MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 45629

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014554	GAA	3	9	241	249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179192
2	NC_014554	ACA	2	6	306	311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179192
3	NC_014554	CAA	2	6	314	319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179192
4	NC_014554	GAA	2	6	436	441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179192
5	NC_014554	GTT	2	6	462	467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179192
6	NC_014554	AGG	2	6	617	622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308179192
7	NC_014554	GAA	2	6	631	636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179192
8	NC_014554	TTA	2	6	655	660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179192
9	NC_014554	CGA	2	6	663	668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179192
10	NC_014554	AAG	2	6	701	706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179192
11	NC_014554	TTC	2	6	709	714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179192
12	NC_014554	GAT	2	6	739	744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179192
13	NC_014554	AAT	2	6	1009	1014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179192
14	NC_014554	ACC	2	6	1024	1029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179192
15	NC_014554	TGG	2	6	1251	1256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179192
16	NC_014554	CTA	2	6	1473	1478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_014554	TAC	2	6	1480	1485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014554	TAT	2	6	1493	1498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014554	TCA	2	6	1574	1579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179193
20	NC_014554	TTC	2	6	1608	1613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179193
21	NC_014554	ACC	2	6	1708	1713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179193
22	NC_014554	TGA	2	6	1725	1730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179193
23	NC_014554	CAA	2	6	1731	1736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179193
24	NC_014554	AGA	2	6	1812	1817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179193
25	NC_014554	AAT	2	6	2125	2130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179193
26	NC_014554	ATG	2	6	2138	2143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179193
27	NC_014554	GAT	2	6	2181	2186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179193
28	NC_014554	AAT	2	6	2194	2199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179193
29	NC_014554	CAG	2	6	2357	2362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179193
30	NC_014554	AAT	2	6	2401	2406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179193
31	NC_014554	AAC	2	6	2486	2491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179193
32	NC_014554	AAG	2	6	2552	2557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179193
33	NC_014554	GAA	2	6	2635	2640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179193
34	NC_014554	GAT	2	6	2798	2803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014554	GCT	2	6	2841	2846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014554	CTA	2	6	2879	2884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014554	TGA	2	6	2898	2903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014554	TTA	2	6	2997	3002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014554	TCA	2	6	3115	3120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014554	CAT	2	6	3275	3280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179194
41	NC_014554	GGT	2	6	3288	3293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179194
42	NC_014554	AAC	2	6	3317	3322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179194
43	NC_014554	GAT	2	6	3345	3350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179194
44	NC_014554	CGG	2	6	3351	3356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179194
45	NC_014554	ACC	2	6	3636	3641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179195
46	NC_014554	GCG	2	6	3707	3712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179195
47	NC_014554	ATC	2	6	3733	3738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179195
48	NC_014554	AAC	2	6	3916	3921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179195
49	NC_014554	GCA	2	6	3950	3955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179195
50	NC_014554	ATC	2	6	4017	4022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179195
51	NC_014554	GCA	2	6	4043	4048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179195
52	NC_014554	CAA	3	9	4191	4199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179195
53	NC_014554	GAC	2	6	4220	4225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179195
54	NC_014554	TTA	2	6	4227	4232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179195
55	NC_014554	GAT	2	6	4245	4250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179195
56	NC_014554	TGA	2	6	4348	4353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179195
57	NC_014554	TTA	3	9	4380	4388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179195
58	NC_014554	CTG	2	6	4431	4436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179195
59	NC_014554	GAG	2	6	4551	4556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308179195
60	NC_014554	ATG	2	6	4611	4616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179196
61	NC_014554	ACG	2	6	4682	4687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179196
62	NC_014554	CCA	2	6	4702	4707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179196
63	NC_014554	TTG	2	6	4722	4727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179196
64	NC_014554	TGA	2	6	4738	4743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179196
65	NC_014554	ATA	2	6	4791	4796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179196
66	NC_014554	GGT	2	6	4895	4900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179196
67	NC_014554	GGT	2	6	4907	4912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179196
68	NC_014554	TGG	2	6	4930	4935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179196
69	NC_014554	GTT	2	6	4958	4963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179196
70	NC_014554	ATC	2	6	4972	4977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179196
71	NC_014554	TTA	2	6	5014	5019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179196
72	NC_014554	TGA	2	6	5077	5082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179196
73	NC_014554	CGG	2	6	5094	5099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179196
74	NC_014554	ACC	2	6	5138	5143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179196
75	NC_014554	GAC	2	6	5161	5166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179196
76	NC_014554	TGA	2	6	5230	5235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179196
