MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Legionella longbeachae NSW150 plasmid pLLO

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014544	ATTTT	2	10	2000	2009	20 %	80 %	0 %	0 %	308051507
2	NC_014544	GAAAA	2	10	2768	2777	80 %	0 %	20 %	0 %	308051508
3	NC_014544	TATTT	2	10	3113	3122	20 %	80 %	0 %	0 %	308051509
4	NC_014544	ATTTT	2	10	3208	3217	20 %	80 %	0 %	0 %	308051509
5	NC_014544	GTTAT	2	10	3490	3499	20 %	60 %	20 %	0 %	308051509
6	NC_014544	TGAGG	2	10	4958	4967	20 %	20 %	60 %	0 %	308051510
7	NC_014544	CTTTT	2	10	5161	5170	0 %	80 %	0 %	20 %	308051510
8	NC_014544	AAGAG	2	10	5438	5447	60 %	0 %	40 %	0 %	308051510
9	NC_014544	TAAAG	2	10	5935	5944	60 %	20 %	20 %	0 %	308051512
10	NC_014544	GGACA	2	10	6648	6657	40 %	0 %	40 %	20 %	308051512
11	NC_014544	CTTGG	2	10	13040	13049	0 %	40 %	40 %	20 %	308051521
12	NC_014544	AGAGC	2	10	13927	13936	40 %	0 %	40 %	20 %	308051522
13	NC_014544	TGGCT	2	10	14352	14361	0 %	40 %	40 %	20 %	308051523
14	NC_014544	GATGC	2	10	15148	15157	20 %	20 %	40 %	20 %	308051523
15	NC_014544	AAACC	2	10	15185	15194	60 %	0 %	0 %	40 %	308051523
16	NC_014544	CCCAA	2	10	21279	21288	40 %	0 %	0 %	60 %	308051530
17	NC_014544	TGCAA	2	10	22482	22491	40 %	20 %	20 %	20 %	308051530
18	NC_014544	AAATT	2	10	22595	22604	60 %	40 %	0 %	0 %	308051530
19	NC_014544	TGATG	2	10	23706	23715	20 %	40 %	40 %	0 %	308051531
20	NC_014544	ATGCA	2	10	24653	24662	40 %	20 %	20 %	20 %	308051533
21	NC_014544	CACTG	2	10	25111	25120	20 %	20 %	20 %	40 %	308051533
22	NC_014544	TTTTG	2	10	25846	25855	0 %	80 %	20 %	0 %	308051534
23	NC_014544	AATGA	2	10	26196	26205	60 %	20 %	20 %	0 %	308051534
24	NC_014544	GCGCT	2	10	29499	29508	0 %	20 %	40 %	40 %	308051535
25	NC_014544	AATAA	2	10	30465	30474	80 %	20 %	0 %	0 %	308051536
26	NC_014544	TTATT	2	10	36586	36595	20 %	80 %	0 %	0 %	308051537
27	NC_014544	TAAGA	2	10	38035	38044	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014544	TTATT	2	10	38080	38089	20 %	80 %	0 %	0 %	308051540
29	NC_014544	TCAAT	2	10	40384	40393	40 %	40 %	0 %	20 %	308051543
30	NC_014544	TTTTC	2	10	40415	40424	0 %	80 %	0 %	20 %	308051543
31	NC_014544	AATAG	2	10	41273	41282	60 %	20 %	20 %	0 %	308051544
32	NC_014544	ACTTC	2	10	45192	45201	20 %	40 %	0 %	40 %	308051550
33	NC_014544	GGCAT	2	10	45509	45518	20 %	20 %	40 %	20 %	308051550
34	NC_014544	GCTTT	2	10	45628	45637	0 %	60 %	20 %	20 %	308051550
35	NC_014544	CATTT	2	10	45704	45713	20 %	60 %	0 %	20 %	308051550
36	NC_014544	TCATT	2	10	46147	46156	20 %	60 %	0 %	20 %	308051550
37	NC_014544	AAATA	2	10	48114	48123	80 %	20 %	0 %	0 %	308051551
38	NC_014544	TTTGT	2	10	49892	49901	0 %	80 %	20 %	0 %	308051553
39	NC_014544	TCCTT	2	10	50664	50673	0 %	60 %	0 %	40 %	308051554
40	NC_014544	AAAAT	2	10	54585	54594	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014544	TTTTA	2	10	55660	55669	20 %	80 %	0 %	0 %	308051558
42	NC_014544	AAATC	2	10	57901	57910	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_014544	TCAAA	2	10	58643	58652	60 %	20 %	0 %	20 %	308051561
44	NC_014544	AGCAA	2	10	59211	59220	60 %	0 %	20 %	20 %	308051561
45	NC_014544	TCCCT	2	10	62575	62584	0 %	40 %	0 %	60 %	308051563
46	NC_014544	TTTAA	2	10	64598	64607	40 %	60 %	0 %	0 %	308051566
47	NC_014544	TTCCT	2	10	68543	68552	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_014544	CTTAT	2	10	71649	71658	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.