MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma fermentans JER chromosome

Total Repeats: 215

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014552	TAATA	2	10	3091	3100	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014552	TTTGT	2	10	6401	6410	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014552	TTTGA	2	10	6853	6862	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014552	AATTT	2	10	7316	7325	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014552	TTTGA	2	10	7392	7401	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014552	TTAAA	2	10	7430	7439	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014552	CAAAA	2	10	7448	7457	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_014552	TTAAA	2	10	11746	11755	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014552	TTCTA	2	10	12419	12428	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_014552	ATAGA	2	10	18117	18126	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014552	TAATT	2	10	19793	19802	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014552	TAAGC	2	10	21011	21020	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_014552	GAAAA	2	10	22784	22793	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014552	TAAAA	2	10	23986	23995	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014552	TAAAT	2	10	28139	28148	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014552	TGAAT	2	10	30389	30398	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014552	CTTAA	2	10	32562	32571	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_014552	TAATA	2	10	43156	43165	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014552	TTTAC	2	10	43391	43400	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_014552	AGATC	2	10	48538	48547	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_014552	TTCAA	2	10	48581	48590	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_014552	ATTAA	2	10	49021	49030	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014552	TATAT	2	10	49083	49092	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014552	ATTTA	2	10	52884	52893	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014552	TTCAT	2	10	53552	53561	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_014552	TAATT	2	10	67474	67483	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014552	ATTTT	2	10	69468	69477	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014552	TTTGT	2	10	69478	69487	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014552	AAGTT	2	10	69555	69564	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014552	AAAAT	2	10	71184	71193	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014552	GATTT	2	10	78540	78549	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014552	ATTTT	2	10	102412	102421	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014552	AATTT	2	10	104840	104849	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014552	AATAA	2	10	106925	106934	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014552	AAAAT	2	10	115153	115162	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014552	AATTA	2	10	122339	122348	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014552	ATTAA	2	10	122995	123004	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014552	TTAAA	2	10	123026	123035	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014552	GAATT	2	10	123263	123272	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014552	ATATT	2	10	154768	154777	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014552	GGAAT	2	10	160086	160095	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014552	TTAAA	2	10	165768	165777	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014552	TTTCT	2	10	171817	171826	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_014552	TTTTA	2	10	209790	209799	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014552	TAATA	2	10	227748	227757	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014552	TAATA	2	10	231322	231331	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014552	AAAAC	2	10	238777	238786	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_014552	ATGAA	2	10	239616	239625	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014552	ATGCT	2	10	239650	239659	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_014552	ATTAT	2	10	239684	239693	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014552	ATTAT	2	10	239799	239808	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014552	ATTAA	2	10	240781	240790	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014552	TTAAT	2	10	243028	243037	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014552	ATAAA	2	10	244116	244125	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014552	ATATA	2	10	255227	255236	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014552	AATTA	2	10	258555	258564	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014552	AAAAT	2	10	259086	259095	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014552	TTTCT	2	10	261321	261330	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_014552	TATAA	2	10	261496	261505	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014552	ATTAA	2	10	264944	264953	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014552	TAAAT	2	10	267566	267575	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014552	TAAAA	2	10	267644	267653	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014552	TAAAT	2	10	279125	279134	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014552	AAATT	2	10	293047	293056	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014552	ATATT	2	10	293442	293451	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014552	AATTA	2	10	302561	302570	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014552	TTAAT	2	10	303978	303987	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014552	ATTTT	2	10	304002	304011	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014552	AATTA	2	10	314493	314502	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014552	AATGC	2	10	320961	320970	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_014552	ACATT	2	10	321162	321171	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_014552	TTATT	2	10	334703	334712	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014552	CAAAA	2	10	341602	341611	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_014552	AATGA	2	10	342044	342053	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014552	TTCAA	2	10	343189	343198	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_014552	ATTAA	2	10	349260	349269	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014552	TAAAA	2	10	362460	362469	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014552	ATTTA	2	10	369843	369852	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014552	TTATT	2	10	372083	372092	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014552	TGATA	2	10	381627	381636	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014552	AAGAA	2	10	395161	395170	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014552	TAAAT	2	10	400317	400326	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014552	AATAT	2	10	406751	406760	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014552	TTAAT	2	10	410739	410748	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014552	ATTTA	2	10	419884	419893	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014552	TTCTT	2	10	420058	420067	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_014552	TTCAT	2	10	420559	420568	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_014552	CTTAA	2	10	423481	423490	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_014552	AAATT	2	10	433367	433376	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014552	ATATC	2	10	448866	448875	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_014552	ATTTA	2	10	450724	450733	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014552	TCTAT	2	10	450765	450774	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_014552	ATATT	2	10	450877	450886	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014552	TATAA	2	10	455913	455922	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014552	AAAAT	2	10	457584	457593	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014552	ATTTA	2	10	457623	457632	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014552	TAAAA	2	10	457675	457684	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014552	TTAAT	2	10	470182	470191	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014552	TTTAT	2	10	474890	474899	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014552	TTTAG	2	10	475308	475317	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014552	ATTAT	2	10	480292	480301	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014552	ATTTT	2	10	480415	480424	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014552	ATTTT	2	10	480522	480531	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014552	ATTTT	2	10	482633	482642	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014552	TAATT	2	10	482768	482777	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014552	TAATT	2	10	495027	495036	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014552	ATATT	2	10	497175	497184	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014552	TAATT	2	10	520819	520828	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014552	TATTT	2	10	520943	520952	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014552	TAAAA	2	10	521770	521779	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014552	TATAT	2	10	525772	525781	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014552	TAATT	2	10	527398	527407	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014552	TAAAT	2	10	532011	532020	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014552	TAAAT	2	10	532402	532411	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014552	ATAAA	2	10	546693	546702	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014552	ATAAA	2	10	548634	548643	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014552	AAATT	2	10	549536	549545	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014552	ATTTT	2	10	576999	577008	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014552	TGCAT	2	10	577932	577941	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_014552	CTTCT	2	10	583752	583761	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
121	NC_014552	CTAAT	2	10	584008	584017	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_014552	AATTT	2	10	587826	587835	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014552	TAATT	2	10	596012	596021	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014552	AATTA	2	10	599786	599795	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014552	ATTTA	2	10	605112	605121	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014552	ATAAA	2	10	605131	605140	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014552	AAAGA	2	10	606042	606051	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014552	ATTTT	2	10	606145	606154	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014552	ATTTC	2	10	611813	611822	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_014552	AATTT	2	10	615788	615797	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014552	GCAAG	2	10	617356	617365	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_014552	ATTTT	2	10	617645	617654	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014552	ATTTA	2	10	621995	622004	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014552	CGTAG	2	10	622369	622378	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
135	NC_014552	CACGA	2	10	622659	622668	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
136	NC_014552	CAAAA	2	10	623246	623255	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_014552	TCCTT	2	10	624489	624498	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
138	NC_014552	AACTA	2	10	625633	625642	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_014552	AAAAG	2	10	643731	643740	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014552	AATCA	2	10	644350	644359	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_014552	TTTGG	2	10	645843	645852	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014552	TTTTA	2	10	649381	649390	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014552	AATTA	2	10	652424	652433	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014552	TTTTA	2	10	665178	665187	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014552	ATGAA	2	10	679137	679146	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014552	TAAAT	2	10	679613	679622	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014552	ATATT	2	10	691662	691671	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014552	CAAAT	2	10	691702	691711	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_014552	TTAAA	2	10	692212	692221	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.