MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Legionella longbeachae NSW150 plasmid pLLO

Total Repeats: 232

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014544	TTTA	2	8	20	27	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014544	CAAC	2	8	59	66	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_014544	AATT	2	8	401	408	50 %	50 %	0 %	0 %	308051506
4	NC_014544	ATTG	2	8	769	776	25 %	50 %	25 %	0 %	308051506
5	NC_014544	TGAT	2	8	1410	1417	25 %	50 %	25 %	0 %	308051507
6	NC_014544	TTTA	2	8	1438	1445	25 %	75 %	0 %	0 %	308051507
7	NC_014544	AATT	2	8	1515	1522	50 %	50 %	0 %	0 %	308051507
8	NC_014544	AGTG	2	8	1951	1958	25 %	25 %	50 %	0 %	308051507
9	NC_014544	CACT	2	8	2028	2035	25 %	25 %	0 %	50 %	308051507
10	NC_014544	TCAA	2	8	2095	2102	50 %	25 %	0 %	25 %	308051507
11	NC_014544	TTGA	2	8	2669	2676	25 %	50 %	25 %	0 %	308051508
12	NC_014544	GTAC	2	8	2807	2814	25 %	25 %	25 %	25 %	308051508
13	NC_014544	ATTA	2	8	2818	2825	50 %	50 %	0 %	0 %	308051508
14	NC_014544	TGTA	2	8	2935	2942	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014544	ATTT	2	8	2964	2971	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014544	ATGC	2	8	3036	3043	25 %	25 %	25 %	25 %	308051509
17	NC_014544	TTCT	2	8	3192	3199	0 %	75 %	0 %	25 %	308051509
18	NC_014544	TCTA	2	8	3334	3341	25 %	50 %	0 %	25 %	308051509
19	NC_014544	GTTT	2	8	3349	3356	0 %	75 %	25 %	0 %	308051509
20	NC_014544	GATA	2	8	3522	3529	50 %	25 %	25 %	0 %	308051509
21	NC_014544	ATTT	2	8	3535	3542	25 %	75 %	0 %	0 %	308051509
22	NC_014544	AAGT	2	8	3544	3551	50 %	25 %	25 %	0 %	308051509
23	NC_014544	TTAA	2	8	5540	5547	50 %	50 %	0 %	0 %	308051511
24	NC_014544	TAGC	2	8	5556	5563	25 %	25 %	25 %	25 %	308051511
25	NC_014544	AATT	2	8	5569	5576	50 %	50 %	0 %	0 %	308051511
26	NC_014544	TTTG	2	8	5644	5651	0 %	75 %	25 %	0 %	308051511
27	NC_014544	TTTA	2	8	6069	6076	25 %	75 %	0 %	0 %	308051512
28	NC_014544	AATT	2	8	6633	6640	50 %	50 %	0 %	0 %	308051512
29	NC_014544	TACT	2	8	6886	6893	25 %	50 %	0 %	25 %	308051512
30	NC_014544	GTAA	2	8	7067	7074	50 %	25 %	25 %	0 %	308051512
31	NC_014544	TGTT	2	8	7375	7382	0 %	75 %	25 %	0 %	308051513
32	NC_014544	ATTC	2	8	7515	7522	25 %	50 %	0 %	25 %	308051513
33	NC_014544	ATTA	2	8	7535	7542	50 %	50 %	0 %	0 %	308051513
34	NC_014544	AAGA	2	8	7653	7660	75 %	0 %	25 %	0 %	308051513
35	NC_014544	TTGT	2	8	8038	8045	0 %	75 %	25 %	0 %	308051513
36	NC_014544	AGAA	2	8	8106	8113	75 %	0 %	25 %	0 %	308051513
37	NC_014544	AAAT	2	8	8257	8264	75 %	25 %	0 %	0 %	308051513
38	NC_014544	GATA	2	8	8714	8721	50 %	25 %	25 %	0 %	308051515
39	NC_014544	AATG	2	8	8912	8919	50 %	25 %	25 %	0 %	308051515
40	NC_014544	GCTT	2	8	9160	9167	0 %	50 %	25 %	25 %	308051515
41	NC_014544	TTGT	2	8	9665	9672	0 %	75 %	25 %	0 %	308051515
42	NC_014544	TAAT	2	8	10004	10011	50 %	50 %	0 %	0 %	308051516
43	NC_014544	AGCT	2	8	10025	10032	25 %	25 %	25 %	25 %	308051516
44	NC_014544	ACTG	2	8	10503	10510	25 %	25 %	25 %	25 %	308051516
45	NC_014544	TCAA	2	8	10868	10875	50 %	25 %	0 %	25 %	308051517
46	NC_014544	CTTT	2	8	11360	11367	0 %	75 %	0 %	25 %	308051517
47	NC_014544	CAGA	2	8	11495	11502	50 %	0 %	25 %	25 %	308051517
48	NC_014544	TACT	2	8	11588	11595	25 %	50 %	0 %	25 %	308051517
