MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Arthrobacter arilaitensis Re117 plasmid pRE117-1

Total Repeats: 145

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014549	CTA	2	6	76	81	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014549	GCG	2	6	634	639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014549	CGA	2	6	649	654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014549	CCG	2	6	736	741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_014549	CGT	2	6	857	862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014549	GCC	2	6	932	937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_014549	GGA	2	6	963	968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014549	CTA	2	6	1125	1130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014549	CGT	2	6	1136	1141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014549	GCA	2	6	1222	1227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_014549	CGT	2	6	1272	1277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014549	CGA	2	6	1311	1316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014549	AGT	2	6	5059	5064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014549	CGG	2	6	5105	5110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014549	TGA	2	6	5178	5183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014549	GGA	2	6	5190	5195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014549	GGC	2	6	5197	5202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014549	GAC	2	6	5241	5246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014549	CAG	2	6	5258	5263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014549	AGA	2	6	5364	5369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014549	GTC	2	6	5557	5562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014549	GAC	2	6	5566	5571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014549	TTC	2	6	5609	5614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014549	TTC	2	6	5651	5656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014549	TAA	2	6	5694	5699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014549	ACT	2	6	5746	5751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014549	AAG	2	6	5833	5838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014549	AAC	2	6	5896	5901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_014549	CGC	2	6	5927	5932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_014549	CCG	2	6	5938	5943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_014549	AAG	2	6	5953	5958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014549	CGA	2	6	5976	5981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_014549	AAC	2	6	6223	6228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014549	AAC	2	6	6347	6352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_014549	GAA	2	6	6403	6408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014549	GCT	2	6	6472	6477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014549	CCT	2	6	6546	6551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_014549	GTT	2	6	6585	6590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014549	ATG	2	6	6665	6670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014549	GTG	2	6	6671	6676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014549	TTG	2	6	6766	6771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014549	CGA	2	6	6784	6789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014549	TGT	2	6	6856	6861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014549	CGG	2	6	6875	6880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_014549	CAG	2	6	7011	7016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014549	CGT	2	6	7203	7208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014549	GGA	2	6	7251	7256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014549	TCA	2	6	13648	13653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014549	TGT	2	6	13658	13663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014549	AGA	2	6	13771	13776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014549	TCT	2	6	13871	13876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014549	CAC	2	6	14041	14046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_014549	TTC	2	6	14157	14162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014549	TCT	2	6	14204	14209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014549	GCT	2	6	14243	14248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_014549	AGT	2	6	14402	14407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014549	GAT	2	6	14501	14506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014549	ACC	2	6	14723	14728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_014549	AGA	2	6	14788	14793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014549	TAC	2	6	14802	14807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014549	CTG	2	6	16310	16315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_014549	TGC	2	6	16396	16401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_014549	GCT	2	6	16495	16500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_014549	ATG	2	6	16532	16537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014549	CAC	2	6	16559	16564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_014549	AGC	2	6	17787	17792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_014549	AAG	2	6	17862	17867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014549	CAT	2	6	17893	17898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_014549	ATC	2	6	17990	17995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_014549	CCA	3	9	18066	18074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_014549	CGA	2	6	18088	18093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_014549	GCG	2	6	18213	18218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_014549	GCC	2	6	18224	18229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_014549	GCT	2	6	18448	18453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_014549	GTG	2	6	18521	18526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014549	GCT	2	6	18743	18748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_014549	TTC	2	6	18754	18759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_014549	TCT	2	6	18847	18852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014549	TGT	2	6	18879	18884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014549	AGA	2	6	18935	18940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014549	CCA	2	6	18974	18979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_014549	CGT	2	6	19016	19021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014549	GCC	2	6	19039	19044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_014549	GCG	2	6	19078	19083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_014549	TAC	2	6	19167	19172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_014549	GAT	2	6	19282	19287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014549	CAA	2	6	19293	19298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_014549	TAA	2	6	19321	19326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014549	TCA	2	6	19341	19346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_014549	CCG	2	6	19572	19577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_014549	GCG	2	6	19619	19624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014549	AAC	2	6	19717	19722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_014549	CCA	2	6	19842	19847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_014549	ACT	2	6	19868	19873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014549	GCA	2	6	19929	19934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_014549	TCC	2	6	19988	19993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_014549	GCG	2	6	20073	20078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014549	TCT	2	6	20101	20106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_014549	CGG	2	6	20143	20148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014549	CGA	2	6	20945	20950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_014549	GTA	2	6	22337	22342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014549	TTC	2	6	22350	22355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_014549	GGT	2	6	22416	22421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014549	ATT	2	6	24732	24737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014549	GCC	2	6	26696	26701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_014549	CAC	2	6	26707	26712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_014549	GCG	2	6	26730	26735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_014549	ACC	2	6	26822	26827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_014549	GGT	2	6	26972	26977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014549	TCG	2	6	27425	27430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_014549	CGG	2	6	27448	27453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_014549	AAG	2	6	27624	27629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014549	CGC	2	6	30808	30813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_014549	TAC	2	6	30821	30826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_014549	CAG	2	6	30988	30993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_014549	TCG	2	6	31060	31065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_014549	GCA	2	6	31129	31134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_014549	GTT	2	6	31220	31225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014549	GAT	2	6	31686	31691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014549	CCG	2	6	40324	40329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_014549	CGA	2	6	40382	40387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_014549	CGC	2	6	44408	44413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_014549	TCG	2	6	44500	44505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_014549	CGG	2	6	44524	44529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_014549	GCC	3	9	44569	44577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_014549	CCG	2	6	44590	44595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_014549	CGC	2	6	44666	44671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_014549	GTT	2	6	44727	44732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014549	GAA	2	6	45057	45062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014549	CAT	2	6	45122	45127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_014549	GCC	2	6	45153	45158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_014549	ACG	2	6	45159	45164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_014549	CGT	2	6	47148	47153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_014549	GAC	3	9	47197	47205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_014549	CGC	2	6	47219	47224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_014549	CAT	2	6	47426	47431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_014549	CTC	2	6	47468	47473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_014549	CCA	2	6	47593	47598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_014549	CAC	2	6	47610	47615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_014549	TCC	2	6	48544	48549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_014549	TAG	2	6	49290	49295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014549	AGA	2	6	49584	49589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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145	NC_014549	CGC	2	6	50335	50340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.