MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 plasmid Cy782206

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014535	TACT	2	8	314	321	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_014535	TAAC	2	8	1173	1180	50 %	25 %	0 %	25 %	307591244
3	NC_014535	TCTA	2	8	1267	1274	25 %	50 %	0 %	25 %	307591244
4	NC_014535	TAAA	2	8	1587	1594	75 %	25 %	0 %	0 %	307591244
5	NC_014535	TAGT	2	8	1628	1635	25 %	50 %	25 %	0 %	307591244
6	NC_014535	CATC	2	8	2195	2202	25 %	25 %	0 %	50 %	307591244
7	NC_014535	AATT	2	8	2566	2573	50 %	50 %	0 %	0 %	307591244
8	NC_014535	CTTG	2	8	2718	2725	0 %	50 %	25 %	25 %	307591244
9	NC_014535	TCTA	2	8	3166	3173	25 %	50 %	0 %	25 %	307591244
10	NC_014535	TAAT	2	8	3174	3181	50 %	50 %	0 %	0 %	307591244
11	NC_014535	TGAA	2	8	3233	3240	50 %	25 %	25 %	0 %	307591244
12	NC_014535	AAAT	2	8	3379	3386	75 %	25 %	0 %	0 %	307591244
13	NC_014535	ATTT	2	8	3478	3485	25 %	75 %	0 %	0 %	307591244
14	NC_014535	AAAT	2	8	3575	3582	75 %	25 %	0 %	0 %	307591244
15	NC_014535	TAAA	2	8	3711	3718	75 %	25 %	0 %	0 %	307591244
16	NC_014535	AAGA	2	8	4054	4061	75 %	0 %	25 %	0 %	307591244
17	NC_014535	TAAA	2	8	4177	4184	75 %	25 %	0 %	0 %	307591244
18	NC_014535	ATCT	2	8	4364	4371	25 %	50 %	0 %	25 %	307591245
19	NC_014535	TTAA	2	8	4494	4501	50 %	50 %	0 %	0 %	307591245
20	NC_014535	ATTT	2	8	4969	4976	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014535	TAAT	2	8	5021	5028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014535	AGTA	2	8	5147	5154	50 %	25 %	25 %	0 %	307591247
23	NC_014535	GAAA	2	8	5221	5228	75 %	0 %	25 %	0 %	307591247
24	NC_014535	GTAT	2	8	5405	5412	25 %	50 %	25 %	0 %	307591247
25	NC_014535	TAAG	2	8	6176	6183	50 %	25 %	25 %	0 %	307591248
26	NC_014535	AATT	2	8	7009	7016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014535	ATAA	2	8	7201	7208	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014535	TAGT	2	8	8949	8956	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014535	ATTA	2	8	9696	9703	50 %	50 %	0 %	0 %	307591252
30	NC_014535	GATT	2	8	9764	9771	25 %	50 %	25 %	0 %	307591252
31	NC_014535	TAGA	2	8	10007	10014	50 %	25 %	25 %	0 %	307591252
32	NC_014535	GCTT	2	8	10252	10259	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_014535	ATTG	2	8	10559	10566	25 %	50 %	25 %	0 %	307591253
34	NC_014535	TAAT	2	8	10724	10731	50 %	50 %	0 %	0 %	307591253
35	NC_014535	TTAA	2	8	10795	10802	50 %	50 %	0 %	0 %	307591253
36	NC_014535	TGAG	2	8	11031	11038	25 %	25 %	50 %	0 %	307591253
37	NC_014535	ATTG	2	8	11171	11178	25 %	50 %	25 %	0 %	307591253
38	NC_014535	TAAC	2	8	11483	11490	50 %	25 %	0 %	25 %	307591253
39	NC_014535	TAAA	2	8	11636	11643	75 %	25 %	0 %	0 %	307591253
40	NC_014535	TAAT	2	8	11714	11721	50 %	50 %	0 %	0 %	307591253
41	NC_014535	AATC	2	8	12504	12511	50 %	25 %	0 %	25 %	307591255
42	NC_014535	TGAA	2	8	12841	12848	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014535	AGTA	2	8	13526	13533	50 %	25 %	25 %	0 %	307591256

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.