MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia sp. CCGE1003 chromosome 1

Total Repeats: 1961

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014539	TAGT	2	8	5915	5922	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014539	GAGT	2	8	6112	6119	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014539	TTAT	2	8	16816	16823	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014539	CAGG	2	8	16837	16844	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014539	AATA	2	8	16920	16927	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014539	TGCC	2	8	23373	23380	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_014539	CTGC	2	8	33719	33726	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_014539	GGTG	2	8	33745	33752	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014539	ATCA	2	8	40012	40019	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_014539	TAGT	2	8	40655	40662	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014539	GGTG	2	8	41064	41071	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014539	TCAC	2	8	42010	42017	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_014539	CACC	2	8	42074	42081	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
14	NC_014539	GCCC	2	8	42118	42125	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15	NC_014539	CGGC	2	8	42224	42231	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_014539	CGTC	2	8	42262	42269	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_014539	GCGA	2	8	44600	44607	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_014539	GCAA	2	8	45530	45537	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_014539	TTCC	2	8	49979	49986	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_014539	GCAG	2	8	50082	50089	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_014539	GTGC	3	12	57376	57387	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_014539	CGTG	2	8	57392	57399	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_014539	GCGT	2	8	65336	65343	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_014539	GCCG	2	8	66629	66636	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_014539	AGGT	2	8	67500	67507	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014539	TGCG	2	8	68052	68059	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_014539	GGCA	2	8	68124	68131	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_014539	GGTG	2	8	68660	68667	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014539	AGAA	2	8	68983	68990	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014539	GTGA	2	8	69052	69059	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014539	GCGG	2	8	69243	69250	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32	NC_014539	GCCG	2	8	78458	78465	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_014539	GGCG	2	8	80351	80358	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
34	NC_014539	TCCT	2	8	82178	82185	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_014539	GCCT	2	8	83985	83992	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_014539	ATCG	2	8	89502	89509	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_014539	CTGC	2	8	97197	97204	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_014539	ACGG	2	8	100283	100290	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_014539	CAGC	2	8	100767	100774	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_014539	GCAG	2	8	100775	100782	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_014539	CGAA	2	8	104935	104942	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_014539	CTGC	2	8	110580	110587	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_014539	TGGC	2	8	117315	117322	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_014539	CAAA	2	8	117409	117416	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_014539	CGCT	2	8	120788	120795	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_014539	TGGC	2	8	124395	124402	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_014539	GCCG	2	8	127330	127337	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_014539	CTGA	2	8	128671	128678	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_014539	GCAC	2	8	128841	128848	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_014539	GACG	2	8	129348	129355	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_014539	GGAT	2	8	129404	129411	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014539	AGGC	2	8	129446	129453	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_014539	ATTT	2	8	132352	132359	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014539	TCCG	2	8	133930	133937	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_014539	GCGA	2	8	140645	140652	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_014539	GCCT	2	8	144510	144517	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_014539	GGGA	2	8	144761	144768	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014539	TATT	2	8	144881	144888	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014539	TGCA	2	8	144893	144900	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_014539	TGAT	2	8	145105	145112	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014539	GTTT	2	8	153058	153065	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014539	GCCG	2	8	153998	154005	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_014539	GGTT	2	8	155415	155422	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014539	CCGA	2	8	156399	156406	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_014539	GCCA	2	8	156421	156428	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_014539	AGCG	2	8	157553	157560	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_014539	ACGA	2	8	158825	158832	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_014539	CGGC	2	8	159407	159414	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_014539	GTAT	2	8	160826	160833	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014539	GCGG	2	8	163529	163536	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
