MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Burkholderia sp. CCGE1003 chromosome 1

Total Repeats: 69369

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014539	ATC	2	6	12	17	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014539	GCC	2	6	113	118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_014539	TGC	2	6	132	137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014539	ATG	2	6	214	219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014539	CGC	2	6	222	227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_014539	GCT	2	6	286	291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014539	TTG	2	6	299	304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014539	GCG	2	6	324	329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014539	TGA	2	6	360	365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307728077
10	NC_014539	CAG	2	6	416	421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728077
11	NC_014539	CGC	2	6	463	468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307728077
12	NC_014539	GCG	2	6	632	637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728077
13	NC_014539	CGG	2	6	685	690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728077
14	NC_014539	CGG	2	6	721	726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728077
15	NC_014539	CGC	2	6	730	735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307728077
16	NC_014539	CGC	2	6	742	747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307728077
17	NC_014539	GGC	2	6	763	768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728077
18	NC_014539	GCC	2	6	824	829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307728077
19	NC_014539	CGG	2	6	879	884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728077
20	NC_014539	CGC	2	6	887	892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307728077
21	NC_014539	CGG	2	6	1084	1089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728077
22	NC_014539	GTG	2	6	1199	1204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307728077
23	NC_014539	CGA	2	6	1228	1233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728077
24	NC_014539	CTA	2	6	1243	1248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307728077
25	NC_014539	CTG	3	9	1262	1270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728077
26	NC_014539	CGA	2	6	1273	1278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728077
27	NC_014539	TCA	3	9	1362	1370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307728077
28	NC_014539	CGA	2	6	1405	1410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728077
29	NC_014539	GCC	2	6	1456	1461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307728077
30	NC_014539	TCG	2	6	1542	1547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728077
31	NC_014539	AAG	2	6	1650	1655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307728077
32	NC_014539	CTG	2	6	1667	1672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728077
33	NC_014539	AGA	2	6	1710	1715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307728077
34	NC_014539	GAA	2	6	1759	1764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307728077
35	NC_014539	CGG	2	6	1858	1863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728077
36	NC_014539	TGC	2	6	1881	1886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728077
37	NC_014539	CGA	2	6	1906	1911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728077
38	NC_014539	GCA	2	6	1914	1919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728077
39	NC_014539	GCG	2	6	1976	1981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014539	AAC	2	6	1992	1997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_014539	GGT	2	6	2032	2037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014539	CGG	2	6	2120	2125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014539	CCT	2	6	2230	2235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307728078
44	NC_014539	CGC	2	6	2270	2275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307728078
45	NC_014539	CAC	2	6	2362	2367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307728078
46	NC_014539	GCG	2	6	2388	2393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728078
47	NC_014539	CTC	2	6	2426	2431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307728078
48	NC_014539	CGC	2	6	2533	2538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307728078
49	NC_014539	CAG	2	6	2645	2650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728078
50	NC_014539	CTA	2	6	2659	2664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307728078
51	NC_014539	TGC	2	6	2676	2681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728078
52	NC_014539	GTG	2	6	2684	2689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307728078
53	NC_014539	TCG	2	6	2741	2746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728078
54	NC_014539	CGA	2	6	2833	2838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728078
55	NC_014539	TGG	2	6	2910	2915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307728078
56	NC_014539	GAA	2	6	2984	2989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307728078
57	NC_014539	GAA	2	6	3113	3118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307728078
58	NC_014539	ACG	2	6	3132	3137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728078
59	NC_014539	TGC	2	6	3207	3212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728078
60	NC_014539	ACG	2	6	3264	3269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728078
61	NC_014539	GTG	2	6	3281	3286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307728078
62	NC_014539	AGC	2	6	3379	3384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_014539	CAG	2	6	3389	3394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_014539	ACA	2	6	3446	3451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307728079
65	NC_014539	CAC	2	6	3550	3555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307728079
66	NC_014539	GAC	2	6	3694	3699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728079
67	NC_014539	CGG	2	6	3753	3758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728079
68	NC_014539	GGC	2	6	3790	3795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728079
69	NC_014539	AAG	2	6	3868	3873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307728079
70	NC_014539	TGA	2	6	3935	3940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307728079
71	NC_014539	CGA	2	6	4002	4007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728079
72	NC_014539	GAA	2	6	4123	4128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307728079
73	NC_014539	CGG	2	6	4143	4148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728079
74	NC_014539	CAA	2	6	4173	4178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307728079
