MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Arthrobacter arilaitensis Re117 chromosome

Total Repeats: 174

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014550	CGTTGT	2	12	24807	24818	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_014550	CAGATA	2	12	25984	25995	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_014550	CCGTTG	2	12	26066	26077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014550	ATAGTC	2	12	27466	27477	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_014550	CCAGTC	2	12	73817	73828	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6	NC_014550	TGGCTG	2	12	92626	92637	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_014550	CTTGTT	2	12	96628	96639	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_014550	GAATAT	2	12	100123	100134	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014550	TGGCTG	2	12	102050	102061	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_014550	CATCCT	2	12	116261	116272	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_014550	GCAATG	2	12	132734	132745	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_014550	GATGCC	2	12	133363	133374	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014550	GCAGGA	2	12	144954	144965	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_014550	CGCAAC	2	12	151960	151971	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
15	NC_014550	GAATAT	2	12	169189	169200	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014550	TGGCTG	2	12	171115	171126	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_014550	GCAAAA	2	12	192662	192673	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_014550	GATCTG	2	12	211564	211575	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_014550	AGGAAC	2	12	246034	246045	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_014550	GGCATA	2	12	246252	246263	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_014550	GTGCTG	2	12	264662	264673	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_014550	ATGCGA	2	12	265303	265314	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_014550	TATACC	2	12	290955	290966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014550	GTAAAA	2	12	345518	345529	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014550	GCCTGC	2	12	504160	504171	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
26	NC_014550	GAGAGC	2	12	510172	510183	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_014550	ATGGCG	2	12	523517	523528	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_014550	CAGCGA	2	12	534531	534542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_014550	GGCGCA	2	12	573113	573124	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_014550	TGGCTG	2	12	579785	579796	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_014550	TGGCTG	2	12	592919	592930	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_014550	GTCTTG	2	12	603817	603828	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_014550	AACCGG	2	12	608569	608580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014550	CTCAAA	2	12	707936	707947	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_014550	GATCGC	2	12	734409	734420	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014550	CGGCAG	2	12	735557	735568	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014550	AACCAA	2	12	747305	747316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014550	ATCGGC	2	12	779045	779056	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014550	AGTGTT	2	12	798736	798747	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014550	GCCGAT	2	12	845754	845765	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_014550	CGCCTG	2	12	850431	850442	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
42	NC_014550	TTAAAT	2	12	858687	858698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014550	CGCAGG	2	12	893965	893976	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014550	TGGGAG	2	12	903360	903371	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014550	CTCTGT	2	12	909663	909674	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014550	AGGGTC	2	12	950229	950240	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_014550	CCCAGG	2	12	952370	952381	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
48	NC_014550	TGCAGC	2	12	986165	986176	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014550	AGAAAT	2	12	995624	995635	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014550	ACTTTG	2	12	999771	999782	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_014550	GGATTA	2	12	1000091	1000102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014550	ATGCAC	2	12	1001984	1001995	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014550	TCGGCA	2	12	1005905	1005916	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014550	CGACTT	2	12	1068533	1068544	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014550	CACAGC	2	12	1128511	1128522	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
56	NC_014550	TCGGCG	2	12	1157689	1157700	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_014550	AGGCCG	2	12	1158510	1158521	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_014550	TGGAAA	2	12	1192156	1192167	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014550	TCCGGT	2	12	1192196	1192207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014550	CCAAAC	2	12	1192822	1192833	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_014550	CGTTTT	2	12	1207124	1207135	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_014550	AGGTGC	2	12	1281966	1281977	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_014550	TGGCTG	2	12	1285550	1285561	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_014550	CGCGGT	2	12	1355025	1355036	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014550	CGTCGG	2	12	1363377	1363388	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_014550	ACTGAA	2	12	1376995	1377006	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_014550	TCTGGC	2	12	1384151	1384162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014550	GCCGCA	2	12	1408123	1408134	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
69	NC_014550	TTTTCG	2	12	1446580	1446591	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_014550	CAGGGT	2	12	1475445	1475456	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_014550	GCTAAC	2	12	1488542	1488553	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_014550	GCTCGC	2	12	1490072	1490083	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
73	NC_014550	TGGCGA	2	12	1490815	1490826	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_014550	GATCGA	2	12	1532187	1532198	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_014550	CTTTTG	2	12	1542588	1542599	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_014550	CTGCCG	2	12	1560201	1560212	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
77	NC_014550	CGGGAA	2	12	1560411	1560422	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_014550	GGTCAG	2	12	1560530	1560541	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_014550	GCCGGT	2	12	1570983	1570994	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_014550	CGTCCG	2	12	1587631	1587642	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
81	NC_014550	GTTGAG	2	12	1717801	1717812	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014550	GGTAAG	2	12	1732300	1732311	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014550	CGCCTG	2	12	1811354	1811365	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
84	NC_014550	ACAGCA	2	12	1824982	1824993	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_014550	TGCTCC	2	12	1904227	1904238	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