71	NC_014539	GCAG	2	8	163564	163571	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_014539	AATT	2	8	165160	165167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014539	GCCT	2	8	166651	166658	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_014539	TGCG	2	8	166669	166676	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_014539	GATG	2	8	167953	167960	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014539	GAAA	2	8	167962	167969	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014539	ACGC	2	8	168103	168110	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_014539	TCGG	2	8	168129	168136	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_014539	TAAT	2	8	169014	169021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014539	CGTA	2	8	169125	169132	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_014539	ATAG	2	8	171319	171326	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014539	TGTC	2	8	173360	173367	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_014539	GTGC	2	8	173481	173488	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_014539	CCAG	2	8	173583	173590	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_014539	TGGG	2	8	173629	173636	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014539	ACGG	2	8	175615	175622	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_014539	GGGC	2	8	180546	180553	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
88	NC_014539	CGGC	2	8	182891	182898	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_014539	CCAG	2	8	183200	183207	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_014539	GCTT	2	8	186736	186743	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_014539	CCCA	2	8	189014	189021	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
92	NC_014539	GGAA	2	8	192653	192660	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014539	GATA	2	8	192783	192790	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014539	GTGC	2	8	199916	199923	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_014539	AGGG	2	8	200044	200051	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014539	GCCG	2	8	202174	202181	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_014539	CTTC	2	8	203860	203867	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_014539	GATT	2	8	203950	203957	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014539	GAGC	2	8	203962	203969	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_014539	TGAT	2	8	209794	209801	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014539	TGGG	2	8	210089	210096	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014539	CTTT	2	8	212852	212859	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_014539	GTTG	2	8	215111	215118	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014539	TGGG	2	8	223908	223915	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014539	CGGA	2	8	223917	223924	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_014539	CCTG	2	8	225429	225436	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_014539	ACAA	2	8	225509	225516	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_014539	GCAC	2	8	225547	225554	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_014539	GAAG	2	8	225852	225859	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014539	CCGC	2	8	225924	225931	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
111	NC_014539	AGCC	2	8	227664	227671	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_014539	GCAT	2	8	239485	239492	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_014539	GCCG	2	8	241356	241363	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_014539	CAGC	2	8	241487	241494	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_014539	CCGG	2	8	241546	241553	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_014539	GCCG	2	8	241554	241561	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_014539	GAGC	2	8	242154	242161	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_014539	AAAG	2	8	242285	242292	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014539	GCGT	2	8	245491	245498	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_014539	CGGT	2	8	246876	246883	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_014539	GGGT	2	8	247273	247280	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014539	CGCA	2	8	250586	250593	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_014539	ACTG	2	8	251743	251750	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_014539	TTTG	2	8	255265	255272	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014539	ACGC	2	8	255465	255472	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_014539	GACA	2	8	255615	255622	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_014539	CCAT	2	8	257456	257463	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_014539	ACGG	2	8	277802	277809	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_014539	TTCG	2	8	281003	281010	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_014539	GCGG	2	8	286543	286550	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
131	NC_014539	GCGG	2	8	286567	286574	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
132	NC_014539	CACG	2	8	286729	286736	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_014539	GTGC	2	8	289999	290006	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_014539	TTGC	2	8	290051	290058	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_014539	CGGG	2	8	290102	290109	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
136	NC_014539	GCAG	2	8	290413	290420	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_014539	CAGG	2	8	290421	290428	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_014539	GCGG	2	8	295117	295124	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
139	NC_014539	CGGC	2	8	295317	295324	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_014539	GCGT	2	8	296382	296389	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_014539	GCTT	2	8	298436	298443	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_014539	GGAC	2	8	300894	300901	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_014539	GCCG	2	8	301063	301070	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_014539	CGGT	2	8	302065	302072	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_014539	ACGC	2	8	302877	302884	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_014539	CGGG	2	8	302902	302909	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
147	NC_014539	GGGC	2	8	302945	302952	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
148	NC_014539	CTGC	2	8	304584	304591	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_014539	GCTT	2	8	307594	307601	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_014539	GAAG	2	8	312688	312695	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014539	CTGG	2	8	313930	313937	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
152	NC_014539	CGGC	2	8	318688	318695	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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500	NC_014539	GCGG	2	8	1035517	1035524	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding

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