49	NC_014544	ATTC	2	8	11822	11829	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_014544	TAAA	2	8	12206	12213	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014544	ACAA	2	8	12301	12308	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_014544	CATG	2	8	12844	12851	25 %	25 %	25 %	25 %	308051520
53	NC_014544	GAAA	2	8	13337	13344	75 %	0 %	25 %	0 %	308051521
54	NC_014544	AAAG	2	8	13460	13467	75 %	0 %	25 %	0 %	308051521
55	NC_014544	AATC	2	8	14108	14115	50 %	25 %	0 %	25 %	308051522
56	NC_014544	AATC	2	8	15514	15521	50 %	25 %	0 %	25 %	308051523
57	NC_014544	AAAT	2	8	15935	15942	75 %	25 %	0 %	0 %	308051524
58	NC_014544	ATTT	2	8	16136	16143	25 %	75 %	0 %	0 %	308051525
59	NC_014544	CGTT	2	8	16372	16379	0 %	50 %	25 %	25 %	308051525
60	NC_014544	ACCT	2	8	16891	16898	25 %	25 %	0 %	50 %	308051525
61	NC_014544	TTCT	2	8	17627	17634	0 %	75 %	0 %	25 %	308051525
62	NC_014544	GTTG	2	8	18885	18892	0 %	50 %	50 %	0 %	308051527
63	NC_014544	CTTG	2	8	19273	19280	0 %	50 %	25 %	25 %	308051527
64	NC_014544	AGTA	2	8	19496	19503	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014544	TTGT	2	8	19628	19635	0 %	75 %	25 %	0 %	308051528
66	NC_014544	ACAA	2	8	19686	19693	75 %	0 %	0 %	25 %	308051528
67	NC_014544	TTTA	2	8	20054	20061	25 %	75 %	0 %	0 %	308051528
68	NC_014544	CAAT	2	8	20670	20677	50 %	25 %	0 %	25 %	308051529
69	NC_014544	TTGA	2	8	20698	20705	25 %	50 %	25 %	0 %	308051529
70	NC_014544	TTGA	2	8	20866	20873	25 %	50 %	25 %	0 %	308051529
71	NC_014544	GTAA	2	8	21013	21020	50 %	25 %	25 %	0 %	308051529
72	NC_014544	AACA	2	8	21460	21467	75 %	0 %	0 %	25 %	308051530
73	NC_014544	TTCG	2	8	21846	21853	0 %	50 %	25 %	25 %	308051530
74	NC_014544	CGTG	2	8	22136	22143	0 %	25 %	50 %	25 %	308051530
75	NC_014544	ATTG	2	8	22511	22518	25 %	50 %	25 %	0 %	308051530
76	NC_014544	GTTT	2	8	22652	22659	0 %	75 %	25 %	0 %	308051530
77	NC_014544	GATT	2	8	22819	22826	25 %	50 %	25 %	0 %	308051530
78	NC_014544	CTAT	2	8	22836	22843	25 %	50 %	0 %	25 %	308051530
79	NC_014544	TGAA	3	12	23747	23758	50 %	25 %	25 %	0 %	308051531
80	NC_014544	TAAA	2	8	23842	23849	75 %	25 %	0 %	0 %	308051532
81	NC_014544	AATT	2	8	25562	25569	50 %	50 %	0 %	0 %	308051533
82	NC_014544	GTTT	2	8	25838	25845	0 %	75 %	25 %	0 %	308051534
83	NC_014544	CTGC	2	8	25956	25963	0 %	25 %	25 %	50 %	308051534
84	NC_014544	TAAT	2	8	26476	26483	50 %	50 %	0 %	0 %	308051534
85	NC_014544	GGGC	2	8	27129	27136	0 %	0 %	75 %	25 %	308051534
86	NC_014544	TAAA	2	8	28168	28175	75 %	25 %	0 %	0 %	308051534
87	NC_014544	AAGG	2	8	28380	28387	50 %	0 %	50 %	0 %	308051534
88	NC_014544	TTAT	2	8	29604	29611	25 %	75 %	0 %	0 %	308051535
89	NC_014544	TTTA	2	8	29844	29851	25 %	75 %	0 %	0 %	308051535
90	NC_014544	ATTT	2	8	29898	29905	25 %	75 %	0 %	0 %	308051535
91	NC_014544	GAAA	2	8	29975	29982	75 %	0 %	25 %	0 %	308051535
92	NC_014544	TGTT	2	8	30895	30902	0 %	75 %	25 %	0 %	308051536
93	NC_014544	AATT	2	8	31045	31052	50 %	50 %	0 %	0 %	308051536
94	NC_014544	ATTT	2	8	31919	31926	25 %	75 %	0 %	0 %	308051536
95	NC_014544	CTTT	2	8	32064	32071	0 %	75 %	0 %	25 %	308051536
96	NC_014544	CAAG	2	8	32103	32110	50 %	0 %	25 %	25 %	308051536
97	NC_014544	CATT	2	8	32198	32205	25 %	50 %	0 %	25 %	308051536
