MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 7538

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014554	CTA	2	6	1473	1478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014554	TAC	2	6	1480	1485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014554	TAT	2	6	1493	1498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014554	GAT	2	6	2798	2803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014554	GCT	2	6	2841	2846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014554	CTA	2	6	2879	2884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014554	TGA	2	6	2898	2903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014554	TTA	2	6	2997	3002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014554	TCA	2	6	3115	3120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014554	ACG	2	6	6583	6588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_014554	AGG	2	6	6661	6666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014554	ATT	2	6	9302	9307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014554	GAA	2	6	9398	9403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014554	CTG	2	6	9412	9417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014554	TCA	2	6	9423	9428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014554	ACA	2	6	9483	9488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_014554	CAG	2	6	9548	9553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014554	CAA	2	6	9745	9750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014554	AAG	2	6	9823	9828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014554	AGG	2	6	9844	9849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014554	GAG	2	6	10821	10826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014554	GTG	2	6	11144	11149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014554	GGT	2	6	11200	11205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014554	ATA	2	6	15300	15305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014554	ATG	2	6	15353	15358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014554	TAA	2	6	15374	15379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014554	TGG	2	6	15380	15385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014554	TTA	2	6	18706	18711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014554	CTT	2	6	18781	18786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_014554	CCA	2	6	18798	18803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_014554	ATA	2	6	18883	18888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014554	GGA	2	6	18979	18984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014554	ATG	3	9	18988	18996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014554	TGT	3	9	19081	19089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014554	CAT	2	6	19124	19129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014554	TCA	2	6	19144	19149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014554	ATT	2	6	20784	20789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014554	CTT	2	6	21039	21044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014554	ATA	2	6	21045	21050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014554	TGA	2	6	31000	31005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014554	GTT	2	6	31175	31180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014554	TAA	2	6	31196	31201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014554	TCA	2	6	31245	31250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014554	TGG	2	6	31269	31274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014554	TGA	2	6	32215	32220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014554	CCT	2	6	32917	32922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_014554	TGA	2	6	35759	35764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014554	GTT	2	6	35794	35799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014554	TGA	2	6	35836	35841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014554	TAA	2	6	35888	35893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014554	GTT	2	6	35931	35936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014554	TGT	2	6	36641	36646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014554	ATG	2	6	37371	37376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014554	CAA	2	6	37454	37459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014554	ACA	2	6	37490	37495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_014554	TAC	2	6	37587	37592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_014554	AGG	2	6	37755	37760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014554	GAA	2	6	42588	42593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014554	TAG	2	6	43793	43798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014554	TAG	2	6	45150	45155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014554	GAA	2	6	45174	45179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014554	AAT	2	6	45189	45194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014554	ATA	2	6	45454	45459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014554	ATT	2	6	45583	45588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014554	TAA	2	6	45616	45621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014554	TTA	2	6	46154	46159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014554	AAT	2	6	46281	46286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014554	ATA	2	6	46381	46386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014554	CTC	2	6	46406	46411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_014554	TAA	2	6	46524	46529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014554	TTA	2	6	46543	46548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014554	TAT	2	6	46561	46566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014554	CTT	2	6	48438	48443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_014554	AAG	2	6	48538	48543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014554	TAC	2	6	48560	48565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_014554	TTC	2	6	49771	49776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_014554	GAT	2	6	49895	49900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014554	TTG	2	6	50609	50614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014554	TCA	2	6	50786	50791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_014554	GCA	2	6	51486	51491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_014554	CAG	2	6	51508	51513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014554	CCA	2	6	51968	51973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_014554	TGG	2	6	51997	52002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014554	TGT	2	6	52831	52836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014554	AAC	2	6	55784	55789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_014554	AGG	2	6	55836	55841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014554	ACG	2	6	57482	57487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_014554	GAA	3	9	57492	57500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014554	TAG	2	6	57544	57549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014554	TCA	2	6	57626	57631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_014554	AGC	2	6	57640	57645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014554	GGT	2	6	57675	57680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014554	TTA	2	6	57723	57728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014554	ATC	2	6	57948	57953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014554	GGT	2	6	58091	58096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014554	CAG	2	6	58215	58220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_014554	AAT	2	6	58839	58844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014554	TGT	2	6	58982	58987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014554	TTA	2	6	58998	59003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014554	ATA	2	6	59030	59035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014554	TGA	2	6	59040	59045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014554	AGG	2	6	59078	59083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014554	ATG	2	6	59572	59577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014554	AAG	2	6	59590	59595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014554	TTA	2	6	59611	59616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014554	TCG	2	6	59693	59698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_014554	TCA	2	6	59776	59781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_014554	TAA	2	6	59803	59808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014554	GAG	2	6	59824	59829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014554	TGG	2	6	62344	62349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014554	ATT	2	6	62383	62388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014554	ATG	2	6	62390	62395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014554	AGG	2	6	62415	62420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014554	TGA	2	6	64228	64233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014554	GAG	2	6	64281	64286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014554	ATA	2	6	64974	64979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014554	GAT	2	6	66089	66094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014554	GCG	2	6	66124	66129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_014554	TCA	2	6	66208	66213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_014554	ATG	2	6	66273	66278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014554	TAG	2	6	66280	66285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014554	CTA	2	6	66305	66310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_014554	GGA	2	6	66332	66337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014554	AAT	2	6	68583	68588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014554	AAG	2	6	71441	71446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014554	GTA	2	6	72497	72502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014554	TGT	2	6	72509	72514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014554	CAC	2	6	73284	73289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_014554	GAT	2	6	75504	75509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014554	TGA	2	6	75621	75626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014554	TGG	2	6	75733	75738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014554	GAT	2	6	75751	75756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014554	AGT	2	6	75782	75787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014554	ATT	2	6	76099	76104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014554	TGG	2	6	76144	76149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014554	GAT	2	6	76187	76192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014554	TGT	2	6	77112	77117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014554	TGG	2	6	77192	77197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014554	GGT	2	6	77256	77261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014554	ATA	2	6	81568	81573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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