MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens DSM 7

Total Repeats: 135

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014551	AGTCAA	2	12	102484	102495	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_014551	TTATTT	2	12	166980	166991	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014551	TCCACG	2	12	250373	250384	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4	NC_014551	AAGCAG	2	12	298224	298235	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_014551	GGAAAA	2	12	303742	303753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014551	GATAAA	2	12	317257	317268	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014551	TATTGA	2	12	318664	318675	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014551	TGATAA	2	12	390973	390984	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014551	GAAAAA	2	12	397148	397159	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014551	TTTTGT	2	12	491194	491205	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014551	GAGGTG	2	12	562815	562826	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014551	AAAAAT	2	12	563138	563149	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014551	AAAGGA	2	12	591400	591411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014551	ATTTGA	2	12	593195	593206	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014551	AGAAAA	2	12	593351	593362	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014551	TTGCAC	2	12	617472	617483	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_014551	ATTAAT	2	12	622968	622979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014551	GAAAAA	2	12	636349	636360	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014551	AAAAGG	2	12	637858	637869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014551	TCAATC	2	12	654300	654311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_014551	CTTTCT	2	12	666563	666574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014551	TTTCTC	2	12	688210	688221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014551	AGAAAA	2	12	700601	700612	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014551	TCAGTA	2	12	704131	704142	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_014551	TCATAA	2	12	704164	704175	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_014551	GTTTAC	2	12	738806	738817	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_014551	ACAAAA	2	12	745131	745142	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_014551	TCCCTT	2	12	786176	786187	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_014551	TCTAGT	2	12	815525	815536	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_014551	CTTTTT	2	12	824974	824985	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_014551	AAAAAT	2	12	847016	847027	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014551	ATGATA	2	12	863979	863990	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014551	TACGGA	2	12	864063	864074	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_014551	TCGAAA	2	12	905651	905662	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_014551	AAAAAG	2	12	914002	914013	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014551	AAAAAT	2	12	923797	923808	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014551	TTATAT	2	12	924918	924929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014551	AGCGAA	2	12	927780	927791	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_014551	TTATAT	2	12	991594	991605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014551	GTGCTG	2	12	994527	994538	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_014551	CATCTT	2	12	996379	996390	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_014551	ACTCTC	2	12	997748	997759	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_014551	TTTATA	2	12	1015972	1015983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014551	ATAAAA	2	12	1033671	1033682	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014551	CTCAAA	2	12	1058187	1058198	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014551	CTTTTT	2	12	1059766	1059777	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_014551	AAAAAG	2	12	1082278	1082289	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014551	TCAGCT	2	12	1087048	1087059	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014551	ATAATG	2	12	1146761	1146772	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014551	TCTTTT	2	12	1152856	1152867	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_014551	GAAAAG	2	12	1161863	1161874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014551	TTACTA	2	12	1167020	1167031	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_014551	AAGGAG	2	12	1182477	1182488	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014551	GAAAAA	2	12	1227174	1227185	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014551	GGCTGC	2	12	1273931	1273942	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_014551	ATTAAA	2	12	1297683	1297694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014551	GTTAAC	2	12	1329395	1329406	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_014551	GGAGGC	2	12	1350265	1350276	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_014551	ATGGAA	2	12	1361785	1361796	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014551	TAATTG	2	12	1479701	1479712	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014551	ATCATT	2	12	1493149	1493160	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_014551	AGAAAA	2	12	1495356	1495367	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014551	ATCATT	2	12	1496393	1496404	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_014551	AAAAGA	2	12	1521811	1521822	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014551	TCAAAC	2	12	1555116	1555127	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_014551	CTTTTT	2	12	1599467	1599478	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_014551	GAGAGG	2	12	1636539	1636550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014551	TTTTGT	2	12	1752184	1752195	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014551	AAAATA	2	12	1872042	1872053	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014551	TATAAA	2	12	1881291	1881302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014551	CATTAA	2	12	1885889	1885900	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_014551	AACAAA	2	12	1923118	1923129	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_014551	GAAAAA	2	12	1924143	1924154	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014551	GATCTT	2	12	1945079	1945090	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_014551	ATAAAA	2	12	2043499	2043510	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014551	AAGAGA	2	12	2043576	2043587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014551	ATAAAA	2	12	2051155	2051166	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014551	ATGATA	2	12	2064624	2064635	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014551	GAAAAA	2	12	2089494	2089505	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014551	CTTTTT	2	12	2093896	2093907	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_014551	CCTTCC	2	12	2125579	2125590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_014551	CGTTTT	2	12	2189541	2189552	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_014551	AAATAA	2	12	2189764	2189775	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014551	ATATTT	2	12	2201023	2201034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014551	CGTCAT	2	12	2355879	2355890	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_014551	TTTATA	2	12	2359974	2359985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014551	AACGGA	2	12	2380888	2380899	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_014551	CAATCT	2	12	2404184	2404195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_014551	TGAAAA	2	12	2412687	2412698	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014551	TTCTAA	2	12	2462606	2462617	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_014551	TTTGTC	2	12	2466626	2466637	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_014551	TGACTT	2	12	2488727	2488738	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_014551	GAAGCA	2	12	2510558	2510569	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_014551	CCTTTG	2	12	2521833	2521844	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014551	ATTTGT	2	12	2542105	2542116	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014551	AAGAAA	2	12	2543601	2543612	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014551	TTCTCC	2	12	2567347	2567358	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_014551	TTATCA	2	12	2633113	2633124	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_014551	GAATCA	2	12	2676088	2676099	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_014551	CCCTCT	2	12	2695378	2695389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_014551	ATTGGA	2	12	2707492	2707503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014551	CTCTTT	2	12	2742173	2742184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_014551	CTTATA	2	12	2755278	2755289	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_014551	TTTAAG	2	12	2768981	2768992	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014551	GGAAAA	2	12	2783452	2783463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014551	CTTATC	2	12	2827456	2827467	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_014551	CTTTAT	2	12	2839632	2839643	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_014551	AAGGCA	2	12	2852420	2852431	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_014551	CTAAAA	2	12	2867452	2867463	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_014551	TTTTTG	2	12	2921955	2921966	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014551	AGGGAC	2	12	2939388	2939399	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_014551	TAATGG	2	12	2947179	2947190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014551	AATTTT	2	12	2968634	2968645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014551	ATTATC	2	12	3065406	3065417	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_014551	CCGCGG	2	12	3072903	3072914	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_014551	TGTTTT	2	12	3093753	3093764	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014551	GGAAAA	2	12	3149263	3149274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014551	TTTTAT	2	12	3154804	3154815	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014551	TAATGA	2	12	3226754	3226765	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014551	GAAAAA	2	12	3291191	3291202	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014551	AAATGA	2	12	3305360	3305371	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014551	TCTTAT	2	12	3436183	3436194	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_014551	GCATAA	2	12	3529694	3529705	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_014551	TAGAAT	2	12	3559801	3559812	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014551	GCGATC	2	12	3594858	3594869	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_014551	ATCTCC	2	12	3647367	3647378	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_014551	AATATA	2	12	3718875	3718886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014551	ATCATT	2	12	3828793	3828804	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_014551	CTCTAT	2	12	3898876	3898887	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_014551	ACAAAT	2	12	3952076	3952087	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_014551	CATGTA	2	12	3953897	3953908	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_014551	AGAAAC	2	12	3958292	3958303	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_014551	GCTCTT	2	12	3963342	3963353	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_014551	GCATAA	2	12	3969878	3969889	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_014551	GAAAAA	2	12	3977721	3977732	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.