MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Thermoanaerobacter sp. X513 chromosome

Total Repeats: 898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014538	AAAAGT	2	12	3529	3540	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	307723222
2	NC_014538	TATGGC	2	12	5633	5644	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307723224
3	NC_014538	TATATC	2	12	7232	7243	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	307723225
4	NC_014538	TCAAAT	2	12	9128	9139	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	307723227
5	NC_014538	ACAAGC	2	12	12265	12276	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	307723228
6	NC_014538	GAGAAA	2	12	12975	12986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307723228
7	NC_014538	TCATGC	2	12	15620	15631	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	307723231
8	NC_014538	GTAGAT	2	12	17810	17821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307723233
9	NC_014538	TTAGGA	2	12	21167	21178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307723236
10	NC_014538	ATATTG	2	12	23111	23122	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	307723237
11	NC_014538	CAGAAC	2	12	27858	27869	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	307723242
12	NC_014538	AAATAA	2	12	36913	36924	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	307723249
13	NC_014538	AAAGAA	2	12	52737	52748	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	307723262
14	NC_014538	TAAAAT	2	12	55135	55146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307723265
15	NC_014538	TTGCAA	2	12	60036	60047	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	307723268
16	NC_014538	TGAAAT	2	12	60411	60422	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	307723268
17	NC_014538	TAGCAG	2	12	61947	61958	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	307723270
18	NC_014538	GAAAAA	2	12	62517	62528	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	307723271
19	NC_014538	TTGCAA	2	12	62761	62772	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	307723271
20	NC_014538	AAAAGG	2	12	62987	62998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307723271
21	NC_014538	GAAAAA	2	12	63427	63438	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	307723272
22	NC_014538	AATAAG	2	12	65212	65223	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	307723273
23	NC_014538	GAAAAA	2	12	66232	66243	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	307723274
24	NC_014538	TAAGTT	2	12	72485	72496	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	307723280
25	NC_014538	GATAAA	2	12	74562	74573	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	307723281
26	NC_014538	AAAATA	2	12	78069	78080	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	307723281
27	NC_014538	TAAAAC	2	12	81389	81400	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	307723285
28	NC_014538	ATTTTT	2	12	89791	89802	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	307723288
29	NC_014538	TTAAAA	2	12	91599	91610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307723291
30	NC_014538	GTAGAT	2	12	92559	92570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307723292
31	NC_014538	TAAATT	2	12	101806	101817	50 %	50 %	0 %	0 %	307723303
32	NC_014538	TTTGTT	2	12	105405	105416	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	307723307
33	NC_014538	TTGAAT	2	12	106302	106313	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	307723308
34	NC_014538	GTACAT	2	12	111008	111019	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	307723311
35	NC_014538	AAACTG	2	12	113023	113034	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	307723313
36	NC_014538	TTTTAT	2	12	114976	114987	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	307723316
37	NC_014538	ATTTCT	2	12	115035	115046	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	307723316
38	NC_014538	CTTTTT	2	12	115177	115188	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	307723316
39	NC_014538	ATATTG	2	12	121602	121613	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	307723323
40	NC_014538	GTAGAA	2	12	124990	125001	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	307723328
41	NC_014538	GGAAAT	2	12	125997	126008	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	307723329
42	NC_014538	TTTTAG	2	12	126289	126300	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	307723330
43	NC_014538	TAGCTA	2	12	127265	127276	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	307723331
44	NC_014538	GCAGGA	2	12	132519	132530	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	307723337
45	NC_014538	AATTGC	2	12	133887	133898	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	307723338
46	NC_014538	CAGGAC	2	12	136173	136184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307723341
47	NC_014538	CAGTGG	2	12	136516	136527	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	307723342
48	NC_014538	GAAAAA	2	12	138536	138547	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	307723345
49	NC_014538	ATGTCA	2	12	139026	139037	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	307723346
50	NC_014538	AAGAAT	2	12	141410	141421	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	307723347
51	NC_014538	GTTTTG	2	12	145680	145691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307723351
52	NC_014538	AATAAA	2	12	146701	146712	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	307723352
53	NC_014538	AGACAA	2	12	148823	148834	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	307723355
54	NC_014538	ATCTGG	2	12	155200	155211	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307723363
55	NC_014538	TGTAAA	2	12	156127	156138	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	307723363
56	NC_014538	GGAGTA	2	12	160721	160732	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	307723367
57	NC_014538	TAAATT	2	12	161143	161154	50 %	50 %	0 %	0 %	307723367
58	NC_014538	TGTAGC	2	12	163858	163869	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307723370
59	NC_014538	GATAAA	2	12	167811	167822	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	307723374
60	NC_014538	AGATGA	2	12	179191	179202	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	307723384
