MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Legionella longbeachae NSW150 plasmid pLLO

Total Repeats: 74

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014544	AG	3	6	720	725	50 %	0 %	50 %	0 %	308051506
2	NC_014544	TA	3	6	1202	1207	50 %	50 %	0 %	0 %	308051506
3	NC_014544	AG	3	6	1565	1570	50 %	0 %	50 %	0 %	308051507
4	NC_014544	AG	3	6	3627	3632	50 %	0 %	50 %	0 %	308051509
5	NC_014544	AT	3	6	3758	3763	50 %	50 %	0 %	0 %	308051509
6	NC_014544	AT	3	6	4569	4574	50 %	50 %	0 %	0 %	308051510
7	NC_014544	TC	3	6	5128	5133	0 %	50 %	0 %	50 %	308051510
8	NC_014544	AC	3	6	6170	6175	50 %	0 %	0 %	50 %	308051512
9	NC_014544	AT	3	6	6249	6254	50 %	50 %	0 %	0 %	308051512
10	NC_014544	AT	3	6	6731	6736	50 %	50 %	0 %	0 %	308051512
11	NC_014544	GA	3	6	7029	7034	50 %	0 %	50 %	0 %	308051512
12	NC_014544	TA	3	6	7350	7355	50 %	50 %	0 %	0 %	308051513
13	NC_014544	TG	3	6	7868	7873	0 %	50 %	50 %	0 %	308051513
14	NC_014544	AT	3	6	8304	8309	50 %	50 %	0 %	0 %	308051513
15	NC_014544	GT	3	6	8674	8679	0 %	50 %	50 %	0 %	308051514
16	NC_014544	GA	3	6	9540	9545	50 %	0 %	50 %	0 %	308051515
17	NC_014544	TA	3	6	11077	11082	50 %	50 %	0 %	0 %	308051517
18	NC_014544	TA	3	6	11321	11326	50 %	50 %	0 %	0 %	308051517
19	NC_014544	CA	3	6	11378	11383	50 %	0 %	0 %	50 %	308051517
20	NC_014544	AG	3	6	11520	11525	50 %	0 %	50 %	0 %	308051517
21	NC_014544	AG	3	6	11964	11969	50 %	0 %	50 %	0 %	308051518
22	NC_014544	AT	3	6	12043	12048	50 %	50 %	0 %	0 %	308051518
23	NC_014544	TA	3	6	12575	12580	50 %	50 %	0 %	0 %	308051519
24	NC_014544	GA	3	6	12584	12589	50 %	0 %	50 %	0 %	308051519
25	NC_014544	TA	3	6	17072	17077	50 %	50 %	0 %	0 %	308051525
26	NC_014544	GT	3	6	21186	21191	0 %	50 %	50 %	0 %	308051530
27	NC_014544	TG	4	8	22300	22307	0 %	50 %	50 %	0 %	308051530
28	NC_014544	GC	3	6	23871	23876	0 %	0 %	50 %	50 %	308051532
29	NC_014544	GC	3	6	23896	23901	0 %	0 %	50 %	50 %	308051532
30	NC_014544	TA	3	6	23927	23932	50 %	50 %	0 %	0 %	308051532
31	NC_014544	GA	3	6	24266	24271	50 %	0 %	50 %	0 %	308051533
32	NC_014544	GT	3	6	24905	24910	0 %	50 %	50 %	0 %	308051533
33	NC_014544	CA	3	6	27029	27034	50 %	0 %	0 %	50 %	308051534
34	NC_014544	GC	3	6	27157	27162	0 %	0 %	50 %	50 %	308051534
35	NC_014544	TC	3	6	27164	27169	0 %	50 %	0 %	50 %	308051534
36	NC_014544	GT	3	6	29804	29809	0 %	50 %	50 %	0 %	308051535
37	NC_014544	CA	3	6	30506	30511	50 %	0 %	0 %	50 %	308051536
38	NC_014544	CA	3	6	31418	31423	50 %	0 %	0 %	50 %	308051536
39	NC_014544	CA	3	6	34583	34588	50 %	0 %	0 %	50 %	308051536
40	NC_014544	GA	3	6	35260	35265	50 %	0 %	50 %	0 %	308051536
41	NC_014544	GA	4	8	35370	35377	50 %	0 %	50 %	0 %	308051536
42	NC_014544	AC	3	6	36645	36650	50 %	0 %	0 %	50 %	308051538
43	NC_014544	CT	3	6	38199	38204	0 %	50 %	0 %	50 %	308051540
44	NC_014544	TC	3	6	41139	41144	0 %	50 %	0 %	50 %	308051544
45	NC_014544	AT	4	8	41574	41581	50 %	50 %	0 %	0 %	308051545
46	NC_014544	AT	3	6	42034	42039	50 %	50 %	0 %	0 %	308051546
47	NC_014544	CT	3	6	42217	42222	0 %	50 %	0 %	50 %	308051546
48	NC_014544	AG	3	6	42229	42234	50 %	0 %	50 %	0 %	308051546
49	NC_014544	CA	3	6	42423	42428	50 %	0 %	0 %	50 %	308051547
50	NC_014544	AT	3	6	43158	43163	50 %	50 %	0 %	0 %	308051548
51	NC_014544	TA	3	6	43368	43373	50 %	50 %	0 %	0 %	308051548
52	NC_014544	TA	3	6	43376	43381	50 %	50 %	0 %	0 %	308051548
53	NC_014544	AG	3	6	44446	44451	50 %	0 %	50 %	0 %	308051550
54	NC_014544	GT	3	6	46239	46244	0 %	50 %	50 %	0 %	308051550
55	NC_014544	GT	3	6	47704	47709	0 %	50 %	50 %	0 %	308051551
56	NC_014544	AT	3	6	49957	49962	50 %	50 %	0 %	0 %	308051553
57	NC_014544	AG	3	6	50008	50013	50 %	0 %	50 %	0 %	308051553
58	NC_014544	CT	3	6	50379	50384	0 %	50 %	0 %	50 %	308051554
59	NC_014544	AG	3	6	50733	50738	50 %	0 %	50 %	0 %	308051554
60	NC_014544	GA	3	6	51560	51565	50 %	0 %	50 %	0 %	308051555
61	NC_014544	TG	3	6	51847	51852	0 %	50 %	50 %	0 %	308051555
62	NC_014544	CG	3	6	57471	57476	0 %	0 %	50 %	50 %	308051559
63	NC_014544	CA	3	6	58974	58979	50 %	0 %	0 %	50 %	308051561
64	NC_014544	AG	3	6	58995	59000	50 %	0 %	50 %	0 %	308051561
65	NC_014544	AG	3	6	60479	60484	50 %	0 %	50 %	0 %	308051561
66	NC_014544	CT	3	6	64057	64062	0 %	50 %	0 %	50 %	308051565
67	NC_014544	TC	3	6	65343	65348	0 %	50 %	0 %	50 %	308051566
68	NC_014544	AT	3	6	65845	65850	50 %	50 %	0 %	0 %	308051567
69	NC_014544	CA	3	6	68092	68097	50 %	0 %	0 %	50 %	308051569
70	NC_014544	CA	3	6	68204	68209	50 %	0 %	0 %	50 %	308051569
71	NC_014544	GC	3	6	68931	68936	0 %	0 %	50 %	50 %	308051570
72	NC_014544	GC	4	8	69134	69141	0 %	0 %	50 %	50 %	308051570
73	NC_014544	TA	4	8	71120	71127	50 %	50 %	0 %	0 %	308051572
74	NC_014544	TA	3	6	71546	71551	50 %	50 %	0 %	0 %	308051572

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.