MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 7022

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014554	GAAT	2	8	582	589	50 %	25 %	25 %	0 %	308179192
2	NC_014554	TAAT	2	8	590	597	50 %	50 %	0 %	0 %	308179192
3	NC_014554	CGAA	2	8	776	783	50 %	0 %	25 %	25 %	308179192
4	NC_014554	GAAA	2	8	1151	1158	75 %	0 %	25 %	0 %	308179192
5	NC_014554	ACTG	2	8	1212	1219	25 %	25 %	25 %	25 %	308179192
6	NC_014554	CGTT	2	8	2563	2570	0 %	50 %	25 %	25 %	308179193
7	NC_014554	GTTA	2	8	3326	3333	25 %	50 %	25 %	0 %	308179194
8	NC_014554	AATT	2	8	3619	3626	50 %	50 %	0 %	0 %	308179195
9	NC_014554	AGCG	2	8	3718	3725	25 %	0 %	50 %	25 %	308179195
10	NC_014554	GTCG	2	8	4148	4155	0 %	25 %	50 %	25 %	308179195
11	NC_014554	ATTA	2	8	4502	4509	50 %	50 %	0 %	0 %	308179195
12	NC_014554	TACG	2	8	5428	5435	25 %	25 %	25 %	25 %	308179196
13	NC_014554	ATTA	2	8	6079	6086	50 %	50 %	0 %	0 %	308179196
14	NC_014554	TGAG	2	8	6258	6265	25 %	25 %	50 %	0 %	308179196
15	NC_014554	ACGT	2	8	6791	6798	25 %	25 %	25 %	25 %	308179197
16	NC_014554	TAGC	2	8	8054	8061	25 %	25 %	25 %	25 %	308179197
17	NC_014554	AAAC	2	8	8848	8855	75 %	0 %	0 %	25 %	308179197
18	NC_014554	TTAC	2	8	9885	9892	25 %	50 %	0 %	25 %	308179198
19	NC_014554	TTGA	2	8	11440	11447	25 %	50 %	25 %	0 %	308179201
20	NC_014554	AACC	2	8	12216	12223	50 %	0 %	0 %	50 %	308179201
21	NC_014554	AATC	2	8	12286	12293	50 %	25 %	0 %	25 %	308179201
22	NC_014554	AATG	2	8	12375	12382	50 %	25 %	25 %	0 %	308179201
23	NC_014554	CAAT	2	8	12737	12744	50 %	25 %	0 %	25 %	308179201
24	NC_014554	CAGT	2	8	13189	13196	25 %	25 %	25 %	25 %	308179201
25	NC_014554	TTGA	2	8	13216	13223	25 %	50 %	25 %	0 %	308179201
26	NC_014554	TTAA	2	8	13366	13373	50 %	50 %	0 %	0 %	308179202
27	NC_014554	CAAT	2	8	13406	13413	50 %	25 %	0 %	25 %	308179202
28	NC_014554	CAAA	2	8	13569	13576	75 %	0 %	0 %	25 %	308179202
29	NC_014554	ACGG	2	8	14535	14542	25 %	0 %	50 %	25 %	308179203
30	NC_014554	ATGG	2	8	15673	15680	25 %	25 %	50 %	0 %	308179204
31	NC_014554	TGGC	2	8	15722	15729	0 %	25 %	50 %	25 %	308179204
32	NC_014554	TGGT	2	8	15841	15848	0 %	50 %	50 %	0 %	308179204
33	NC_014554	TTTA	2	8	16037	16044	25 %	75 %	0 %	0 %	308179204
34	NC_014554	GACG	2	8	16577	16584	25 %	0 %	50 %	25 %	308179204
35	NC_014554	GATC	2	8	16714	16721	25 %	25 %	25 %	25 %	308179205
36	NC_014554	AGCT	2	8	17263	17270	25 %	25 %	25 %	25 %	308179205
37	NC_014554	GCTA	2	8	17493	17500	25 %	25 %	25 %	25 %	308179206
38	NC_014554	AAAC	2	8	19704	19711	75 %	0 %	0 %	25 %	308179207
39	NC_014554	ACGA	2	8	20311	20318	50 %	0 %	25 %	25 %	308179207
40	NC_014554	TAAG	2	8	20996	21003	50 %	25 %	25 %	0 %	308179208
41	NC_014554	AAAC	2	8	21106	21113	75 %	0 %	0 %	25 %	308179209
42	NC_014554	ATGA	2	8	21121	21128	50 %	25 %	25 %	0 %	308179209
43	NC_014554	CGAA	2	8	21420	21427	50 %	0 %	25 %	25 %	308179209
44	NC_014554	CAAC	2	8	22912	22919	50 %	0 %	0 %	50 %	308179209
45	NC_014554	GCGG	2	8	23024	23031	0 %	0 %	75 %	25 %	308179210
46	NC_014554	ATTG	2	8	24025	24032	25 %	50 %	25 %	0 %	308179210