86	NC_014550	GTGCGG	2	12	1975235	1975246	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_014550	CTGCCC	2	12	2011231	2011242	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_014550	GCGGAT	2	12	2018198	2018209	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_014550	TGGTTT	2	12	2020574	2020585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014550	CAGCCC	2	12	2039351	2039362	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_014550	GCAAAA	2	12	2106580	2106591	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_014550	TAGAAA	2	12	2125979	2125990	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014550	AGCTCA	2	12	2162358	2162369	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_014550	TGCTGG	2	12	2194128	2194139	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_014550	AGCTAA	2	12	2197342	2197353	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_014550	GTGCGC	2	12	2240205	2240216	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_014550	TCCCTC	2	12	2261104	2261115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_014550	GCACAC	2	12	2273036	2273047	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
99	NC_014550	AGCATC	2	12	2424110	2424121	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014550	GCTGTG	2	12	2517292	2517303	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_014550	GTGTGC	2	12	2520629	2520640	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_014550	TGCGGC	2	12	2541351	2541362	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_014550	GCCAGA	2	12	2545309	2545320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_014550	ATCATT	2	12	2559958	2559969	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_014550	ACGATG	2	12	2561086	2561097	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_014550	GCAGGG	2	12	2566511	2566522	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_014550	GAATTC	2	12	2569780	2569791	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_014550	TGGTTT	2	12	2581089	2581100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014550	CGCAGG	2	12	2581753	2581764	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_014550	CCAGGT	2	12	2596333	2596344	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_014550	GCCCGC	2	12	2597412	2597423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_014550	CTTTGG	2	12	2703490	2703501	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_014550	TTAACC	2	12	2754870	2754881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_014550	GGTTCA	2	12	2775626	2775637	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_014550	AGAACC	2	12	2798451	2798462	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_014550	GTGCCG	2	12	2823760	2823771	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_014550	TTTGGC	2	12	2844977	2844988	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_014550	GCATCA	2	12	2847434	2847445	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_014550	ACTTCC	2	12	2848550	2848561	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_014550	CAAGGC	2	12	2850762	2850773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_014550	TACGAT	2	12	2853245	2853256	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_014550	CGGTGG	2	12	2906529	2906540	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_014550	TAGACT	2	12	2977776	2977787	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_014550	GACACG	2	12	3004993	3005004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_014550	GGCGCC	2	12	3009040	3009051	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_014550	TTCCGT	2	12	3106492	3106503	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_014550	ATTCTC	2	12	3145721	3145732	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_014550	CCCTTT	2	12	3150815	3150826	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_014550	CCCCGG	2	12	3160826	3160837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_014550	GCAGAT	2	12	3196085	3196096	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_014550	CTGGCA	2	12	3196446	3196457	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_014550	TTCATC	2	12	3211001	3211012	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_014550	CATGTT	2	12	3234976	3234987	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_014550	CCTTGG	2	12	3234993	3235004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_014550	CGGACT	2	12	3263575	3263586	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_014550	CGCGGT	2	12	3286967	3286978	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_014550	CCGACA	2	12	3299357	3299368	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
138	NC_014550	GCTCAC	2	12	3303298	3303309	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
139	NC_014550	TTCTCC	2	12	3307500	3307511	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_014550	TTCAGC	2	12	3308348	3308359	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_014550	CGGTGA	2	12	3317337	3317348	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_014550	GCAGGC	2	12	3318163	3318174	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_014550	AGTGGG	2	12	3318177	3318188	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014550	CTGGAG	2	12	3330837	3330848	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_014550	CCTTGG	2	12	3344281	3344292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_014550	CTCTTC	2	12	3368441	3368452	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_014550	AGGTGG	2	12	3369844	3369855	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014550	GGTCGT	2	12	3370670	3370681	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
149	NC_014550	TCAGCT	2	12	3374967	3374978	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_014550	TTCATA	2	12	3384415	3384426	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
151	NC_014550	GCTGTG	2	12	3398876	3398887	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
152	NC_014550	CTTCGG	2	12	3437062	3437073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_014550	ACAGCC	2	12	3452678	3452689	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
154	NC_014550	CAACGC	2	12	3473144	3473155	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
155	NC_014550	GATCAA	2	12	3502514	3502525	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
156	NC_014550	CGCACC	2	12	3502581	3502592	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
157	NC_014550	CAAGCG	2	12	3575519	3575530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_014550	TCGGCA	2	12	3601437	3601448	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_014550	TAGAGG	2	12	3610377	3610388	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
160	NC_014550	CGCATA	2	12	3694960	3694971	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_014550	GGCGCC	2	12	3711991	3712002	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
162	NC_014550	CCTTGA	2	12	3716220	3716231	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_014550	TGCAGT	2	12	3720413	3720424	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
164	NC_014550	TCGACC	2	12	3730559	3730570	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
165	NC_014550	TCCGGC	2	12	3748043	3748054	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
166	NC_014550	GCGAAC	2	12	3748872	3748883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
167	NC_014550	CGCTGG	2	12	3749395	3749406	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_014550	GTCCAA	2	12	3750272	3750283	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_014550	CAGAAG	2	12	3750903	3750914	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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173	NC_014550	TGAGTA	2	12	3848693	3848704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.