75	NC_014539	TGC	2	6	4190	4195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728079
76	NC_014539	AAC	2	6	4297	4302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307728079
77	NC_014539	CGG	2	6	4317	4322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728079
78	NC_014539	CGA	2	6	4422	4427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728079
79	NC_014539	GAA	2	6	4534	4539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307728079
80	NC_014539	GTG	2	6	4540	4545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307728079
81	NC_014539	ACG	2	6	4583	4588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728079
82	NC_014539	GCA	2	6	4601	4606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728079
83	NC_014539	TCG	2	6	4751	4756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728079
84	NC_014539	GGC	2	6	4771	4776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728079
85	NC_014539	GCT	2	6	4866	4871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728079
86	NC_014539	GAC	2	6	4927	4932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728079
87	NC_014539	CAT	4	12	4962	4973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307728079
88	NC_014539	GCT	3	9	5010	5018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728079
89	NC_014539	GAT	2	6	5046	5051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307728079
90	NC_014539	GCC	2	6	5079	5084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307728079
91	NC_014539	TGC	2	6	5183	5188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728079
92	NC_014539	CTG	2	6	5248	5253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728079
93	NC_014539	GGT	2	6	5262	5267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307728079
94	NC_014539	GCC	2	6	5279	5284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307728079
95	NC_014539	ACG	2	6	5288	5293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728079
96	NC_014539	GGC	3	9	5346	5354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728079
97	NC_014539	CGA	2	6	5505	5510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728079
98	NC_014539	GCG	2	6	5582	5587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728079
99	NC_014539	GCG	2	6	5600	5605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728079
100	NC_014539	GCA	2	6	5609	5614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728079
101	NC_014539	AGC	2	6	5681	5686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728079
102	NC_014539	AGC	2	6	5717	5722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728079
103	NC_014539	GAC	2	6	5730	5735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728079
104	NC_014539	ACG	2	6	5806	5811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728079
105	NC_014539	GAT	2	6	5821	5826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307728079
106	NC_014539	CGG	2	6	5987	5992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_014539	AGT	2	6	5995	6000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014539	GCC	2	6	6001	6006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_014539	TGA	2	6	6039	6044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014539	GCA	2	6	6124	6129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_014539	GCG	3	9	6131	6139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_014539	CGT	2	6	6230	6235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728080
113	NC_014539	GCC	2	6	6298	6303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307728080
114	NC_014539	TCG	2	6	6315	6320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728080
115	NC_014539	AAG	2	6	6419	6424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307728080
116	NC_014539	TTG	2	6	6454	6459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307728080
117	NC_014539	AGA	2	6	6779	6784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307728080
118	NC_014539	GCC	2	6	6793	6798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307728080
119	NC_014539	GAA	2	6	6868	6873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307728080
120	NC_014539	TGA	2	6	6932	6937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307728080
121	NC_014539	TCA	2	6	6955	6960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307728080
122	NC_014539	TGA	2	6	7020	7025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307728080
123	NC_014539	ACC	2	6	7105	7110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307728080
124	NC_014539	ACG	2	6	7227	7232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728080
125	NC_014539	AGA	2	6	7251	7256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307728080
126	NC_014539	GGC	2	6	7300	7305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728080
127	NC_014539	ATG	2	6	7315	7320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307728080
128	NC_014539	TCA	2	6	7445	7450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307728080
129	NC_014539	GAT	2	6	7453	7458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307728080
130	NC_014539	GGC	2	6	7564	7569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728080
131	NC_014539	TCA	2	6	7658	7663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307728080
132	NC_014539	GCA	2	6	7803	7808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728080
133	NC_014539	CGG	2	6	7883	7888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728080
134	NC_014539	TCG	2	6	8060	8065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728081
135	NC_014539	CGG	2	6	8106	8111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728081
136	NC_014539	CTA	2	6	8242	8247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307728081
137	NC_014539	CGG	2	6	8256	8261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728081
138	NC_014539	TCC	2	6	8376	8381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307728081
139	NC_014539	CGA	2	6	8517	8522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728081
140	NC_014539	GAC	2	6	8527	8532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728081
141	NC_014539	GCA	2	6	8666	8671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728081
142	NC_014539	ATG	2	6	8842	8847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307728082
143	NC_014539	TGT	2	6	9025	9030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307728082
144	NC_014539	GCA	2	6	9123	9128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728082
145	NC_014539	TGC	2	6	9172	9177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728082
146	NC_014539	ATA	2	6	9194	9199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307728082
147	NC_014539	AGA	2	6	9309	9314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307728082