47	NC_014554	AGTG	2	8	24144	24151	25 %	25 %	50 %	0 %	308179211
48	NC_014554	GGTT	2	8	24242	24249	0 %	50 %	50 %	0 %	308179211
49	NC_014554	GGAA	2	8	25393	25400	50 %	0 %	50 %	0 %	308179212
50	NC_014554	CCGA	2	8	25442	25449	25 %	0 %	25 %	50 %	308179212
51	NC_014554	AGCT	2	8	26376	26383	25 %	25 %	25 %	25 %	308179212
52	NC_014554	TCTT	2	8	26409	26416	0 %	75 %	0 %	25 %	308179212
53	NC_014554	CGGT	2	8	26493	26500	0 %	25 %	50 %	25 %	308179212
54	NC_014554	CCAG	2	8	26572	26579	25 %	0 %	25 %	50 %	308179212
55	NC_014554	TCAG	2	8	27061	27068	25 %	25 %	25 %	25 %	308179213
56	NC_014554	ATGG	2	8	27207	27214	25 %	25 %	50 %	0 %	308179213
57	NC_014554	CGTG	2	8	27605	27612	0 %	25 %	50 %	25 %	308179213
58	NC_014554	CCTA	2	8	27970	27977	25 %	25 %	0 %	50 %	308179213
59	NC_014554	AACC	2	8	28131	28138	50 %	0 %	0 %	50 %	308179213
60	NC_014554	ATTG	2	8	28148	28155	25 %	50 %	25 %	0 %	308179213
61	NC_014554	CAAG	2	8	28268	28275	50 %	0 %	25 %	25 %	308179213
62	NC_014554	TGAT	2	8	28882	28889	25 %	50 %	25 %	0 %	308179213
63	NC_014554	ACGA	2	8	29134	29141	50 %	0 %	25 %	25 %	308179213
64	NC_014554	GATT	2	8	29284	29291	25 %	50 %	25 %	0 %	308179214
65	NC_014554	TTTA	2	8	29648	29655	25 %	75 %	0 %	0 %	308179214
66	NC_014554	CGTG	2	8	29683	29690	0 %	25 %	50 %	25 %	308179214
67	NC_014554	CATT	3	12	30048	30059	25 %	50 %	0 %	25 %	308179214
68	NC_014554	TGGC	2	8	30193	30200	0 %	25 %	50 %	25 %	308179214
69	NC_014554	TGGA	2	8	31346	31353	25 %	25 %	50 %	0 %	308179215
70	NC_014554	CAGA	2	8	31692	31699	50 %	0 %	25 %	25 %	308179215
71	NC_014554	AGCC	2	8	32569	32576	25 %	0 %	25 %	50 %	308179216
72	NC_014554	TAGC	2	8	32671	32678	25 %	25 %	25 %	25 %	308179216
73	NC_014554	ATCC	2	8	32744	32751	25 %	25 %	0 %	50 %	308179216
74	NC_014554	CGAT	2	8	33915	33922	25 %	25 %	25 %	25 %	308179217
75	NC_014554	AGTG	2	8	34068	34075	25 %	25 %	50 %	0 %	308179217
76	NC_014554	CGGT	2	8	34210	34217	0 %	25 %	50 %	25 %	308179217
77	NC_014554	TAGT	2	8	34656	34663	25 %	50 %	25 %	0 %	308179217
78	NC_014554	TTGA	2	8	36110	36117	25 %	50 %	25 %	0 %	308179218
79	NC_014554	AACG	2	8	36860	36867	50 %	0 %	25 %	25 %	308179219
80	NC_014554	CAAC	2	8	37105	37112	50 %	0 %	0 %	50 %	308179220
81	NC_014554	GATG	2	8	37941	37948	25 %	25 %	50 %	0 %	308179221
82	NC_014554	AATT	2	8	38527	38534	50 %	50 %	0 %	0 %	308179222
83	NC_014554	TCAG	2	8	38821	38828	25 %	25 %	25 %	25 %	308179222
84	NC_014554	CAGT	2	8	38977	38984	25 %	25 %	25 %	25 %	308179222
85	NC_014554	TGTA	2	8	38997	39004	25 %	50 %	25 %	0 %	308179222
86	NC_014554	GTCT	2	8	39019	39026	0 %	50 %	25 %	25 %	308179222
87	NC_014554	ATTT	2	8	40521	40528	25 %	75 %	0 %	0 %	308179223
88	NC_014554	AATT	2	8	40537	40544	50 %	50 %	0 %	0 %	308179223
89	NC_014554	AGTC	2	8	40598	40605	25 %	25 %	25 %	25 %	308179223
90	NC_014554	CGTA	2	8	40705	40712	25 %	25 %	25 %	25 %	308179223
91	NC_014554	CAAT	2	8	40813	40820	50 %	25 %	0 %	25 %	308179223
92	NC_014554	AAGC	2	8	41463	41470	50 %	0 %	25 %	25 %	308179223