98	NC_014544	ATGC	2	8	33237	33244	25 %	25 %	25 %	25 %	308051536
99	NC_014544	CCGA	2	8	33493	33500	25 %	0 %	25 %	50 %	308051536
100	NC_014544	TGAT	2	8	33727	33734	25 %	50 %	25 %	0 %	308051536
101	NC_014544	GGAA	2	8	34070	34077	50 %	0 %	50 %	0 %	308051536
102	NC_014544	AAAT	2	8	34403	34410	75 %	25 %	0 %	0 %	308051536
103	NC_014544	CCTT	2	8	34476	34483	0 %	50 %	0 %	50 %	308051536
104	NC_014544	TCAT	2	8	35464	35471	25 %	50 %	0 %	25 %	308051536
105	NC_014544	AAGG	3	12	36021	36032	50 %	0 %	50 %	0 %	308051536
106	NC_014544	TCAA	2	8	36127	36134	50 %	25 %	0 %	25 %	308051536
107	NC_014544	TCAA	2	8	36208	36215	50 %	25 %	0 %	25 %	308051536
108	NC_014544	TTAA	2	8	36219	36226	50 %	50 %	0 %	0 %	308051536
109	NC_014544	GAAC	2	8	36453	36460	50 %	0 %	25 %	25 %	308051537
110	NC_014544	CATT	2	8	36684	36691	25 %	50 %	0 %	25 %	308051538
111	NC_014544	TTTA	2	8	37018	37025	25 %	75 %	0 %	0 %	308051538
112	NC_014544	TTTC	2	8	37071	37078	0 %	75 %	0 %	25 %	308051538
113	NC_014544	ATTA	2	8	37424	37431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014544	TTAA	2	8	37700	37707	50 %	50 %	0 %	0 %	308051539
115	NC_014544	ATAG	2	8	37890	37897	50 %	25 %	25 %	0 %	308051539
116	NC_014544	AGTG	2	8	38356	38363	25 %	25 %	50 %	0 %	308051540
117	NC_014544	ATCA	2	8	38430	38437	50 %	25 %	0 %	25 %	308051540
118	NC_014544	AATT	2	8	38955	38962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014544	TAAA	2	8	39255	39262	75 %	25 %	0 %	0 %	308051541
120	NC_014544	TTAT	2	8	39749	39756	25 %	75 %	0 %	0 %	308051541
121	NC_014544	AATT	2	8	39884	39891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014544	AGAA	2	8	39944	39951	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014544	GGAA	2	8	40002	40009	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014544	ATTT	2	8	40922	40929	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014544	TACT	2	8	41000	41007	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_014544	GATT	2	8	41704	41711	25 %	50 %	25 %	0 %	308051545
127	NC_014544	TTTG	2	8	41734	41741	0 %	75 %	25 %	0 %	308051545
128	NC_014544	AATT	2	8	42180	42187	50 %	50 %	0 %	0 %	308051546
129	NC_014544	AATT	2	8	42323	42330	50 %	50 %	0 %	0 %	308051547
130	NC_014544	ATAA	2	8	42641	42648	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014544	GTAA	2	8	42694	42701	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014544	TAAA	2	8	42766	42773	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014544	CGAA	2	8	42922	42929	50 %	0 %	25 %	25 %	308051548
134	NC_014544	CAAA	2	8	43327	43334	75 %	0 %	0 %	25 %	308051548
135	NC_014544	ATCC	2	8	44079	44086	25 %	25 %	0 %	50 %	308051549
136	NC_014544	CCAT	2	8	44653	44660	25 %	25 %	0 %	50 %	308051550
137	NC_014544	GTAC	2	8	45867	45874	25 %	25 %	25 %	25 %	308051550
138	NC_014544	ATCA	2	8	46049	46056	50 %	25 %	0 %	25 %	308051550
139	NC_014544	ATAA	2	8	46110	46117	75 %	25 %	0 %	0 %	308051550
140	NC_014544	GGAT	2	8	46623	46630	25 %	25 %	50 %	0 %	308051550
141	NC_014544	TCCT	2	8	46859	46866	0 %	50 %	0 %	50 %	308051550
142	NC_014544	AAGA	2	8	46935	46942	75 %	0 %	25 %	0 %	308051550
143	NC_014544	TGCT	2	8	47014	47021	0 %	50 %	25 %	25 %	308051550
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.