MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 plasmid Cy782206

Total Repeats: 165

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014535	TTA	2	6	291	296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014535	TAG	2	6	354	359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014535	TTA	2	6	360	365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014535	CAA	2	6	380	385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014535	TTA	2	6	394	399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014535	TAA	2	6	515	520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014535	GGC	2	6	655	660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014535	ACA	2	6	970	975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014535	TAA	2	6	1105	1110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
10	NC_014535	TAC	2	6	1123	1128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591244
11	NC_014535	TGT	2	6	1181	1186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307591244
12	NC_014535	AAT	2	6	1219	1224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
13	NC_014535	TAT	2	6	1365	1370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591244
14	NC_014535	TAA	2	6	1378	1383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
15	NC_014535	TAA	2	6	1424	1429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
16	NC_014535	AAT	2	6	1445	1450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
17	NC_014535	TTA	2	6	1566	1571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591244
18	NC_014535	TCA	2	6	1664	1669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591244
19	NC_014535	TAG	2	6	1678	1683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591244
20	NC_014535	TAA	2	6	1786	1791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
21	NC_014535	AGT	2	6	1899	1904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591244
22	NC_014535	TAA	2	6	1920	1925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
23	NC_014535	CAT	2	6	1950	1955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591244
24	NC_014535	GTT	2	6	2037	2042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307591244
25	NC_014535	TAA	2	6	2143	2148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
26	NC_014535	ATT	2	6	2290	2295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591244
27	NC_014535	CTT	2	6	2355	2360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307591244
28	NC_014535	ATA	2	6	2413	2418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
29	NC_014535	CTA	2	6	2475	2480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591244
30	NC_014535	TCA	2	6	2510	2515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591244
31	NC_014535	TCA	2	6	2549	2554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591244
32	NC_014535	TCA	2	6	2618	2623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591244
33	NC_014535	TAA	2	6	2638	2643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
34	NC_014535	ATA	2	6	2826	2831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
35	NC_014535	ATT	2	6	2848	2853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591244
36	NC_014535	CTT	2	6	2922	2927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307591244
37	NC_014535	TAG	2	6	3003	3008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591244
38	NC_014535	TAA	2	6	3037	3042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
39	NC_014535	CCT	2	6	3086	3091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307591244
40	NC_014535	ATA	2	6	3115	3120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
41	NC_014535	CAT	2	6	3195	3200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591244
42	NC_014535	TAG	2	6	3201	3206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591244
43	NC_014535	TAA	2	6	3313	3318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
44	NC_014535	TCA	2	6	3464	3469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591244
45	NC_014535	TAG	2	6	3486	3491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591244
46	NC_014535	TAA	2	6	3645	3650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
47	NC_014535	TAA	2	6	3676	3681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
48	NC_014535	TAA	2	6	3844	3849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
49	NC_014535	ATC	2	6	3928	3933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591244
50	NC_014535	ATT	2	6	4082	4087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591244
51	NC_014535	ATT	2	6	4168	4173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591244
52	NC_014535	TTA	2	6	4220	4225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591244
53	NC_014535	AAT	2	6	4534	4539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591245
54	NC_014535	TCA	2	6	4668	4673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591245
55	NC_014535	ATC	3	9	4803	4811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591246
56	NC_014535	ATA	2	6	4821	4826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591246
57	NC_014535	TTA	2	6	4879	4884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591246
58	NC_014535	TAT	2	6	4928	4933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014535	CAT	2	6	4978	4983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014535	CTA	2	6	5122	5127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591247
61	NC_014535	TAC	2	6	5179	5184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591247
62	NC_014535	ATA	2	6	5278	5283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591247
63	NC_014535	CAA	2	6	5316	5321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307591247
64	NC_014535	TAG	2	6	5413	5418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591247
65	NC_014535	GAA	2	6	5469	5474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307591247
66	NC_014535	ATA	2	6	5494	5499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591247
67	NC_014535	ATT	2	6	5520	5525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591247
68	NC_014535	ATG	2	6	5638	5643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591247
69	NC_014535	TCA	2	6	5979	5984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591248
