MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Arthrobacter arilaitensis Re117 plasmid pRE117-1

Total Repeats: 31

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014549	CTCGG	2	10	1890	1899	0 %	20 %	40 %	40 %	308171846
2	NC_014549	GCCGG	2	10	2949	2958	0 %	0 %	60 %	40 %	308171847
3	NC_014549	CTGGG	2	10	4874	4883	0 %	20 %	60 %	20 %	308171850
4	NC_014549	AGGAG	2	10	9768	9777	40 %	0 %	60 %	0 %	308171851
5	NC_014549	CGGTG	2	10	10189	10198	0 %	20 %	60 %	20 %	308171851
6	NC_014549	AGGTC	2	10	10680	10689	20 %	20 %	40 %	20 %	308171852
7	NC_014549	ACCGT	2	10	10755	10764	20 %	20 %	20 %	40 %	308171852
8	NC_014549	AGGTT	2	10	13722	13731	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014549	GGAAA	2	10	13920	13929	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014549	TCCAT	2	10	15593	15602	20 %	40 %	0 %	40 %	308171854
11	NC_014549	CTACG	2	10	17609	17618	20 %	20 %	20 %	40 %	308171856
12	NC_014549	TGGAC	2	10	18160	18169	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_014549	ATGGA	2	10	21542	21551	40 %	20 %	40 %	0 %	308171858
14	NC_014549	TGGCG	2	10	21999	22008	0 %	20 %	60 %	20 %	308171858
15	NC_014549	GATCT	2	10	24830	24839	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_014549	ATGCG	2	10	25472	25481	20 %	20 %	40 %	20 %	308171863
17	NC_014549	ATCGC	2	10	26218	26227	20 %	20 %	20 %	40 %	308171864
18	NC_014549	CGCTG	2	10	27608	27617	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_014549	ATGCC	2	10	29526	29535	20 %	20 %	20 %	40 %	308171867
20	NC_014549	GATAG	2	10	29742	29751	40 %	20 %	40 %	0 %	308171867
21	NC_014549	TGATC	2	10	30917	30926	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_014549	CAGGC	2	10	36568	36577	20 %	0 %	40 %	40 %	308171873
23	NC_014549	GGCCC	2	10	37057	37066	0 %	0 %	40 %	60 %	308171873
24	NC_014549	GGCTC	2	10	38535	38544	0 %	20 %	40 %	40 %	308171874
25	NC_014549	ATCGC	2	10	39012	39021	20 %	20 %	20 %	40 %	308171874
26	NC_014549	TCGGG	2	10	40080	40089	0 %	20 %	60 %	20 %	308171876
27	NC_014549	TCCGC	2	10	43256	43265	0 %	20 %	20 %	60 %	308171882
28	NC_014549	CGCTA	2	10	46812	46821	20 %	20 %	20 %	40 %	308171884
29	NC_014549	ACGGA	2	10	47275	47284	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_014549	CTAAT	2	10	49259	49268	40 %	40 %	0 %	20 %	308171887
31	NC_014549	GCCGC	2	10	49409	49418	0 %	0 %	40 %	60 %	308171888

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.