148	NC_014539	CGT	2	6	9330	9335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728082
149	NC_014539	GTC	2	6	9346	9351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728082
150	NC_014539	CAA	2	6	9417	9422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307728082
151	NC_014539	GCA	3	9	9539	9547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728082
152	NC_014539	TTG	2	6	9863	9868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_014539	GTT	2	6	9913	9918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_014539	TCA	2	6	10041	10046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_014539	ATA	2	6	10092	10097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307728083
156	NC_014539	GTT	2	6	10259	10264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307728083
157	NC_014539	ATC	2	6	10315	10320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307728083
158	NC_014539	GTT	2	6	10352	10357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307728083
159	NC_014539	ACC	2	6	10426	10431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307728083
160	NC_014539	TGC	2	6	10533	10538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728083
161	NC_014539	CGG	2	6	10602	10607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728083
162	NC_014539	TCC	2	6	10714	10719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307728083
163	NC_014539	TAT	2	6	10769	10774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307728083
164	NC_014539	ATA	2	6	10804	10809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307728083
165	NC_014539	GAT	2	6	11114	11119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307728084
166	NC_014539	GCT	2	6	11284	11289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728084
167	NC_014539	CAG	2	6	11337	11342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_014539	GCC	2	6	11387	11392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307728085
169	NC_014539	CGC	2	6	11532	11537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307728085
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177	NC_014539	TCG	2	6	12210	12215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728086
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228	NC_014539	CAG	2	6	16608	16613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
229	NC_014539	ACG	2	6	16761	16766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728090
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232	NC_014539	CTG	2	6	16940	16945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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234	NC_014539	GCG	2	6	17231	17236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728091
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237	NC_014539	AGT	2	6	17786	17791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307728092
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249	NC_014539	GTC	2	6	18591	18596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728093
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251	NC_014539	CAA	2	6	18649	18654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307728093
252	NC_014539	GCC	2	6	18702	18707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307728093
253	NC_014539	TTC	2	6	18725	18730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307728093
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255	NC_014539	TGG	2	6	18802	18807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307728093
256	NC_014539	GCG	2	6	18889	18894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728093
257	NC_014539	CGG	2	6	19016	19021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728093
258	NC_014539	TCG	2	6	19065	19070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728093
259	NC_014539	CTA	2	6	19293	19298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307728093
260	NC_014539	GTG	2	6	19396	19401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307728093
261	NC_014539	CGA	2	6	19671	19676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728093
262	NC_014539	CGA	2	6	19707	19712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728093
263	NC_014539	ACG	2	6	19744	19749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728093
264	NC_014539	GGA	2	6	19809	19814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307728093
265	NC_014539	TCC	2	6	19868	19873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307728093
266	NC_014539	CGA	2	6	19893	19898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728093
267	NC_014539	TGC	2	6	19904	19909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728093
268	NC_014539	GAT	2	6	19963	19968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307728093
269	NC_014539	GGC	2	6	19971	19976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728093
270	NC_014539	CGC	2	6	19998	20003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307728093
271	NC_014539	CGA	2	6	20077	20082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728093
272	NC_014539	TTG	2	6	20125	20130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307728093
273	NC_014539	GCG	2	6	20187	20192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728093
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278	NC_014539	GTT	2	6	20590	20595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307728094
279	NC_014539	CGA	2	6	20648	20653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728094
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281	NC_014539	TTG	2	6	20743	20748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307728094
282	NC_014539	CGG	2	6	20752	20757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728094
283	NC_014539	GCA	2	6	20790	20795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728094
284	NC_014539	GTC	2	6	20878	20883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728094
285	NC_014539	TGG	2	6	20885	20890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307728094
286	NC_014539	CGG	2	6	20938	20943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728094
287	NC_014539	CGT	2	6	21012	21017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728094
288	NC_014539	GTC	2	6	21150	21155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728094
289	NC_014539	CCT	2	6	21189	21194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307728094
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291	NC_014539	CGA	2	6	21514	21519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728095
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303	NC_014539	GGT	2	6	22624	22629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307728095
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