70	NC_014535	ATT	2	6	6234	6239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591248
71	NC_014535	CAT	2	6	6297	6302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591249
72	NC_014535	TTA	3	9	6344	6352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591249
73	NC_014535	GTT	2	6	6369	6374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307591249
74	NC_014535	AAT	2	6	6765	6770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591249
75	NC_014535	TCA	2	6	6839	6844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591249
76	NC_014535	TAA	2	6	6978	6983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014535	ACA	2	6	7112	7117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_014535	GAT	2	6	7130	7135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014535	TAA	2	6	7177	7182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014535	TAA	2	6	7387	7392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014535	TAA	2	6	7422	7427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014535	TAA	2	6	7498	7503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014535	TGC	2	6	7714	7719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_014535	TTA	2	6	8114	8119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591250
85	NC_014535	TTA	2	6	8132	8137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591250
86	NC_014535	ATG	2	6	8451	8456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591250
87	NC_014535	TCA	2	6	8807	8812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591250
88	NC_014535	TAA	2	6	8861	8866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014535	GTT	2	6	8902	8907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014535	ATA	2	6	8943	8948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014535	GAC	2	6	9018	9023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307591251
92	NC_014535	AAT	2	6	9064	9069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591251
93	NC_014535	AAG	2	6	9119	9124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307591251
94	NC_014535	ATT	2	6	9163	9168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591251
95	NC_014535	TTA	2	6	9305	9310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591251
96	NC_014535	AAC	2	6	9356	9361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_014535	GTT	2	6	9377	9382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014535	TTA	2	6	9392	9397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014535	ACA	2	6	9414	9419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307591252
100	NC_014535	ATT	2	6	9451	9456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591252
101	NC_014535	ACG	2	6	9484	9489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307591252
102	NC_014535	TAA	2	6	9621	9626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591252
103	NC_014535	CTA	2	6	9802	9807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591252
104	NC_014535	AAC	2	6	9944	9949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307591252
105	NC_014535	AAG	2	6	10036	10041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307591252
106	NC_014535	TAA	2	6	10116	10121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591252
107	NC_014535	ATT	2	6	10137	10142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591252
108	NC_014535	ACT	2	6	10174	10179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591252
109	NC_014535	CAT	2	6	10240	10245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_014535	ATA	2	6	10315	10320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014535	ACT	2	6	10324	10329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_014535	ACT	2	6	10353	10358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_014535	GTG	2	6	10490	10495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307591253
114	NC_014535	ATA	2	6	10525	10530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591253
115	NC_014535	TCA	2	6	10531	10536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591253
116	NC_014535	ATA	2	6	10597	10602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591253
117	NC_014535	ATT	2	6	10621	10626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591253
118	NC_014535	ATT	2	6	10663	10668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591253
119	NC_014535	ACA	2	6	10713	10718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307591253
120	NC_014535	ATA	2	6	10737	10742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591253
121	NC_014535	TAT	2	6	10874	10879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591253
122	NC_014535	ATA	2	6	10944	10949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591253
123	NC_014535	TGA	2	6	11010	11015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591253
124	NC_014535	ATA	2	6	11065	11070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591253
125	NC_014535	TTG	2	6	11121	11126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307591253
126	NC_014535	ATG	2	6	11314	11319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591253
127	NC_014535	AGT	2	6	11343	11348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591253
128	NC_014535	TCA	2	6	11383	11388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591253
129	NC_014535	TCA	2	6	11401	11406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591253
130	NC_014535	ATA	2	6	11465	11470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591253
131	NC_014535	GTC	2	6	11549	11554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307591253
132	NC_014535	ATG	2	6	11703	11708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591253
133	NC_014535	TAA	2	6	11759	11764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591253
134	NC_014535	ATC	2	6	11811	11816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591253
135	NC_014535	TAA	2	6	11820	11825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591253
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138	NC_014535	TAA	2	6	11956	11961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591254
139	NC_014535	TAA	2	6	12072	12077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591254
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.