	2	10	134817	134826	60 %	20 %	0 %	20 %	308179315
71	NC_014554	TAAAC	2	10	137473	137482	60 %	20 %	0 %	20 %	308179318
72	NC_014554	ATGAA	2	10	140036	140045	60 %	20 %	20 %	0 %	308179320
73	NC_014554	GGAAT	2	10	140547	140556	40 %	20 %	40 %	0 %	308179321
74	NC_014554	ATTAA	2	10	142082	142091	60 %	40 %	0 %	0 %	308179321
75	NC_014554	TGACG	2	10	143308	143317	20 %	20 %	40 %	20 %	308179323
76	NC_014554	TCACC	2	10	144910	144919	20 %	20 %	0 %	60 %	308179325
77	NC_014554	AACTA	2	10	145860	145869	60 %	20 %	0 %	20 %	308179326
78	NC_014554	GCAAA	2	10	145951	145960	60 %	0 %	20 %	20 %	308179326
79	NC_014554	ACCGA	2	10	146134	146143	40 %	0 %	20 %	40 %	308179326
80	NC_014554	TTTTA	2	10	147871	147880	20 %	80 %	0 %	0 %	308179329
81	NC_014554	TATCT	2	10	149805	149814	20 %	60 %	0 %	20 %	308179331
82	NC_014554	CAACG	2	10	151811	151820	40 %	0 %	20 %	40 %	308179332
83	NC_014554	ATTGG	3	15	153309	153323	20 %	40 %	40 %	0 %	308179333
84	NC_014554	AAAAC	2	10	155037	155046	80 %	0 %	0 %	20 %	308179335
85	NC_014554	TCCGG	2	10	155056	155065	0 %	20 %	40 %	40 %	308179335
86	NC_014554	TTAAC	2	10	155673	155682	40 %	40 %	0 %	20 %	308179335
87	NC_014554	GTTGT	2	10	155786	155795	0 %	60 %	40 %	0 %	308179335
88	NC_014554	AGGTC	2	10	157039	157048	20 %	20 %	40 %	20 %	308179336
89	NC_014554	GATCG	2	10	157924	157933	20 %	20 %	40 %	20 %	308179337
90	NC_014554	CAACG	2	10	165754	165763	40 %	0 %	20 %	40 %	308179342
91	NC_014554	TTCGT	2	10	168414	168423	0 %	60 %	20 %	20 %	308179343
92	NC_014554	TCTGG	2	10	168597	168606	0 %	40 %	40 %	20 %	308179343
93	NC_014554	AACTG	2	10	174744	174753	40 %	20 %	20 %	20 %	308179346
94	NC_014554	GGCGT	2	10	182568	182577	0 %	20 %	60 %	20 %	308179351
95	NC_014554	TGTGA	2	10	182667	182676	20 %	40 %	40 %	0 %	308179351
96	NC_014554	TTTGG	2	10	183727	183736	0 %	60 %	40 %	0 %	308179352
97	NC_014554	ATCTG	2	10	185598	185607	20 %	40 %	20 %	20 %	308179353
98	NC_014554	AACCC	2	10	196094	196103	40 %	0 %	0 %	60 %	308179365
99	NC_014554	TCCAA	2	10	198419	198428	40 %	20 %	0 %	40 %	308179367
100	NC_014554	AGGAC	2	10	198566	198575	40 %	0 %	40 %	20 %	308179367
101	NC_014554	AGTTG	2	10	199303	199312	20 %	40 %	40 %	0 %	308179368
102	NC_014554	TTGTG	2	10	199581	199590	0 %	60 %	40 %	0 %	308179368
103	NC_014554	ACTTG	2	10	201409	201418	20 %	40 %	20 %	20 %	308179370
104	NC_014554	TACGT	2	10	201906	201915	20 %	40 %	20 %	20 %	308179371
105	NC_014554	AAAAT	2	10	204099	204108	80 %	20 %	0 %	0 %	308179373
106	NC_014554	ACCAT	2	10	206313	206322	40 %	20 %	0 %	40 %	308179376
107	NC_014554	ATGCA	2	10	211513	211522	40 %	20 %	20 %	20 %	308179379
108	NC_014554	GGCGC	2	10	217059	217068	0 %	0 %	60 %	40 %	308179387
109	NC_014554	AGCTT	2	10	221805	221814	20 %	40 %	20 %	20 %	308179390
110	NC_014554	TGAAC	2	10	222646	222655	40 %	20 %	20 %	20 %	308179392
111	NC_014554	ACTGA	2	10	223464	223473	40 %	20 %	20 %	20 %	308179393
112	NC_014554	TGATG	2	10	224915	224924	20 %	40 %	40 %	0 %	308179394
113	NC_014554	TTGGT	2	10	225310	225319	0 %	60 %	40 %	0 %	308179394
114	NC_014554	AGCGC	2	10	229400	229409	20 %	0 %	40 %	40 %	308179399
115	NC_014554	GTGAC	2	10	231907	231916	20 %	20 %	40 %	20 %	308179401
116	NC_014554	TCTAT	2	10	232036	232045	20 %	60 %	0 %	20 %	308179402
117	NC_014554	GGTCA	2	10	236386	236395	20 %	20 %	40 %	20 %	308179407
118	NC_014554	GTGAC	2	10	236675	236684	20 %	20 %	40 %	20 %	308179407
119	NC_014554	TAATT	2	10	237096	237105	40 %	60 %	0 %	0 %	308179407
120	NC_014554	GTGAC	2	10	242166	242175	20 %	20 %	40 %	20 %	308179411
121	NC_014554	ACAAT	2	10	242900	242909	60 %	20 %	0 %	20 %	308179412
122	NC_014554	TAAAG	2	10	248526	248535	60 %	20 %	20 %	0 %	308179418
123	NC_014554	TAAGA	2	10	250368	250377	60 %	20 %	20 %	0 %	308179420
124	NC_014554	CTGGC	2	10	252366	252375	0 %	20 %	40 %	40 %	308179423
125	NC_014554	CCGTT	2	10	254068	254077	0 %	40 %	20 %	40 %	308179424
126	NC_014554	AACGG	2	10	255091	255100	40 %	0 %	40 %	20 %	308179426
127	NC_014554	AGTGA	2	10	255784	255793	40 %	20 %	40 %	0 %	308179427
128	NC_014554	GCCTT	2	10	256902	256911	0 %	40 %	20 %	40 %	308179428
129	NC_014554	AAGTT	2	10	257313	257322	40 %	40 %	20 %	0 %	308179428
130	NC_014554	GAATT	2	10	258347	258356	40 %	40 %	20 %	0 %	308179429
131	NC_014554	CGTTA	2	10	258751	258760	20 %	40 %	20 %	20 %	308179430
132	NC_014554	AATTA	2	10	259198	259207	60 %	40 %	0 %	0 %	308179430
133	NC_014554	GGCGT	2	10	259875	259884	0 %	20 %	60 %	20 %	308179431
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258	NC_014554	TGAAT	2	10	486805	486814	40 %	40 %	20 %	0 %	308179647
259	NC_014554	GATTC	2	10	486989	486998	20 %	40 %	20 %	20 %	308179647
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