MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Escherichia coli O26:H11 str. 11368 plasmid pO26_4

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014543	TGG	2	6	34	39	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307950759
2	NC_014543	GGC	2	6	88	93	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307950759
3	NC_014543	GCC	2	6	197	202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307950759
4	NC_014543	ATG	2	6	302	307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307950759
5	NC_014543	ATA	2	6	434	439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307950759
6	NC_014543	AGA	2	6	552	557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307950759
7	NC_014543	AAT	2	6	579	584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307950759
8	NC_014543	CGC	2	6	898	903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_014543	AGC	2	6	905	910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014543	ATG	2	6	925	930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014543	ACC	2	6	952	957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_014543	ATT	2	6	1152	1157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014543	ATT	2	6	1218	1223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014543	GCT	2	6	1318	1323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014543	AAC	2	6	1356	1361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014543	ACA	3	9	1375	1383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307950760
17	NC_014543	CGA	2	6	1459	1464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307950760
18	NC_014543	GAA	2	6	1502	1507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307950760
19	NC_014543	GCA	2	6	1606	1611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014543	GCG	2	6	1849	1854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_014543	CAA	2	6	1932	1937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014543	GCA	2	6	2320	2325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014543	CTC	2	6	2412	2417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_014543	CAC	2	6	2538	2543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_014543	TAA	2	6	2646	2651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307950761
26	NC_014543	CAA	2	6	2725	2730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307950761
27	NC_014543	AAG	2	6	2762	2767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307950761
28	NC_014543	TGG	2	6	2791	2796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307950761
29	NC_014543	AGA	2	6	2866	2871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307950761
30	NC_014543	AAT	2	6	2919	2924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307950761
31	NC_014543	ATG	2	6	2933	2938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307950761
32	NC_014543	CAT	2	6	2940	2945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307950761
33	NC_014543	AAT	2	6	3354	3359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307950761
34	NC_014543	CTG	2	6	3413	3418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307950761
35	NC_014543	CAA	2	6	3453	3458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307950761
36	NC_014543	CAT	3	9	3643	3651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014543	CCA	2	6	3700	3705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_014543	CAT	2	6	3813	3818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014543	AGC	2	6	3837	3842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014543	TAA	2	6	3873	3878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014543	ACA	2	6	3898	3903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_014543	GGA	2	6	3919	3924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014543	CAA	2	6	3940	3945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014543	TGT	2	6	3991	3996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014543	ATA	2	6	4028	4033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.