MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 plasmid Cy782202

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014534	ATCTTT	2	12	89	100	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_014534	CTTTAT	2	12	558	569	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_014534	GATAAG	2	12	582	593	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014534	TGAAGA	2	12	2061	2072	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014534	GCACTC	2	12	2445	2456	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6	NC_014534	CTACAG	2	12	3351	3362	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014534	AACCCG	2	12	9156	9167	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
8	NC_014534	CCTATT	2	12	33042	33053	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014534	AGAAAA	2	12	33423	33434	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014534	AAAGAA	2	12	33630	33641	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014534	TAAAAA	2	12	38955	38966	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014534	AAAATT	2	12	76208	76219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014534	TTTAAA	2	12	82454	82465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014534	TTTAAA	2	12	82473	82484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014534	TTTTAA	2	12	145087	145098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014534	GTTGCG	2	12	166006	166017	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_014534	GGGTTT	2	12	167036	167047	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014534	AATATA	2	12	180811	180822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014534	TGAGAA	2	12	224963	224974	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014534	CAATAT	2	12	226588	226599	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_014534	ATCTAC	2	12	251273	251284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014534	ATAAAT	2	12	254027	254038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014534	TTTGGC	2	12	268523	268534	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_014534	AAATAG	2	12	294425	294436	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014534	GCCTAT	2	12	296107	296118	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_014534	ATTAAA	2	12	298302	298313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014534	GATAGA	2	12	307682	307693	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014534	CTAATT	2	12	314912	314923	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_014534	CTACTT	2	12	326445	326456	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_014534	ATCGCC	2	12	330996	331007	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
31	NC_014534	AAACGT	2	12	334642	334653	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_014534	TTCATT	2	12	344541	344552	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_014534	GCGGAA	2	12	348807	348818	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_014534	TTACCG	2	12	356034	356045	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_014534	AAAGAA	2	12	358374	358385	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014534	ATTTAA	2	12	358585	358596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014534	TTTTAC	2	12	359021	359032	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_014534	TTCCCC	2	12	380446	380457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_014534	GTACCC	2	12	387941	387952	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
40	NC_014534	GCCAAA	2	12	388412	388423	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_014534	AGAGCC	2	12	388700	388711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_014534	ACGTTT	2	12	394470	394481	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_014534	AAGGGG	2	12	400991	401002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014534	GATAAG	2	12	403179	403190	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014534	TTTTCC	2	12	403429	403440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014534	TTAGTT	2	12	406525	406536	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014534	ATTATC	2	12	416068	416079	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_014534	CACACC	2	12	418217	418228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_014534	TGGCTT	2	12	425100	425111	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_014534	AAAGAA	2	12	431250	431261	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014534	ATTTAA	2	12	431461	431472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014534	TAAAAA	2	12	440899	440910	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014534	TTAAAA	2	12	443993	444004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014534	GTTTAG	2	12	451618	451629	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014534	GTTTTT	2	12	452470	452481	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014534	GAAAAA	2	12	456773	456784	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014534	TAATCT	2	12	462101	462112	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.