MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Legionella longbeachae NSW150 plasmid pLLO

Total Repeats: 92

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014544	TA	3	6	310	315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014544	AG	3	6	720	725	50 %	0 %	50 %	0 %	308051506
3	NC_014544	TA	3	6	1202	1207	50 %	50 %	0 %	0 %	308051506
4	NC_014544	AG	3	6	1565	1570	50 %	0 %	50 %	0 %	308051507
5	NC_014544	TG	3	6	2996	3001	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014544	AG	3	6	3627	3632	50 %	0 %	50 %	0 %	308051509
7	NC_014544	AT	3	6	3758	3763	50 %	50 %	0 %	0 %	308051509
8	NC_014544	AT	3	6	4569	4574	50 %	50 %	0 %	0 %	308051510
9	NC_014544	TC	3	6	5128	5133	0 %	50 %	0 %	50 %	308051510
10	NC_014544	AC	3	6	6170	6175	50 %	0 %	0 %	50 %	308051512
11	NC_014544	AT	3	6	6249	6254	50 %	50 %	0 %	0 %	308051512
12	NC_014544	AT	3	6	6731	6736	50 %	50 %	0 %	0 %	308051512
13	NC_014544	GA	3	6	7029	7034	50 %	0 %	50 %	0 %	308051512
14	NC_014544	TA	3	6	7350	7355	50 %	50 %	0 %	0 %	308051513
15	NC_014544	TG	3	6	7868	7873	0 %	50 %	50 %	0 %	308051513
16	NC_014544	AT	3	6	8304	8309	50 %	50 %	0 %	0 %	308051513
17	NC_014544	TA	3	6	8416	8421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014544	GT	3	6	8674	8679	0 %	50 %	50 %	0 %	308051514
19	NC_014544	GA	3	6	9540	9545	50 %	0 %	50 %	0 %	308051515
20	NC_014544	TA	3	6	11077	11082	50 %	50 %	0 %	0 %	308051517
21	NC_014544	TA	3	6	11321	11326	50 %	50 %	0 %	0 %	308051517
22	NC_014544	CA	3	6	11378	11383	50 %	0 %	0 %	50 %	308051517
23	NC_014544	AG	3	6	11520	11525	50 %	0 %	50 %	0 %	308051517
24	NC_014544	AG	3	6	11964	11969	50 %	0 %	50 %	0 %	308051518
25	NC_014544	AT	3	6	12043	12048	50 %	50 %	0 %	0 %	308051518
26	NC_014544	TA	3	6	12575	12580	50 %	50 %	0 %	0 %	308051519
27	NC_014544	GA	3	6	12584	12589	50 %	0 %	50 %	0 %	308051519
28	NC_014544	TA	3	6	17072	17077	50 %	50 %	0 %	0 %	308051525
29	NC_014544	GT	3	6	21186	21191	0 %	50 %	50 %	0 %	308051530
30	NC_014544	TG	4	8	22300	22307	0 %	50 %	50 %	0 %	308051530
31	NC_014544	GC	3	6	23871	23876	0 %	0 %	50 %	50 %	308051532
32	NC_014544	GC	3	6	23896	23901	0 %	0 %	50 %	50 %	308051532
33	NC_014544	TA	3	6	23927	23932	50 %	50 %	0 %	0 %	308051532
34	NC_014544	GA	3	6	24266	24271	50 %	0 %	50 %	0 %	308051533
35	NC_014544	GT	3	6	24905	24910	0 %	50 %	50 %	0 %	308051533
36	NC_014544	CA	3	6	27029	27034	50 %	0 %	0 %	50 %	308051534
37	NC_014544	GC	3	6	27157	27162	0 %	0 %	50 %	50 %	308051534
38	NC_014544	TC	3	6	27164	27169	0 %	50 %	0 %	50 %	308051534
39	NC_014544	GT	3	6	29804	29809	0 %	50 %	50 %	0 %	308051535
40	NC_014544	CA	3	6	30506	30511	50 %	0 %	0 %	50 %	308051536
41	NC_014544	CA	3	6	31418	31423	50 %	0 %	0 %	50 %	308051536
42	NC_014544	CA	3	6	34583	34588	50 %	0 %	0 %	50 %	308051536
43	NC_014544	GA	3	6	35260	35265	50 %	0 %	50 %	0 %	308051536
44	NC_014544	GA	4	8	35370	35377	50 %	0 %	50 %	0 %	308051536
45	NC_014544	AC	3	6	36645	36650	50 %	0 %	0 %	50 %	308051538
46	NC_014544	TA	4	8	37248	37255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014544	TG	3	6	37303	37308	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014544	CT	3	6	38199	38204	0 %	50 %	0 %	50 %	308051540