61	NC_014538	GCGGTG	2	12	193022	193033	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	307723393
62	NC_014538	TAAGAA	2	12	195957	195968	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	307723395
63	NC_014538	TACTGT	2	12	197112	197123	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	307723396
64	NC_014538	AATGAG	2	12	197610	197621	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	307723397
65	NC_014538	ATTGGT	2	12	199874	199885	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	307723399
66	NC_014538	TGGATG	2	12	202150	202161	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	307723401
67	NC_014538	TATACC	2	12	203712	203723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307723403
68	NC_014538	TAAGAA	2	12	208835	208846	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	307723407
69	NC_014538	TAAAAA	2	12	210158	210169	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	307723408
70	NC_014538	ATGCAT	2	12	213544	213555	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	307723411
71	NC_014538	AAATTT	2	12	213933	213944	50 %	50 %	0 %	0 %	307723411
72	NC_014538	TTGATA	2	12	214007	214018	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	307723412
73	NC_014538	AAAGAA	2	12	214332	214343	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	307723412
74	NC_014538	ATTGAT	2	12	218852	218863	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	307723417
75	NC_014538	TAAAGA	2	12	225321	225332	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	307723422
76	NC_014538	GGATTA	2	12	231585	231596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307723428
77	NC_014538	ATTCAT	2	12	232598	232609	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	307723429
78	NC_014538	AAAGAT	2	12	233241	233252	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	307723430
79	NC_014538	CTTGAG	2	12	238088	238099	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307723437
80	NC_014538	AAGCAA	2	12	238964	238975	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	307723437
81	NC_014538	TAGCAA	2	12	242232	242243	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	307723440
82	NC_014538	GAAAAG	2	12	248217	248228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307723444
83	NC_014538	GAAATA	2	12	252608	252619	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	307723446
84	NC_014538	TTTAGA	2	12	255524	255535	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	307723447
85	NC_014538	TTCTTT	2	12	259004	259015	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	307723450
86	NC_014538	TTAATG	2	12	268851	268862	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	307723461
87	NC_014538	ATGTAG	2	12	269807	269818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307723462
88	NC_014538	AGAGTT	2	12	273701	273712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307723466
89	NC_014538	TCTACA	2	12	281702	281713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307723472
90	NC_014538	CAATTT	2	12	283354	283365	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	307723474
91	NC_014538	TTTCTA	2	12	283975	283986	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	307723474
92	NC_014538	GAAATA	2	12	285905	285916	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	307723476
93	NC_014538	AAGAAA	2	12	298861	298872	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	307723486
94	NC_014538	CTACAA	2	12	303010	303021	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	307723491
95	NC_014538	AGAAAA	2	12	305169	305180	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	307723493
96	NC_014538	AAAGAA	2	12	305338	305349	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	307723493
97	NC_014538	TGCTAC	2	12	305925	305936	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	307723494
98	NC_014538	AAAAGA	2	12	316877	316888	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	307723504
99	NC_014538	AGATAT	2	12	317399	317410	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	307723504
100	NC_014538	TGATAA	2	12	317552	317563	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	307723504
101	NC_014538	AATAGA	2	12	319771	319782	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	307723506
102	NC_014538	TCCAGG	2	12	324536	324547	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	307723511
103	NC_014538	AGGTCA	2	12	329328	329339	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	307723515
104	NC_014538	GTATAT	2	12	332058	332069	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	307723515
105	NC_014538	AGCACC	2	12	332543	332554	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	307723515
106	NC_014538	AGCAGT	2	12	333787	333798	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	307723516
107	NC_014538	ATAATT	2	12	334608	334619	50 %	50 %	0 %	0 %	307723517
108	NC_014538	TATTGA	2	12	335782	335793	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	307723518
109	NC_014538	GCTTAT	2	12	340087	340098	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	307723523
110	NC_014538	AAAAAT	2	12	340256	340267	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	307723523
111	NC_014538	GAATAT	2	12	345080	345091	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	307723528
112	NC_014538	AATTGC	2	12	350635	350646	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	307723534
113	NC_014538	CGGAGG	2	12	351388	351399	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	307723534
114	NC_014538	AGAGAT	2	12	358952	358963	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	307723542
115	NC_014538	GGGACT	2	12	359587	359598	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	307723542
116	NC_014538	TGAAAA	2	12	359620	359631	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	307723542
117	NC_014538	ACTCTT	2	12	361098	361109	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	307723544
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461	NC_014538	CGAGCA	2	12	1280040	1280051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307724426
462	NC_014538	TTTCAA	2	12	1283944	1283955	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	307724431
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