77	NC_014554	GAC	2	6	5384	5389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179196
78	NC_014554	TGA	2	6	5403	5408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179196
79	NC_014554	CAA	2	6	5416	5421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179196
80	NC_014554	GAA	2	6	5450	5455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179196
81	NC_014554	TCA	2	6	5481	5486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179196
82	NC_014554	TTG	2	6	5510	5515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179196
83	NC_014554	TGT	2	6	5569	5574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179196
84	NC_014554	GCA	2	6	5645	5650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179196
85	NC_014554	GCT	2	6	5756	5761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179196
86	NC_014554	TAG	2	6	5836	5841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179196
87	NC_014554	GTT	2	6	5863	5868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179196
88	NC_014554	GAA	2	6	5999	6004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179196
89	NC_014554	GGT	2	6	6041	6046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179196
90	NC_014554	GTT	2	6	6139	6144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179196
91	NC_014554	ACC	2	6	6196	6201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179196
92	NC_014554	GAA	2	6	6251	6256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179196
93	NC_014554	GTT	2	6	6299	6304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179196
94	NC_014554	GCG	2	6	6373	6378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179196
95	NC_014554	TGA	2	6	6394	6399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179196
96	NC_014554	TCT	2	6	6423	6428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179196
97	NC_014554	ACG	2	6	6583	6588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014554	AGG	2	6	6661	6666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014554	CGG	2	6	6820	6825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179197
100	NC_014554	AAG	2	6	6874	6879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179197
101	NC_014554	TTG	2	6	6890	6895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179197
102	NC_014554	ATC	2	6	6914	6919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179197
103	NC_014554	ATG	2	6	7130	7135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179197
104	NC_014554	CAG	2	6	7151	7156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179197
105	NC_014554	ACA	2	6	7219	7224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179197
106	NC_014554	ATT	2	6	7402	7407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179197
107	NC_014554	ATG	2	6	7559	7564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179197
108	NC_014554	CGG	2	6	7603	7608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179197
109	NC_014554	AAG	2	6	7754	7759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179197
110	NC_014554	GAA	2	6	7791	7796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179197
111	NC_014554	TGA	2	6	7851	7856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179197
112	NC_014554	ATT	2	6	7867	7872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179197
113	NC_014554	GAA	2	6	7899	7904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179197
114	NC_014554	ATT	2	6	8080	8085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179197
115	NC_014554	GAA	2	6	8089	8094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179197
116	NC_014554	GAA	4	12	8185	8196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179197
117	NC_014554	GTG	2	6	8267	8272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179197
118	NC_014554	ATG	3	9	8300	8308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179197
119	NC_014554	GAC	2	6	8328	8333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179197
120	NC_014554	ATG	2	6	8342	8347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179197
121	NC_014554	TCA	2	6	8438	8443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179197
122	NC_014554	GAT	3	9	8620	8628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179197
123	NC_014554	ATC	2	6	8671	8676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179197
124	NC_014554	ACG	2	6	8684	8689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179197
125	NC_014554	CGA	2	6	8706	8711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179197
126	NC_014554	GAT	2	6	8770	8775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179197
127	NC_014554	TCA	3	9	8822	8830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179197
128	NC_014554	GTG	2	6	8885	8890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179197
129	NC_014554	GAA	2	6	8922	8927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179197
130	NC_014554	GAC	2	6	8946	8951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179197
131	NC_014554	AAG	2	6	8963	8968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179197
132	NC_014554	GAT	2	6	9073	9078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179197
133	NC_014554	TGA	2	6	9123	9128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179197
134	NC_014554	CAA	2	6	9206	9211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179197
135	NC_014554	ATT	2	6	9302	9307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014554	GAA	2	6	9398	9403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014554	CTG	2	6	9412	9417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_014554	TCA	2	6	9423	9428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_014554	ACA	2	6	9483	9488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_014554	CAG	2	6	9548	9553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_014554	CAA	2	6	9745	9750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_014554	AAG	2	6	9823	9828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014554	AGG	2	6	9844	9849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014554	CGA	2	6	9910	9915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179198
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161	NC_014554	ATA	2	6	10596	10601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179199
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169	NC_014554	CAA	2	6	10843	10848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179200
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243	NC_014554	TAA	2	6	15374	15379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
244	NC_014554	TGG	2	6	15380	15385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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383	NC_014554	ATG	2	6	25652	25657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179212
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