49	NC_014544	TC	3	6	41139	41144	0 %	50 %	0 %	50 %	308051544
50	NC_014544	AT	4	8	41574	41581	50 %	50 %	0 %	0 %	308051545
51	NC_014544	AT	3	6	42034	42039	50 %	50 %	0 %	0 %	308051546
52	NC_014544	CT	3	6	42217	42222	0 %	50 %	0 %	50 %	308051546
53	NC_014544	AG	3	6	42229	42234	50 %	0 %	50 %	0 %	308051546
54	NC_014544	CA	3	6	42423	42428	50 %	0 %	0 %	50 %	308051547
55	NC_014544	AT	3	6	43158	43163	50 %	50 %	0 %	0 %	308051548
56	NC_014544	TA	3	6	43368	43373	50 %	50 %	0 %	0 %	308051548
57	NC_014544	TA	3	6	43376	43381	50 %	50 %	0 %	0 %	308051548
58	NC_014544	AG	3	6	44446	44451	50 %	0 %	50 %	0 %	308051550
59	NC_014544	GT	3	6	46239	46244	0 %	50 %	50 %	0 %	308051550
60	NC_014544	GT	3	6	47704	47709	0 %	50 %	50 %	0 %	308051551
61	NC_014544	AT	3	6	49957	49962	50 %	50 %	0 %	0 %	308051553
62	NC_014544	AG	3	6	50008	50013	50 %	0 %	50 %	0 %	308051553
63	NC_014544	AT	3	6	50321	50326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014544	CT	3	6	50379	50384	0 %	50 %	0 %	50 %	308051554
65	NC_014544	AG	3	6	50733	50738	50 %	0 %	50 %	0 %	308051554
66	NC_014544	GA	3	6	51560	51565	50 %	0 %	50 %	0 %	308051555
67	NC_014544	TG	3	6	51847	51852	0 %	50 %	50 %	0 %	308051555
68	NC_014544	TA	3	6	52029	52034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014544	AG	3	6	52433	52438	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014544	AG	3	6	54204	54209	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014544	TA	3	6	57077	57082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014544	AT	3	6	57180	57185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014544	CG	3	6	57471	57476	0 %	0 %	50 %	50 %	308051559
74	NC_014544	CT	3	6	57682	57687	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_014544	CA	3	6	58974	58979	50 %	0 %	0 %	50 %	308051561
76	NC_014544	AG	3	6	58995	59000	50 %	0 %	50 %	0 %	308051561
77	NC_014544	AG	3	6	60479	60484	50 %	0 %	50 %	0 %	308051561
78	NC_014544	CT	4	8	61489	61496	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_014544	AT	3	6	61817	61822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014544	CA	3	6	61909	61914	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_014544	CT	3	6	64057	64062	0 %	50 %	0 %	50 %	308051565
82	NC_014544	TA	3	6	64419	64424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014544	TC	3	6	65343	65348	0 %	50 %	0 %	50 %	308051566
84	NC_014544	AT	3	6	65845	65850	50 %	50 %	0 %	0 %	308051567
85	NC_014544	CA	3	6	68092	68097	50 %	0 %	0 %	50 %	308051569
86	NC_014544	CA	3	6	68204	68209	50 %	0 %	0 %	50 %	308051569
87	NC_014544	GC	3	6	68931	68936	0 %	0 %	50 %	50 %	308051570
88	NC_014544	GC	4	8	69134	69141	0 %	0 %	50 %	50 %	308051570
89	NC_014544	CA	3	6	70185	70190	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_014544	TA	4	8	71120	71127	50 %	50 %	0 %	0 %	308051572
91	NC_014544	TA	3	6	71546	71551	50 %	50 %	0 %	0 %	308051572
92	NC_014544	TA	3	6	71731	71736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.