MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Vulcanisaeta distributa DSM 14429 chromosome

Total Repeats: 122

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014537	GATTTT	2	12	6167	6178	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014537	TTAAAT	2	12	52170	52181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014537	TTTCTA	2	12	58046	58057	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_014537	GAGGTT	2	12	108555	108566	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014537	CCCCAC	2	12	124248	124259	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
6	NC_014537	AGGGGT	2	12	139469	139480	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014537	TGATTT	2	12	144126	144137	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014537	GTACTG	2	12	210431	210442	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_014537	GCGTTA	2	12	245327	245338	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_014537	AATTTT	2	12	262978	262989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014537	GCTTTA	2	12	284267	284278	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_014537	AATTTT	2	12	325391	325402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014537	TTACCT	2	12	376716	376727	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014537	TGTGAA	2	12	393714	393725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014537	TAAAAA	2	12	397039	397050	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014537	TCAAGC	2	12	460790	460801	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_014537	ATGTTA	2	12	480932	480943	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014537	ATGAGA	2	12	492982	492993	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014537	GAGGGT	2	12	497274	497285	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014537	ATTTAA	2	12	522110	522121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014537	AAAATT	2	12	543578	543589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014537	TATCAA	2	12	577888	577899	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_014537	TTTCCA	2	12	587885	587896	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014537	GCATAT	2	12	589638	589649	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_014537	CCAACC	2	12	628320	628331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_014537	TTGGGT	2	12	633017	633028	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014537	GGTTGG	2	12	633031	633042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014537	TGCCCA	2	12	644797	644808	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
29	NC_014537	ATTATC	2	12	675543	675554	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_014537	GGTGAG	2	12	681502	681513	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014537	TGAAGT	2	12	688591	688602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014537	ACATAA	2	12	739330	739341	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_014537	CCTGTC	2	12	740485	740496	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
34	NC_014537	TACGTA	2	12	746526	746537	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_014537	TTGGTT	2	12	756988	756999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014537	TAGCCA	2	12	817253	817264	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014537	TTCTTT	2	12	829545	829556	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_014537	AACCAT	2	12	837079	837090	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014537	AAAATT	2	12	903348	903359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014537	TTATGA	2	12	956180	956191	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014537	TACGTA	2	12	971297	971308	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_014537	TTAATT	2	12	995187	995198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014537	ATTGAT	2	12	1031682	1031693	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014537	TTGGGC	2	12	1087195	1087206	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_014537	TTTTGT	2	12	1103470	1103481	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014537	ATTATC	2	12	1161088	1161099	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_014537	ATTTAA	2	12	1179955	1179966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014537	AAAATT	2	12	1208145	1208156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014537	ATTTAC	2	12	1217819	1217830	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_014537	TTAAAT	2	12	1232521	1232532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014537	AATATA	2	12	1243954	1243965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014537	TTTTTA	2	12	1279088	1279099	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014537	GTTATT	2	12	1287769	1287780	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014537	AATGAA	2	12	1295800	1295811	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014537	AATTAA	2	12	1305056	1305067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014537	ATTTCT	2	12	1335525	1335536	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_014537	ATAAAA	2	12	1335556	1335567	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014537	TTTTAA	2	12	1336389	1336400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014537	ATGCAT	2	12	1336811	1336822	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_014537	TAATTC	2	12	1351571	1351582	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_014537	GCCGGG	2	12	1360073	1360084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_014537	TTTTAA	2	12	1381734	1381745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014537	CCTTCT	2	12	1385177	1385188	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_014537	TTTTAA	2	12	1386102	1386113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014537	GTCCGA	2	12	1429504	1429515	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_014537	TAAGGT	2	12	1429690	1429701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014537	TATTTA	2	12	1452978	1452989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014537	AAGGAG	2	12	1453718	1453729	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014537	TATTTA	2	12	1458334	1458345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014537	TTAGTA	2	12	1466262	1466273	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014537	TCATAT	2	12	1468521	1468532	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_014537	TTTCAA	2	12	1499715	1499726	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_014537	AATTAA	2	12	1523035	1523046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014537	CCTTCT	2	12	1531482	1531493	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_014537	GTAATA	2	12	1539424	1539435	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014537	GATCAC	2	12	1565744	1565755	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_014537	ATTACT	2	12	1570220	1570231	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_014537	TAAAAA	2	12	1586203	1586214	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014537	ATGAAC	2	12	1612549	1612560	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_014537	TTGTTT	2	12	1616521	1616532	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014537	GTTATT	2	12	1616542	1616553	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014537	TTTTGA	2	12	1616587	1616598	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014537	CCCGGC	2	12	1629320	1629331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_014537	GATAAC	2	12	1691576	1691587	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_014537	TAATGA	2	12	1718366	1718377	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014537	TTAATT	2	12	1719604	1719615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014537	CGTATT	2	12	1735047	1735058	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_014537	TCCTTA	2	12	1768583	1768594	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_014537	GGCAAT	2	12	1784302	1784313	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_014537	CAAGGC	2	12	1828284	1828295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_014537	CCCGGC	2	12	1828329	1828340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_014537	TAAATC	2	12	1837212	1837223	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_014537	CTATTT	2	12	1840285	1840296	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_014537	TTGTTT	2	12	1840425	1840436	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014537	TTAATT	2	12	1933298	1933309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014537	GGTTAG	2	12	1943385	1943396	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014537	TTTAAA	2	12	1948591	1948602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014537	ATAACG	2	12	1972557	1972568	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_014537	TTTGCG	2	12	1982561	1982572	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_014537	TTAATA	2	12	2003052	2003063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014537	TAGAAA	2	12	2007390	2007401	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014537	GTATGA	2	12	2061084	2061095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014537	GATTTA	2	12	2063886	2063897	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014537	TTTATT	2	12	2069612	2069623	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014537	ATTTTT	2	12	2069632	2069643	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014537	ATATAA	2	12	2095784	2095795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014537	AATGTA	2	12	2099778	2099789	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014537	ATTTTA	2	12	2105778	2105789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014537	AATAGA	2	12	2105838	2105849	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014537	ATGACC	2	12	2223488	2223499	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_014537	TAAAAA	2	12	2244134	2244145	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014537	GTTGTC	2	12	2256751	2256762	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_014537	CCCTAG	2	12	2257495	2257506	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
114	NC_014537	ACCACA	2	12	2266710	2266721	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_014537	GGGGCC	2	12	2270216	2270227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_014537	TATTTT	2	12	2314235	2314246	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014537	AGCTTT	2	12	2316722	2316733	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_014537	ATTATA	2	12	2320067	2320078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014537	AAAATT	2	12	2320092	2320103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014537	ATTTTA	2	12	2337683	2337694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014537	GTAAGG	2	12	2339946	2339957	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014537	TCGCTT	2	12	2351179	2351190	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.