93	NC_014554	ACAG	2	8	41935	41942	50 %	0 %	25 %	25 %	308179224
94	NC_014554	ACGT	2	8	42209	42216	25 %	25 %	25 %	25 %	308179224
95	NC_014554	TCGA	2	8	43047	43054	25 %	25 %	25 %	25 %	308179225
96	NC_014554	TTTA	2	8	43079	43086	25 %	75 %	0 %	0 %	308179225
97	NC_014554	TATT	2	8	43407	43414	25 %	75 %	0 %	0 %	308179225
98	NC_014554	GATG	2	8	43529	43536	25 %	25 %	50 %	0 %	308179225
99	NC_014554	ATTA	2	8	43907	43914	50 %	50 %	0 %	0 %	308179226
100	NC_014554	TGAC	2	8	44334	44341	25 %	25 %	25 %	25 %	308179226
101	NC_014554	CGGC	2	8	44753	44760	0 %	0 %	50 %	50 %	308179226
102	NC_014554	ACCA	2	8	44827	44834	50 %	0 %	0 %	50 %	308179226
103	NC_014554	AAGT	2	8	46648	46655	50 %	25 %	25 %	0 %	308179228
104	NC_014554	TATG	2	8	46868	46875	25 %	50 %	25 %	0 %	308179228
105	NC_014554	GATC	2	8	47132	47139	25 %	25 %	25 %	25 %	308179228
106	NC_014554	CTAG	2	8	47811	47818	25 %	25 %	25 %	25 %	308179230
107	NC_014554	GACT	2	8	47841	47848	25 %	25 %	25 %	25 %	308179230
108	NC_014554	TTTG	2	8	49046	49053	0 %	75 %	25 %	0 %	308179231
109	NC_014554	CATC	2	8	50470	50477	25 %	25 %	0 %	50 %	308179232
110	NC_014554	TGGC	2	8	50490	50497	0 %	25 %	50 %	25 %	308179232
111	NC_014554	GCAC	2	8	50975	50982	25 %	0 %	25 %	50 %	308179233
112	NC_014554	CAGT	2	8	51288	51295	25 %	25 %	25 %	25 %	308179233
113	NC_014554	AATT	2	8	51465	51472	50 %	50 %	0 %	0 %	308179233
114	NC_014554	AACG	2	8	51598	51605	50 %	0 %	25 %	25 %	308179234
115	NC_014554	TTGT	2	8	51691	51698	0 %	75 %	25 %	0 %	308179234
116	NC_014554	GGAC	2	8	52030	52037	25 %	0 %	50 %	25 %	308179235
117	NC_014554	GGTC	2	8	52067	52074	0 %	25 %	50 %	25 %	308179235
118	NC_014554	CCAA	2	8	54325	54332	50 %	0 %	0 %	50 %	308179236
119	NC_014554	AAAC	2	8	56585	56592	75 %	0 %	0 %	25 %	308179237
120	NC_014554	AAGT	2	8	56733	56740	50 %	25 %	25 %	0 %	308179237
121	NC_014554	TCAA	2	8	57092	57099	50 %	25 %	0 %	25 %	308179237
122	NC_014554	TTTG	2	8	58544	58551	0 %	75 %	25 %	0 %	308179238
123	NC_014554	TGAT	2	8	59477	59484	25 %	50 %	25 %	0 %	308179239
124	NC_014554	ATGA	2	8	60792	60799	50 %	25 %	25 %	0 %	308179241
125	NC_014554	GTTA	2	8	60959	60966	25 %	50 %	25 %	0 %	308179241
126	NC_014554	GTCG	2	8	62628	62635	0 %	25 %	50 %	25 %	308179243
127	NC_014554	ATCA	2	8	62752	62759	50 %	25 %	0 %	25 %	308179243
128	NC_014554	GCTG	2	8	62936	62943	0 %	25 %	50 %	25 %	308179243
129	NC_014554	GTTA	2	8	63153	63160	25 %	50 %	25 %	0 %	308179243
130	NC_014554	AAGC	2	8	63481	63488	50 %	0 %	25 %	25 %	308179243
131	NC_014554	GAAC	2	8	63559	63566	50 %	0 %	25 %	25 %	308179243
132	NC_014554	TCAC	2	8	64367	64374	25 %	25 %	0 %	50 %	308179245
133	NC_014554	AAGT	2	8	65323	65330	50 %	25 %	25 %	0 %	308179246
134	NC_014554	ATTT	2	8	65475	65482	25 %	75 %	0 %	0 %	308179246
135	NC_014554	TACT	2	8	65513	65520	25 %	50 %	0 %	25 %	308179246
136	NC_014554	TTAA	2	8	65669	65676	50 %	50 %	0 %	0 %	308179246
137	NC_014554	CCGT	2	8	65870	65877	0 %	25 %	25 %	50 %	308179246
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